Microbiologie environnementale

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Les sols contiennent normalement une quantité finie de l’eau, qui peut être exprimé comme la « teneur en humidité du sol. » Cette humidité existe dans les pores entre les agrégats du sol (l’espace poral inter global) et au sein des agrégats du sol (l’espace poral intra-agrégat) (Figure 1). Normalement, cet espace interstitiel est occupé par air et/ou d’eau. Si tous...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Luisa Ikner Une technique aseptique est une compétence fondamentale largement pratiquée dans le domaine de la microbiologie environnementale qui nécessite un équilibre de pleine conscience et la pratique en laboratoire. Bonne utilisation de cette technique réduit le risque de contamination bactérienne ou fongique des réactifs, milieux de culture et les échantillons environnementaux. Une...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Luisa Ikner Le spectre de la recherche en microbiologie environnementale est large dans la portée et l’application potentielle. Que le travail soit de laboratoire avec des isolats bactériens connus, ou en matière de prélèvement d’échantillons de sol ou d’eau contenant des isolats bactériens inconnus, la capacité de rapidement et visuellement discerner les populations cultivables...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Sol compose de la mince couche à la surface de la terre, contenant les facteurs biotiques et abiotiques qui contribuent à la vie. La partie non biologique comprend des particules inorganiques variant en taille et en forme qui déterminent la texture du sol. La portion biotique incorpore les résidus végétaux, racines, matières organiques et micro-organismes. Diversité...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Les champignons sont des organismes eucaryotes hétérotrophes et à l’exception des levures, sont aérobies. Ils sont abondants dans les sols de surface et sont importants pour leur rôle dans le cycle des éléments nutritifs et la décomposition des matières organiques et les contaminants organiques. Blanc de champignons (phanerochaete chryosporium) par exemple, (Figure 1)...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Luisa Ikner Les méthodes traditionnelles d’analyse des communautés microbiennes dans les sols comportent habituellement soit culturels dosages utilisant la dilution et méthodologie sur médias sélectifs et différenciés ou dénombrement direct des essais de placage. Les comptes directs offrent des informations sur le nombre total de bactéries présentes, mais ne donnent aucune information...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Réaction en chaîne par polymérase (PCR) est une technique utilisée pour détecter des microorganismes présents dans le sol, l’eau et les milieux atmosphériques. En amplifiant les sections spécifiques de l’ADN, la PCR peut faciliter la détection et l’identification des micro-organismes de la cible vers le bas pour l’espèce, la souche et sérotype/pathovar niveau. La...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Réaction en chaîne polymérase transcription inverse (RT-PCR) implique le même processus que la PCR classique — cyclisme température d’amplification des acides nucléiques. Toutefois, alors que la PCR classique ne fait qu’amplifier acides désoxyribonucléiques (ADN), RT-PCR permet l’amplification des acides ribonucléiques (ARN) par le biais de la formation de l’ADN...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR), également connu sous le nom de PCR en temps réel, est une technique moléculaire largement utilisé pour la numération des microorganismes dans l’environnement. Avant cette approche, quantification des microorganismes se limitait essentiellement à des techniques classiques de culture-basée. Cependant, la mise en...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Luisa Ikner Analyse de qualité de l’eau surveille les influences anthropiques tels que les polluants, les nutriments, pathogènes et autres éléments qui peuvent influer sur l’intégrité de l’eau comme une ressource. La contamination fécale contribue pathogènes microbiens qui menacent les plantes, animaux et la santé humaine avec ou à une maladie. La demande en eau croissante et strictes...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Luisa Ikner La qualité des eaux destinée à une utilisation dans des milieux agricoles, récréative et domestique est d’une grande importance en raison du risque de flambées de maladies d’origine hydrique. Les agents microbiens impliqués dans ces événements incluent des parasites, bactéries et virus qui sont détachent en grand nombre dans les selles des personnes infectées et des animaux.

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Alex Wassimi Les virus sont un groupe unique d’entités biologiques qui infectent les organismes tant procaryotes et eucaryotes. Ils sont des parasites qui n’ont aucune capacité métabolique et afin de reproduire, s’appuient sur le métabolisme de l’hôte pour produire des pièces virales qui s’assemblent à l’intérieur des cellules de l’hôte. Les virus sont ultramicroscopiques — trop petit...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaLes auteurs mettant en évidence : Bradley Schmitz et Luisa Ikner Sols superficiels sont un mélange hétérogène de particules inorganiques et organiques qui se combinent ensemble pour former des agrégats secondaire. Au sein et entre les agrégats sont vides ou pores qui contiennent à la fois visuellement de l’air et l’eau. Ces conditions créent un écosystème idéal pour les bactéries, donc tous les sols contiennent...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaDémonstration d’auteur : Luisa Ikner Les bactéries sont parmi les formes de vie les plus abondants sur terre. Ils sont trouvent dans chaque écosystème et sont vitales pour la vie quotidienne. Par exemple, les bactéries affect, ce que les gens mangent, boivent et respirer, et il y a effectivement plus de bactéries dans le corps d’une personne que les cellules de mammifères. En raison de l’importance des...

Source : Laboratoires du Dr Ian poivre et Dr Charles Gerba - Université de l’ArizonaAuteur mettant en évidence : Bradley Schmitz Les algues sont un groupe très hétérogène de micro-organismes qui ont un trait commun, à savoir la possession des pigments photosynthétiques. Dans l’environnement, les algues peuvent causer des problèmes pour les propriétaires de piscine de plus en plus dans l’eau. Algues peuvent également causer des problèmes dans les eaux de surface, tels que les lacs et les...