Gen silme ve protein aşırı ekspresyonu proteinlerin işlevleri çalışmak için sık kullanılan yöntemlerdir. Bu makalede, bir nüfus protein konsantrasyonu fonksiyonu ve tek hücreli düzeylerde fenotip gelişimi analiz için bir protokol<em> Saccharomyces cerevisiae</em>.
Abstract
Gen silme ve protein aşırı ekspresyonu proteinlerin işlevleri çalışmak için sık kullanılan yöntemlerdir. Bu makalede, bir nüfus protein konsantrasyonu fonksiyonu ve tek hücreli düzeylerde fenotip gelişimi analiz için bir protokol<em> Saccharomyces cerevisiae</em>. Bu protokol bir proteinin aşırı ekspresyonu dayalı olmasına rağmen, protein ekspresyonu baskılanması bağlı morfolojik fenotipleri için kolayca adapte olabilir. Bizim laboratuvar endositik adaptör protein epsin sinyal özelliklerini inceleyerek ilgileniyor. Bu amaç için korunmuş fazla dile getirdiği baskın bir olumsuz yaklaşım kullanıldı<u> E</u> Psin<u> N</u> -<u> T</u> Erminal<u> H</u> Omology (ENTH) etki alanı endojen epsin-2 (Ent2 veya YLR206W) fonksiyonları ile müdahale edebilmek için. Biz iskele proteinler, septins bir ailenin mislocalization bağımlı bir hücre bölünmesi kusur yol açan vahşi tip hücrelerde Ent2 (ENTH2) ENTH etki bu aşırı ekspresyonu gözlemledi.
Protocol
A. Hücre Kültürü ve Protein İndüksiyon Bu bölümde, hücre kültürü, maya hücreleri bir ayarlanabilir organizatörü protein ifade indüksiyon takip koşulları, hücre döngüsü Nocodazole ile senkronizasyonu, açıklamaktadır. Yaban tip maya suşu W303 (leu2-3, 112 trp1-1 can1-100 ura3-1 ade2-1 his3-11, 15) kontrolü altında ilgi bizim gen (ENTH2) içeren yüksek kopyasını (2μ) plazmid DNA ile dönüştürdü. metionin repressible organizatörü (MET…
Discussion
Bu protokol, protein aşırı ekspresyonu üzerine morfolojik bir fenotip (uygun hücre bölünmesi geçmesi mümkün maya hücresi) gelişimini izlemek anlatılmaktadır. Bu işlemi yaparken, daha hızlı ve belirsiz sonuçlar hücreleri zarar verebilir olarak tavsiye santrifüj hızda peletleme maya hücreleri hasat hatırlamak önemlidir. Metilen mavisi ve Calcofluor beyaz toksik olarak hemen önce görüntüleme hücreleri yaşamak için ilave edilmelidir. Bu işlem aynı zamanda kolayca hedef kontrollü bir organiz…
Acknowledgements
Brian G. Coon ve Claudia B. Hanna yararlı tartışmalar ve destek için teşekkür ederiz. Bu proje, Dep start-up fonları tarafından desteklenen. Biyolojik Bilimler, Purdue Üniversitesi R. Claudio Aguilar ve R. Claudio Aguilar Purdue Kanser Merkezi aracılığıyla bir Amerikan Kanser Derneği Kurumsal Araştırma Bursu.
Gietz, R. D., Woods, R. A. .High efficiency transformation with lithium acetate in Molecular Genetics of Yeast: A Practical Approach. , 121-134 (1994).
Mukherjee, D., Sen, A., Aguilar, R. C. Analysis of the Development of a Morphological Phenotype as a Function of Protein Concentration in Budding Yeast. J. Vis. Exp. (37), e1863, doi:10.3791/1863 (2010).