Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Immunology and Infection

Fractionation subcellular של דגימות מדרכי העיכול טריים וקפואים

Published: July 15, 2018 doi: 10.3791/57740
* These authors contributed equally

Summary

כאן, אנו מציגים פרוטוקול לביצוע של fractionation סלולרית פשוטה לצורך הקמת מכשול ההפרדה subcellular של חלבונים cytoplasmic וגרעיני ב אנושי ביופסיות מעיים טריים וקפואים.

Abstract

המטרה של פרוטוקול זה היא fractionate רקמה אנושית מעיים מתקבל על ידי אנדוסקופיה לתוך תאים גרעינית, cytoplasmic לניתוח לוקליזציה של חלבונים ספציפיים או חלבון מתחמי במדינות רקמות שונות (קרי, בריא נגד המחלה). שיטה זו שימושית עבור fractionation של שתי דגימות רקמה מעיים טריים וקפואים; זה נגיש עבור כל המעבדות לא זמן רב.

Introduction

חלבונים להשתתף כמעט את כל הפונקציות הביולוגי בתוך תא, כל וריאציה במבנה שלהם, כמות או מיקום יכול להוביל תרחיש פתוגניים. רקמות מדגם fractionation שיטות הן בגישה שימושי כדי להפחית את המורכבות של מחלות הקשורות חלבון ניתוחים. מספר מחקרים להשתמש במידע לוקליזציה חלבון או להעשיר את חלבון מתא סלולרית ספציפית, אז עבור fractionation לשחזור של חלבונים שלמים פרוטוקול זה שימושי לענות על שאלות ביולוגיות מסוימות. לקביעת ההתאמה subcellular של חלבונים וניטור הפצה compartmental או אינטראקציות על הבסיס שלהם תנאים המחלה תסייע לזהות מחלה הקשורה הבדלים תפקודיים1,2. לכן, בשיטה זו שואפת reproducibly fractionate רקמת המעי ביופסיות, טריים וקפואים, לתוך תאים subcellular cytoplasmic וגרעיני.

דגימות הביופסיה מעיים מתקבלים באופן שגרתי במהלך אנדוסקופיה הליכים3 (איור 1), יכול לשמש ביעילות עבור כימות חלבון או לימודים immunoprecipitation. מאז דגימות רקמה מן המעי אפיתל יכיל חלבונים אשר עשויים להיות מעורבים ישירות בפתוגנזה המחלה4, דגימות ביופסיה מעיים הם מקור חשוב מאוד לצורך זיהוי מוצלח מעיים מחלות ספציפיות חלבונים. דגימות רקמה, החולה קפוא מאוחסנים יחד עם המידע הקליני הם משאבים שימושיים עבור חלבונים, הכנה מדגם לשחזור ופשוט הוא סוגיה מרכזית לספק מידע compartmental תא באמצעות הגבלת כמויות קפוא רקמות5.

ישנם מספר ערכות זמינים מסחרית לצורך הקמת מכשול ההפרדה של שברים הסלולר, אבל אלה יקרים יותר, בדרך כלל זמן רב יותר מאשר בפרוטוקול המוצג כאן. פרוטוקולים בהתבסס על צנטריפוגה הדרגתיים מרובים-צעד, מעברי צבע רציף גם בעבר שימשו את fractionation של מגוון התאית בתאים ברקמות שונות6,7. עם זאת, שמירה על מרקם של מעברי צבע רציף לעתים קרובות משימה קשה. פרוטוקולים דומה המבוסס על פירוק רציפים של ממברנות תוארו קודם לכן אבל הם בדרך כלל צריך יותר משני מאגרי, הידיים בזמן הוא עוד8 .

כאשר fractionating דגימות רקמה, לזכור את הרקמה הזאת דגימות נוכח תא התא, התא-מטריקס אינטראקציות כי הן לא נוכח בתאים בתרבית חשוב בעת הליך שאיבת חלבון. פירוט נאותה בין תאים מטריצה חוץ-תאית מבלי להשפיע על איכות החלבון יהיה גורם קריטי ב בידוד חלבון9רקמת המעי. ב פרוטוקול זה, אנשי קשר תא התא, התא-מטריקס הם קודם שבור, משחררים את התאים ומאפשר את המאגר להגיע אל התאים הבודדים. כדי למנוע ערבוב לפני fractionation חלבון-תא, פירוט של אנשי הקשר להתרחש מבלי לשנות את התקינות של התאים או את הקרומים גרעיני.

בשל העשרת של פרוטאזות שונים רירית המעי10, חשוב לשלוט השפלה חלבון במהלך החילוץ. כדי למזער את ההשפלה חלבון פוטנציאליים, מעכבי פרוטאז מרובים חייבים להיכלל במאגרי מיצוי חלבונים. בנוסף, אם תמציות עומדים לשמש עבור מבחני פונקציונלי, זה חיוני כדי למנוע את דנטורציה של חלבונים או proteolysis כמו זה יגרום לאובדן חלבון פעילות11. למטרה זו, הפרוטוקול מבוצע ב 4 ° C, phenylmethylsulfonyl טריים פלואוריד (PMSF) מתווסף המאגרים-ריכוז סופי של 0.1 מ מ רק לפני השימוש כדי לעכב עוד יותר proteolysis.

הצעד הראשון תא fractionation הוא שיבוש רקמות פירוק התא. כאמור, המטרה היא disaggregate את התאים ואת לשבור שאותם לפתוח במינימום נזקים. דגימות רקמה מעיים חייבת להיות הומוגני, התאים lysed כדי להשיג שבירה המרבי של קרום התא. ב פרוטוקול זה, אנו משתמשים במערבל שהעקב ממונע לשבור רקמת המעי אשר הוא הומוגני תוך שניות על-ידי פעולה vortexing במהירות גבוהה. לאחר המגון, תאי הרקמות מודגרת בתוך מאגר היפוטוניק יפרץ קרום התא, אך ימנע הגרעינים שלמים, ואחריו תוספת של חומר ניקוי denaturing (nonyl phenoxypolyethoxylethanol) מערבולת קצר להפרדת הגרעינים מתוך השבר cytoplasmic. לאחר הסרת הציטופלסמה, קרום גרעין התא הוא פרץ לתוך מאגר hypertonic ברעידות.

השיטה המוצגת כאן היא שיטה המתאימה עבור fractionation subcellular של ביופסיות מעיים טריים וקפואים זה הושגו במהלך הליכי אנדוסקופי, נע בין 2 ו- 10 מ"ג במשקל. את הפרוטוקול היא קלה, לשחזור ואת יכולה להתבצע באמצעות מכשור מעבדתי בסיסי, ריאגנטים בתוך פחות משעה.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

מחקר זה אושרה על-ידי קרוסס אוניברסיטת אתיקה המנהלים, ניתוחים בוצעו לאחר הסכמה מדעת היה המתקבלים בכל המקצועות או הוריהם.

1. ביופסיה אוסף

הערה: דגימות ביופסיה מן התריסריון דיסטלי של המטופלים מתקבלים במהלך אנדוסקופיה אבחון שגרתי ניהול ביופסיות הטווח בין 2 ו- 10 מ"ג במשקל. הרקמה ביופסיה היא רקמה מורכבת המורכב לסוגי תאים שונים לרבות אפיתל, מערכת החיסון ותאי אנדותל. הגסטרואנטרולוגיה קליניים לבצע אנדוסקופיה את הבאים הוקמה הנחיות קליניות.

  1. הנח את הביופסיה על נייר סינון סטרילי רק לאחר אנדוסקופיה.
  2. להשתמש מלקחיים כדי להעביר את ביופסיות 1.5 mL צינורות, להשרות אותם עם PBS, ולמקם אותו לתוך cryotube.
  3. שמור צינורות על הקרח עד שהם מגיעים במעבדה.
    1. הפעל עיבוד של ביופסיות טריים באופן מיידי.
  4. ביופסיות קפוא, פלאש להקפיא את הביופסיה המכילים צינורות, לאחסן בחנקן נוזלי עד השימוש.
    הערה: חשוב לשמור על המדגם קפוא עד המאגר שהושלם קר 1 נוסף.

2. מאגר הכנה

הערה: לפני שמתחילים, תוספת המאגרים כדלקמן.

  1. להוסיף 1 מ"מ DTT (ריכוז סופי), מאגר פרוטאז, פוספטאז מעכב קוקטייל (1 x ריכוז סופי) למאגר היפוטוניק 1, hypertonic 2 (טבלה 1).
    1. להכין 1.5 מ של מאגר 1 ו- 150 µL מאגר 2 עבור דגימה. DTT יהיה למנוע החמצון של הדגימות.
  2. להכין מאגר שטיפת גרעינים על-ידי הוספת 1% דטרגנט (nonyl phenoxypolyethoxylethanol) כדי ריכוז סופי של 0.1% אל המאגר כבר שהושלם 1. להכין 1 מ"ל גרעינים מאגר שטיפת לדגימה.

3. ביופסיה המגון

  1. ביופסיות טריים
    1. מקום איחדו חד פעמיים את המיקסר ממונע. לוודא איחדו יגיע לתחתית הצינור.
    2. להוציא את הביופסיה מ cryotube ולמקם אותו צינור 1.5 מ עם טיפ פיפטה.
    3. להוסיף 200 µL מאגר שהושלם 1 צינור 1.5 מ.
    4. Homogenize את הביופסיה עם איחדו עד הרקמה מופרת לחלוטין ולשמור אותו בקרח.
    5. לאחר כל והביופסיות הם הומוגני להמשיך בשלב 4.
      הערה: יש לשנות בקווקז חד פעמי בין ביופסיות.
  2. ביופסיות קפוא
    התראה: להתמודד עם חנקן נוזלי בקפידה; מגע של חנקן נוזלי עם העור או העיניים עלול לגרום פגיעה חמורה מקפיא. להגן על כפות הידיים והעיניים תמיד בעת עבודה עם חנקן נוזלי.
    1. קח כמה חנקן נוזלי בתוך קופסה לאחסון את cryotubes שאוחזר למיכל חנקן.
    2. למצוא את הביופסיה במיכל חנקן ולמקם את cryotube בתיבה עם החנקן הנוזלי. חזור על שלב זה עבור כל והביופסיות.
    3. להעביר את הביופסיה cryotube צינור 1.5 מ.
      הערה: ביופסיות תצורף הצינור קפוא. לדחוף את הביופסיה עם טיפ פיפטה סטרילי אז זה הם ינותקו מהצינור.
    4. להוסיף 200 µL מאגר שהושלם 1.
    5. Homogenize הרקמה באמצעות שהעקב ופצצות מרגמה עד הרקמה מופרת לחלוטין, שמירה על הטמפרטורה ב 4 מעלות צלזיוס לאורך כל ההליך.
      הערה: אל תתנו ביופסיות להפשיר לפני הוספת המאגר.

4. ציטופלזמה בידוד

  1. דגירה ביופסיה homogenized על קרח למשך 10 דקות.
  2. להוסיף 10 µL של 1% סבון (nonyl phenoxypolyethoxylethanol) כל דגימה כדי ריכוז סופי של 0.05%.
    הערה: תאים ויוצרים פרץ על ידי פירוק osmotic כמו הנוזל מתון ישבש את קרום התא.
  3. דגירה על קרח למשך 5 דקות.
  4. מערבולת בקצרה, צנטריפוגה ב 400 x g ב- 4 הלעפה תרוטרפמט למשך 2 דקות.
  5. לאחר vortexing, להסיר את תגובת שיקוע, להעביר אותו צינור נקי mL 1.5; זה יהיה השבר cytoplasmic. אל תמחק את גלולה.

5. גרעיני בידוד

  1. Resuspend בגדר מהשלב הקודם עם 200 µL גרעינים שטיפת המאגר.
  2. Centrifuge את הצינור למשך 2 דקות 400 x g ו- 4 מעלות צלזיוס.
  3. למחוק את תגובת שיקוע, חזור על התהליך הכביסה פעמיים נוספות.
    הערה: מנקי יסיר cytoplasmic זיהום בהשבר הגרעין.
  4. לאחר לשטוף את השלישי, resuspend בגדר ב 100 µL מאגר 2.
  5. לנער את הדגימה נמרצות ב 4 הלעפה תרוטרפמט במשך 30 דקות לחלופין, דגירה המדגם על קרח, מערבולת כל 5 דקות.
  6. לאחר טלטולים, centrifuge את הדגימה 10 דקות בשיא המהירות (> 12,000 x g) ו- 4 מעלות צלזיוס.
  7. לאחר vortexing, להעביר את תגובת שיקוע לתוך 1.5 נקי חדש. mL שפופרת. זה יהיה השבר הגרעין.

6. חלבון כמת

הערה: לכמת את החלבונים עם bicinchoninic חומצה (BCA) חלבון assay ערכת. ריכוז חלבונים בהשברים ינוע בין 0.5 ל- 5 µg/µL, להיות נמוך השבר הגרעין (ראו טבלה 2 ריכוז חלבון הנובעת מ- 2 מ ג ביופסיות).

  1. להכין עיקול רגיל עם כמויות (µg) אלבומין שור (BSA) שלהלן12: 0-0.5-1-2-3-4-5-6.
  2. הכינו את ריאגנטים הדרושים לשימוש µL 100 של המיקס הסופי BCA לדגימה.
  3. פיפטה 2 µL של כל שבר חלבון במנת טוב 96, להוסיף את תערובת BCA, בצע את הוראות היצרן עבור הקריאה.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

איור 1 מראה של צביעת אאוזין hematoxylin של מקטע המעי ביופסיה עם שלם villi ומבנים הקריפטה.

התוצאות נציג של fractionation גרעינית, cytoplasmic באמצעות פרוטוקול זה מוצגים נתוני 2 ו- 3. בניסוי שמוצג באיור 2, רעננה (Fh) ו- (Fz) קפוא ביופסיה בעת ובעונה אחת היו fractionated בעקבות פרוטוקול המובאת כאן, אבן חשופה המערבית התבצע בעזרת μg 20 של כל דגימה. ריכוז חלבון כל שבר ו ביופסיה מוצגות בטבלה מס ' 2, ריכוז חלבון אינם שונים מאוד בין הטרייה הרקמה קפוא. התשואה של חלבון המופק והביופסיות 2 מ ג הוא סביב 3-4 µg/µL השבר cytoplasmic, כ- 1.5 µg µL ב השבר הגרעין. כדי לבדוק את טוהר השברים, HSP90 טובולין שימשו כפקדי cytoplasmic HDAC1 ואת H3 כמו פקדים גרעיני13. זה יכול להיות שנצפו כי HSP90 טובולין הם ראשי ממוקם בציטופלסמה, HDAC1, H3 ממוקם בגרעין עם ערבוב מאוד מינימלי בין שני שברים. כדי להעריך אם הפרוטוקול משפיע על מוות של תאים, אנחנו גם מחק לנוכחות של קספאז 3. איור 2, שתי דוגמאות מציגים מכתים מאוד מינימלי עבור קספאז 3 המאשר כי ההליך אינו משפיע על מסלול מוות התא גם לאחר פלאש מקפיא את הביופסיה. גם נותחה אם חלבון השינויים נשמרים לאחר הניתוח, כך החלבונים יכול לשמש עבור מבחני פונקציונלי במורד הזרם. PhosphoSTAT1 שימשו מכתימה הביופסיה הקפואה בשימוש fractionation הזה הגיע מאדם בודד עם מצב דלקתי במעיים; . זה לא נכון של הביופסיה טריים. כצפוי, phosphoSTAT1 ממוקם בציטופלסמה של הביופסיה הקפואה, המאשר כי השינויים חלבון נשמרים לאחר fractionation.

הפארמצבטית של השיטה באמצעות ביופסיות קפוא מוצג באיור3. תספיג בוצעה לאחר fractionation של שלושה עצמאית קפוא ביופסיות, ו השברים נקיים עם חלבונים תא מינימלי ערבוב (איור 3 א): HSP90 ממוקם cytoplasmic שבר, HDCA1 השבר הגרעין. בנוסף, גם נמוג ונעלם החלבון XPO1 הנמצאים בשני שברים גרעינית, cytoplasmic14 . זה יכול להיות שנצפו רמות XPO1 לכמת על-ידי ImageJ יציבים ב כל שבר (איור 3B), המאשר הפארמצבטית של תוצאות באמצעות ביופסיות שונות.

Figure 1
איור 1 : Micrograph אור של מקטע אפיתל המעי, מוכתם אאוזין hematoxylin, מ ביופסיה על ידי הליך אנדוסקופי. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.

Figure 2
איור 2 : כתם נציג המערבי fractionation subcellular הופיעה רעננה (Fh) וביופסיה (Fz) קפוא. HSP90 טובולין שימשו בתור פקדי cytoplasmic ו HDAC1 ו- H3 כפקדי גרעינית. הנוכחות של CASP3 ו- phosphoSTAT3 היו גם העריכו. 

Figure 3
איור 3 : Fractionation תוצאות של שלושה עצמאית קפוא ביופסיות. (א) כתם נציג המערבי fractionation subcellular הופיעה שלוש ביופסיות קפואים (1, 2 ו- 3). HSP90 שימש בתור פקד cytoplasmic ו HDAC1 פקד גרעינית. הלוקליזציה של XPO1 היה גם העריכו. (B) יחסית כימות של XPO1 בכל אחד של השבר נעשה באמצעות תוכנת ImageJ. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.

מאגר רכיבים הערות
מאגר היפוטוניק 1 10 מ מ HEPES pH 7.9 1.5 ml מאגר/מדגם
10 מ מ אשלגן כלורי
EDTA 0.1 nmM
מאגר hypertonic 2 20 מ מ HEPES pH 7.9 150 µl מאגר/מדגם
400 מ NaCl
0.1 מ מ EDTA
* הערה: מאגרי שניתן לאחסן ב- 4ºC לחודש.
* * הערה: מאגרי חייב להיות שיושלם עם מעכבי proteinase ו פוספטאז ו DTT לפני השימוש

טבלה 1: מאגר הרכב.

טרי קפוא
ציטופלזמה 2.975 4.612
גרעין 1.516 1.385

טבלה 2: ריכוז חלבון של כל אחד השברים ב ביופסיה טריים וקפואים 2 מ ג בשימוש איור 2; ריכוז מוצג μg/μL.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

הפרוטוקול המתואר כאן משמש את fractionation גרעינית, cytoplasmic של ביופסיות מעיים. החלבונים מטוהרת הם לא שפגע בסימני והוא יכול לשמש לא רק בניתוח תספיג כמוצג באיור 2 ו- 3 אלא גם מבחני הדורשים מקופלת מקורי חלבונים כגון immunoprecipitation, electrophoretic ניידות shift assay (EMSA) או יליד לזיהוי בג'ל (עמוד).

השיטה המתוארת מסתמך על המגון מכני של הרקמה יחד עם פירוק osmotic להתפוצץ קרום התא מבלי להשפיע על קרום גרעיני. התוצאה היא fractionation נקי של שני החלבונים cytoplasmic וגרעיני שישמש עבור ניתוחים במורד הזרם. חשוב לשלוט ההשפלה של החלבונים בתהליך על-ידי התוספת של מעכבי חלבון ו פוספטאז. יתר על כן, אם חלבונים שחולצו שישמש עבור מבחני פונקציונלי במורד הזרם, חשוב גם למנוע דנטורציה proteolysis של הדגימות. התהליכים צריכה להתבצע ב 4 ° C, PMSF יש להוסיף גם את המאגרים.

ההליך המתואר פרוטוקול זה פשוט וזול, זמן עיבוד הדגימה היא מזערית. בעיות כגון זמן עיבוד טיימס ושימוש fractionation יקר ערכות אינם האילוצים של פרוטוקול זה.

ביופסיות טריים וקפואים שניהם ניתן להשתמש בפרוטוקול זה, עם ביופסיות קפוא מתן תוצאות די נקי, לשחזור fractionation כפי שניתן לראות באיור 2 ו- 3. אם יש זיהום תא, הפעם פירוק התא יכול להיות מופחת כדי למנוע את שחרורו של הגרעין אל הציטופלסמה, ניתן להוסיף שטיפה צעדים כדי למנוע זיהום cytoplasmic בתא גרעינית.

האפשרות של שימוש ברקמות קפוא לניתוח עצמאי לשברים גרעינית, cytoplasmic חלבון יכול להגדיל את הידע שלנו על מחלות מעיים דלקתיות שבו מאוחסנים ביופסיות קפוא. יתר על כן, טכניקה זו יכולה להיות מותאם לרקמות האנושיות שנרכשו על ידי ביופסיות מסוגים אחרים. יש לשנות את עוצמת הקול של מאגרי בשימוש בהתאם לגודל של הביופסיה.

הפרוטוקול המתואר כאן נועד ליצור רקמה לשחזור שברים; עם זאת, כמה השתנות פנימית בתוך המדגם, כולל את הגודל ואת המצב של הרקמה יכול להוביל סטיות כמות חלבון והפצה שמנוהלים על כל שבר.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

המחברים אין לחשוף.

Acknowledgments

מחברים להכיר את הסיוע של לופז Ander ו Miren Telletxea הקלטה ועריכה וידאו. ACR ממומן על-ידי התחברות Ikerbasque של פרויקט מחקר שבסיסה Celiacos דה מדריד (ACM). מחדרהמלון הוא ממומן על ידי פרויקט ISCIII-PI16/00258, והיתה שותפה במימון מאת האיחוד האירופי ERDF/ESF "דרך להפוך את אירופה". הוא ממומן על ידי מענק פרוייקט מחקר 2015111068 של מחלקת הבריאות בסקית. IRG מלכה פרחיה נתמכים על ידי מענקים מלגת predoctoral את UPV/EHU והבסקים משרד החינוך, בהתאמה.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
HEPES Sigma Aldrich H4034-1kg
KCl Sigma Aldrich P9333-1kg
EDTA Sigma Aldrich E9884-100G
NaCl Sigma Aldrich 5588886-1kg
DTT Sigma Aldrich 10197777001
PMSF Thermo Scientific 36978
Proteinase and phosphatase inhibitors Thermo Scientific A32959
NP-40  Sigma Aldrich CA-630 Detergent
BCA assay Thermo Scientific 23227 Protein quantification kit
Disposable plastic pestles Sigma Aldrich Z359947-100EA
Dounce homogeneizer VWR 431-0100
Microcentrifuge Eppendorf 5415-R
Shacker IKA MS3 basic

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Cox, B., Emili, A. Tissue subcellular fractionation and protein extraction for use in mass-spectrometry-based proteomics. Nature Protocols. 1 (4), 1872-1878 (2006).
  2. Itzhak, D. N., Tyanova, S., Cox, J., Borner, G. H. Global, quantitative and dynamic mapping of protein subcellular localization. eLife. 5, (2016).
  3. Preedy, V. R., Watson, R. R., Ronald, R. Methods in disease investigating the gastrointestinal tract. , Greenwich Medical Media. (1998).
  4. Alex, P., Gucek, M., Li, X. Applications of proteomics in the study of inflammatory bowel diseases: Current status and future directions with available technologies. Inflammatory bowel diseases. 15 (4), 616-629 (2009).
  5. Ericsson, C., Franzén, B., Nistér, M. Frozen tissue biobanks. Tissue handling, cryopreservation, extraction, and use for proteomic analysis. Acta oncologica (Stockholm, Sweden). 45 (6), 643-661 (2006).
  6. Hoffmann, K., et al. New application of a subcellular fractionation method to kidney and testis for the determination of conjugated linoleic acid in selected cell organelles of healthy and cancerous human tissues. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 381 (6), 1138-1144 (2005).
  7. Foster, L. J., et al. A Mammalian Organelle Map by Protein Correlation Profiling. Cell. 125 (1), 187-199 (2006).
  8. Baghirova, S., Hughes, B. G., Hendzel, M. J., Schulz, R. Sequential fractionation and isolation of subcellular proteins from tissue or cultured cells. MethodsX. 2, e440-e445 (2015).
  9. Börner, A., et al. Subcellular protein extraction from human pancreatic cancer tissues. BioTechniques. 46 (4), 297-304 (2009).
  10. Antalis, T. M., Shea-Donohue, T., Vogel, S. N., Sears, C., Fasano, A. Mechanisms of disease: protease functions in intestinal mucosal pathobiology. Nature clinical practice. Gastroenterology. 4 (7), 393-402 (2007).
  11. Cutler, P. Protein purification protocols. , Humana Press. (2004).
  12. Walker, J. M. The Bicinchoninic Acid (BCA) Assay for Protein Quantitation. The Protein Protocols Handbook. , 11-14 (1996).
  13. McLane, L. M., et al. Differential localization of T-bet and Eomes in CD8 T cell memory populations. Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950). 190 (7), 3207-3215 (2013).
  14. Nguyen, K. T., Holloway, M. P., Altura, R. A. The CRM1 nuclear export protein in normal development and disease. International journal of biochemistry and molecular biology. 3 (2), 137-151 (2012).

Tags

אימונולוגיה זיהום גיליון 137 fractionation הסלולר גרעין הציטופלסמה ביופסיה מעיים חלבון רקמות טרי קפוא רקמות
Fractionation subcellular של דגימות מדרכי העיכול טריים וקפואים
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Romero-Garmendia, I.,More

Romero-Garmendia, I., Jauregi-Miguel, A., Santin, I., Bilbao, J. R., Castellanos-Rubio, A. Subcellular Fractionation from Fresh and Frozen Gastrointestinal Specimens. J. Vis. Exp. (137), e57740, doi:10.3791/57740 (2018).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter