Summary
종양 미세 환경은 암 성장과 침략의 필수적인 부분입니다. 암의 진행을 모방 하기 위해 생물학적으로 관련 된 인간 매트릭스가 필요 합니다. 이 프로토콜은 인간 평활 근 종 기반 매트릭스를 적용 하 여 시험관 내 3 차원 세 포스 페 로이드 침입 검정에 대 한 개선을 도입 한다. 이 프로토콜은 또한 컴퓨터 기반 세포 침입 분석을 소개 합니다.
Abstract
2 차원 세포 배양 기반 분석 법은 시험관 내 암 연구에서 흔히 사용 된다. 그러나, 그들은 종양 미세 환경을 형성 하는 몇 가지 기본 요소 부족. 보다 신뢰할 수 있는 시험관 내 결과를 얻기 위해, 몇몇 3 차원 (3d) 세포 배양 분석 법이 도입 되었다. 이러한 검정은 암 세포가 세포 외 기질과 상호작용할 수 있게 합니다. 이 상호 작용은 세포 형태학 뿐 아니라 증식 및 침략과 같은 세포 행동에 영향을 미칩니다. 추가적으로,이 상호 작용은 몇몇 프로 및 항 종양 분자의 발현을 유도 하거나 억제할 수 있었습니다. 스 페 로이드 침략 분석은 암 세포 침입을 연구 하기에 적합 한 3D 시험관 내 방법을 제공 하기 위해 개발 되었다. 현재 마우스 육 종 유래 매트릭스 (MSDM)와 쥐 꼬리 유형 I 콜라겐과 같은 동물 유래 매트릭스는 주로 스 페 로이드 침입 분석에 사용 됩니다. 인간 종양 미세 환경과 동물 유래 매트릭스의 차이를 고려 하 여, 인간 근 종 유래 매트릭스 (HMDM)는 양성 자 궁 평활 근 종 조직 으로부터 개발 되었다. HMDM은 MSDM 보다 더 나은 암 세포의 이주와 침략을 유도 하는 것으로 나타났습니다. 이 프로토콜은 HMDM/피 브린 매트릭스를 사용 하는 단순 하 고 재현성이 높고 신뢰할 수 있는 3D 인간 종양 기반 세 포스 페 로이드 침입 분석 법을 제공 했습니다. 또한 이미징 및 분석에 대 한 자세한 지침이 포함 되어 있습니다. 구형 oid는 HMDM/피 브린 매트릭스 내 U 자형 초 저 부착 플레이트에서 성장 하 고이를 통해 침입 합니다. 침공 매일 이미지, 측정, 그리고 일 아 티 스크와 피지 ImageJ 소프트웨어를 사용 하 여 분석. 분석 플랫폼은 인간 후 두 일차 및 전이성 편평 세포 암 세포 주를 사용 하 여 입증 되었다. 그러나, 상기 프로토콜은 다른 고 형 암 세포 주에도 적합 하다.
Introduction
종래의 2 차원 (2D) 세포 배양 연구는 암 연구에 상당히 기여 하였다. 현재, 연구원은 더 나은 생체 내 조건1을 모방 하기 위하여 3 차원 (3d) 세포 배양 분석을 향해 더 이동 하 고 있습니다. 상기 3 차원 암 세포 배양 액은 세포 세포 및 세포 기질 상호작용, 유전자 발현 프로필, 약물 감수 성 및 신호 전달 경로의 활성 측면에서 복잡 한 종양 미세 환경을 보다 정확하 게 반영 한다.
여러 가지 3 차원 세포 배양 모델은 종양 조직에 대 한 종양의 설명과 같은 암 연구에 사용 되는, 칩 상에 서, 그리고 다중 세포 종양 스 페 드 로이드3,4. 다중 세포 종양 구형은 현재 인간 종양1,5에서 생체 내 조건의 여러 특징을 모방 함에 따라 널리 사용 되 고 있다. 스 페 로이드 직경이 500 μ m 보다 크면, 저 산소 부위 및 괴 사 중심을 갖고,이에 따라 생체 내 종양 상황2를 나타내는 것 이다.
많은 합성 (예를 들면, 실록) 및 동물 유래 (예를 들어, 랫 트 테일 타입 I 콜라겐 및 마우스 육 종 유래 매트릭스, msdm 이라고 함) 매트릭스는3차원 세포 배양 분석 실험을 위해 개발 되어 왔으며, 7,8. 지금까지, 상업적으로 이용 가능한 기질 중 누구도 인간 종양 조직에서 유래 하지 않았습니다. 따라서 암 세포 침 습 과정8에 상당한 영향을 미치는 인간 종양 미세 환경의 특징이 결여 되어 있다.
묘 겔 (HMDM으로 지칭 되는 인간 근 종 유래 매트릭스)은 인간 자 궁 근 종 종양 조직9로부터 추출 된다. HMDM의 단백질 함량이 MSDM의 단백질과 크게 다르다는 것이 밝혀졌습니다. 사실, HMDM 단백질의 66%는 MSDM 단백질과 다릅니다. 한편, 라미 닌, IV 형 콜라겐, 헤 파란 설 페이트 proteoglycans, 니도 겐 및 표 피 성장 인자와 같은 일부 단백질은 모두 매트릭스10에 존재 한다. 추가적으로, 마우스는 효소 내용에서 인간과 다르지만, 인간으로는 생쥐11보다 78 더 적은 단백질 분해를 갖는다.
피 브린은 단독으로 또는 다른 물질과 결합 하 여 스 캐 폴드 재 (12)로 널리 사용 되 고 있다. 3 차원 세포 배양 분석에서, 상업적으로 입수 가능한 인간 피 브리 노 겐 및 트 롬 빈이 결합 하 여 피 브린 하이드로 겔 (12)을 형성 한다.
이 프로토콜은 이전에 도입 된 3 차원 종양 세 포스 페 로이드 침입 분석 법7의 개선을 설명 한다. 이 새로운 프로토콜은 마우스 유래 종양 매트릭스 대신에 인간 종양 유래 매트릭스를 적용 합니다. 그것은 또한 일 아 티 스크와 피지 ImageJ 소프트웨어를 사용 하 여 이미징 및 분석 기술을 포함 한다. 이 프로토콜은 여러 가지 고체 암 세포 주의 세 포스 페 로이드 분석에 사용 될 수 있습니다. 그것은 새로운 항 암 치료를 개발 하 고 암 세포 침략에 특정 분자의 효과 연구 하는 생물학적으로 관련 된 도구를 제공 합니다.
Protocol
1. 다중 세포 종양 구형 체의 생성
참고: 이 프로토콜은 여기에서 UT-SCC-42A 및-42B 세포 주를 통해 입증 되었지만 다른 세포 주를 사용 하 여 적용할 수도 있습니다.
- 42A 및-42B 세포를 인산 완충 식 염 액 (PBS) 6 mL에 넣고 0.05%의 트립 신-EDTA를 75 플라스 크에 첨가 하 고 플라스 크 를 세포 배양 인큐베이터 (37 ° c, 5% co2, 95% 습도)로 세척 하여 2-5 min으로 한다.
- 세포가 현미경으로 분리 되어 있는지 확인 하십시오. 그런 다음 완전 한 Dulbecco의 수정 된 독수리 배지 (DMEM) 배지 (DMEM)를 첨가 하 고 50 효소를 중화 하는 100의 페니실린, 100 μ g/m l streptomycin, 250 ng/ml의 암포 테리 신 B, 0.4 μ g/m l 아 스 코르 브 산) 2 플라스 크)를 넣고 세포 현 탁 액을 15ml 원뿔형 튜브로 전달 한다.
주: 연구 중인 세포에 적합 한 세포 배양 배지를 선택 하십시오. - 200 x g 에서 세포 현 탁 액을 5 분간 원심 분리 합니다.
- 상층 액을 제거 하 고 2-5 mL의 완전 DMEM에서 세포 펠 릿을 중단 합니다.
- 세포를 카운트 하 고 완전 한 DMEM 세포 현 탁 액을 2만 세포/m l의 최종 농도로 희석 하십시오.
참고: 최적의 세포 수는 각 세포 라인에 대해 결정 되어야 합니다. - 셀 서 스 펜 션의 50 μ l을 각각의 초 저 부착 96-웰 둥근 바닥 플레이트에 잘 주입 하 여 최종 농도의 1000 세포를 잘 추출 합니다.
- 플레이트를 세포 배양 인큐베이터 (37 ° c, 5% CO2, 95% 습도)로 이송 한다. 4 일 후, 반전 현미경으로 종양 세 포스 페 로이드 형성을 육안으로 확인 하 고 분석을 진행 한다. 우물 당 하나의 구형 체만 있는지 확인 하십시오.
참고: 구형 체를 형성 하는 데 걸린 시간은 다른 세포 주 들 사이에서 변한다.
2. 입체 세 포스 페 로이드 침 습 분석
참고: 젤이 우물에 추가 될 때 1:1 희석 되기 때문에 2x 솔루션을 준비 하십시오.
- 37 ° c에서 유지 되는 수 조에서 얼음 및 피 브리 노 겐 원 액에 HMDM을 재개 한다. 완전히 가용 화 되 고 얼음에 용액을 넣지 않을 때까지 피 브리 노 겐을 방해 하지 마십시오. 침전이 발생 합니다.
- 각 시 약의 적절 한 부피를 섞어 주세요: 1MG/MLHMDM (최종 농도: 0.5 밀리 그램), 0.6 (최종 농도: 66.6 0.3/ml), 최종 농도: 7mg/ml의 피 브리 노 겐 1 밀리 그램/m l 33.3. ).
참고: 단지 우물에 혼합물을 분주 하기 전에 피 브리 노 겐을 추가 하 고 신속 하 게 작동; 그것은 몇 분 안에 젤을 형성 합니다. 한 번에 몇 개의 우물을 치료 하십시오. - 젤의 50 μ l을 각각의 웰에 넣습니다. 팁을 우물의 안쪽 벽 쪽으로 향하게 하 고 pipet를 천천히 향하게 하십시오. 기포 (역 피 펫 팅 기법 사용)를 피하고 포스 페 로이드를 웰의 중심에서 움직이지 않도록 하십시오.
- 플레이트를 다시 세포 배양 인큐베이터에 반납 하 고 HMDM/피 브린 매트릭스가 30 분 동안 응고 되 게 하 고, 젤의 상단에 DMEM 완전 한 수 100 μ l를 각각의 웰에 첨가 한다.
3. 이미징
- 역 광 현미경을 사용 하 여 구형 체를 매일 이미지 한다. 또는 자동 이미징 시스템을 사용 합니다.
4. 이미지 분할
- 일 아 티 크를 열고 픽셀 분류 워크플로 (그림 1A)를 선택 합니다. 사용자가 만든 주석을 기반으로 픽셀을 분류 합니다. (Ilp)를 컴퓨터에 저장 합니다.
- 분석용 이미지를 추가 합니다. 입력 데이터 를 클릭 하 고 새로 추가 를 선택한 다음 이미지를 선택 합니다 (그림 1B).
-
피쳐 선택에서 피쳐 선택을 클릭 하 고 피쳐 (그림 1C, 빨간색 직사각형)를 선택 합니다.
주: 선택한 피쳐는 대략적으로 배경과 객체를 분리 하는 시각적 특성과 일치 해야 하며 분류자를 학습 하는 데 사용 됩니다.- 상자를 클릭 하 여 기능을 선택 합니다. 선택한 상자가 녹색으로 바뀝니다 (그림 1C, 파란색 직사각형).
참고: 여기서 사용자는 여러 가지 기능 유형 및 축척 중에서 선택할 수 있습니다. 색상 또는 명도를 기준으로 개체를 분리 하려면 색상/강도를 선택 해야 합니다. 밝기 또는 색상 그라디언트를 기준으로 오브젝트를 분리 하려면 가장자리를 선택 해야 합니다. 질감은 이미지의 개체에 특별 한 텍스처 모양이 있는 경우 중요 한 기능입니다. 이 분석에서는 컬러/강도 (시그마 0)와에 지 시그마 6이 사용 됩니다.
- 상자를 클릭 하 여 기능을 선택 합니다. 선택한 상자가 녹색으로 바뀝니다 (그림 1C, 파란색 직사각형).
-
교육의 경우 교육을 클릭 하 고 교육 섹션에 레이블 1과 레이블 2 라는 레이블이 있습니다 (그림 1D, 빨간색 직사각형). 레이블이 하나만 있는 경우 레이블 추가를 눌러 새 레이블을 추가 합니다 (그림 1D, 파란색 직사각형).
- 배경을 레이블 중 하나 (그림 1d, 노란색)와 다른 레이블이 있는 셀로 표시 합니다 (그림 1d, 파랑).
- 이미지의 처음 10%에 대 한 소프트웨어를 훈련. 현재 보기에서 다음 이미지를 선택 합니다.
- 첫 번째 이미지의 셀과 배경이 표시 된 후 라이브 업데이트 (그림 1D, 자주색 사각형)를 누릅니다.
참고: 다음 이미지를 사용 하면 이전 이미지에 따라 분석이 자동으로 수행 됩니다.
- 훈련이 완료 되 고 일 아 티 크는 모든 이미지를 분석 한 후, 예측 내보내기를클릭 합니다. 소스에서 간단한 세분화 를 선택 합니다. 확률 또는 다른 것을 선택 하지 마십시오 (그림 1E).
- 예측 내보내기 섹션에서 이미지 설정 내보내기 선택 에서 원하는 출력 파일 형식을 선택 합니다 (그림 1E). 모두 내보내기를 클릭 하 여 라벨의 결과를 내보냅니다 (그림 1F). 이 파일은 원본 이미지와 동일한 폴더로 내보내집니다.
참고:이 실험에서는. h5 형식이 사용 됩니다.
5. 피지 ImageJ 지역 분석
-
배율 설정
- 피지 ImageJ에서 스케일 막대로 원본 이미지를 엽 니 (그림 2a). 이미지의 크기와 치수가 분석 된 이미지와 동일한 지 확인 합니다. 선 선택 도구를 사용 하 여 알려진 길이의 선을 그립니다 (그림 2B).
참고: 이 프로토콜은 피지 ImageJ 1.51 (64 비트)를 사용 하 여 실행 되 고 일 라이 크-1.3.2 rc. - 분석 및 배율 설정 (그림 2C)을 클릭 합니다. 알려진 거리 필드에 알려진 거리 를 설정 하 고 적절 한 단위를 설정 하 고 전역 (그림 2d)을 클릭 합니다.
- 피지 ImageJ에서 스케일 막대로 원본 이미지를 엽 니 (그림 2a). 이미지의 크기와 치수가 분석 된 이미지와 동일한 지 확인 합니다. 선 선택 도구를 사용 하 여 알려진 길이의 선을 그립니다 (그림 2B).
-
매크로 설치
- 플러그인이 설치 되지 않은 경우 다음 단계를 따르십시오. 도움말, 업데이트를 클릭 합니다. 열기 창 Imagej 업데이터, 업데이트 사이트 관리를 클릭 합니다. 열린 창에서 업데이트 사이트 관리를 클릭 하 고 다음 닫기를클릭 합니다. 다음 클릭 변경 적용 창 imagej 업데이터. 이 프로세스는 다소 시간이 걸릴 수 있습니다. 다음 창은 텍스트가 성공적으로 업데이트된 정보 입니다. 확인 을 클릭 하 고 imagej를 다시 시작 합니다.
- 플러그인, 매크로및 설치 를 클릭 합니다 (그림 3a). 그런 다음 카운터 .ijm 파일을 선택 하 고 ( 추가 정보참조) 열기를 클릭 합니다.
참고: 매크로는 특히 영역을 측정 하기 위해 작성 되었습니다. 소프트웨어를 열 때마다 매크로를 설치 해야 합니다.
-
면적 분석
- 모든 플러그인이 설치 되 면 이미지를 분석 합니다. 플러그인 을 클릭 하 고 ( 그림 3C)로 스크롤합니다. HDF5 가져오기를선택 하 고,. h5 형식의 파일을 선택 하 고 열기 및 로드를 클릭 하 고 LUT를 적용 합니다 (그림3c, D).
- 키보드 (매크로)에서 a 버튼을 누르면 요약 창에 전체 영역이 표시 됩니다 (그림 3E).
Representative Results
4 일 후에 UT-SCC-42B (전이성 후 두 SCC 세포 주) 세포 시드, 매트릭스 (HMDM/피 브린, MSDM 또는 콜라겐)를 형성 된 스 페 로이드 (day 0)에 첨가 하 고 3 일 동안 침공을 모니터링 하였다. 여기에 이미지는 도립 현미경을 사용 하 여 매일 얻었다 (그림 4).
일단 포함 되 면, HMDM/피 브린 매트릭스의 세포는 하루 후 급속 하 게 침입 하 여 매트릭스로 확장 되기 시작 했습니다 (그림 4A). MSDM의 셀은 주변 매트릭스로 침입 하지 않고 대신 비대칭 구조를 형성 합니다 (그림 4B). 한편, 콜라겐의 세포는 약간 침범 하지만, 매트릭스 수축으로 인해 분석이 어려웠다 (도 4c). 일부 콜라겐 웰에서, 스 페 로이드는 3 일 후에도 사라졌다 (그림 4C).
도 5 는 1 차 후 두 SCC 세포 주 UT-Scc-42A 및 대응 하는 전이성 세포 라인 UT-Scc-42B의 hmdm/피 브린의 세포 침 윤의 정량화를 나타낸 것 이다. HMDM/피 브린 스 페 로이드의 라이브 셀 분석 시스템을 사용 하 여 촬영 한 비디오 (동영상 1)는 매트릭스 내에서 그 뒤에 다른 세포에 의해 가닥을 형성 하는 SCC 세포의 이동을 보여준다.
그림 1 : 이미지 세분화. 이미지 분할의 선택 된 단계를 사용 합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 2 : 크기 조정 설정. 피지 ImageJ를 사용 하 여 확장 설정의 선택 된 단계. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 3 : ImageJ를 이용한 침략 분석. 피지 ImageJ를 사용 하 여 이미지 분석의 선택 된 단계. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 4 : UT-SCC-42B 세포가 세 가지 다른 매트릭스로 침입 합니다. 3 차원 구형에서의 SCC 세포 침입의 대표 이미지. 침략은 3 일 동안 따르고, 심상은 거꾸로 한 현미경을 사용 하 여 매일 촬영 되었습니다. (C) 콜라겐을 함유 하는것이다. 마지막 열은 3 일째 침공의 설명을 나타냅니다. 스케일 바 = 200 μ m. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 5 : HMDM/피 브린의 SCC 세포 침입 정량화. 일차 후 두 UT-SCC-42A 및 상응 하는 전이성 후 두 UT-SCC-42B SCC 세포 주 침입은 일 아 티 스크 및 피지 ImageJ 소프트웨어를 사용 하 여 분석 되었다. 결과는 3 개의 독립적인 실험의 평균 ± 표준 편차를, 각각 삼중으로 나타낸다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
비디오 1: 3 일 동안 HMDM/피 브린 내에서 SCC 세포 이동. 이 비디오를 보려면 여기를 클릭 하십시오. (마우스 오른쪽 버튼을 클릭 하 여 다운로드 합니다.)
Discussion
제시 된 방법은 인간 종양 미세 환경 모방 행렬 내에서 암 세포의 침투성을 평가 하는 3 차원 인간 종양 기반 분석을 제공 한다. 암 세포 침략은 표준 현미경으로 매일 화상 진 찰과 심상 분석 소프트웨어를 사용 하 여 쉽게 측정 될 수 있습니다. 이 방법은 단순히 증식 하는 것이 아니라 세포 침공을 보여줍니다.
MSDM과 달리 HMDM/피 브린 매트릭스는 온도 제어가 필요 하지 않습니다. 이 방법은, 특히 한 플레이트에서 다른 판으로 구형 oid를 전송할 필요 없이, 수행 하기 쉽다. 그것은 단지 하나의 기술적으로 민감한 단계, 매트릭스에 피 브리 노 겐의 추가. 피 브리 노 겐은 몇 분 후 겔을 시작 하기 때문에, 피 브리 노 겐을 추가 하려면 한 번에 몇 개의 웰만을 강력 하 게 파이 펫 팅 하 고 처리 해야 합니다. 또한 파이 펫 팅이 고압 방식으로 수행 되는 경우 스 페 로이드를 교란 하 고 U 자형의 중심 위치에서 이동 하는 위험이 있습니다. 구형 체의 전위는 이미징 및 결국 분석을 복잡 하 게 할 수 있습니다.
분석은 HMDM 또는 피 브리 노 겐의 농도를 변경 하 여 수정할 수 있습니다. 세포는 또한 뒤에 오는 분자 연구를 위해 고정 되 고 염색 될 수 있습니다. 이 방법은 완전히 자동화 된 형태로 수정 될 수 있지만, 일반 현미경과 두 개의 오픈 소스 소프트웨어로 수행 할 수 있으며 값비싼 장비가 필요 하지 않습니다.
기존의 MSDM 기반 3D 분석과 비교 하 여,이 분석은 세포 침 습 특성을 더 잘 나타낼 수 있었다. MSDM과 같은 지 하 막 함유 라미 네이션이 풍부한 매트릭스에서 성장 하는 구형 체는 실제 침 윤 보다 암 세포의 증식이 더 많을 수 있으며,이는 낮은 침입 용량으로 인해 여러 암 세포 주에서 침략 분석에 부적합 합니다. 또 다른 자주 사용 되는 매트릭스 인 I 형 콜라겐은 3 차원 배양 시 가장자리에서 줄어드는 경향이 있으며,이는 스 페 로이드 현지화와 웰의 이미징에 영향을 줍니다. 또한 인간 종양 미세 환경 모방 모델 (myoma 디스크 및 그것의 녹는 형태)를 사용 하 여 더 많은 (HSC-3) 및 더 적은 (SCC-25) 공격적인 혀 암 세포 주에 대 한 내재 성 침 습 적 성질 간의 차이가 입증 되었습니다 10,13.
이 분석은 또한 인간 근 종 종양의 잔여 물질 로부터 HMDM이 추출 되기 때문에 MSDM을 사용 하는 것 보다 더 윤리적 이다. 현재, hmdm은 인간 종양 유래 ECM 제품으로 서, 많은 암 관련 시험관 내 분석8,10에 적합 한 것으로 보인다. 앞으로 동물 조직 유래 매트릭스는 매트릭스 생산을 위해 동물을 희생할 필요성을 줄이기 위해 인간 종양 기반 매트릭스로 대체 될 수 있습니다.
2D 세포 배양 분석을 3D 방법으로 대체 하면 암 세포 거동에 대 한 보다 정확한 정보를 제공 합니다. 현재 여러 가지 3D 모델과 상업용 행렬이 있지만 불행히도 모든 암 세포 주에 적합 한 것은 없습니다. 연구원은 그들의 특정 분석을 위한 가장 적합 한 매트릭스를 선택 해야 합니다. 분석 및 매트릭스의 최적 매칭은 까다로울 수 있지만 결과의 신뢰도를 현저 하 게 높일 수 있습니다.
Disclosures
저자는 공개 할 것이 없습니다.
Acknowledgments
저자는이 연구의 기금 자에 게 감사 합니다: Sigrid 주 리소 재단, 핀란드 암 학회, 헬싱키 대학 중앙 병원 연구 기금. 저자는 기술 도움을 위해 헬싱키 대학의 바이오 메디 움 이미징 유닛을 인정 합니다.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Amphotericin B solution | Merck | A2942 | |
| Aprotinin from bovine lung | Merck | A6279 | Measure the protein concentration before use. |
| Ascorbic acid | Applichem | A1052 | |
| BioLite Cell Culture Treated Flasks | Thermo Scientific | 130190 | |
| DMEM/F-12 | Gibco by Life Technologies | 31330-038 | |
| DS-Fi2 Digital Camera | Nikon Instruments | ||
| DS-U3 Digital Camera Controller | Nikon Instruments | ||
| Eclipse TS100 Inverted Microscope | Nikon Instruments | ||
| Fetal bovine serum (FBS) | Gibco by Life Technologies | 10270106 | Heat inactivate for 30 min at 56 °C in waterbath before use. |
| Fibrinogen, Plasminogen-Depleted, Human Plasma | Merck | 341578 | Solubility: 25 mg/ml in H2O. Warm the H2O and the fibrinogen to 37 °C prior to dissolution. Do not disturb until the fibrinogen is completely solubilized. Stock solutions stored at -70 °C should be thawed in a water bath maintained at 37 °C. |
| Fiji ImageJ 1.51 image processing program | Freeware, NIH | ||
| Hydrocortisone | Merck | H0888 | |
| Ilastik software for image classification and segmentation | Freeware | ||
| IncuCyte Zoom Live-Cell Analysis System | Essen BioScience | ||
| Myogel | Lab made | ||
| Penicillin-Streptomycin | Gibco by Life Technologies | 15140-122 | |
| Phosphate buffered saline (PBS) | Lab made | ||
| Scepter 2.0 Cell Counter | Merck | PHCC20040 | |
| Scepter Cell Counter Sensors, 60 µm | Merck | PHCC60050 | |
| Thrombin from human plasma | Merck | T6884-100UN | |
| Trypsin-EDTA (0.5%) 10x, no phenol red | Gibco by Life Technologies | 15400054 | |
| Ultra-Low Attachment 96-Well Plate | Corning | 7007 | |
| UT-SCC-42A and UT-SCC-42-B cell lines | The cell lines were established at the Department of Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery, Turku University Hospital (Turku, Finland). |
References
- Jung, H., et al. Cell Spheroids with Enhanced Aggressiveness to Mimic Human Liver Cancer In vitro and In Vivo. Scientific Reports. 7, 10499-10514 (2017).
- Vinci, M., et al. Advances in establishment and analysis of three-dimensional tumor spheroid-based functional assays for target validation and drug evaluation. BMC Biology. 10, 29 (2012).
- Nath, S., Devi, G. R. Three-dimensional culture systems in cancer research: Focus on tumor spheroid model. Pharmacology and Therapeutics. , 94-108 (2016).
- Albanese, A., Lam, A. K., Sykes, E. A., Rocheleau, J. V., Chan, W. C. W. Tumour-on-a-chip provides an optical window into nanoparticle tissue transport. Nature Communications. 4, 2718 (2013).
- Friedrich, J., Seidel, C., Ebner, R., Kunz-Schughart, L. A. Spheroid-based drug screen: considerations and practical approach. Nature Protocols. 4, 309-324 (2009).
- Berens, E. B., Holy, J. M., Riegel, A. T., Wellstein, A. A Cancer Cell Spheroid Assay to Assess Invasion in a 3D Setting. Journal of Visualized Experiments. (105), e53409 (2015).
- Vinci, M., Box, C., Eccles, S. A. Three-Dimensional (3D) Tumor Spheroid Invasion Assay. Journal of Visualized Experiments. (99), e52686 (2015).
- Salo, T., et al. A novel human leiomyoma tissue derived matrix for cell culture studies. BMC Cancer. 15, 981 (2015).
- Nurmenniemi, S., et al. A novel organotypic model mimics the tumor microenvironment. The American Journal of Pathology. 175, 1281-1291 (2009).
- Salo, T., et al. Organotypic three-dimensional assays based on human leiomyoma-derived matrices. Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. 373 (1737), 20160482 (2018).
- Overall, C. M., Blobel, C. P. In search of partners: linking extracellular proteases to substrates. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 8, 245-257 (2007).
- Ahmed, T. A. E., Dare, E. V., Hincke, M. Fibrin: a versatile scaffold for tissue engineering applications. Tissue Engineering Part B: Reviews. 14 (2), 199-215 (2008).
- Hoornstra, D., et al. Fermented Lingonberry Juice Inhibits Oral Tongue Squamous Cell Carcinoma Invasion In vitro Similarly to Curcumin. In Vivo. 32, 1089-1095 (2018).
