Summary
이 프로토콜은 현탁 배양 조건을 사용하여 유도만능줄기세포(iPSC)에서 신장 오가노이드를 생산하기 위한 포괄적이고 효율적인 방법을 제시합니다. 이 연구의 주요 초점은 초기 세포 밀도와 WNT 작용제 농도의 결정에 있어 신장 오가노이드 연구에 관심이 있는 연구자에게 도움이 됩니다.
Abstract
신장 오가노이드는 다양한 접근법을 통해 유도만능줄기세포(iPSC)에서 생성할 수 있습니다. 이러한 오가노이드는 질병 모델링, 약물 스크리닝 및 잠재적인 치료 응용 분야에 큰 가능성을 가지고 있습니다. 이 글에서는 iPSC에서 신장 오가노이드를 생성하는 단계별 절차를 제시하며, 이는 PS(Posterior Primitive Streak)에서 시작하여 중간 중배엽(IM)까지 이어집니다. 이 접근법은 동물성 성분이 없는 정의된 배지인 APEL 2 배지에 의존합니다. 4일 동안 고농도의 WNT 작용제(CHIR99021)를 보충한 후 섬유아세포 성장 인자 9(FGF9)/헤파린과 저농도 CHIR99021를 추가로 3일 동안 보충합니다. 이 과정에서는 성공적인 신장 오가노이드 생성에 매우 중요하기 때문에 iPSC를 시작할 때 최적의 세포 밀도와 CHIR99021 농도를 선택하는 데 중점을 둡니다. 이 프로토콜의 중요한 측면은 낮은 점착 플레이트의 현탁 배양으로, IM이 사구체, 근위 관형 및 원위 관형 구조를 포함하는 네프론 구조로 점진적으로 발전할 수 있도록 하며, 모두 시각적으로 이해할 수 있는 형식으로 제공됩니다. 전반적으로, 이 상세한 프로토콜은 다양한 iPSC에서 신장 오가노이드를 생성하는 효율적이고 구체적인 기술을 제공하여 성공적이고 일관된 결과를 보장합니다.
Introduction
신장은 기능 단위에 따라 생리적 항상성을 유지하는 데 중요한 역할을 합니다. 노폐물을 배출하는 네프론은 체액의 구성을 조절할 수 있습니다. 유전적 돌연변이 또는 기타 고위험 요인에 의해 발생하는 만성 신장 질환(CKD)은 결국 말기 신장 질환(ESKD)으로 진행됩니다1,2. ESKD는 네프론의 재생 능력이 제한되어 있기 때문인 것으로 보인다. 따라서 신대체 요법이 필요합니다. 인간 iPSC의 유도 분화는 신장 발달을 연구하고, 환자별 질병을 모델링하고, 신독성 약물 스크리닝을 수행하는 데 사용할 수 있는 환자별 3D 신장 오가노이드의 체외 생성을 가능하게 합니다 3,4.
배아 발달 과정에서 신장은 원시 줄무늬(PS)와 구별되는 중간 중배엽(IM)에서 유래합니다. 고전적인 WNT 신호전달 경로는 FGF(FGF9, FGF20) 및 BMP(JNK를 통한 Bmp7 신호전달)5,6,7의 조정된 참여로 IM의 추가적인 분화를 유도할 수 있다. 그들은 신장 전구 세포 (NPC)의 두 가지 중요한 세포 집단을 생산합니다 : 요관 새싹 (UB)과 메타 네프릭 중간엽 (MM)은 각각 수집 덕트와 네프론을 형성합니다 8,9. 각 네프론은 근위 세뇨관 및 원위 세뇨관과 같은 사구체 및 세뇨관 세그먼트와 Henle10,11의 고리로 구성됩니다. 위에서 언급한 이론에 따르면, 현재 발표된 프로토콜은 신장 오가노이드를 유도하기 위해 신호 캐스케이드 및 성장 인자 자극을 모방합니다 5,12.
지난 몇 년 동안 인간 iPSC를 신장 오가노이드 5,6,7,12로 분화하기 위한 많은 프로토콜이 개발되었습니다. Takasato et al.7은 FGF9로 대체하기 전에 CHIR(WNT 작용제) 치료 기간을 최적화했습니다. 프로토콜에 따르면 4일 동안 CHIR에 노출된 후 3일 동안 FGF9에 노출되는 것이 iPSC에서 IM을 유도하는 가장 효과적인 방법입니다. 트랜스웰 필터는 절차에서 배양 형식으로 활용되었습니다. 그러나 이 방법은 초보자에게는 어렵습니다. 따라서 Kumar et al.13은 문화권 형식을 변경하려고 시도하고 문화권을 일시 중단하기로 결정했습니다. 그들은 7일째에 부착 세포를 해리하여 네프론과 같은 구조를 포함하는 배아체(EB)로 조립할 수 있도록 낮은 부착 플레이트에 파종했습니다. 그러나 이러한 방법의 배치 효과는 특히 다른 iPSC에서 분명했습니다. 또한, 다른 문헌에서는 CHIR의 농도가 7 μM에서 12 μM까지 다양하다고 보고했습니다 5,13,14.
우리는 세포 밀도와 CHIR의 농도가 다양한 iPSC의 오가노이드 생성에 영향을 미칠 수 있다고 추측했으며, 이는 실험에서 여러 번 검증되었습니다. 본 프로토콜은 Kumar et al.13 의 연구 방법을 약간 수정하여 사용자에게 단계별 절차를 제공했습니다. 접근 방식의 일정과 개략도는 그림 1에 나와 있습니다.
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Protocol
본 연구에 사용된 iPSC는 상업적 출처에서 얻은 것입니다. 세포는 시판되는 기저막 매트릭스-코팅 플레이트 상에 mTeSR 배지로 유지하였다( 재료 표 참조). 표 1 은 연구에 사용된 모든 배지 조성물을 포함하고 있다.
1. 분화 및 후방 원시 줄무늬(PS) 유도를 위한 iPSC 도금
- 멤브레인 매트릭스 코팅된 6웰 플레이트에서 2mL DPBS로 iPSC를 세척합니다. 피펫을 사용하여 DPBS를 흡인합니다.
- 시중에서 판매되는 세포 분리 용액( 재료 표 참조) 1mL를 추가하여 iPSC를 분리하고 37°C에서 5분 동안 배양합니다.
- iPSC에 mTeSR 1mL를 추가하고 세포가 플라스틱 표면에서 들어 올려졌는지 확인합니다.
- 실온(RT)에서 3분 동안 400 x g 에서 세포를 원심분리합니다. 세포 펠릿을 재현탁시키고 혈구계를 사용하여 세포 수를 계산합니다.
- 멤브레인 매트릭스로 코팅된 24웰 또는 6웰 플레이트에 다양한 세포 밀도를 파종하고 10μM Rho 키나아제 억제제(Y-27632)가 보충된 mTeSR로 배양합니다( 재료 표 참조). 37°CCO2 인큐베이터에서 밤새 배양합니다.
참고: PS를 유도하기 위해 최적의 CHIR99021 농도와 적절한 세포 밀도는 iPSC 라인에 따라 다릅니다. 밀도 범위(예: 0.6, 0.9, 1.2, 1.5, 1.8, 2.4 * 10 제곱센티미터당3 개의 단일 셀)와 7μM-12μM의 CHIR99021 농도 범위를 파종합니다. 같은 날에 각 밀도와 각 CHIR의 분화를 시작합니다. 24웰 플레이트에서 최적의 CHIR99021 농도와 적절한 세포 밀도를 찾은 다음 6웰 플레이트에서 배양을 확장합니다. 여기서는 6웰 플레이트를 기반으로 하는 프로토콜을 제공합니다. - 다음날 mTeSR을 흡인하고 2mL의 DPBS로 세포를 세척합니다.
- 2mL의 I단계 배지(8-12μM CHIR99021를 포함하는 줄기세포 분화 배지)(표 1)를 추가합니다(Day 0 참조).
- 37°C 인큐베이터에서 4일 동안 배양한 후 이틀에 한 번씩 단계 I 배지를 새로 고칩니다.
2. 신성 중간 중배엽(IM) 유도
- 4일째에 스테이지 I 배지를 제거하고 2mL의 DPBS로 세척합니다.
- 2mL의 II기 배지(200ng/mL FGF9, 1μg/mL 헤파린 및 1μM CHIR99021를 포함하는 줄기세포 분화 배지)를 세포에 추가합니다(표 1).
- 37°C 인큐베이터에서 배양하고 7일까지 2일마다 배지를 새로 고칩니다.
3. 현탁 배양에서 신장 오가노이드 생성
참고: 0일차부터 7일차까지의 관찰 기간 동안 세포의 상태가 중요합니다. 세포가 성공적인 증식을 보이고 중요한 세포 파편 없이 쌓이면 중간 중배엽(IM)의 성공적인 유도를 보여주며 다음 단계로 진행할 준비가 되었음을 나타냅니다. 그러나 세포가 초기 세포자멸사의 징후를 보인 후 괴사 또는 파손이 뒤따른다면 CHIR99021 또는 세포 밀도의 부적절한 농도를 나타낼 수 있습니다.
- 7일째에 II단계 배지를 제거하고 2mL의 DPBS로 세포를 세척합니다.
- 세포 분리 용액 1mL를 각 웰에 추가하고 세포가 위상차 하에서 굴절될 때까지 37°C에서 5분 동안 배양합니다.
- 2단계 배지 1mL를 세포에 피펫팅하고 혼합한 후 세포가 표면에서 들어 올려졌는지 확인합니다.
- 세포 현탁액을 15mL 튜브에 모으고 실온에서 3분 동안 400 x g 으로 원심분리합니다.
- 10μM Rho 키나아제 억제제(Y-27632)가 보충된 3단계 배지(0.1% 메틸셀룰로오스(MC), 0.1% 폴리비닐알코올(PVA)에 200ng/mL FGF9, 1μg/mL 헤파린 및 1μM CHIR99021 함유된 줄기세포 분화 배지) 2mL의 3단계 배지(2mL의 상층액을 제거하고 세포 펠릿을 재현탁시킵니다)에 세포 펠릿을 재현탁시킵니다( 재료 표 참조). 부드럽게 섞는다.
- 셀 현탁액과 시드를 1:3의 비율로 6웰 저접착 플레이트에 혼합합니다. 플레이트를 37°C 및 5% CO 2의 인큐베이터에서 궤도 셰이커(CO2 내성, 60rpm으로 회전)에 놓습니다.
- 24시간 후 Rho 키나아제 억제제(Y-27632)를 제거하고 III기 배지(200ng/mL FGF9, 1μg/mL 헤파린, 1μM CHIR99021, 0.1% MC, 0.1% PVA가 포함된 줄기세포 분화 배지 보충제)를 추가합니다. 2 일 동안 문화. 아래 단계에 따라 서스펜션 문화에서 매체를 변경합니다.
- 무균 가위로 1mL 피펫의 끝을 잘라냅니다.
- 6웰 플레이트를 부드럽게 흔들어 플레이트 중앙에 오가노이드를 정렬합니다.
- 준비된 피펫으로 오가노이드를 15mL 튜브에 흡입하고 5분 동안 그대로 둡니다.
- 상층액을 흡인하고 오가노이드를 튜브 바닥에 남겨 둡니다.
- 새 배지를 추가하여 오가노이드를 재현탁하고 6웰 저접착 플레이트에 다시 플레이트합니다.
- 인큐베이터에서 60rpm으로 접착력이 낮은 플레이트를 계속 흔듭니다. 12일차까지 이틀에 한 번씩 3단계 배지를 교체합니다.
- 12일째에 배지를 IV기 배지(0.1% MC 및 0.1% PVA를 함유한 줄기세포 분화 배지)로 변경합니다.
- 25일차까지 이틀에 한 번씩 배지를 교체합니다. 오가노이드는 12-25일째에 성숙한 네프론 구조로 점진적으로 발달할 수 있습니다.
4. 신장 오가노이드의 면역형광 염색
- 신장 오가노이드를 15mL 튜브에 모으고 2mL PBS로 세척합니다.
- 5-10분 동안 굳힌 후 신장 오가노이드를 갓 준비한 2% PFA에 4°C에서 20분 동안 고정합니다.
- PFA를 제거하고 0.3% Triton X-100(0.3% PBST)이 함유된 1mL PBS로 오가노이드를 세척하고 셰이커(회전 속도가 60rpm을 초과하지 않음)에서 8분 동안 골고루 흔든 다음 5분 동안 그대로 둔 다음 상층액을 제거합니다. 세 번 반복합니다.
참고: 오가노이드는 4°C에서 0.3% PBST에서 2-4주 동안 보관할 수 있습니다. - 고정 오가노이드를 10% 당나귀 혈청과 함께 PBST(차단 완충액)( 재료 표 참조)에 4°C에서 밤새 배양합니다.
- 1차 항체( 재료 표에 나열됨)를 차단 완충액에 1:300의 비율로 희석합니다.
- 1차 항체가 있는 오가노이드를 4°C에서 교반하면서 밤새 배양합니다.
NOTE: 사구체와 세뇨관이 하나의 오가노이드에서 동시에 염색될 수 있는지 확인하십시오. - 오가노이드를 1mL 0.3% PBST로 세척하고 셰이커(회전 속도가 60rpm을 초과하지 않음)에서 8분 동안 골고루 흔든 다음 5분 동안 그대로 둔 다음 상층액을 제거합니다. 세 번 반복합니다.
- 오가노이드를 2차 항체( 재료 표에 나열됨)와 DAPI로 교반하면서 4°C에서 하룻밤 동안 배양합니다. 그런 다음 4.7단계를 반복합니다.
참고: 2차 항체와 DAPI는 모두 차단 용액, 2차 항체(1:400) 및 DAPI(1:1000)에 희석되어 있습니다. - 염색 후 오가노이드를 메탄올(각각 25%, 50%, 75%, 100%씩 5분 동안 5분)로 탈수한 다음 벤질 알코올과 벤질 벤조에이트(BABB, 1:2 비율)를 5분 동안 투과시킵니다( 재료 표 참조).
- 투명화된 오가노이드를 유리 바닥 접시에 담고( 재료 표 참조) 공초점 현미경으로 검사합니다.
알림: 이미징 시 유리 접시 바닥에 있는 페트리 접시를 선택하고 침투할 때 BABB를 페트리 접시에 직접 넣어 접시 바닥을 촉촉하게 유지합니다.
5. 시험관 내 덱스트란 흡수 분석
- 25일째에 오가노이드를 100μg/mL의 형광 표지 덱스트란( 재료 표 참조)과 함께 37°C 및 5%CO2의 인큐베이터에서 4시간 동안 배양합니다.
- 4시간 후 새로운 배지로 전환하고 광시야 형광 현미경을 사용하여 살아있는 세포 배양 이미지를 캡처합니다.
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Representative Results
IM의 생성은 GSK3 억제제 CHIR99021 사용하여 표준 WNT 신호 전달을 활성화한 후 FGF9/헤파린을 활성화하여 달성됩니다. 0일차부터 4일차까지 iPSC는 빠르게 팽창하여 능형형 또는 삼각형 모양을 취합니다. 합류점은 90%-100%에 도달하고 7일까지 고르게 축적됩니다. 현탁 배양 시 응집체는 7일째에 해리된 후 자발적으로 네프론 구조를 형성합니다. 현탁 배양을 통해 생성된 신장 오가노이드는 관형 구조를 나타내며 응집 18일 후 명시야 이미지에서 쉽게 관찰할 수 있습니다(그림 2 및 그림 3).
일반적으로 iPSC의 24웰 플레이트의 웰에서 시작하는 한 번의 분석은 200-300개의 오가노이드를 생성합니다. 이 중 80%-90%는 네프론과 유사한 구조를 포함합니다(그림 2). hiPSC-B1 iPSC 라인의 경우, 신장 오가노이드를 생성하기 위한 최상의 조건은 8μM CHIR99021로 24웰 플레이트의 웰에서 1.8-2.0 x 10 4 세포를 배양하는 것입니다(그림 2, 그림 3 및 그림 4). 이러한 신장 오가노이드는 2-3일마다 IV기 배지를 교체하여 25일 이후 최대 1-2주 동안 유지할 수 있습니다.
전체 오가노이드의 면역형광 분석은 NPHS1-, Synaptopodin(SYNAPO-) 및 WT1-표지된 족세포, MEIS1/2/3-표지된 간질세포, LTL-로 표지된 Lotus Tetragonolobus Lectin, E-Cadherin(ECAD-)으로 표지된 원위세뇨관 및 GATA3-표지된 수집관을 포함한 네프론 세그먼트의 존재를 보여줍니다. 또한, 이 프로토콜은 CD31로 양성 염색을 보이는 내피 세포를 유도합니다(그림 5).
마지막으로, in vitro 덱스트란 흡수 분석은 신장 오가노이드의 생리학적으로 관련된 기능을 나타냅니다. 신장 오가노이드(7일 + 18일)를 100μg/mL의 형광 표지 덱스트란으로 4시간 동안 배양한 후, 덱스트란이 명시야 이미지에서 근위세뇨관으로 유입되는 것이 관찰되었습니다(그림 5L 및 그림 6).
그림 1: 실험 일정 및 프로토콜 개요. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2: 다양한 농도의 CHIR99021을 사용한 0일차부터 7일차까지의 신장 오가노이드 생성. 스케일 바: 100 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3: 다양한 농도의 CHIR99021을 사용한 8일차부터 21일차까지의 신장 오가노이드 생성. 스케일 바: 100 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 4: 1.5 x 10 4에서 2.2 x 104 세포/웰까지 다양한 세포 밀도를 7일차에 캡처한 이미지. 스케일 바: 100 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 5: 신장 오가노이드의 대표적인 컨포칼 면역형광 이미지. (A,B) D7+11 신장 오가노이드의 네프론 전구 세포(SALL1, 파란색), 세뇨 전 응집체(PAX8, 자홍색), 포도세포(NPHS1, 파란색)의 마커에 대한 면역형광 분석. (씨케이) 오가노이드의 분할 패터닝에 대한 면역형광 분석은 족세포(NPHS1, NPHS2, SYNAPO 및 WT1, 빨간색; MAFB, 녹색), 근위세뇨관(LTL, 흰색; LRP2, 파란색; CUBN, 빨간색), 원위 세뇨관(ECAD, 녹색), 수집 관(GATA3, 분홍색), 간막 세포(PDGFR, 빨간색), 간질 세포(MEIS1/2/3, 녹색), 인테그린 베타 1(TIGB1, 녹색) 및 내피 세포(CD31, 녹색). 스케일 바: 100 μm (A,C,E-J), 50 μm (B) 및 10 μm (D,K). (L) 덱스트란 업데이트 분석 후 신장 오가노이드의 면역형광 분석. 기준자: 10 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 6: 25일차 신장 오가노이드의 체외 기능 검증. (서기-인도) 10kDa의 형광 표지 덱스트란으로 배양된 신장 오가노이드의 라이브 이미지. 눈금 막대: 100 μm (A,B); 10μm(C,D)입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
| 시약 | 주식 conc. | 작업 conc. |
무대  보통 |
||
| 아펠 | 해당 사항 없음 | 해당 사항 없음 |
| CHIR 99021 님 | 10 마이크로미터 | 4-12 마이크로미터 |
무대  보통 |
||
| 아펠 | 해당 사항 없음 | 해당 사항 없음 |
| FGF9 시리즈 | 100ng/μL | 200ng/mL |
| rHSA (rHSA) | 0.2g/mL | 1μg/mL |
| 덤플링을 | 2mg/mL | 1μg/mL |
| CHIR 99021 님 | 10 마이크로미터 | 1 μM의 |
무대  보통 |
||
| 아펠 | 해당 사항 없음 | 해당 사항 없음 |
| FGF9 시리즈 | 100ng/μL | 200ng/mL |
| rHSA (rHSA) | 0.2g/mL | 1μg/mL |
| 덤플링을 | 2mg/mL | 1μg/mL |
| CHIR 99021 님 | 10 마이크로미터 | 1 μM의 |
| PVA (폴리에이) | 1% | 0.10% |
| 엠씨 | 1% | 0.10% |
무대  보통 |
||
| 아펠 | 해당 사항 없음 | 해당 사항 없음 |
| PVA (폴리에이) | 1% | 0.10% |
| 엠씨 | 1% | 0.10% |
표 1: 연구에 사용된 배지 조성물.
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Discussion
iPSC에서 신장 오가노이드를 생성하기 위한 자세한 프로토콜이 설명되었으며, 여기에는 기저 배지, 초기 세포 밀도 및 CHIR99021 농도에 대한 약간의 변형이 포함됩니다. 다양한 실험에서 성공적인 신장 오가노이드 생성을 위한 중요한 요소는 중간 중배엽(IM)과 7일째 세포 상태의 초기 분화인 것으로 밝혀졌습니다. 더욱이, 상이한 iPSC 라인은 세포 증식 및 분화 잠재력의 변화를 나타내어 최적의 세포 밀도 및 CHIR99021 농도가 다양해졌습니다 5,13,14. 따라서 각 iPSC 라인에 대한 이상적인 조건을 결정하는 것은 환자 특이적 iPSC에서 상당한 수의 신장 오가노이드를 생산하는 데 필수적입니다.
최적의 조건을 식별하려면 대규모 생산을 위해 배양을 6웰 플레이트로 확장하기 전에 24웰 플레이트를 사용하여 예비 실험을 수행하는 것이 좋습니다. 이 단계를 통해 연구원은 세포 형태 및 양을 기반으로 유도의 성공을 평가할 수 있습니다. 또한 오가노이드는 고정 후 2-4주 동안 완전한 구조로 보존될 수 있어 이 방법의 실현 가능성과 유용성을 높일 수 있습니다.
이 프로토콜을 사용하여 생성된 신장 오가노이드는 일반적으로 약 50-300μm를 측정하며 명시야 현미경으로 관찰할 때 관형 구조를 나타냅니다. 면역형광 분석은 NPHS1 및 WT1로 표지된 족세포, LTL, LRP2 및 CUBN으로 표지된 근위세뇨관, ECAD로 표지된 원위세뇨관, GATA3로 표지된 채집관, MEIS1/2/3으로 표지된 간질세포와 같은 신장 네프론의 신뢰할 수 있는 형성을 확인한다13. 또한 이 프로토콜은 CD31로 염색된 내피 세포의 존재를 유도하여 신장 오가노이드 내에서 혈관화의 가능성을 시사합니다.
체외 덱스트란 흡수 분석은 예비 여과 및 재흡수와 같은 신장 오가노이드의 생리학적으로 관련된 기능을 보여줍니다. 따라서 질병 모델링 및 기능 장애 메커니즘 연구에 매우 적합합니다. 그러나 이러한 신장 오가노이드의 성숙도는 임신 초기의 인간 신장과 유사하며, 체외 배양에서 혈관 구조가 부족하다는 점에 유의하는 것이 중요하다13. 근본적인 메커니즘을 밝히기 위해서는 추가 연구가 필요합니다.
결론적으로, 설명된 프로토콜은 iPSC에서 신장 오가노이드를 생성하는 유망한 방법을 제공하여 추가 연구 및 연구를 위한 길을 제공합니다.
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Disclosures
저자들은 잠재적인 이해 상충을 보고하지 않았습니다.
Acknowledgments
우리는 과거와 현재의 모든 Mao 및 Hu Lab 구성원이 흥미로운 토론과 프로젝트에 큰 기여를 한 것에 대해 매우 감사합니다. 국립아동보건임상연구센터(National Clinical Research Center for Child Health)의 큰 지원에 감사드립니다. 이 연구는 중국 국립자연과학재단(U20A20351 Jianhua Mao, 82200784 Lidan Hu), 중국 저장성 자연과학재단(No. LQ22C070004 Lidan Hu), 장쑤성 자연과학재단(보조금 번호. BK20210150 Gang Wang에게).
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 96 Well Cell Culture Plate, Flat-Bottom | NEST | Cat #701003 | |
| Accutase | STEMCELL Technologies | Cat #07920 | |
| Antibodies | |||
| Benzyl alcohol | Sigma-Aldrich | Cat #100-51-6 | |
| Benzyl benzoate | Sigma-Aldrich | Cat #120-51-4 | |
| Biological Safety Cabinet | Haier | Cat #HR40  A2 |
|
| Biotin anti-human LTL (1:300) | Vector Laboratories | Cat #B-1325 | |
| Blood mononuclear cells hiPS-B1 (iPSc, female) | N/A | N/A | |
| Carbon dioxide level shaker | HAMANY | Cat #C0-06UC6 | |
| Chemicals, peptides, and recombinant proteins | |||
| CHIR99021 (Wnt pathway activator) | STEMCELL Technologies | Cat #72054 | |
| Costar Multiple 6 Well Cell Culture Plate | Corning | Cat #3516 | |
| Costar Ultra-Low Attachment 6 Well Plate | Corning | Cat #3471 | |
| CryoStor CS10 | STEMCELL Technologies | Cat #07930 | |
| DAPI stain Solution | Coolaber | Cat #SL7102 | |
| Dextran, Alexa Fluor 647 | Thermo SCIENTIFIC | Cat #D22914 | |
| DMEM/F-12 HEPES-free | Servicebio | Cat #G4610 | |
| Donkey Anti-Sheep IgG H&L (Alexa Fluor 647) | Abcam | Cat #ab150179 | |
| Donkey serum stoste | Meilunbio | Cat #MB4516-1 | |
| D-PBS (without calcium, magnesium, phenol red) | Solarbio Life Science | Cat #D1040 | |
| Dry Bath Incubator | Shanghai Jingxin | Cat #JX-10 | |
| Dylight 488-Goat Anti-Mouse IgG (1:400) | Earthox | Cat #E032210 | |
| Dylight 488-Goat Anti-Rabbit IgG (1:400) | Earthox | Cat #E032220 | |
| Dylight 549-Goat Anti-Mouse IgG (1:400) | Earthox | Cat #E032310 | |
| Dylight 549-Goat Anti-Rabbit IgG (1:400) | Earthox | Cat #E032320 | |
| Dylight 649-Goat Anti-Rabbit IgG (1:400) | Earthox | Cat #E032620 | |
| Experimental models: Cell Lines | |||
| Forma Steri-Cycle CO2 Incubator | Thermo SCIENTIFIC | Cat #370 | |
| Geltre LDEV-Free | Gibco | Cat #A1413202 | |
| Glass Bottom Culture Dishes | NEST | Cat #801002 | |
| Goat anti-human CUBN (1:300) | Santa Cruz Biotechnology | Cat #sc-20607 | |
| Heparin Solution (Cell culture supplement) | STEMCELL Technologies | Cat #07980 | |
| Human Recombinant FGF-9 | STEMCELL Technologies | Cat #78161 | |
| Inverted Microscope | OLYMPUS | Cat #CKX53 | |
| Laser Scanning Confocal Microscope | OLYMPUS | Cat #FV3000 | |
| Methyl cellulose | Sigma-Aldrich | Cat #M7027 | |
| Micro Centrifuge | HENGNUO | Cat #2-4B | |
| Mouse anti-human CD31 (1:300) | BD Biosciences | Cat #555444 | |
| Mouse anti-human ECAD (1:300) | BD Biosciences | Cat #610182 | |
| Mouse anti-human Integrin beta 1 (1:300) | Abcam | Cat #ab30394 | |
| Mouse anti-human MEIS 1/2/3 (1:300) | Thermo SCIENTIFIC | Cat #39795 | |
| Mowiol 4-88 (Polyvinylalcohol 4-88) | Sigma-Aldrich | Cat #81381 | |
| mTeSR1 5X Supplement | STEMCELL Technologies | Cat #85852 | |
| mTeSR1 Basal Medium | STEMCELL Technologies | Cat #85851 | |
| Nunc CryoTube Vials | Thermo SCIENTIFIC | Cat #377267 | |
| Others | |||
| Rabbit anti-human GATA3 (1:300) | Cell Signaling Technology | Cat #5852S | |
| Rabbit anti-human LRP2 (1:300) | Sapphire Bioscience | Cat #NBP2-39033 | |
| Rabbit anti-human Synaptopodin (1:300) | Abcam | Cat #ab224491 | |
| Rabbit anti-human WT1 (1:300) | Abcam | Cat #ab89901 | |
| Rabbit anti-mouse PDGFR (1:300) | Abcam | Cat #ab32570 | |
| Recombinant Human Serum Albumin (rHSA) | YEASEN | Cat #20901ES03 | |
| Sheep anti-human NPHS1 (1:300) | R&D Systems | Cat #AF4269 | |
| STEMdiff APEL 2 Medium | STEMCELL Technologies | Cat #05275 | |
| Streptavidin Cy3 (1:400) | Gene Tex | Cat #GTX85902 | |
| Versene (1X) | Gibco | Cat #15040066 | |
| Y-27632 (Dihydrochloride) | STEMCELL Technologies | Cat #72304 |
References
- Tekguc, M., et al. Kidney organoids: a pioneering model for kidney diseases. Translational Research. 250, 1-17 (2022).
- Hill, N. R., et al. Global prevalence of chronic kidney disease - a systematic review and meta-analysis. PLOS ONE. 11 (7), 0158765 (2016).
- Rossi, G., Manfrin, A., Lutolf, M. P. Progress and potential in organoid research. Nature Reviews Genetics. 19 (11), 671-687 (2018).
- Takasato, M., et al. Directing human embryonic stem cell differentiation towards a renal lineage generates a self-organizing kidney. Nature Cell Biology. 16 (1), 118-126 (2014).
- Morizane, R., Lam, A. Q., Freedman, B. S., Kishi, S., Valerius, M. T., Bonventre, J. V. Nephron organoids derived from human pluripotent stem cells model kidney development and injury. Nature Biotechnology. 33 (11), 1193-1200 (2015).
- Freedman, B. S., et al. Modelling kidney disease with CRISPR-mutant kidney organoids derived from human pluripotent epiblast spheroids. Nature Communications. 6 (1), 8715 (2015).
- Takasato, M., et al. Kidney organoids from human iPS cells contain multiple lineages and model human nephrogenesis. Nature. 526 (7574), 564-568 (2015).
- Mugford, J. W., Sipilä, P., McMahon, J. A., McMahon, A. P. Osr1 expression demarcates a multi-potent population of intermediate mesoderm that undergoes progressive restriction to an Osr1-dependent nephron progenitor compartment within the mammalian kidney. Developmental biology. 324 (1), 88-98 (2008).
- SaxOn, L., Sariola, H.
- Kobayashi, A., et al. Six2 defines and regulates a multipotent self-renewing nephron progenitor population throughout mammalian kidney development. Cell Stem Cell. 3 (2), 169-181 (2008).
- Boyle, S., et al. Fate mapping using Cited1-CreERT2 mice demonstrates that the cap mesenchyme contains self-renewing progenitor cells and gives rise exclusively to nephronic epithelia. Developmental Biology. 313 (1), 234-245 (2008).
- Nishinakamura, R. Human kidney organoids: progress and remaining challenges. Nature Reviews Nephrology. 15 (10), 613-624 (2019).
- Kumar, S. V., et al. Kidney micro-organoids in suspension culture as a scalable source of human pluripotent stem cell-derived kidney cells. Development. 146 (5), 172361 (2019).
- Takasato, M., Er, P. X., Chiu, H. S., Little, M. H. Generation of kidney organoids from human pluripotent stem cells. Nature Protocols. 11 (9), 1681-1692 (2016).
