Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Michele C. Darrow; Imanol Luengo; Mark Basham; Matthew C. Spink; Sarah Irvine; Andrew P. French; Alun W. Ashton; Elizabeth M.H. Duke

doi:10.3791/56162

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Volume de Segmentation et analyse des matériaux biologiques à l’aide de Workbench SuRVoS (Super-région Volume Segmentation)

Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

JoVE Journal
Biology

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Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volume de Segmentation et analyse des matériaux biologiques à l’aide de Workbench SuRVoS (Super-région Volume Segmentation)

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11:38 min

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August 23, 2017

DOI:

10.3791/56162-v

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10.3791/56162-v

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August 23, 2017

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Michele C. Darrow¹, Imanol Luengo^1,2, Mark Basham¹, Matthew C. Spink¹, Sarah Irvine¹, Andrew P. French², Alun W. Ashton¹, Elizabeth M.H. Duke¹

¹Science Division, Harwell Science and Innovation Campus,Diamond Light Source ²School of Computer Science,University of Nottingham

Summary

Segmentation des données tridimensionnelles de nombreuses techniques d’imagerie est un goulot d’étranglement majeur dans l’analyse des systèmes biologiques complexes. Nous décrivons ici l’utilisation de SuRVoS établi à semi-automatiquement segment volumétrique des données diverses échelles de longueur à l’aide d’ensembles de données exemple de tomographie cryo-électronique, cryo tomographie à rayons x mou et techniques de tomographie aux rayons x phase contraste.