Journal
/
Genetics
/
间歇酵母 2-混合筛序列数据的信息化分析
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Informatic Analysis of Sequence Data from Batch Yeast 2-Hybrid Screens
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

间歇酵母 2-混合筛序列数据的信息化分析

DOI:
10.3791/57802-v

•

09:14 min

•

June 28, 2018

•

, , ,
1Molecular Physiology and Biophysics,University of Iowa

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:50Mapping Fastq Files
  • 02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
  • 06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
  • 08:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

酵母菌群的深度测序为阳性酵母 2-混合相互作用可能产生大量的信息关于相互作用的伙伴蛋白。在这里, 我们描述了具体的生物信息学工具的操作和定制的更新软件来分析这些屏幕的序列数据。

Tags

Informatic AnalysisSequence DataBatch Yeast 2-hybrid ScreensProtein InteractomesBioinformatics ProcessingUser-friendly Graphic User InterfaceMolecular BiologistsCell BiologistsBiochemistsMAPster SoftwareDEEPN AnalysisHISAT2Multi-threadingReference DNA GenomeY2H Prey Library InsertsMapped FilesUnmapped Reads

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

接合交配测定在接合介入转移蛋白的序列特异性分析

的转录分析<em>ç</em>。<em>线虫</em> RNA测序数据通过炫套房的银河项目

双向逆转录病毒整合位点PCR方法和定量数据分析工作流程

斑马鱼 RNASeq-based 基因表达数据的样品制备与分析

从土壤、根际和根 Endosphere 提取细菌群落数据的根菌群探析

单分子荧光原位杂交 (smFISH) 在发芽酵母营养生长和减数分裂中的分析

基于交配的酵母超表达文库筛选

减法基因组学的新序列发现

强化酵母单杂交筛网识别与人 dna 序列结合的转录因子

哺乳动物细胞中基于CRISPR的聚集基因屏幕

Read Article