Journal
/
Genetics
/
Romanen sekvens oppdagelsen av subtraktiv Genomics
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics

Romanen sekvens oppdagelsen av subtraktiv Genomics

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Formålet med denne protokollen er å bruke en kombinasjon av beregningsorientert og benk forskning for å finne romanen sekvenser som ikke kan lett skilles fra en co rensing rekkefølge, som kan være bare delvis kjent.

Tags

Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

In vitro transkripsjon Analyser og deres program i Drug Discovery

Novel RNA-bindende proteiner Isolering av den raske Methodology

Konjugerbare Mating Analyser for sekvens-spesifikk analyse av Transfer proteiner involvert i Konjugasjon

Bestemmelse av den optimale Chromosomal plassering(er) gir et DNA i Escherichia coli bruker en ny Transposon-mediert tilnærming

Høy fett diett fôring og høy gjennomstrømning Triacylglyceride analysen i Drosophila Melanogaster

Sekvens-spesifikke og selektiv anerkjennelse av Double-strandet RNAs over Single-strandet RNAs av kjemisk endret peptid nukleinsyrer

Informatic analyse av sekvens Data fra satsvis gjær 2-Hybrid-skjermer

Sekvensering av mRNA fra hele Blood bruke Nanopore sekvensering

Navigering MARRVEL, en Web-basert verktøy som integrerer Human Genomics og modell organisme genetikk informasjon

Utforske sekvens plass til å identifisere bindende områder for regulatoriske RNA-binding proteiner

Read Article