Denne artikel introducerer en eksperimentel protokol med 3D-scanningsteknologi, som bygger bro mellem to rumlige skalaer: den makroskopiske rumlige skala af helhjernens anatomi, som er afbildet af MRI ved > 100 μm og den mikroskopiske rumlige skala af neuronal distributioner ved immun Histokemisk farvning og et multielektrode array system og andre metoder (~ 10 μm).