Journal
/
Genetics
/
En komplet pipeline til isolering og sekvensering af MicroRNAs og analyse af dem ved hjælp af open source-værktøjer
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools

En komplet pipeline til isolering og sekvensering af MicroRNAs og analyse af dem ved hjælp af open source-værktøjer

DOI:
10.3791/59901-v

•

00:09 min

•

August 21, 2019

•

, ,
1Division of Medical Genetics,University of Washington School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:513’ Adaptor Ligation
  • 04:465’ Linker Ligation
  • 05:44Reverse Transcription (RT)
  • 06:33PCR Amplification and Agarose Gel Purification
  • 08:10Results: Representative MicroRNA Analyses
  • 08:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her beskriver vi en trinvis strategi for isolering af små RNAs, berigende for microRNAs og klargøring af prøver til sekvensering med høj gennemløb. Vi beskriver derefter, hvordan man behandler sekvens læsninger og justerer dem til microRNAs ved hjælp af open source-værktøjer.

Tags

MicroRNARNA SequencingBioinformaticsGel PurificationSmall RNARNA IsolationGene TherapyDisease Mechanism

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Påvisning af Copy Number Ændringer Brug Single Cell Sequencing

Robust DNA isoleret og høj overførselshastighed sekventering bibliotek konstruktion til Herbarium prøver

Målrettet næste generation Sequencing og bioinformatik rørledningen for at evaluere genetiske determinanter for forfatningsmæssige sygdom

Sjælden begivenhed registrering ved hjælp af fejl-korrigeret DNA og RNA sekventering

En hurtig og letkøbt Pipeline for generering af genomisk punkt mutanter i C. elegans bruger CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

Ultralow Input Genome Sequencing bibliotek forberedelse fra en enkelt Tardigrade prøvemateriale

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)

Isolering, sekventering og analysere ekstracellulære MicroRNA fra humane mesenkymale stamceller

Sekvensering af mRNA fra fuldblod ved hjælp af Nanopmalm sekvensering

Massespektrometri-baseret Proteomics analyser ved hjælp af OpenProt Database til at afsløre nye proteiner oversat fra ikke-kanoniske åbne læserammer

Read Article