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Eine vollständige Pipeline zum Isolieren und Sequenzieren von MicroRNAs und deren Analyse mithilfe von Open Source Tools
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools
DOI:

00:09 min

August 21, 2019

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Chapters

  • 00:04Title
  • 00:513’ Adaptor Ligation
  • 04:465’ Linker Ligation
  • 05:44Reverse Transcription (RT)
  • 06:33PCR Amplification and Agarose Gel Purification
  • 08:10Results: Representative MicroRNA Analyses
  • 08:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Hier beschreiben wir eine schrittweise Strategie zur Isolierung kleiner RNAs, zur Anreicherung von microRNAs und zur Vorbereitung von Proben für die Sequenzierung mit hohem Durchsatz. Anschließend wird beschrieben, wie Sequenzlesevorgänge verarbeitet und mithilfe von Open-Source-Tools an microRNAs ausgerichtet werden.

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