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Spatial Temporal Analysis of Fieldwise Flow in Microvasculature
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Analyse temporelle spatiale du flux en champ dans la microvasculature

DOI:
10.3791/60493-v

•

09:39 min

•

November 18, 2019

•

, , , , , , , , , , ,
1Biocomplexity Institute,Indiana University, 2Department of Intelligent Systems Engineering,Indiana University, 3Department of Physics,Indiana University, 4Scientific Designs, 5Department of Medicine,Indiana University, 6School of Public Health,Indiana University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:39Vascular Network Definition using TrakEM2 in FIJI
  • 03:52Vascular Flow Quantification Using STAFF
  • 07:26Results: Representative Vascular Skeleton Generation and Kymograph and Velocity Data Analyses
  • 08:58Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Pour quantifier le flux microvasculaire des séquences d'images capillaires à grande vitesse, nous avons développé le logiciel STAFF (Spatial Temporal Analysis of Fieldwise Flow). Sur l'ensemble du champ d'images et au fil du temps, STAFF évalue les vitesses de débit et génère une séquence de cartes spatiales codées en couleur pour la visualisation et la sortie tabulaire pour les analyses quantitatives.

Tags

Spatial Temporal AnalysisMicrovascular FlowFlow VelocitiesTrakEM2Vascular NetworkArea ListPaintbrush ToolImage ProcessingFijiBrightness/contrast

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