iCLIP - Transcriptome רחב מיפוי של חלבון-RNA אינטראקציות עם רזולוציה נוקלאוטיד יחיד

59.8K צפיות

צוטט 203 פעמים

10:45 דק׳

30 באפריל 2011

10.3791/2638-v

30 באפריל 2011

59.8K צפיות

Julian Konig¹ , Kathi Zarnack² , Gregor Rot³ , Tomaz Curk³ , Melis Kayikci¹ , Blaz Zupan³ , Daniel J. Turner⁴ , Nicholas M. Luscombe² , Jernej Ule¹

¹Laboratory of Molecular Biology, Medical Research Council - MRC, ²European Bioinformatics Institute, EMBL Heidelberg, ³Computer and Information Science, University of Ljubljana, ⁴Wellcome Trust Genome Campus, Wellcome Trust Sanger Institute

הסידור המרחבי של חלבונים RNA מחייב על תעתיק הוא הקובע המפתח של תקנה שלאחר תעתיק. לכן, פיתחנו הפרט נוקלאוטיד UV ברזולוציה crosslinking ו immunoprecipitation (iCLIP) המאפשר מיפוי מדויק גנום רחב של אתרי הקישור של חלבון-RNA מחייב.