Summary

Volume di grandi dimensioni (20L +) Filtrazione di campioni d'acqua di mare costiero

Published: June 18, 2009
doi:

Summary

Questo volume video di documenti di grandi dimensioni (≥ 20 L) filtrazione di biomassa microbica, compresa tra 0.22μm e 2.7μm di diametro, dalla colonna d'acqua.

Abstract

Il flusso di lavoro inizia con la raccolta delle acque marine costiere per la comunità microbica a valle, le analisi dei nutrienti e dei gas traccia. Per questo metodo, i campioni sono stati raccolti dal ponte della HMS operativo John Strickland a Inlet Saanich. Questo volume video di documenti di grandi dimensioni (≥ 20 L) filtrazione di biomassa microbica, compresa tra 0.22μm e 2.7μm di diametro, dalla colonna d'acqua. Due campioni 20L può essere filtrato contemporaneamente utilizzando una sola unità pompa dotata di quattro teste rotanti. La filtrazione è fatto nel settore lunghi viaggi, o immediatamente dopo il ritorno per gite di un giorno. E 'importante registrare la quantità di acqua che passa attraverso ogni unità sterivex filtro. Per prevenire la formazione di biofilm tra i viaggi di campionamento, tutte le apparecchiature di filtrazione devono essere lavate con acido cloridrico diluito e acqua deionizzata e sterilizzati in autoclave immediatamente dopo l'uso. Questa procedura richiederà circa 5 ore più un ora in più per la pulizia.

Protocol

Messa a punto di apparecchiature di filtrazione Per impostare l'apparato di filtrazione, utilizzare una pinzetta per posizionare un grado GF / D filtro in unità abitativa prefiltro. Liberamente stringere la custodia a mano. Come regola generale, non stringere troppo o l'unità perdite una volta che la parte di pompaggio. Sostituire il tappo di damigiana con il tappo in autoclave e il tubo attaccato con attenzione inserito il tubo interno in damigiana senza toccarla. Se neces…

Discussion

E 'indispensabile per pulire panche e pompe con un panno umido dopo l'uso per rimuovere ogni traccia persistente di acqua salata che altrimenti corrodere attrezzature. Anche se la procedura è semplice, il requisito di tempo può essere esteso a seconda della concentrazione di biomassa o detriti nel campione essere filtrato.

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Vorremmo ringraziare la Fondazione canadese per l'innovazione, la British Columbia Fondo di conoscenza per lo sviluppo e la Nazionale di Scienze e Ingegneria Research Council (NSERC) del Canada per sostenere gli studi in corso sulle regioni di scarsità di ossigeno delle acque costiere oceaniche e aperto. DAW è stata sostenuta da borse di studio da NSERC, Killam e la fondazione TULA Centro finanziato per la diversità microbica e Evolution.

Materials

Material Name Type Company Catalogue Number Comment
Peristaltic pump   Masterflex (Cole Palmer) 77913-20, 77200-62, 77200-04  
Tygon LFL tubing   Masterflex (Cole Palmer) 06429-24 For filtration apparatus
Hose clamps   Cole Palmer 0683204 For filtration apparatus
1/4” x 3/16” pipe adaptors   Cole Palmer 31702-20 For filtration apparatus
Polypropylene prefilter housing   ADVANTEC 501200 For filtration apparatus
Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock)   Cole Palmer 31507-27 For filtration apparatus
2“ Magnets     For filtration apparatus  
3 port carboy caps       For filtration apparatus
GV 0.22 μm STERIVIX filters   Millipore SVGV01R5  
47 mm diameter 2.7 μm GF/D filters   Whatman 1823047  
Lysis buffer Reagent     0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3)
0.1 % HCl Reagent     For post-filtration rinse
Autoclaved water Reagent     For post-filtration rinse

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Cite This Article
Walsh, D. A., Zaikova, E., Hallam, S. J. Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples. J. Vis. Exp. (28), e1161, doi:10.3791/1161 (2009).

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