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Biology

Ordinamento a singola cellula di cellule staminali mesenchimali immunofenotipizzate da denti decidui esfoliati umani

Published: November 10, 2023 doi: 10.3791/65723
* These authors contributed equally

Summary

Questo protocollo descrive l'uso della selezione cellulare attivata dalla fluorescenza di cellule staminali mesenchimali umane utilizzando il metodo di selezione a singola cellula. In particolare, l'uso del sorting a singola cellula può raggiungere una purezza del 99% delle cellule immunofenotipizzate da una popolazione eterogenea se combinato con un approccio basato sulla citometria a flusso multiparametrica.

Abstract

Le cellule staminali mesenchimali (MSC) di un organismo possiedono una straordinaria capacità di differenziarsi in più lignaggi di cellule adulte nel corpo e sono note per le loro proprietà immunomodulatorie e antinfiammatorie. L'uso di queste cellule staminali è una manna per il campo della biologia rigenerativa, ma allo stesso tempo, una rovina per la medicina rigenerativa e le terapie a causa delle molteplici ambiguità cellulari ad esse associate. Queste ambiguità possono derivare dalla diversità nella fonte di queste cellule staminali e dalle loro condizioni di crescita in vitro , che si riflettono entrambe sulla loro eterogeneità funzionale.

Ciò garantisce metodologie per fornire popolazioni purificate e omogenee di MSC per applicazioni terapeutiche. I progressi nel campo della citometria a flusso hanno permesso di rilevare popolazioni di singole cellule utilizzando un approccio multiparametrico. Questo protocollo delinea un modo per identificare e purificare le cellule staminali dai denti decidui esfoliati umani (SHED) attraverso la selezione di singole cellule assistita da fluorescenza. L'espressione simultanea di marcatori di superficie, vale a dire, CD90-isotiocianato di fluoresceina (FITC), CD73-peridinina-clorofilla-proteina (PerCP-Cy5.5), CD105-alloficocianina (APC) e CD44-V450, ha identificato gli espressiori positivi "luminosi" delle MSC utilizzando la citometria a flusso multiparametrica. Tuttavia, è stato osservato un calo significativo nelle percentuali di quadrupli espressiori di questi marcatori positivi dal passaggio 7 in poi ai passaggi successivi.

Le sottopopolazioni immunofenotipizzate sono state ordinate utilizzando la modalità di ordinamento a singola cellula in cui solo due marcatori positivi e uno negativo costituivano i criteri di inclusione. Questa metodologia ha garantito la vitalità cellulare delle popolazioni selezionate e ha mantenuto la proliferazione cellulare dopo lo smistamento. L'applicazione a valle per tale ordinamento può essere utilizzata per valutare la differenziazione specifica del lignaggio per le sottopopolazioni gated. Questo approccio può essere applicato ad altri sistemi a singola cellula per migliorare le condizioni di isolamento e per acquisire informazioni multiple sui marcatori di superficie cellulare.

Introduction

Le cellule staminali mesenchimali (MSC) possono essere considerate una fonte scalabile di cellule adatte alle terapie cellulari e possono essere considerate un sistema gold standard nella medicina rigenerativa. Queste cellule possono essere isolate da una varietà di fonti nel corpo con diverse origini tissutali1. A seconda del tessuto di origine, ogni tipo di MSC mostra un comportamento in vitro ambiguo2. Ciò è ben osservato nelle loro proprietà morfologiche e funzionali3. Diversi studi hanno mostrato variazioni intraclonali nelle dimensioni, tra cui la differenziazione dei tessuti adulti, lo stato genomico e l'architettura metabolica e cellulare delle MSC 2,4.

L'immunofenotipizzazione delle cellule è stata un'applicazione comune della citometria a flusso per l'identificazione delle cellule staminali ed è stata utilizzata dall'International Society for Cell and Gene Therapy (ISCT) nel 2006 per prescrivere un elenco di criteri minimi per identificare le cellule come MSC. Ha affermato che insieme all'aderenza plastica e alla capacità di differenziarsi in tre linee (osteogeniche, condrogeniche e adipogeniche) in vitro, il ≥95% della popolazione cellulare deve esprimere CD105, CD73, CD90 e queste cellule devono mancare dell'espressione (≤2% positiva) di CD34, CD45, CD11b, CD14 e HLA-DR, come misurato dalla citometria a flusso5. Sebbene le MSC fossero definite da una serie di biomarcatori secondo i criteri minimi dell'ISCT, le loro proprietà immunitarie non potevano essere confrontate con questi biomarcatori e c'era bisogno di ulteriori oltre questi criteri per rendere più facili da quantificare i confronti tra studi e le variazioni clonali2.

Nonostante le linee guida stabilite dall'ISCT, un'ampia ricerca sulle MSC ha dimostrato che esiste un'eterogeneità in questa popolazione, che potrebbe derivare da una moltitudine di fattori, principalmente a causa della natura ubiquitaria dell'eterogeneità che si verifica tra i donatori di MSC6, le fonti di tessuto7, le singole cellule all'interno di una popolazione clonale8 e le condizioni di coltura2,9, Ore 10. La caratterizzazione e la purificazione di queste cellule primarie da una varietà di fonti tissutali per garantire la qualità e il destino cellulare sono fasi chiave della loro produzione. La necessità di comprendere le variazioni mostrate all'interno della popolazione richiede un metodo efficiente per risolverle in sottopopolazioni che possono essere suddivise e raccolte separatamente11. Le analisi a livello di singola cellula aiutano a superare le sfide della variazione cellula-cellula, riducono il rumore biologico derivante da una popolazione eterogenea e offrono la possibilità di studiare e caratterizzare cellule rare12.

In base allo scopo e ai parametri scelti, possono essere impiegati diversi metodi per ordinare e arricchire le popolazioni selezionate. Le tecniche di selezione cellulare possono comprendere sia metodi di selezione alla rinfusa che metodi di selezione a singola cellula. Mentre lo smistamento di massa può arricchire le popolazioni bersaglio attraverso lo smistamento cellulare attivato magneticamente (MACS)13, il frazionamento 14 e l'elutriazione 15, lo smistamento a cellula singola può arricchire popolazioni più omogenee per mezzo del selezionatore cellulare attivato dalla fluorescenza (FACS)11. Un'analisi comparativa di ciascuno di questi metodi, con il proprio insieme di vantaggi e svantaggi, è evidenziata nella Tabella 1.

Tabella 1: Analisi comparative di diverse tecniche: MACS, Frazionamento, Elutriazione e FACS evidenziando le differenze nel loro principio e i vantaggi e gli svantaggi della scelta di una particolare tecnica rispetto ad un'altra. Abbreviazioni: MACS = Magnetic-activated cell sorting; FACS = Selezione cellulare attivata dalla fluorescenza. Clicca qui per scaricare questa tabella.

Dall'avvento della tecnica, la citometria a flusso a singola cellula ha svolto un ruolo importante nell'enumerazione16, nel rilevamento e nella caratterizzazione di una specifica popolazione cellulare in un campione eterogeneo17. Hewitt et al. nel 2006 hanno gettato le basi di una metodologia di selezione cellulare automatizzata per migliorare l'isolamento di pool omogenei di cellule staminali embrionali umane differenziate (hESCs)18. Lo smistamento a singola cellula ha arricchito la popolazione di hESC trasdotte con GFP facilitando l'isolamento di cloni geneticamente modificati, aprendo una nuova dimensione nella ricerca clinica. Per migliorare l'efficienza dello smistamento, sono stati generalmente adottati due approcci; O i terreni di raccolta delle popolazioni selezionate vengono modificati per sostenere la vitalità e la proliferazione delle cellule post-selezionate19 o l'algoritmo/software di selezione delle cellule viene opportunamente modificato12.

Con il progresso della tecnologia, i citometri a flusso commerciali e i selezionatori cellulari sono stati in grado di aiutare ad affrontare le sfide che sono state affrontate durante lo smistamento asettico di popolazioni cellulari fragili e rare, in particolare cellule staminali di origini diverse. Una delle principali sfide dei biologi delle cellule staminali è stata l'isolamento clonale di cellule staminali pluripotenti umane seguendo i protocolli di trasfezione richiesti negli studi di editing genetico19. Questo problema è stato affrontato ordinando singole cellule in piastre a 96 pozzetti rivestite con fibroblasti embrionali di topo (MEF) insieme a integratori e inibitori commerciali di piccole molecole ROCK. Tuttavia, le strategie di isolamento cellulare potrebbero essere in gran parte perfezionate con l'uso dell'index sorting, una caratteristica dell'algoritmo di sorting che identifica l'immunofenotipo delle singole cellule selezionate12. Questa raffinata modalità di selezione di singole cellule ha contribuito non solo a migliorare l'efficienza di selezione per le cellule staminali, in particolare per quanto riguarda le rare popolazioni di cellule staminali ematopoietiche, ma ha anche collegato in modo efficiente i cloni a singola cellula ai loro saggi funzionali a valle20.

Questo articolo si concentra sullo smistamento di singole cellule di cellule staminali immunofenotipizzate da denti decidui esfoliati umani (SHED) per l'arricchimento di sottopopolazioni per studiare le loro capacità di differenziazione funzionale. Utilizzando una combinazione di due marcatori MSC-positivi, CD90 e CD73, e di un marcatore ematopoietico negativo CD45, le MSC sono state immunofenotipizzate e sono stati identificati gli espressiori deboli e nulli. Sulla base del loro immunofenotipo le sottopopolazioni sono state identificate come MSC pure, popolazioni singole positive e doppie negative. Sono stati ordinati utilizzando la modalità di ordinamento a singola cellula per ottenere sottopopolazioni pure e arricchite per ulteriori studi funzionali per identificare se l'espressione differenziale dei marcatori fosse un artefatto delle condizioni di coltura in vitro o se avesse qualche effetto anche sulle proprietà funzionali. Le cellule che non erano espressioni omogenee dei "marcatori MSC positivi" sono state ordinate per studiare le loro proprietà funzionali.

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Protocol

Approvazione etica e consenso alla partecipazione: i campioni di polpa dentale decidua esfoliata umana sono stati ricevuti dopo aver ottenuto il consenso informato e la piena approvazione etica da parte del Dipartimento orale e maxillofacciale dello Sri Rajiv Gandhi Dental College and Hospital (SRGCDS), Bengaluru, in conformità con gli standard stabiliti dal Comitato di autorizzazione etica dell'ospedale, SRGCDS. A seguito di ciò, l'isolamento, la coltura, il mantenimento e l'applicazione di SHED sono stati approvati e in conformità con le linee guida raccomandate dal Comitato Istituzionale per la Ricerca sulle Cellule Staminali (IC-SCR) presso l'Istituto di Medicina Rigenerativa Manipal, MAHE - Bengaluru. Vedere la Tabella dei materiali per i dettagli su tutti i materiali e i reagenti utilizzati in questo protocollo.

1. Preparazione di reagenti e tamponi

  1. Per la manutenzione delle colture
    1. Preparare i terreni di coltura cellulare MSC (10%) utilizzando terreno basale per hESC indifferenziate, 10% di siero fetale bovino (FBS), 1% di L-glutammina e 1% di penicillina-streptomicina (Pen-streptococco) (Tabella 2).
    2. Preparare i terreni di coltura cellulare MSC (20%) utilizzando terreno basale per hESC indifferenziate, 20% FBS, 1% L-glutammina e 1% Pen-strep (Tabella 2).
    3. Preparare i terreni neutralizzanti utilizzando un terreno basale per hESC indifferenziate, L-glutammina all'1% e antibiotico-antimicotico (Anti-Anti) all'1% (Tabella 2).
  2. Per l'analisi citofluorimetrica e lo smistamento
    1. Preparare il tampone di colorazione utilizzando FBS al 2% in soluzione salina tamponata con fosfato (PBS).
    2. Preparare una soluzione madre di 4′,6-diamidino-2-fenilindolo (DAPI) (1 μg/mL) aggiungendo 1 μL in 1 mL di PBS
  3. Per la differenziazione specifica del lignaggio delle MSC
    1. Preparare i terreni di differenziazione per la differenziazione osteogenica, condrogenica e adipogenica secondo la composizione descritta nella Tabella 3. Conservare le aliquote preparate a 4 °C per tutta la durata dell'esperimento.
    2. Preparare terreni affamati di siero (2% di terreno) utilizzando terreno basale per hESC indifferenziate, 2% FBS, 1% L-glutammina e 1% Pen-strep (Tabella 2).
TIPO DI SUPPORTO SCOPO DEI MEDIA COMPOSIZIONE PER 50 mL
FBS Penna-Streptococco L-Glutammina TERRENO BASALE PER hESC INDIFFERENZIATE
10% media Cultura e manutenzione MSC 5 mL 500 μL 500 μL 44 ml
20% media Test CFU-F 10 ml 500 μL 500 μL 39 ml
Terreni affamati di siero (2%) Terreni per pozzetti di controllo in protocollo di differenziamento 1 mL 500 μL 500 μL 48 ml
Mezzi neutralizzanti Terreno per neutralizzare la sospensione cellulare dopo tripsinizzazione - 500 μL 500 μL 49 ml

Tabella 2: Terreni di coltura cellulare per il mantenimento della coltura e i saggi. Abbreviazioni: MSC = cellula staminale mesenchimale; CFU-F = unità formante colonie-fibroblasto.

COMPONENTI TERRENI OSTEOGENICI TERRENI CONDROGENICI TERRENI ADIPOGENICI
Terreni basali 90 ml 90 ml 90 ml
Mezzi di induzione 10 ml 10 ml 10 ml
Volume totale 100 ml 100 ml 100 ml

Tabella 3: Mezzi di differenziazione per la differenziazione trilineage degli SHED.

2. Cultura e manutenzione degli SHED

  1. Mantenere le cellule in terreni di coltura MSC al 10% ed eseguire cambi di terreno ogni 2 giorni o secondo necessità.
  2. Tripsinizzare le cellule al 95% di confluenza utilizzando lo 0,25% di tripsina-EDTA.
  3. Neutralizzare le cellule dopo la tripsinizzazione utilizzando mezzi neutralizzanti.
  4. Centrifugare la provetta a 300 × g per 6 minuti a temperatura ambiente per ottenere un pellet cellulare.
  5. Decantare il surnatante e risospendere il pellet cellulare in terreni di coltura MSC al 10%.
  6. Semina le cellule in piastre di coltura cellulare appena preparate contenenti il 10% di terreni di coltura MSC per ulteriori esperimenti o sub-coltura.
    NOTA: La densità di semina ottimale per i capannoni è di 0,2 × 10 6 celle in una capsula da 100 mm e di 0,8 × 10 6 celle in un matraccio T-75, per ottenere rispettivamente 1,5 × 10 6 celle e 4 × 10 6 cellule, al 90-100% di confluenza.

3. Caratterizzazione delle MSC

  1. Saggio di crescita cellulare a breve termine
    1. Seme 4 × 104 cellule/pozzetto in triplice copia in piastre da 6 pozzetti in terreni di coltura MSC al 10%.
    2. Incubare le piastre per 7 giorni a 37 °C ed effettuare cambi di terreno ogni 2 giorni.
    3. Raccogliere le cellule nei giorni 2, 4 e 8 utilizzando un trattamento con tripsina allo 0,25% e lavare con terreni di coltura.
    4. Centrifugare le cellule a 300 g per 6 minuti a temperatura ambiente e risospendere il pellet in 1 mL di terreno.
    5. Contare le cellule utilizzando un emocitometro e determinarne la vitalità con il metodo di esclusione del blu tripano.
    6. Calcolare il tasso di proliferazione utilizzando l'equazione (1):
      Equation 1(1)
  2. Saggio dell'unità formante coloni-fibroblasti (CFU-F)
    1. Seminare 10.000 cellule in un piatto da 100 mm e coltivarle in terreni di coltura MSC al 20%.
    2. Incubare le piastre per 14 giorni a 37 °C ed effettuare cambi di terreno ogni 3 giorni.
    3. Dopo 14 giorni, sciacquare le colonie con PBS, fissarle con colorante crystal violet in metanolo e risciacquare nuovamente con PBS per rimuovere la macchia residua.
    4. Conta e immagina le colonie.
      NOTA: Contare le colonie con >50 cellule. L'efficienza di formazione delle colonie è calcolata come numeri di unità formanti colonie.
  3. Test di immunofluorescenza
    1. Seminare le MSC su piastre da 35 mm e lasciarle crescere fino all'80-90% di confluenza.
    2. Rimuovere il supporto e sciacquare le stoviglie con PBS una volta.
    3. Fissare le cellule con 1 mL di paraformaldeide al 4% (PFA) incubandole per 1 ora a temperatura ambiente o per una notte a 4 °C.
    4. Dopo il fissaggio, lavare i pozzetti con PBST per 3 x 5 minuti sul bilanciere.
    5. Aggiungere lo 0,3% di Triton X-100 in PBST (soluzione di Tween 20 allo 0,05% in PBS) per permeabilizzare le cellule. Tienilo sul bilanciere per 15 minuti a temperatura ambiente.
    6. Lavare i pozzetti con PBST per 3 x 5 minuti sul bilanciere.
    7. Aggiungere il 3% di albumina sierica bovina (BSA) per bloccarlo e tenerlo sul bilanciere per 1 ora a temperatura ambiente.
    8. Lavare i pozzetti con PBST per 3 x 5 minuti sul bilanciere.
    9. Aggiungere 800 μL di diluizione 1:500 di antivimentina per topi, tenerlo sul bilanciere per 1 ora a temperatura ambiente e trasferire la piastra a 4 °C per l'incubazione notturna.
    10. Il giorno successivo, rimuovere l'anticorpo primario e lavare i pozzetti con PBST per 3 x 5 minuti sul bilanciere.
    11. Aggiungere 800 μL di diluizione 1:1.000 dell'anticorpo secondario adsorbito incrociato IgG (H+L) anti-topo di capra, Alexa Fluor 555, e tenerlo per 3 ore a temperatura ambiente sul bilanciere.
    12. Lavare i pozzetti con PBST per 3 x 5 minuti sul bilanciere.
    13. Aggiungere le sonde per falloidina Alexa fluor 488 da 240 μL in 1.000 μL di PBS e incubare a temperatura ambiente per 60 minuti sul bilanciere.
    14. Lavare i pozzetti con PBST per 3 x 5 minuti sul bilanciere.
    15. Aggiungere 700 μL di montante DAPI e osservare le cellule al microscopio.
  4. Differenziazione specifica del lignaggio
    1. Differenziazione in base alla cultura 2D
      1. Prendi due piastre da 48 pozzetti ed etichettale rispettivamente come linee osteogeniche e adipogeniche.
      2. Seminare 15.000 cellule/pozzetto in quattro pozzetti di ciascuna piastra e coltivarle in terreni di coltura MSC al 10%.
      3. Una volta che il monostrato di cellule ha raggiunto il 90% di confluenza, etichettare i primi due pozzetti come "Controllo" e sostituire il terreno esistente con terreno affamato di siero (2% di terreno). Negli ultimi due pozzetti etichettati come "Test", aggiungere i mezzi di differenziazione di uno dei due lignaggi, adipogenico o osteogenico. Contrassegnalo come Giorno 0.
      4. Sostituisci delicatamente i terreni ogni tre giorni per evitare la desquamazione e fai attenzione a evitare contaminazioni.
      5. Mantieni queste condizioni fino al ventunesimo giorno; quindi il processo per l'esperimento di colorazione.
    2. Differenziazione in base alla cultura 3D
      1. Prelevare due provette da 15 mL per eseguire la differenziazione condrogenica utilizzando la coltura di pellet 3D.
      2. Trasferire 1 × 10 6 cellule in ciascuna provetta e centrifugare a 300 × g per6 minuti per formare un pellet. Etichettare una provetta come "Controllo" e aggiungervi il 10% di terreno di coltura MSC; etichettare l'altra provetta come 'Test' e aggiungere il mezzo di differenziazione condrogenica. Posizionare con cura le provette nell'incubatrice con i tappi avvitati senza stringere. Contrassegnalo come Giorno 0.
      3. Cambiare il supporto ogni tre giorni con attenzione, in modo da non spostare/disintegrare il pellet durante i cambi di supporto.
      4. Mantieni queste condizioni fino al ventunesimo giorno e poi elabora le cellule per ulteriori esperimenti.
  5. Colorazione citochimica specifica per il lignaggio
    1. Per le colture 2D, utilizzare le piastre MSC differenziate (test) e indifferenziate (controllo) (dal punto 3.4.1.5.) per la colorazione e, per prima cosa, rimuovere il terreno e lavare due volte con PBS. Fissare le cellule con PFA al 4% per 30 minuti a temperatura ambiente, rimuovere il surnatante e lavare una volta con PBS. Eseguire la colorazione per ogni lignaggio come segue.
      1. Per il lignaggio degli adipociti, aggiungere la soluzione di permeabilizzazione dal kit e incubare la piastra per 5 minuti a temperatura ambiente. Preparare e aggiungere 1 mL di soluzione di lavoro Oil red O e conservarlo per 10 min. Rimuovere la macchia e fare cinque lavaggi con acqua distillata.
      2. Per il lignaggio degli osteociti, aggiungere il 5% di nitrato d'argento appena preparato (in acqua distillata) a ciascun pozzetto e tenere la piastra sotto UV per 1 ora. Rimuovere la soluzione e aggiungere il 2,5% di tiosolfato di sodio per rimuovere l'argento non reagito; Conservare per 5 min. Rimuovere la macchia, lavare due volte con acqua distillata e osservare le cellule macchiate al microscopio.
    2. Per le colture 3D, raccogliere il pellet dopo la fine del periodo di differenziazione di cui al punto 3.4.2.3 e ottenere criosezioni del tessuto differenziato sotto forma di pellet. Lasciare asciugare i vetrini all'aria e a temperatura ambiente prima di procedere alla colorazione.
      1. Per il lignaggio dei condrociti, seguire le indicazioni del kit di colorazione per aggiungere un volume sufficiente di soluzione di lavaggio, rimuoverla, aggiungere la soluzione fissante e incubare per 30 minuti. Lavare con acqua distillata, aggiungere la soluzione colorante e incubare per 30 minuti. Lavare tre volte con acido cloridrico 0,1 N; Aggiungere acqua distillata per neutralizzare l'acidità. Osservare le cellule colorate al microscopio in campo chiaro.

4. Colorazione della superficie cellulare per l'immunofenotipizzazione

NOTA: Le piastre di coltura cellulare consigliate per ottenere un numero ottimale di cellule nei passaggi 4.2-4.5 sono piastre da 100 mm o matracci T75.

  1. Preparazione delle cellule per esperimenti di citofluorimetria
    1. Tripsinizzare e raccogliere le cellule da un piatto/matraccio confluente e centrifugare a 300 × g per 6 minuti per ottenere il pellet cellulare.
    2. Risospendere il pellet in 1 mL di terreno e determinare la conta delle cellule vitali utilizzando un emocitometro seguendo il metodo di esclusione del blu di tripano.
    3. Centrifugare nuovamente la sospensione cellulare dopo il conteggio e somministrare altri due lavaggi al pellet con 1 mL di tampone colorante.
    4. Scartare il surnatante e infine risospendere il pellet in un volume appropriato del tampone colorante a seconda del protocollo (vedere i passaggi da 4.2 a 4.5).
  2. Preparazione dei controlli di compensazione
    1. Prendi sette provette FACS ed etichettale come Unstained, DAPI, V450, FITC, PE, PerCP-Cy 5.5 e APC.
    2. Risospendere il pellet finale nel tampone di colorazione (vedere il punto 4.1.) mantenendo una densità cellulare di 0,5 × 10,6 cellule per 50 μL per provetta per le provette non colorate e DAPI.
    3. Preparare le provette monocoloranti per la compensazione come descritto nella Tabella 4.
    4. Dopo la preparazione, agitare delicatamente ogni provetta e incubare al buio per 30 minuti.
    5. Dopo l'incubazione, effettuare due lavaggi aggiungendo 1 mL di tampone colorante a ciascuna provetta, seguiti da un breve vortex e centrifugazione a 200 g per 10 minuti a temperatura ambiente.
    6. Scartare il surnatante, risospendere il pellet in 500 μL di tampone colorante e metterlo da parte fino all'acquisizione.
    7. Per il tubo DAPI, eseguire un trattamento a shock termico incubandolo a bagnomaria a 60 °C per 5 minuti seguiti da 15 minuti su ghiaccio. Aggiungere 5 μL di DAPI alla sospensione e tenerla al buio fino all'acquisizione della corsa.
  3. Preparazione dei controlli di fluorescenza meno uno (FMO)
    1. Risospendere il pellet finale nel tampone colorante (vedere il punto 4.1) mantenendo una densità cellulare di 0,5 × 106 cellule per 50 μL per ciascuna provetta.
    2. Prendi cinque provette FACS ed etichettale come isotipo CD44-V450, CD90-FITC, CD45-PE, isotipo CD73-PerCP Cy5.5 e isotipo CD105-APC.
    3. Preparare la sospensione cellulare e anticorpale secondo la Tabella 5.
    4. Agitare delicatamente le provette e incubarle per 30 minuti a temperatura ambiente al buio.
    5. Dopo l'incubazione, somministrare due lavaggi con 1 mL di tampone colorante a ciascuna provetta, seguiti da un breve vortex e centrifugazione a 200 g per 10 minuti a temperatura ambiente.
    6. Scartare il surnatante, risospendere il pellet in 500 μL di tampone colorante e metterlo da parte fino all'acquisizione.
  4. Preparazione dei campioni per l'analisi
    1. Risospendere il pellet finale nel tampone di colorazione (vedere il passaggio 4.1) mantenendo una densità cellulare di 0,5 × 106 cellule per 50 μL per ciascuna provetta.
    2. Prendi due provette FACS ed etichettale come provette miste 1 e 2.
    3. Preparare la sospensione cellulare e anticorpale secondo la Tabella 6.
    4. Agitare delicatamente le provette e incubarle per 30 minuti a temperatura ambiente al buio.
    5. Dopo l'incubazione, somministrare due lavaggi con 1 mL di tampone colorante a ciascuna provetta, seguiti da un breve vortex e centrifugazione a 200 g per 10 minuti a temperatura ambiente.
    6. Scartare il surnatante, risospendere il pellet in 500 μL di tampone colorante e mettere da parte fino all'acquisizione.
  5. Preparazione dei campioni per la selezione di singole cellule
    1. Prendi due provette FACS, aggiungi 1 ml di FBS e arrotola la provetta fino a formare uno strato uniforme di FBS all'interno di ciascuna provetta. Incubare per 1-2 ore durante l'elaborazione del campione per la colorazione. Etichettare queste provette come provette miste 1 e 2.
    2. Risospendere il pellet finale nel tampone di colorazione (vedere il punto 4.1) mantenendo una densità cellulare di 2-3 × 10,6 cellule per 50 μL per ciascuna provetta.
    3. Preparare la sospensione cellulare e anticorpale in provette miste 1 e 2 secondo la Tabella 7.
    4. Agitare delicatamente le provette e incubarle per 30 minuti a temperatura ambiente al buio.
    5. Dopo l'incubazione, somministrare due lavaggi con 1 mL di tampone colorante a ciascuna provetta, seguiti da un breve vortex e centrifugazione a 200 g per 10 minuti a temperatura ambiente.
    6. Scartare il surnatante, risospendere il pellet in 500 μL di tampone colorante e mettere da parte. Aggiungere 5 μL di DAPI 15 minuti prima della cernita.
      NOTA: Si noti che per gli esperimenti di smistamento si consiglia una maggiore densità cellulare per provetta.
Tipo di tubo Perline Comp Positive* Perline Comp Negative* Cellule Anticorpo aggiunto
Tubo FITC 1 goccia 1 goccia CD90-FITC anti-umano (2 μL)
Tubo V450 1 goccia 1 goccia CD44-V450 anti-umano (2 μL)
Tubo PerCP-Cy 5.5 1 goccia 1 goccia CD73-PerCP anti-umano Cy 5,5 (2 μL)
Tubo in PE 1 goccia 1 goccia CD45-PE anti-umano (2 μL)
Tubo APC 1 goccia 1 goccia CD105-APC anti-umano (2 μL)
Tubo DAPI 50 μL
Tubo non colorato 50 μL
*1 goccia = 60 μL di sospensione del tallone

Tabella 4: Campioni di controllo della compensazione. Abbreviazioni: Comp = compensazione; DAPI = 4',6-diamidino-2-fenilindolo; FITC = isotiocianato di fluoresceina; APC = alloficocianina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla.

TIPO DI TUBO ANTICORPO CONTRO IL MARCATORE POSITIVO (2 μL) ANTICORPO CONTRO IL MARCATORE NEGATIVO (2 μL) AGGIUNTA DI ANTICORPI ISOTIPICI (2 μL) VOLUME TOTALE DEGLI ANTICORPI VOLUME DI SOSPENSIONE CELLULARE AGGIUNTO VOLUME DI TAMPONE COLORANTE AGGIUNTO
Tubo FMO CD90-FITC - Anti-umano CD44-V450 CD45-PE anti-umano Isotipo FITC IgG1 10 μL 50 μL 40 μL
- CD73 anti-umano PerCP Cy 5.5
- CD105-APC anti-umano
CD73-PerCP Valvola FMO Cy5.5 - Anti-umano CD44-V450 CD45-PE anti-umano Isotipo PerCP Cy 5.5 IgG1 10 μL 50 μL 40 μL
- CD90-FITC anti-umano
- CD105-APC anti-umano
Tubo FMO CD44-V450 - CD90-FITC anti-umano CD45-PE anti-umano Isotipo V450 IgG1 10 μL 50 μL 40 μL
- CD73-PerCP anti-umano Cy 5.5
- CD105-APC anti-umano
Tubo FMO CD105-APC - Anti-umano CD44-V450 CD45-PE anti-umano Isotipo APC IgG1 10 μL 50 μL 40 μL
- CD90-FITC anti-umano
- CD73-PerCP anti-umano Cy 5.5
Tubo FMO CD45-PE - Anti-umano CD44-V450 - Isotipo PE IgG1 10 μL 50 μL 40 μL
- CD90-FITC anti-umano
- CD73-PerCP anti-umano Cy 5.5
- CD105-APC anti-umano

Tabella 5: Campioni di controllo FMO. Abbreviazioni: FMO = fluorescenza meno uno; FITC = isotiocianato di fluoresceina; APC = alloficocianina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla.

TIPO DI TUBO ANTICORPO CONTRO IL MARCATORE POSITIVO (2 μL) ANTICORPO CONTRO IL MARCATORE NEGATIVO (2 μL) VOLUME TOTALE DEGLI ANTICORPI VOLUME DI SOSPENSIONE CELLULARE AGGIUNTO VOLUME DI TAMPONE COLORANTE AGGIUNTO
Tubo misto 1 - Anti-umano CD44-V450 CD45-PE anti-umano 10 μL 50 μL 40 μL
- CD90-FITC anti-umano
- CD73-PerCP anti-umano Cy5.5
- CD105-APC anti-umano
Tubo misto 2 - Anti-umano CD44-V450 CD45-PE anti-umano 10 μL 50 μL 40 μL
- CD90-FITC anti-umano
- CD73-PerCP anti-umano Cy5.5
- CD105-APC anti-umano

Tabella 6: Provette per campioni per l'immunofenotipizzazione multicolore di SHED. Abbreviazioni: SHEDs = cellule staminali da denti decidui esfoliati umani; PE = ficoeritrina.

TIPO DI TUBO ANTICORPO CONTRO MARCATORE POSITIVO (3 μL) ANTICORPO CONTRO IL MARCATORE NEGATIVO (3 μL) VOLUME TOTALE DEGLI ANTICORPI VOLUME DI SOSPENSIONE CELLULARE AGGIUNTO VOLUME DI TAMPONE COLORATO AGGIUNTO
Tubo misto 1 - CD90-FITC anti-umano CD45-PE anti-umano 9 μL 50 μL 41 μL
- CD73-PerCP anti-umano Cy5.5
Tubo misto 2 - CD90-FITC anti-umano CD45-PE anti-umano 9 μL 50 μL 41 μL
- CD73-PerCP anti-umano Cy5.5

Tabella 7: Provette di reazione per cernita a singola cellula. Abbreviazioni: FITC = isotiocianato di fluoresceina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla.

5. Selezione a cellula singola

  1. Preparazione del selezionatore cellulare
    1. Installare un ugello da 100 μm nello smistatore.
      NOTA: L'ugello appropriato è almeno cinque volte il diametro della particella da selezionare. Il fluido di guaina da utilizzare per la cernita deve essere deciso in base al tipo di campione e alla sensibilità dell'esperimento; Per questo esperimento è stato utilizzato un fluido di guaina brevettato.
    2. Eseguire il controllo di qualità (QC) giornaliero dello strumento e impostare il selezionatore per l'esperimento. Fare riferimento al manuale dello strumento per una guida dettagliata alla configurazione dello strumento.
  2. Impostazione della matrice di retribuzione
    1. Impostare la matrice di compensazione utilizzando tubi di compensazione a macchia singola dal punto 4.2.
    2. Nel software proprietario, selezionare Esperimento dalla barra degli strumenti e fare clic su Impostazione compensazione. Apri Crea controlli di compensazione.
    3. Controllare i marcatori e confermare. Viene aggiunto un nuovo campione denominato "Compensazione" in base al quale i nuovi tubi denominati controlli del marcatore vengono aggiunti automaticamente dal software.
    4. Seleziona il tubo non colorato ed eseguilo per registrare 5.000 eventi. Trascinare il gate sulla popolazione di celle e applicarlo a tutti i controlli di compensazione. Questo per impostare le tensioni e il gate negativo per ogni parametro fluorescente.
    5. Allo stesso modo, caricare separatamente i tubi di compensazione delle macchie singole, registrare e salvare i dati. Selezionare il cancello che delimita la popolazione di interesse e applicarlo a tutti i controlli di compensazione. In questo modo è possibile impostare le porte positive per ogni parametro fluorescente.
    6. Seleziona Esperimento dalla barra degli strumenti e fai clic sul collegamento Calcola valori di compensazione | e salva.
      NOTA: Una volta generata la matrice auto-comp utilizzando il software, i parametri di tensione dei fluorocromi non possono essere modificati per nessuno dei canali nei tubi misti.
  3. Acquisizione dati
    1. Registrare 10.000 cellule in ogni provetta dal punto 4.3. e 4.4 per raccogliere dati per l'analisi dell'immunofenotipo delle cellule.
  4. Preparazione dei dispositivi di raccolta
    1. A seconda dello scopo delle popolazioni cellulari ordinate, scegliere tra piastre a 6, 24 pozzetti, 48 pozzetti o 96 pozzetti.
    2. Rivestire i pozzetti con 200-500 μL di FBS e mantenere le piastre indisturbate per 2 ore.
    3. Dopo 2 ore, rimuovere l'FBS residuo e aggiungere 200-500 μL di terreno di coltura MSC al 10%.
  5. Ordinamento delle celle in modalità di ordinamento a cella singola
    1. Eseguire il canale misto 1 (dal passaggio 4.5) e registrare 10.000 eventi per impostare i gate sulla popolazione di interesse da ordinare, utilizzando la strategia di gating appropriata.
    2. Caricare una piastra di raccolta e impostare il numero di cellule target tra 2.500 e 5.000 cellule/pozzetto e selezionare la maschera di purezza per l'ordinamento a cellula singola.
    3. Raccogli le popolazioni ordinate nel dispositivo di raccolta e tienile sul ghiaccio fino alla fine dell'esperimento di smistamento.
    4. Una volta terminato, trasferire le piastre nell'incubatore al 5% di CO2 per mantenere le colture a 37 °C.
      NOTA: Dopo l'acquisizione, i file di dati grezzi sono stati esportati in formato .fcs (v.3.0. e successive). I report di ordinamento generati dopo ogni esperimento registravano il numero di eventi/celle ordinati per ogni pozzetto assegnato e indicavano il numero di conflitti che erano stati interrotti.

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Representative Results

Gli SHED sono stati caratterizzati con saggi di immunofluorescenza standard che mostrano l'espressione di vimentina (filamenti intermedi rossi di tipo III), filamenti di actina (Alexa fluor 488 Phalloidin Probes) e nuclei colorati con DAPI (Figura 1A). Per stimare le loro capacità proliferative e di formazione di colonie, sono stati eseguiti saggi standard di crescita cellulare a breve termine. Nella Figura 1B è stato mostrato un aumento di 14,3 volte del tasso di proliferazione dal giorno 2 al giorno 8. Le proprietà clonogeniche degli SHED sono state determinate dai saggi CFU-F mostrati nella Figura 1C-E. Secondo i criteri ISCT, le MSC multipotenti sono state in grado di differenziarsi nei tre lignaggi di derivazione mesodermica. La colorazione citochimica con Oil Red O è stata utilizzata per rilevare le goccioline di olio negli adipociti differenziati (Figura 1F); La colorazione di von Kossa è stata utilizzata per colorare i depositi di calcio presenti nella matrice degli osteoblasti differenziati (Figura 1G); e gli aggrecani nella coltura 3D sono stati colorati per il blu di Alcian nei condroblasti differenziati (Figura 1H).

Per caratterizzare l'immunofenotipo degli SHED, sono stati impostati saggi di citometria a flusso multiparametrica. Gli esperimenti sono stati eseguiti insieme all'uso di quattro tipi di controlli sperimentali, vale a dire i controlli di compensazione (Tabella 4), i controlli FMO e isotipi (Tabella 5) e i controlli non colorati. Gli isotipi di tutti gli anticorpi MSC e HSC utilizzati sono stati aggiunti insieme alle provette FMO per discriminare i segnali positivi rispetto a quelli negativi e l'espressione dell'antigene alta rispetto a quella debole. La Figura 2A mostra la distribuzione dei controlli FMO e isotipo utilizzati per ogni esperimento. I grafici di densità rappresentativi non hanno mostrato alcuna espressione dell'isotipo FITC degli anticorpi CD90 FITC. Allo stesso modo, le sovrapposizioni dell'istogramma (Figura 2B) hanno confrontato i livelli di espressione dei campioni colorati insieme ai loro controlli nei rispettivi canali di FITC, PerCP Cy5.5 e PE. L'espressione positiva dei marcatori CD90 e CD73 (istogrammi rossi) e l'espressione negativa di CD45 sono paragonabili a quelle dei loro controlli non colorati e FMO (istogrammi blu e nero, rispettivamente).

La caratterizzazione degli immunofenotipi basata sulla citometria a flusso ha mostrato la distribuzione dei marcatori da uno degli SHED di passaggio precoce (P6) (Figura 3A-H). Sia i marcatori raccomandati dall'ACCT che CD44 hanno determinato le popolazioni parentali come MSC. La popolazione tetra-positiva dimostrata nei grafici di densità ha mostrato un'espressione del ≥98% di CD90+CD73+CD105+CD44+ e un'espressione del ≤2% di marcatori CD45. Più di cinque esperimenti indipendenti hanno mostrato risultati simili. Gli SHEDs a passaggio tardivo (P12), che hanno mostrato un'espressione differenziale dei marcatori positivi, sono stati scelti per l'ordinamento a singola cellula di espressioni alti e deboli (Figura 4A-H). Seguendo la strategia di gating (Figura 4H), singoletti→ cellule vive→ non-HSC→ doppie popolazioni CD73+CD90+ e CD73+CD90- singolarmente positive sono state ordinate utilizzando la modalità di ordinamento a cellula singola. Le popolazioni selezionate sono state raccolte in layout di piastre a 96 pozzetti/48 pozzetti/6 pozzetti con diversi conteggi di semina per pozzetto (File supplementare 1). Sono stati effettuati tre tentativi consecutivi in una singola fase di esperimenti di selezione e la sopravvivenza delle cellule dopo la selezione (negli espressiori a doppio positivo: CD90+CD73+) per esperimento è stata del 100%. Sono state condotte tre fasi indipendenti di esperimenti. Abbiamo confrontato il numero di cellule cresciute per pozzetto dopo l'ordinamento al numero di cellule ordinate per pozzetto.

La Figura 5A mostra che le cellule post-selezionate CD90+CD73+ raccolte nella piastra a 96 pozzetti hanno mostrato aderenza e proliferazione come la loro popolazione parentale. È stato osservato che le cellule selezionate raggiungono il 70-80% di confluenza il sesto giorno dopo lo smistamento. Le cellule post-selezionate aderenti e proliferanti sono state differenziate in presenza di fattori di crescita adipogenici e poi colorate dopo il giorno 15 con Oil Red O utilizzando anche cellule di controllo post-selezionate (indifferenziate) appropriate (Figura 5B,C).

Figure 1
Figura 1: Caratterizzazione di cellule staminali da denti decidui esfoliati umani. (A) La colorazione in immunofluorescenza conferma che le MSC isolate esprimono vimentina (rosso, filamenti intermedi di tipo III), filamenti di actina (Alexa fluor 488 Phalloidin Probes) e DAPI (blu, nuclei). Fotomicrografia ottenuta con ingrandimento originale di 20x. Barra della scala = 10 μm. (B) Il saggio di crescita cellulare a breve termine degli SHEDs mostra la loro elevata capacità proliferativa, come osservato dal significativo aumento del numero di cellule in coltura entro il giorno 2 e da un aumento di 14,3 volte del tasso di proliferazione alla fine del giorno 8 (n = 3, valore p<0,01). Sono state mostrate le barre di errore della deviazione standard. (C-E) Il saggio CFU-F e la colorazione Crystal violet confermano la capacità di formare colonie degli SHED; (C) si prevede che si formino più colonie dopo 14 giorni in coltura; (D) singola colonia clonogenica originata da una singola cellula; (E) La singola colonia di SHED, colorata con viola cristallino, mostra la tipica morfologia fibroblastica delle cellule. (F-H) Si prevede che le MSC in condizioni in vitro appropriate subiscano la differenziazione in linee adipogeniche, osteogeniche e condrogeniche entro il giorno 21. La colorazione citochimica mostra (F) Oil Red O (il riquadro mostra un'immagine 40x dell'adipocita che mostra goccioline di olio), (G) von Kossa e (H) Alcian Blue colorazione per i lignaggi adipogenici, osteogenici e condrogenici, rispettivamente, al giorno 22. Le fotomicrografie sono ottenute con un ingrandimento originale di 20x. Barra della scala = 10 μm. Abbreviazioni: MSCs = cellule staminali mesenchimali; DAPI = 4',6-diamidino-2-fenilindolo; SHEDs = cellule staminali da denti decidui esfoliati umani; CFU-F = unità formante colonie-fibroblasto. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figure 2
Figura 2: Controlli negativi utilizzati in un esperimento multiparametrico . (A) I controlli Fluorescenza Meno Uno sono stati visualizzati in forma tabellare, dove i controlli FMO sono stati sostituiti dai loro isotipi specifici. I grafici rappresentativi della densità (da sinistra a destra) mostrano il controllo non colorato (a sinistra), l'FMO di CD90 FITC (al centro) con l'aggiunta di tutti gli anticorpi tranne CD90 FITC insieme all'aggiunta dell'isotipo CD90 FITC e il campione completamente colorato con l'aggiunta di tutti gli anticorpi del pannello (a destra). (B) La sovrapposizione dell'istogramma rappresenta il confronto di tre tipi di campioni, il nero rappresenta l'FMO, il blu rappresenta i campioni non colorati e il rosso rappresenta i campioni completamente colorati nei rispettivi canali. Abbreviazioni: FMO = fluorescenza meno uno; FITC = isotiocianato di fluoresceina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla; PE = ficoeritrina. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figure 3
Figura 3: Immunofenotipizzazione multiparametrica degli SHED (P6). (A) SSC-A versus FSC-A: in base alle loro proprietà di dispersione laterale e diretta, le cellule di interesse sono gated e separate dai detriti; (B) FSC-H contro FSC-A e (C) SSC-H contro SSC-A: i due grafici sono impiegati per la discriminazione del doppietto, che consente la selezione dei singoletti eliminando gli aggregati che possono generare segnali falsi positivi; (D) SSC-A versus CD45 PE: il gating di esclusione consente di selezionare la popolazione di CD45- dai singoletti; (E) CD73 PerCP-Cy5.5 rispetto a CD90 FITC: dai singoletti vivi CD45-, le cellule CD90+CD73+ sono gated; (F) CD44 V450 versus CD105 APC: la popolazione CD90+CD73+, è ulteriormente controllata per definire le cellule CD90+CD73+CD44+CD105+ tetra-positive; (G) SSC-A versus Tempo(i): Il grafico mostra l'acquisizione stabile nel tempo (secondi) e che nessun evento ha causato fluttuazioni di pressione durante l'acquisizione; (H) Gerarchia di gating. Abbreviazioni: SHEDs = cellule staminali da denti decidui esfoliati umani; FITC = isotiocianato di fluoresceina; APC = alloficocianina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla; SSC-A = area di dispersione-picco laterale; FSC-A = area di dispersione diretta-picco; FSC-H = altezza del picco di dispersione in avanti. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figure 4
Figura 4: Selezione a singola cellula di SHED immunofenotipizzati (P12). (A-F) Una strategia di gating basata sull'esclusione passo dopo passo per ordinare le MSC pure nel seguente ordine sequenziale: da cellule a singlets_1, a singlets_2, a cellule vive DAPI, a cellule CD45 non ematopoietiche e infine a cellule CD90+CD73+. Le popolazioni gated mostrate in (F) sono state ordinate utilizzando la modalità di ordinamento a cella singola. (G) Il grafico SSC-A rispetto al tempo (i) descrive lo smistamento ininterrotto dei campioni. (H) Gerarchia di gating. (n=3, Efficienza di ordinamento = 100%). Abbreviazioni: SHEDs = cellule staminali da denti decidui esfoliati umani; MSC = cellule staminali mesenchimali; DAPI = 4',6-diamidino-2-fenilindolo; FITC = isotiocianato di fluoresceina; APC = alloficocianina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla; SSC-A = area di dispersione-picco laterale. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figure 5
Figura 5: Caratterizzazione morfologica e funzionale degli SHED post-selezionati. (A) Le immagini a contrasto di fase delle popolazioni post-selezionate sono state raccolte in una piastra a 96 pozzetti il giorno 6 con un ingrandimento originale di 10x, barra della scala = 10 μm (il riquadro mostra un'immagine 20x che raffigura le singole cellule ordinate che cambiano morfologia in MSC simili a fibroblasti). Colorazione citochimica per la differenziazione adipogenica utilizzando Oil Red O osservata in (B) popolazione post-sorta indifferenziata (controllo) e (C) differenziata post-sort ad un ingrandimento originale di 20x, barra della scala = 10 μm (il riquadro mostra un'immagine 40x che raffigura le goccioline di olio osservate). Abbreviazioni: SHEDs = cellule staminali da denti decidui esfoliati umani. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

File supplementare 1: report di ordinamento compilati generati per esperimento. Fare clic qui per scaricare il file.

Tabella supplementare S1: Configurazione ottica di BD FACSAria Fusion. Abbreviazioni: LP = passaggio lungo; PMT = tubo fotomoltiplicatore; DAPI = 4',6-diamidino-2-fenilindolo; FITC = isotiocianato di fluoresceina; APC = alloficocianina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla. Fare clic qui per scaricare il file.

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Discussion

Nel campo dell'ingegneria tissutale e della medicina rigenerativa, tra le fonti postnatali, le MSC orali derivate da tessuto hanno suscitato un profondo interesse a causa dei loro obblighi etici minimi e del notevole potenziale di differenziazione multilignaggio21. Le cellule staminali della polpa dentale (DPSC) del terzo molare impattato e le SHED hanno attirato la maggior parte dell'attenzione tra le MSC dentali per il loro potenziale terapeutico nelle malattie neurodegenerative e traumatiche22. Il protocollo descritto in questo manoscritto aiuta a caratterizzare gli SHED utilizzando un approccio multiparametrico e a ordinare ulteriormente le popolazioni di interesse utilizzando l'approccio di ordinamento a singola cellula. Tuttavia, l'applicazione di questo protocollo non è limitata solo alle MSC orali, ma può anche essere utilizzata per l'immunofenotipizzazione e lo smistamento delle MSC da altri tessuti di origine nel corpo umano23.

Diversi passaggi critici di questo protocollo devono essere discussi in questa sede per la sua efficace attuazione per il problema biologico affrontato. La chiave di ogni protocollo di selezione è il controllo di due componenti importanti: i controlli biologici e i controlli sperimentali. Per cominciare, la manutenzione pulita della coltura garantisce che il campione utilizzato non venga compromesso durante lo smistamento. La vitalità cellulare nella preselezione in sospensione di una singola cellula deve garantire che si inizi con oltre il 70% di popolazioni di cellule vitali, seguita dall'analisi e dalla cernita delle sottopopolazioni sane. Il tampone colorante utilizzato nella sospensione unicellulare deve contenere il 2% di FBS e gli esperimenti devono essere eseguiti al meglio a temperatura ambiente. La selezione della corretta confluenza di queste cellule primarie (80-85% di confluenza) evita di comprometterne la vitalità cellulare e riduce le possibilità di aggregati di grandi dimensioni. Inoltre, l'uso di un marcatore vivo/morto (DAPI in questo protocollo) è essenziale per ogni esperimento di smistamento. In questo studio, poiché i campioni utilizzati erano MSC con un diametro approssimativo di 20-35 μm, la dimensione dell'ugello scelta è stata di 100 μm per selezionarli a una pressione di 20 psi sulla fusione BD FACSAria. Ciò ha permesso la selezione cellulare senza compromettere la vitalità cellulare durante il processo a una pressione di guaina inferiore. Per informazioni dettagliate sulle condizioni di impostazione dell'ordinamento, si consiglia di fare riferimento alla guida24 del software BD FACSDiva.

Un prerequisito essenziale per gli esperimenti multicolore in citometria a flusso è la necessità di controlli appropriati; ci sono quattro tipi principali di controlli utilizzati qui: autofluorescenza, isotipi, FMO e controlli di compensazione. La matrice di autocompensazione ha permesso una compensazione accurata, prevenendo il bleedthrough spettrale nei rivelatori, e ha utilizzato sia perle di compensazione che celle per questo scopo. Il campione non colorato ha fissato la soglia per l'autofluorescenza delle MSC. Le provette miste con tutti e quattro gli anticorpi includono l'isotipo e gli FMO di ciascun anticorpo utilizzato. Il controllo della compensazione DAPI è stato eseguito utilizzando MSC, che sono stati elaborati separatamente (con shock termico). Il pannello anticorpale (come indicato nella Tabella 8) qui utilizzato è specificamente progettato per le hMSC in base ai criteri indicati dall'ISCT e alla configurazione dello strumento del selezionatore di cellule BD FACSAria Fusion (fare riferimento alla Tabella supplementare S1). Questo è molto importante durante la pianificazione di esperimenti di citometria a flusso multiparametrica. Il pannello di caratterizzazione utilizzato per l'immunofenotipizzazione è costituito da quattro marcatori MSC positivi (CD90, CD105, CD73 e CD44) e un marcatore negativo (CD45). Al contrario, il pannello per l'esperimento di smistamento contiene due marcatori positivi (CD90 e CD73), un marcatore negativo (CD45) e un marcatore vivo/morto (DAPI) per garantire un alto conteggio di MSC vive.

Anticorpo/Marcatore Fluorocromo Profilo di superficie hMSC Lunghezza d'onda del laser (nm) Picco di eccitazione (nm) Picco di emissione (nm)
CD44 V450 Dovrebbe esprimere; >95% 405 405 450
CD90 FITC 488 495 519
CD73 PerCP-Cy5.5 488 488 695
CD105 APC 640 650 660
CD45 PE NON dovrebbe esprimere; <2% 561 566 574
DAPI - Marcatore di cellule morte 405 358 461

Tabella 8: Pannello multicolore progettato per la caratterizzazione e lo smistamento di SHEDs mediante citometria a flusso. Abbreviazioni: FITC = isotiocianato di fluoresceina; APC = alloficocianina; PE = ficoeritrina; PerCP = proteina peridinina-clorofilla.

Selezione della maschera di purezza del tipo
Considerando l'imprevedibilità dell'eterogeneità cellulare nelle MSC, la selezione di massa potrebbe non raggiungere necessariamente il livello di purezza tra le popolazioni selezionate. In questo studio abbiamo ottimizzato il protocollo di selezione a singola cellula per identificare i cloni a singola cellula e tracciare le loro proprietà funzionali dopo la selezione in termini di potenza. Lo smistamento di singole cellule è stato eseguito su una BD FACSAria Fusion, che ha avuto la flessibilità delle seguenti impostazioni: scelta di ugello da 100 μm, pressione della guaina di 20 psi, una portata regolabile (mantenuta a 20 μL/min) e una velocità di soglia a 380 eventi/s. Le possibilità di selezionare due celle bersaglio invece di una sono minime in questo metodo. Normalmente, viene selezionata la modalità di ordinamento a cella singola dell'algoritmo in grado di risolvere l'ordinamento di popolazioni pure di cellule bersaglio e considerare quante gocce verranno smistate nel dispositivo di raccolta scelto. La modalità Precisione deve essere scelta con precisione in modo tale da poter combinare le maschere disponibili negli algoritmi di ordinamento e creare una condizione di ordinamento rigorosa per ordinare le popolazioni di interesse più pure. La modalità di ordinamento a cella singola non compromette una cella target se viene aggregata a una cella non target durante l'ordinamento e ciò raggiunge il livello di purezza che ci aspettiamo in questo approccio. Questo è stato il modulo selezionato in questo protocollo e le cellule ordinate sono state raccolte in dispositivi a piastre da 96, 48 pozzetti, 24 pozzetti e 6 pozzetti.

In questo studio, abbiamo ordinato le sottopopolazioni in base al loro immunofenotipo differenziale, vale a dire CD90 + CD73 + CD45-. Sia nei protocolli di caratterizzazione che in quelli di smistamento, la nostra strategia di gating (come mostrato in Figura 3 e Figura 4) si è basata sull'esclusione del gating dalla popolazione CD45- per darci la popolazione non ematopoietica (in quanto questi sono stati validati e caratterizzati in precedenza con i marcatori prescritti dall'ISCT), dopo l'identificazione dei singoletti. Alla fine, le MSC sono state identificate dalla popolazione CD45- utilizzando i marcatori ISCT positivi. Vale la pena notare qui che non c'è molta differenza in percentuali nel primo gating degli espressiori positivi dei marcatori ISCT seguiti dagli espressiori negativi di CD45. Tuttavia, poiché lo scopo di questo ordinamento è stato quello di identificare le cellule che mostrano un'espressione alterata dei marcatori MSC noti, abbiamo concluso la nostra analisi con i grafici di espressione positiva.

Nelle figure rappresentative il 97% delle cellule CD45- sono MSC, ma durante la quantificazione delle espressioni dell'antigene, abbiamo visto che il 75% delle cellule sono doppiamente positive dei due marcatori CD90 e CD73, mentre ci sono diverse popolazioni che sono espressioni singola-positivi degli stessi marcatori (mostrati in Figura 3F) e poche cellule che non esprimono affatto i marcatori.

Durante la caratterizzazione di queste cellule, abbiamo identificato le sottopopolazioni come MSC tetra-positive, popolazioni triplo positive e doppio-negative. Questa espressione differenziale dei marcatori MSC si espande con l'aumentare dei passaggi e quindi nasce la necessità di studiare e correlare questa differenza con le loro proprietà funzionali. Lo scopo ultimo della selezione delle MSC nel nostro studio è quello di creare un'analisi comparativa tra le sottopopolazioni identificate e determinare se le espressioni differenziali dei marcatori positivi hanno implicazioni funzionali.

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Disclosures

Gli autori dichiarano che non vi è alcun conflitto di interessi per quanto riguarda la pubblicazione di questo articolo.

Acknowledgments

Ringraziamo la Flow Cell Facility del Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research, Bengaluru, India, per l'utilizzo della struttura centrale della citometria a flusso. La crio-sezione della coltura di pellet di cellule differenziate è stata eseguita presso il Neuberg Anand Reference Laboratory, Bengaluru, India. Questo lavoro è stato sostenuto dal finanziamento intramurale dell'UC da parte della Manipal Academy of Higher Education (MAHE), in India. AG è grata per il supporto della borsa di studio Dr. T. M. A. Pai di MAHE.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Alcian Blue Stain HiMedia CCK029-1KT
Antibiotic-Antimycotic (100x)  Gibco by ThermoFisher 15240062
BD CompBead Plus Anti-Mouse Ig, κ/Negative Control (BSA) Compensation Plus (7.5 µm) Particles Set BD Biosciences 560497
BD FACS Accudrop Beads  BD Biosciences 345249 Used to set up the Laser delay when the sort module opens.
BD FACS Aria Fusion Flow cytometer BD Biosciences ---
BD FACS Diva 9.4 BD Biosciences ---
BD FACS Sheath Fluid BD Biosciences 342003 Used as sheath fluid for both analysis and sorting experiments in the BD FACSAria Fusion
BD FACSDiva CS&T Research Beads BD Biosciences 655050 Used for Instrument configuration depending on the nozzle size.
BD Horizon V450 Mouse Anti-Human CD44 BD Biosciences 561292
BD Horizon V450 Mouse IgG2b, κ Isotype Control BD Biosciences 560374 CD44-V450 isotype
BD Pharmingen APC Mouse Anti-Human CD105 BD Biosciences 562408
BD Pharmingen APC Mouse IgG1, κ Isotype Control BD Biosciences 555751 CD105-APC isotype
BD Pharmingen DAPI Solution BD Biosciences 564907 DAPI Stock solution of 1 mg/mL
BD Pharmingen FITC Mouse Anti-Human CD90 BD Biosciences 555595
BD Pharmingen FITC Mouse IgG1, κ Isotype Control BD Biosciences 555748 CD90-FITC isotype
BD Pharmingen PE Mouse Anti-Human CD45 BD Biosciences 555483
BD Pharmingen PE Mouse IgG1, κ Isotype Control BD Biosciences 555749 CD45-PE isotype
BD Pharmingen PerCP-Cy 5.5 Mouse Anti-Human CD73 BD Biosciences 561260
BD Pharmingen PerCP-Cy 5.5 Mouse IgG1, κ Isotype Control BD Biosciences 550795 CD73-PerCP-Cy 5.5 isotype
BD Pharmingen Purified Mouse Anti-Vimentin BD Biosciences 550513
Bovine serum albumin Hi-Media  TC548-5G
Crystal violet Nice chemical pvt ltd  C33809
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline Sigma-aldrich   D5652-50L dPBS used for culture work and maintenance. 
Ethanol  --- --- Used for general sterlization.
Fetal Bovine Serum  Gibco by ThermoFisher  10270-106
Goat anti-Mouse IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 555 ThermoFisher Scientific  A-21422
KO-DMEM Gibco by ThermoFisher  10829018 Basal medium for undifferentiated hESCs, used in the preparation of culture media
L-Glutamine 200mM (100x) Gibco by ThermoFisher 25030-081
Methanol, for Molecular Biology  Hi-Media  MB113
Oil red O HiMedia  CCK013-1KT
Paraformaldehyde  loba chemie 30525-89-4
Penicillin Streptomycin (100x) Gibco by ThermoFisher  15140- 122
Phalloidin (ActinGreen 488 ReadyProbes reagent) Invitrogen  R37110
Silver Nitrate HiMedia  MB156-25G
Sodium Thiosulphate pentahydrate Chemport 10102-17-7
Sphero Rainbow Fluorescent Particles, 3.0 - 3.4 µm BD Biosciences 556291
Staining buffer  Prepared in MIRM  ---- It was prepared using 2% FBS in PBS 
StemPro Adipogenesis Differentiation Basal Media  Gibco by ThermoFisher  A10410-01 Basal media for Adipogenic media
StemPro Adipogenesis Supplement Gibco by ThermoFisher  A10065-01 Induction media for Adipogenic media
StemPro Chondrogenesis Supplement Gibco by ThermoFisher  A10064-01 Induction media for Chondrogenic media
StemPro Osteogenesis Supplement Gibco by ThermoFisher  A10066-01 Induction media for Osteoogenic media
StemPro Osteogenesis/Chondrogenesis Differentiation Basal Media  Gibco by ThermoFisher  A10069-01 Basal media for both Ostegenic and Chondrogenic media
Triton-X-100 Hi-Media  MB031
Trypan Blue  Gibco by life technologies  15250-061
Trypsin - EDTA Solution 1x Hi-media  TCL049
Tween-20  MERCK  9005-64-5

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References

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Gupta, A., Mukhopadhyay, R.,More

Gupta, A., Mukhopadhyay, R., Khandelwal, H., Nala, N., Chakraborty, U. Single-Cell Sorting of Immunophenotyped Mesenchymal Stem Cells from Human Exfoliated Deciduous Teeth. J. Vis. Exp. (201), e65723, doi:10.3791/65723 (2023).

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