Summary
光シートベースの蛍光顕微鏡による昆虫の胚の形態形成を撮像する技術の状態となっています。このプロトコルは、輪郭とモドキTribolium castaneumの胚に適した3つの取り付け技術を比較し、ライブイメージングに適して2つの新規のカスタムメイドのトランスジェニック系統を導入し、本質的な品質管理を説明し、現在の実験の限界を示しています。
Abstract
コクヌストモドキTriboliumののcastaneumは、発生遺伝学と進化の発生生物学における重要な昆虫モデル生物となっています。光シートベースの蛍光顕微鏡とモドキTribolium胚の観察は、従来の広視野および共焦点蛍光顕微鏡を介して複数の利点を有します。光シートベース顕微鏡のユニークな特性のために、生きた標本の3次元画像は、高信号対雑音比で記録することができ、大幅にいくつかの持続期間にわたって光退色ならびに複数の方向に沿って光毒性を減少させ日々。以上の4方法論開発の年とデータの継続的な増加に伴い、時間がモドキTriboliumコミュニティでだけでなく、大規模で昆虫コミュニティに光シートの技術の利用のための標準的な操作手順を確立することが適切と思われます。このプロトコルは、適切なF 3つの取り付け技術を説明しますまたは異なる目的、長期的なライブイメージングに適した2つの新規カスタムメイドトランスジェニックモドキTriboliumラインを提示し、固定胚の細胞内構造を標識するのに5つの蛍光色素を示唆して記録されたデータのタイムリーな評価のためのデータの後処理についての情報を提供します。代表的な結果は、長期ライブイメージング、光学セクショニングおよび複数の方向に沿って同じ胚の観察に集中します。それぞれのデータセットは、ダウンロード資源として提供されています。最後に、プロトコルは、ライブイメージングアッセイ、電流制限および他の昆虫種に概説した手順を適用するための品質管理について説明します。
このプロトコルは、主に標準的な実験設備をアウトパフォームイメージングソリューションを模索発達生物学者を対象としています。これは、開発し、ミクロスを絞り込む技術志向の研究室/コミュニティ間のギャップを埋めるために継続的な試みを促進します方法論的にコピーして、技術的な課題への「プラグ・アンド・プレイのソリューションを必要とする生命科学研究所/コミュニティ。さらに、それは注目の的に生物学的な質問を移動公理的アプローチをサポートしています。
Introduction
darklingのカブトムシ(ゴミムシダマシ科)の大ファミリーに属するコクヌストモドキTriboliumののcastaneumは 、農業と生命科学の中に長い歴史を持っており、果実はキイロショウジョウバエを飛ぶした後、第2最高の研究のモデル昆虫モデル生物です。最後の四十年の間に、それは、様々な理由のための胚の形態形成に、過去20年の間に、進化の発生生物学では、発生遺伝学における強力かつ人気のある昆虫のモデル生物になったと:
ショウジョウバエとモドキTribolium両方がHolometabolaに属しているが、約300万年前に1、2、3、4分岐しました。 ショウジョウバエの胚発生は、一般に、高度に誘導されたとみなされているが、 モドキTriboliumは develのより祖先モードを示します昆虫種5、6、7、8、9のかなり大きい割合で発見されるopment。その口器とアンテナは胚10、11、12、13、14、15の間に既に出現すなわちまず、 モドキTriboliumは 、非インボリュートヘッドの開発を示します。第二に、 モドキTriboliumが短生殖発達の原理に従う、 すなわち、腹部のセグメントがgermband伸び16、17、18、19の間に後部成長ゾーンから連続的に添加されます。第三に、 モドキTriboliumが開発し、後に劣化します2胚体外膜は唯一の腹側に胚をカバー羊膜、および完全に20、21、22胚を包む漿膜を、 すなわち 。両方の膜は、非常に重要な形態形成23と同様に、微生物24、25、乾燥26に対して保護的な役割を果たしています。第四に、胎生開発脚は幼虫のライフステージの間に完全に機能していると蛹変態27、28、29、30、31時の大人の足のための原基としての役割を果たす。
それらの小さなサイズと控えめな要求に、研究室でモドキTriboliumの栽培は非常に簡単です。野生型の培養物(WT)株またはトランスジェニック系統は、典型的には約100~300成人から成り、フルグレイン小麦から成る増殖培地で3〜4センチ高い(約50g充填した1リットルのガラス瓶(フットプリント80センチメートル2))内に維持することができます小麦粉は非アクティブ乾燥酵母を補いました。水の供給は不要です。これは、小規模または中規模の市販の昆虫インキュベーター内甲虫培養物の多数を維持するために小さな研究所を可能にします。 モドキTriboliumの後の発生段階(幼虫後約第四齢、蛹及び成虫)を容易にふるい分けすることにより成長培地から分離されます。同期胚は産卵中に短い期間の成人をインキュベートすることによって得られます。在庫管理は、典型的には22〜25°C(世代あたり約10週間)で行っている間に急速な発展のために、甲虫の培養物を、32°C(世代あたり約4週間)に保たれています。
最後の10年以内に、多くの標準テック新興モデル生物ブック32にまとめたようhniquesは徐々に、 モドキTriboliumに適応され、最適化されています。非常に重要で、このような胚33、幼虫34、35または親36、37 RNA干渉に基づく遺伝子ノックダウン、 のpiggyBac 38、39又はミノス 40トランスポザーゼシステムおよびCRISPR / Cas9ベースゲノムのいずれかと生殖細胞系変換などの高度な遺伝学的方法でありますエンジニアリング41。また、 モドキTriboliumゲノムは、42十年ほど前に配列決定されており、効率的かつゲノムワイドな同定及び遺伝子44の系統的な分析を可能にするゲノムの第三ラウンドアセンブリ43を解放し 、中であります45、46。また、他の4つの鞘翅目の種のゲノムは、比較遺伝的アプローチ47、48、49、50のために用意されています。配列決定ゲノムとの関連では、二つの大規模な遺伝子分析は、挿入突然変異誘発画面51、画面52、53をノックダウン系統的RNA干渉ベースの遺伝子、すなわち 、実行されています。
広視野共焦点または光シートベース顕微鏡(LSFM)と蛍光ライブイメージングは、多次元コンテキスト( 表1)に( すなわち、形態形成)時間の関数としてモドキTriboliumの胚の形態を観察することができます。広視野と共焦点蛍光顕微鏡では、excitエーション発光光が同じ対物レンズを介して導かれます。両方のアプローチにおいて、試料全体がすべて記録された2次元平面のために照射されます。したがって、試料は、非常に高いエネルギーレベルに供されます。 LSFMにおいて、焦点面における唯一のフルオロフォアは、2枚の垂直に配置された対物レンズ( 図1)を用いて照明および検出の分離に励起されます。単一平面照明顕微鏡(SPIM)とデジタル走査されたレーザ光のシートベースの蛍光顕微鏡(DSLM、 図2) - - LSFMは、二つのカノン実装で来て、従来のアプローチに比べていくつかの重要な利点を提供する:(I)固有の光学セクショニング能力(ii)は、良好な距離分解能、(iii)の光退色を強く減少したレベル、(IV)、非常に低い光毒性、(V)高い信号対雑音比、(VI)、比較的高い取得速度、(VII)イメージング複数の方向および(vi沿って低い開口数の照明対物レンズ54、55、56の使用へII)より深い組織浸透。
LSFMはすでに正常ほぼ全胚の形態形成57を文書化すると背側の閉鎖23の先頭に胚体外膜の破裂の原則を分析するためモドキTriboliumに適用されています。一般的にモドキTriboliumコミュニティで昆虫科学のためLSFMの魅力を高めるために、それは標準的な操作手順を確立し、方法、プロトコルおよび顕微鏡は、使いやすさのとなりのレベルにリソースのプールを改善するために非常に重要です発生生物学研究所での標準的なツールを-use、および生物学的な質問は注目の的に滞在。
このプロトコルはモドキTriboliumの基礎から始まります</ em>の栽培、 すなわちメンテナンス、生殖および胚のコレクション。次に、2つの実験戦略が示されている:(I)カスタムメイドのトランスジェニック系統のライブイメージングおよび蛍光色素( 表2)を用いて染色した固定された胚の(ii)のイメージング。その後、わずかに異なる目的を持つ3つの取り付け技術は、( 図3および表3)について詳細に説明する:(I)アガロースカラム、(ii)のアガロース半球および(iii)新規クモの巣ホルダ。プロトコルは、LSFMとデータ取得手順を説明します。イメージングモダリティとキーの考慮事項が概説されています。最後に、胚の検索について説明すると、基本的なデータ処理のための提案が提供されます。代表的な結果で、よりライブイメージングデータを2つの新規カスタムメイドおよびグリアブルー58個のトランスジェニック系が示されており、それぞれの撮像データセットをダウンロード可能なリソースとして提供されます。また、画像蛍光色素の様々な染色された固定胚のデータが提示されています。議論は、品質管理、ライブイメージングアプローチの現在の制限および他の種へのプロトコルの適応に焦点を当てています。
プロトコルは、試料室及び典型的には、直径を有する金属、プラスチックまたはガラス製の円筒状の要素である標準化された試料ホルダ54、59、60、のための回転可能なクランプ機構が装備されている光シートベースの蛍光顕微鏡用に書かれていますミリの範囲です。プロトコルはまた、両方のカノン実装、 すなわち SPIMとDSLM、ならびに二つ以上の照明および検出腕61、62、63とのセットアップのために適しています。代表的な結果は、2つのスペクトル・チャネルのデータを示し、緑色(IL488nmレーザー、50分の525バンドパスフィルタを介して検出)および561 nmレーザーと赤色(照明、70分の607バンドパスフィルタを介して検出)を有する部分の光量が、プロトコルは、3つのまたは4つのスペクトル・チャネルに拡張することができます。
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Protocol
1.畜産モドキTriboliumの文化
注:標準的な条件は、25℃のインキュベーション温度、12時間明/ 12時間暗サイクルにおける相対湿度70%として定義されます。 モドキTriboliumの飼育についての詳細は、それぞれのガイドラインは64利用可能です。このプロトコルは、キログラムの量で調製し、数ヶ月間保存することができる2つの異なる粉ベースのメディアを必要とします。
- 小麦粉と非アクティブ乾燥酵母での作業に先立ち、24時間、-20℃で未開封のパッケージを格納し、それらを室温まで加温してみましょう。この手順は、潜在的な病原体を排除します。
- 不活性な乾燥酵母を選別(w / w)の5%で選別フルグレイン粉を補うことにより、増殖培地を調製し、710μmのメッシュサイズを有するふるいを通して完全粒小麦粉および不活性乾燥酵母を渡します。
- 250&#でふるいを405細かい小麦粉と不活性乾燥酵母を渡します181; Mのメッシュサイズは、次いで、不活性な乾燥酵母を選別(w / w)の5%選別405細かい小麦粉を補うことによって産卵培地を調製します。
- 介して各モドキTribolium文化を渡します とふるい 800μmのメッシュサイズ。残りの増殖培地を捨てます。大きなガラス皿に幼虫、蛹および成人を転送します。
- 何の子孫の文化が存在しない場合は、新しい子孫の文化を確立するために、新たなガラス瓶に約80幼虫および/または蛹を転送します。何の幼虫および/または蛹が存在しない場合は、代わりに約40の大人を取ります。成長培地の50グラムを追加し、標準的な条件下でインキュベートします。
- 撮像培養を確立するために、別の新しいガラス瓶に約300の大人(500~700 mg)を集めます。成長培地の50グラムを追加し、標準的な条件下でインキュベートします。撮像培養は、胚の回収前に新鮮な増殖培地中で少なくとも24時間沈降することを可能にします。
- 映像文化の成長培地を交換し、少なくとも2つずつたち胚のコレクションと一緒に行うことができますEKS、(3.2を参照)。 2〜3ヶ月後、子孫の文化からの新成人によって完全に映像文化を交換してください。
- 非ホモ接合トランスジェニックラインを使用する場合は、非トランスジェニック動物を除去することにより、頻繁に子孫の文化をキュレート。各導入遺伝子は致命的ではない場合、または両方の染色体上に存在する無菌性を引き起こす場合、理想的には、ホモ接合線を生成します。ホモ接合性培養物は、典型的には、より高い平均蛍光レベルを有しており、唯一の遺伝子型が存在するので、全体的な実験条件は、狭いです。
2.顕微鏡のセットアップとキャリブレーション
注: モドキTribolium胚を約600から660ミクロンの前後の長さは約300から330ミクロンの横方向の直径を有しています。最も近代的なCCDカメラは、約9ミリメートル×7ミリメートルのセンサーチップサイズを有する11.4ミクロンの直径、及び6.45ミクロンの画素の画素距離、すなわち 。倍率10倍の対物レンズと組み合わせた場合、胚は0.645ミクロンの画素ピッチとTOTOに撮像することができます。最も近代的なsCMOSカメラは21.3ミクロンの直径、すなわち約16ミリメートル×14mmの大きいセンサチップサイズ、および6.5ミクロンのピクセルのピクセル距離を有します。 20X倍率対物レンズと組み合わせた場合、胚は0.325ミクロンの画素ピッチとTOTOに撮像することができます。
- 顕微鏡照明および検出対物レンズを取り付けます。レーザーと蛍光フィルターは非常によく、フルオロフォアの吸収および発光スペクトルと一致していることを確認してください。
- 顕微鏡にサンプルチャンバを取り付けます。 PBS pH7.4のまたは任意の他の適切な画像化緩衝液と試料室を充填します。
- 上のスイッチや顕微鏡を校正。特注の光シートベースの顕微鏡(より具体的にDSLM実装のため)のための包括的校正ルーチンおよびトラブルシューティングのガイドラインは、PRを公表されていますeviously 65。商用デバイスの場合、非常に慎重に、製造元の指示に従ってください。媒体の試料室を枯渇や楽器だけでなく、試料に大混乱を引き起こす可能性があります誤操作。
トランスジェニックまたはWT胚の3コレクション
- 800μmのメッシュサイズの篩を通してイメージングコロニーを渡します。新しいガラス瓶に大人のカブトムシを収集し、産卵中の10グラムを追加します。光の中で25℃、70%相対湿度で1時間産卵培養物をインキュベートします。
- 周り30~100胚を含有産卵媒体から大人を分離するために800μmのメッシュサイズを有するふるいを通して産卵培養を渡します。新しいガラスボトルに大人を転送し、新鮮な増殖培地の古いまたは50グラムのいずれかを追加します。
- 観察は、均一な胚盤葉期(例えば、データセットDS0002)で開始する必要がある場合、25℃及び70%相対湿度で15時間産卵培地をインキュベートします。 TO germband後退(例えばデータセットのDS0001とDS0003)の先頭から開始、32℃及び70%相対湿度で23時間の胚をインキュベートします。他の発達段階が所望される場合、各文献64、65を参照し、必要に応じて、インキュベーション時間及び/又は温度を適応させます。
4.胚Dechorionation
注:絨毛膜が卵殻の外側の層であり、タンパク質および多糖類から成ります。これは、吸収性を強く光が、適切な開発のためにではないが不可欠であるため、化学的に除去することができます。
- 300μmのメッシュサイズの篩を通して産卵メディアを渡します。 100μmのメッシュサイズのセルストレーナーで胚を収集し、残りの産卵培地を廃棄します。
- 以下のように6ウェルプレートを調製:10mLのPBS pHが7.4と9mLのPBSとB1とB2のウェルとA1、A2、A3とB3井戸を埋めます。その後、慎重に追加B1とB2に1 mLの次亜塩素酸ナトリウム。ステップ実体顕微鏡下で、4.8から4.3までの進捗状況を確認します。注意次亜塩素酸ナトリウムは腐食性があります。
- ウェルA1にセルストレーナーを挿入(PBS pH7.4)で、穏やかに撹拌しながら1分間の胚を洗浄します。大きな小麦粉の粒子は、胚から切り離す必要があります。
- B1ウェル(PBS pH7.4中の次亜塩素酸ナトリウム)にセルストレーナーを移し、30秒間激しくプレートを振ります。残りの小麦粉粒子は、胚から完全に切り離すべきです。
- ウェルA2(PBS pH7.4)中にセルストレーナーを移し、穏やかに撹拌しながら1分間胚を洗浄します。
- dechorionationため、B2ウェル(PBS pH7.4の中に次亜塩素酸ナトリウム)にセルストレーナーを転送します。絨毛膜が破裂するまで激しくプレートを振ると、胚から切り離されます。 dechorionated胚は普通シルエットを有するが絨毛膜は、裂傷エッジを有する薄い、半透明膜のように見えます。
- 転送番目ウェルA3に電子セルストレーナー(PBS pH7.4)で、穏やかに撹拌しながら1分間胚を洗浄します。任意の絨毛膜断片はまだ洗濯後の胚に接続されている場合は、ステップ4.6を繰り返します。
- B3ウェル(PBS液pH7.4)で胚を格納します。数時間の記憶は、胚を傷つけるが、開発が続いていることを心に留めておくことはありません。
- 可能であれば非ホモ接合トランスジェニック系統については、いずれかの非蛍光胚を削除します。 WTまたはトランスジェニック胚の固定および染色のために、ステップ6に進み、トランスジェニック胚のライブイメージングのためにステップ5に進みます。
5.卵黄膜透過処理、固定、染色
注:卵黄膜は、卵殻の内側の層です。これは、蛍光色素のために不浸透性であるため、化学的に染色前に透過処理する必要があります。
- 固定/透過化溶液(1.5mLの4%(PBSのpHは6.9でw / v)のパラホルムアルデヒドとのシンチレーションバイアルを充填ND 1.5mLのn-ヘプタン)。バイアルに絵筆で、胚を転送します。アルミホイルでカバーバイアルを光からフルオロフォアを保護し、毎分50の回転で揺動プラットフォーム上で30分間インキュベートします。注意パラホルムアルデヒドは、毒性及び腐食性、n-ヘプタンは、可燃性及び毒性です。
- 固定液を除去し、胚を3mlに15分間3回、0.1%(v / v)のトリトンX-100を治療PBS pHを7.4にし、続いて一回15分間、3 mL中に1%(v / v)のトリトンX-100で毎分50の回転で、ロッキングプラットフォーム上でPBSのpHは7.4。注意トリトンX-100は、腐食性です。
- 透過処理溶液を除去し、バイアルに0.5mLの染色溶液を加えます。例示的な染色溶液は、 表2に提供されます。毎分50の回転でロッキングプラットフォーム上で4℃で一晩ステイン胚。 表2で提案されている染料のため、洗浄が不要です。
アガロース実装6の調製
- 1グラムの低溶融を追加アガロースを100mLのPBS pH7.4中及び小アガロース粒子が依然として存在する場合、粒子が完全に溶解するまで30秒間隔で加熱処理を繰り返し、800 W.におけるマイクロ波オーブン中で2~3分間混合物を加熱します。上記のように装着アガロースが固化したアガロースは、加熱により再液化することができ、新たに毎回を用意する必要がありません。あまりにも多くの水が蒸発する前に、このプロセスは、5~6回繰り返すことができます。
- 加熱アガロースで2本の1.5mLの反応管に充填し、サーモ中35℃で、これらのチューブを保持し、アガロースは、約40〜45℃まで冷却することを可能にします。
7.胚試料室に取り付け及び挿入
- オプション1:アガロースカラム( 図3A〜Cは、まずカラム;表3、第二カラム)
- 蒸留水で1.0 mLシリンジを記入し、小さなゴム製のホースを用いてガラスキャピラリー開口部の1に取り付けます。蒸留水でキャピラリー途中まで記入してください。
- 絵筆で胚を選択し、他のガラスキャピラリー開口部の内側に配置します。胚が乾燥する前に次のステップに迅速に進みます。
- 液体アガロースに毛細血管を固執し、ゆっくりとキャピラリーに胚と一緒に液体アガロースの数μLを描きます。その後すぐに胚をアガロースと一緒に引きずられるように描画力を高めます。最後に、アガロースの数μLは、胚の上方および下方であるべきです。数分間わき毛細血管を設定し、アガロースが固化しましょう。
- 約5mmの長さにダイヤモンドガラスカッターでキャピラリーを短くしてください。残りの断片は、完全にアガロースで充填されるべきであり、胚は、第四分位内でなければなりません。
- 試料室にピンと鋼製シリンダーを挿入し、ピンの上にキャピラリ断片スティック。アガロースカラムには、数ミリメートルFを突出すべきです胚が含まれている部分と毛細血管の断片をROM。
- オプション2:アガロース半球( 図3A〜C、第二カラム;表3、第3列)
- 底部開口部に半球が形成されるまでアガロースで上から鋼管を埋めるためにそれを使用し、その後、1.0 mLシリンジに液体アガロースの200μLを描きます。半球の直径はパイプの直径に等しくなければなりません。アガロースが固化するまで数分待ちます。
- 絵筆で、胚を選択し、前端がアクセス可能となるようにブラシの先端の上に再配置します。薄膜でそれをカバーするために、液体アガロースにアガロース半球を浸し。
- 直立アガロース半球のポールの上にその前端との胚を置きます。周りのスチールパイプを回してブラシで胚の位置を修正します。必要に応じて、胚/半球の境界にアガロース2μLを添加することによって胚を安定化させます。理想的LY、胚の表面の半分以下は、アガロースで覆われるべきであり、側面は、できるだけ急峻であるべきです。
- ゆっくりと試料室に半球と胚との鋼管を挿入します。
- オプション3:蜘蛛の巣ホルダー( 図3A〜C、3列目;表3、第4列)
- 絵筆を持つ胚を選んで、脇に置きます。
- 、5-8μL液体アガロースでクモの巣ホルダの長穴を覆うだけ薄いアガロース膜が残るまでアガロースの大部分を除去。
- アガロースフィルム上に胚を置き、その位置を調整します。注意深く長穴のx軸中心に胚を移動し、長穴の長軸と、その細長い前後軸を整列させます。
- ゆっくりと試料室に取り付けられた胚とクモの巣ホルダーを挿入します。それは励起と発光と干渉しないようにクモの巣ホルダーを置き光、 すなわち、45°X軸とZ軸に対して。
8.光学シートベースの蛍光顕微鏡
- 胚を撮影する必要がありますどのように多くの方向(および沿って方向)に沿って決定します。 (方向に沿って0°、90°、180°、270°)の四方は、典型的には、カバレッジとエネルギー負荷との間の良好なトレードオフを提供します。
- 蛍光チャネル数を設定します。各チャネルのための主要なパラメータは、レーザー線、蛍光フィルタ、レーザパワーと露光時間です。長期的なライブイメージングのために、統合されたエネルギー負荷が胚の許容値を超えないことが重要です。 μW100〜300のレーザパワーが胚の生存率に影響を与えるべきではないながら、25~50ミリ秒の露光時間は、高速撮像を保証します。固定された試料について、露光時間及びレーザパワーは、少なくとも倍にすることができます。
- ライブイメージングアッセイのために、時間の経過を設定します。コンプモドキTriboliumのLETEの胚発生は32-35°C 64で室温(23±1℃)で約7日間と少し未満3日かかります。観察されるべき形態形成のイベントに応じた時間間隔を定義します。短い時間的間隔については、露光時間及びレーザパワーを(8.2を参照)を下げることを検討してください。
- レーザーに曝すことなく、視野の中心にx軸及びy軸に沿って透過光モードで胚を置き。実装工程中に発生している可能性がいかなる損害について胚を検査するために90°ステップで360°で胚を回転させます。
- 顕微鏡は、z軸と背腹軸、すなわち 、例えば、X軸と横軸を軸と胚軸を整列させるために、y軸の周りに適切に胚を回転させます。蜘蛛の巣ホルダー技術を使用している場合、アライメントができない場合があります。
- 蛍光モードでは、FO Zスタックを定義します各方向Rとなります。目の前の空間バッファとして胚の後ろに25〜50ミクロンを追加します。バッファを含む、典型的なZスタックはモドキTribolium胚の周り350-400ミクロンをカバーします。また、4倍の横方向の間隔であるべきであるZ-間隔を定義するx軸に沿って間隔をIEと66を Y軸。
- 二つ以上の胚が並行して画像化されている場合は、次の胚と8.4で再起動してください。
- 長期イメージングのために、サンプルチャンバが十分なPBS pH7.4のまたは他の画像化緩衝液で満たされていることを確認。また、試料室の開口部を覆います。
- イメージング処理を開始します。長期的なライブイメージングのために、すべての胚のために、すべてのチャネルですべての方向に沿って正しい取得を監視します。時折胚が生きているし、適切な位置にあることを、次の日の間にご確認ください。
9.胚の検索と品質管理
- イメージングが完了したら、と試料ホルダーを削除試料室からの胚。ライブイメージングアッセイからの胚のみが取得する必要があります。固定および染色された胚を破棄することができます。
- ライブイメージングアッセイを行った場合、オブジェクトのスライドに胚を移します。アガロースカラム技術のために、外科用メス、マイクロナイフ又はかみそりの刃でアガロース周囲から胚を取り出します。アガロース半球技術ため、オブジェクトスライドに平坦な側面と半球を移します。胚の除去は必要ありません。クモの巣ホルダ技術のために、穏やかに絵筆を有するアガロース膜から胚を取り外します。幼虫が孵化するまで、標準的な条件下で、飽和湿度雰囲気中で小さなガラス皿中のオブジェクトスライドをインキュベートします。
- 孵化後、24ウェルプレートの個々のウェルに幼虫を移し、各ウェルに増殖培地の500 mgの追加。標準的な条件下でインキュベートします。非画像WTおよびトランスジェニックlarvに結像幼虫の総開発時間と形態を比較AE(議論を参照)。 WTの開発を特徴づけるアッセイでは、明らかな形態学的な収差は、理想的には目立ってはなりません。
- 幼虫たら、健康な成人に開発し、同じバックグラウンド系統の適切なWTパートナーとそれらを提供します。 2週間後、子孫の生産のために確認してください。また、インターParesにおけるそれらを交配して子孫の繁殖力を確認することを検討してください。画像形成された胚は肥沃な子孫を生み出す肥沃な大人に成長したときのみ、画像化手順は、非侵襲的とみなすことができます。
10.画像データ処理
注:画像データ処理のために、オープンソースの画像処理ソフトウェアImageJの67またはその誘導体のFIJI 68が推奨されています。どちらのバージョンだけでなく、包括的なドキュメントがwww.imagej.netで発見されています。 LSFMデータのための標準的なファイルフォーマットは、タグ付き画像ファイル形式(TIFF)です。固有のコンテナオプションは、STOを可能に例えば、Zスタックまたはドラッグアンドドロップを介して、ImageJの又はフィジー開くことができる単一のファイル内のz最大突起の時系列として画像スタックの怒り。
- 必要に応じて、y軸(イメージ→変換→回転)と胚の前後軸を整列させるために、Zスタックを回転させます。回転パラメータがなく、時間の経過と蛍光チャンネルについて、各方向ごとに個別に設定する必要がありますのでご注意ください。
- 沿って、Zスタックをトリミング最小限背景ようにx軸、y軸およびz軸(20 - x軸及びy軸に沿って40ピクセル、5 - z軸に沿った10面)はxに対して(まま - とy軸、長方形選択ツール、トリミング→次にイメージを使用;スライスキーパー→スタック→ツール)→Z軸用画像のために。トリミングパラメータが各方向にではなく時点と蛍光チャンネルごとに個別に設定する必要がありますのでご注意ください。
- 各ZスタックのためのZ最大投影を計算します(画像→スタック→Zプロジェクト、最大強度を選択してください)。強度投影計算は一つの空間次元を削除データ簡略化の手順です。
- 長期ライブイメージングデータのために、処理は10.1すべての方向、全ての時点および全ての蛍光チャネル65 10.3〜ステップ実行ImageJのまたはフィジーのスクリプトの使用を検討してください。理想的には、チャネルおよび方向ごとのすべてのzの最大突起を連結一つTIFF容器内の時系列として保存。あるいは、フィジーためBigDataViewer 69プラグインは、テラバイト、大規模なデータセットをナビゲートするために使用することができます。
- トランスジェニック系統及び撮像モダリティに応じて、時間スタックの動的強度の調整が原因光退色および/またはフルオロフォア発現変動に望ましいかもしれません。 ImageJ-またはFIJI-固有のブリーチ補正機能のいずれか(画像→ヒストグラムマッチング選択し、→ブリーチ補正を調整します)、またはdedicaテッドソフト65が提案されています。
- 胚が(イメージ→カラー→チャンネルをマージ)、及び/又は複数の方向に沿って複数の蛍光チャネルに方向(画像スタック→→ツール→は結合)とチャネルマージの水平方向の組み合わせを記録した場合に推奨されています。
- 登録し、最終的にデコンボリューション71との組み合わせで、複数の方向70に沿って取得した、Zスタックの融合は、均一な品質及び等方性解像度の優れた三次元画像の計算を可能にします。両方のプラグインは、オープンソースとフィジーのプリインストールされているが、それらは、試料の周りのランドマーク(蛍光微小球、 例えばビーズ )の存在を必要とします。
- 大規模な定量的データ抽出及び分析のためのオープンソースのソフトウェアフレームワークは、細胞核72又はCELのセグメント化および追跡のための、例えば、も利用可能ですL形状認識73。
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Representative Results
このプロトコルは、生活の蛍光イメージング又はLSFMで固定し、染色しモドキTribolium胚の実験の枠組みを記載しています。光退色及び光毒性の低いレベルに、その光学切片機能の直接の結果は、LSFMは長期的なライブイメージングのために特に適しています。
新規AGOC {ATub'H2B-mEmerald}#1トランスジェニックラインは、α-チューブリン1プロモーター74の制御下histone2B-mEmerald融合タンパク質を発現します。蛍光シグナルは、主に漿膜、卵黄嚢およびいくつかの神経細胞塊から得られるので、それは、エンハンサートラップのような発現パターン51を示しています。この行を使用して、室温(23±1℃)で、胚発生の66時間はgermband引込み及び背側閉鎖(補足映画1)を覆う、記録しました。このラインヘッド付属( 図4A)及び背側閉鎖( 図4B)中漿膜移行の動力学内のニューロンのクラスタを可視化するために使用することができます。新規AGOC {ATub'H2B-mEmerald}#4行が#4のラインと同じ導入遺伝子を運ぶが、異なるゲノム位置で。これは明らかエンハンサートラップのパターンを示していないが、このプロモーター74のために前述したように蛍光シグナルが時空遍在検出可能です。このラインは、二つの深さレベル( 図4C)での光学セクショニング能力を実証するために伸びgermbandする原腸形成の遷移で画像化しました。別の特徴は、特にライブイメージングのために、発生生物学で使用LSFMセットアップのための規格である試料回転を介して複数の方向に沿って、Zスタックの取得です。グリアブルー58行において、例えば、サンプルの回転のすべて腹側神経索に沿って周りのグリア細胞の再編成、ならびに、同じ胚( 図4D、 補足動画2)において、背側部位から適切に見ることができ、左側頭葉における増殖動態の観察OWS。ダウンロード可能なリソース、メタおよびアクセス情報は、 補足表1に発見されたとして、この研究に関連したライブイメージングデータセットが用意されています。
ライブイメージングのためのトランスジェニック系統の選択はまだ限られているので、小型の蛍光色素は、特に細胞内構造を標識するために使用することができます。 SYTOXグリーン核細胞に結合し、YOYO-1、BOBO-3ヨウ化物は、核エンベロープに結合した( 図5A)は、それぞれ、緑色または赤色チャネルで可視化することができるが、緑色チャネルで可視化することができますこれらの染料は、特定の胚性構造体を強調するために使用することができますこのような漿膜瘢痕( 図5B、最初の列)、後方腹漿膜細胞( 図5B、第二カラム)又は漿膜窓閉鎖時に現れる漿膜-羊膜germband組織三層としてURES、( 図5B、第第5列)。デュアルカラー染色は一緒にアレクサフルオロ共役ファロイジン染料で染色することができるアクチン細胞骨格と同じ胚内の2つの細胞内構造、例えば核エンベロープの可視化を可能にします。 BOBO-3ファロイジン488( 図5D)と組み合わせることができるが、例えば、YOYO-1ヨウ化物は、ファロイジン546( 図5C)と組み合わせることができます。
固定手順が固有fluorescencを消光するので、既に特定の蛍光タンパク質を発現するトランスジェニック胚を固定し、染色することも便利ですE信号のみわずか。アクチン細胞骨格は、赤チャンネル( 図6に見えるようになるように、例えば、核が緑色チャネルで検出されたAGOC {ATub'H2B-mEmerald}#4のトランスジェニックライン、から胚を、ファロイジン546で染色することができます)。
図1: 従来の広視野の比較、共焦点レーザー走査及び光学シートベースの蛍光顕微鏡。従来の広視野落射蛍光顕微鏡は、適切なフィルタ又は光源として発光ダイオードを高出力光とキセノン/水銀蒸気ランプを使用します。取得した各二次元画像のために、全体の試料は、非回折限界光円錐で照明されます。共焦点レーザー走査型蛍光顕微鏡では、回折限界ガウシアンレーザビームは、サウスカロライナ試料と蛍光介しannedインコヒーレントポイントごとに検出されます。同様に、従来の広視野落射蛍光顕微鏡に、試料全体が取得した各二次元画像のために照射されます。光シートベースの蛍光顕微鏡では、回折限界ガウシアンレーザビームは、検出軸に対して垂直に試料を照明します。蛍光は、平面面によって、またはライン・バイ・ラインのいずれかで検出されます。 2次元画像の取得中に、検出対物レンズの焦点面を中心にわずかな体積は、励起光の影響を受けます。試料の残りの量は、光毒性影響を受けない、外の焦点ぼかしに寄与しない、点灯していないとによる光退色に蛍光団を失うことはありません。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
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図2: 光学シートベースの蛍光顕微鏡の原理。 LSFMにおいて、照明および検出は、少なくとも2つの光路に分割されます。少なくとも1本の検出アームが蛍光シグナル(緑色)の並列検出のための適切なフィルターとカメラを装備している間に少なくとも1本の照明アームは、光シート(シアン)を生成するために使用されます。 LSFMは、二つのカノンの実装は、単一の(または選択)平面照明顕微鏡(青色の背景)とデジタル走査されたレーザ光シート顕微鏡(赤色バックグラウンド)を有しています。試料と相互に光シートを相対的に移動させることにより、三次元画像が取得されます。複数の方向に沿って情報を優先的に重力に沿って配向され、y軸の周りに試料を回転させることによって回収されます。ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55629/55629fig2large.jpg」ターゲット= 『_空白』>この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図3: ライトシートベースの蛍光顕微鏡で モドキTribolium の胚発生のレコーディングに使用された3つの異なる取付テクニック 。 (A)アガロースカラムは、胚をガラスキャピラリーから、埋め込まれたアガロースカラムを押す小さなピンとスチールシリンダーを指します。アガロース半球は、鋼管に取り付けられています。胚を、アガロース少量の半球のポールに取り付けられています。クモの巣ホルダは、鋼製シリンダーの上部に取り付けられた長穴を有する金属のシートです。胚は、Tにまたがる薄いアガロース膜に接着されます彼は穴をスロット。光シート顕微鏡内の3つの取り付け技術の(B)スキーム。 (C)DSLM内で適用3つの取り付け技術。 (D)は、3つの実装技術を用いて記録グリアブルートランスジェニック系統の胚からの代表的な画像。 germband後退の開始時にある胚を、透過光像と一致するように、上部に向かって配向し、その後端部で示されています。 FM、蛍光モード; ZA、強度調整とZ最大投影。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図4: モドキTribolium 胚 のライブイメージング 。 (A <背側閉鎖へgermband後退からの遷移でAGOC {ATub'H2B-mEmerald}#1行の胚)> /強いです。この行は、エンハンサートラップ発現パターンを示します。蛍光シグナルは、主に漿膜、卵黄嚢および少数の神経細胞クラスターに見出されます。胚は5時間の間隔で、15時間の期間にわたって示されています。詳細画像は、ヘッド付属のセルクラスタを示しています。最初に、クラスタが依然として漿膜細胞(最初の列)で覆われている、漿膜破裂の際、細胞は、ヘッドの回転運動に伴って追従します。 (B)0時30分時間の間隔で1:30時間背閉鎖時に示された同じ胚。詳細画像は卵黄嚢を超える破裂漿膜の移行を示しています。 (C)上段:伸びgermbandする原腸形成の遷移におけるAGOC {ATub'H2B-mEmerald}#4ラインの胚。中央下段:単一平面が1:30の間隔で10:30時間の期間にわたって2つの深さに示します。時間。 (D)7:30時間の間隔で50:30時間の期間にわたって示さgermband後退時グリア青い線の胚。詳細画像は、左側頭葉におけるグリア細胞の形態形成の再編成を示しています。 ZA、強度調整とZ最大投影。強度調整とPA単一の平面。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図5: 固定、染色、およびGermband伸長時WT胚のIimaging。 すなわち、いずれかSYTOXグリーンで染色された(A)胚、ファジー核染色、またはYOYO-1ヨウ化物又はBOBO-3ヨウ化物、 すなわち 2つの核エンベロープ染色。 (B)YOYO-1ヨウ化物染色エンブリーO。詳細には、漿膜瘢痕(最初の列)、大後方腹漿膜細胞の核膜(第二カラム)又は漿膜の三層組織組織、羊膜および(第5列)が実際の胚組織を示します。ファロイジン488とBOBO-3ヨウ化YOYO-1ヨウ化ファロイジン546(D)デュアルカラー染色(C)デュアルカラー染色。 ZA、強度調整とZ最大投影。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図6:AGOC {ATub 'H2B-mEmerald}#1回線 から固定および染色したトランスジェニック胚の写真 。このトランスジェニック系統はmEmeraldラベルを表現します全胚発生を通して遍在核/クロマチンマークアルファチューブリン1プロモーターの制御下ED histone2B(H2B)。胚はさらに、アクチン細胞骨格/ F-アクチンを標識アレクサフルオロ546ファロイジンで染色しました。 ZA、強度調整とZ最大投影。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
基準 | 蛍光顕微鏡の種類 | ||
従来の広い視野 | 共焦点レーザー走査 | 光シートベース | |
対物レンズのセットアップ | 1枚の対物レンズ、中 - 高NA | 2枚の垂直方向に配置された対物レンズ、照明:低NA、検出:高NA | |
照明光源 | 白色光源と適切なフィルタ( 例えば 、水銀ショートアークランプ) またはクリーンアップフィルタとLEDベース | クリーンアップフィルター付きレーザー ( 例えばダイオードまたはDPPSレーザー) | クリーンアップフィルター付きレーザー ( 例えばダイオードまたはDPPSレーザー) |
二次元画像ごとに照明 | サンプル全体 | サンプル全体 (典型的には、二次元のガウスビームスキャン) | のみ焦点面 (DSLM:一次元のガウスビームスキャン) |
検出 | 平行 (典型的にはCCDまたはsCMOSカメラ) | シーケンシャル (光電子増倍管) | 平行 (典型的にはCCDまたはSCMOSカメラ) |
画像形成速度 | (画像あたりのミリ秒)の高速 | スロー(画像あたりの秒数) | (画像あたりのミリ秒)の高速 |
アウトオブ焦点蛍光 | 差別しません | ピンホールによってほぼ完全に遮断され (拒絶効率は直径に依存します) | ほとんど存在しません (唯一の散乱による) |
空間次元 | 2 (X / Y) | 3 (X / Y / Z) | 3 (X / Y / Z) |
さらなる自由度 | 2 (時間、蛍光チャネル) | 2 (時間、蛍光チャネル) | 3 (時間、蛍光チャンネル方向) |
横方向の解像度 | R (0.6λ/ NA) | 0.66 R (0.4λ/ NA) | R (0.6λ/ NA) |
光学切片機能 | ノー | はい (検出経路における差別) | はい (照明経路75の判別) |
可用性と価格 | 主に商業用、低コスト | 主に、商業、高価 | 商用、高価 特注、適度54,59,60,75 |
モドキTribolium胚をカバーするライブイメージングの出版物 | 6 44,76,77,78,79,80 | 7 23,77,79,81,82,81 (スピンディスク共焦点)83,84,85 | 4 23,57,65,86 |
表1 - 蛍光を発するの特徴モドキTribolium ライブイメージングで使用NCE顕微鏡技術。
染料 | 染色 | 希釈 |
SYTOXグリーン | 核(ファジー) | 1 10,000(1:のddH 2 Oで100と1:1%で100(PBS中w / v)のBSA) |
YOYO-1ヨウ化物 | 核エンベロープ | 1 10,000(1:のddH 2 Oで100と1:1%で100(PBS中w / v)のBSA) |
BOBO-3ヨウ化物 | 核エンベロープ | 1 10,000(1:のddH 2 Oで100と1:1%で100(PBS中w / v)のBSA) |
アレクサフルオロ488ファロイジン | アクチン細胞骨格 | 1:100(PBS中1%(w / v)のBSA) |
アレクサフルオロ546ファロイジン | アクチン細胞骨格 |
表2 - 染色ソリューション。
アガロースカラム (オプション1) | 半球 (オプション2) | 蜘蛛の巣ホルダー (オプション3) | |
根拠 | 胚は、毛細管から押し出されるアガロースカラムに埋め込まれています | 胚の後方端部は、アガロース半球の極に接着されます | 胚は長穴にまたがる薄いアガロース膜に接着されます |
試料ホルダー | ピンとスチールシリンダー | 鋼管 | とスチールシリンダー 長穴 |
無制限(任意の) | 無制限(任意の) | 4(0°、90°、180°、270°) | |
必要なスキルレベル | 適度 | 高い | 低いです |
胚の周りのアガロース | 高い | 低いです | 適度 |
セッションあたりの胚の数 | 最大3つ | 1 | 最大6つ |
胚検索 | トリッキー | イージー | イージー |
使い捨て機器 | ガラスキャピラリー | - | - |
推奨 | 短期的なライブイメージング、染色した胚 | 長期のライブイメージング | 長期的なライブイメージング、染色した胚 |
<強い>参照 | 3 23,87,88 | 2 57,65 | この出版物 |
表3 - 取付方法のメリットとデメリット。
収差の表現型の誘導 | 根拠 | ステップ | 参照(方法論) |
胚RNA干渉 | 二本鎖RNAをノックダウンするために、1つ以上の特定の遺伝子を合胞体胚盤葉段階の胚に注入されます | ステップ4.8の後に胚を注入。 | 2 33,81 |
親RNA干渉 | 二本鎖RNAは、FEMAに横方向に注入されます子孫における遺伝子ノックダウンにつながる腹部のセグメント3と4との間ル蛹、 | ステップ1.5から蛹を取ります。 | 2 36,37 |
劣性胚致死変異株 | 劣性胚致死変異ヘテロ接合収率は約25%のホモ接合体変異子孫を運ぶ産卵の文化 | ステップ1.5の間に撮像ラインに変異ラインを横切ります。 | 3 39,51,89 |
外的要因の応用 | 特定の生物活性または毒性因子は外因的撮像バッファに追加することによって胚に適用されます | ステップ2.2の間、撮像バッファに因子を追加します。 | 2 83,85 |
表4 - 収差の表現型のLSFMライブイメージング
補足表1 - 長期ライブイメージングデータセットDS0001-0003のメタデータとパラメータ。 ファイルをダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
補足作品1 - AGOC {ATub'H2B-mEmerald}#1トランスジェニック系統から モドキTribolium 胚 のライブイメージング 。
この行は、エンハンサートラップ発現パターンを示します。蛍光シグナルは、主に漿膜、卵黄嚢および神経細胞のサブセットに見出されます。胚は、時点間の0:30時間の間隔で66:00時間に0:00時間から4つの方向に沿って示されています。映画はgermband後退の初めに開始され、背側の閉鎖が完了すると終了します。フレームレートは毎秒5つのフレームです。 ZA、強度調整とZ最大投影。 ファイルをダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
補足作品2 - グリア-青トランスジェニック系統から モドキTribolium 胚 のライブイメージング 。
胚は、時点間の0:30時間の間隔で66:00時間に0:00時間から4つの方向に沿って示されています。映画はgermband後退の初めに開始され、背側の閉鎖が完了すると終了します。フレームレートは毎秒5つのフレームです。 ZA、強度調整とZ最大投影。 ファイルをダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
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Discussion
品質管理
ライブイメージングアッセイでは、準備と記録手順は、非侵襲的でなければならない、 すなわち観察中(コレクション、dechorionation、サンプルホルダーに取り付け)も統合されたエネルギー負荷を処理する機械的および化学的でもないが、試料の生存率に影響を与える必要があります。 WTの開発を特徴づける研究のために、それは胚が正常に取得され、記録処理を存続し、健康な成人に発展した実験からのみ利用データに推奨されます。大人は肥沃である必要があり、任意の形態学的収差を示してはならないし、その子孫も肥沃でなければなりません。特に長期のライブイメージングアッセイで生存率が低い、のための3つの主要な理由があります。
まず、胚の表面は、おそらくイオンとガス交換を妨げ、胚mechanを収縮ステップ7中アガロースで広範囲に覆われましたICALLY。影響を受けた胚は、初期胚発生中に画像化する場合は特に、一般的に、数時間のために目立たない開発突然逮捕し、迅速に蛍光シグナルを失います。クモの巣ホルダ技術では、表面のせいぜい半分は非常に薄いアガロース層によって覆われているいくつかの経験と、半球の技術を用いて、アガロース中に埋め込まれている面画分は、三分の一以下に維持することができます。第二に、胚に適用される総合エネルギー負荷が許容範囲を超えています。ステップ8.2に示す値は、経験則として機能しますが、以下の基準を考慮すべきである:(I)初期胚発生中の胚が遅く胚発生時のレーザー照射だけでなく、胚を我慢していないこと、(ii)統合されたエネルギーが、下の露光時間以上の時間間隔のいずれかでの負荷は同じかもしれないが、高いレーザーパワーが高い露光時間又はより短い時間的間隔で低レーザパワーよりもストレスのように見えます、(III)より高い波長は、典型的には、より良好な耐容性であり、フルオロフォア発現強度はレーザ照射公差に反比例するように思われるのに対し、(iv)のトランスジェニック系統のために、許容限界は、ライン固有であるように見えます。さらに、融合タンパク質および/または細胞内局在のデザインも役割を果たしています。第三に、胚は、実装工程中に破損しています。ここで最も重要な要因は、次亜塩素酸ナトリウム溶液中でのインキュベーション時間が完全に絨毛膜を除去することが必要と短いということです。より長いインキュベーション時間は、胚を傷つける可能性があります。ケアはまた、穿刺又は圧搾胚をブラシで、周囲温度でアガロース実装を維持しないように注意すべきです。実際のイメージング処理が始まる前に、破損した胚は、実行可能なものと交換することができるように破損した胚は、ステップ8.4の間に識別することができます。
これらのガイドラインに従うことで、一般的にエンブリーの85から90パーセントの周りにOSは、ライブイメージング手順とハッチを生き残ります。孵化した胚の約90%が健康で豊かな大人に成長します。生存率は、温度を撮像し、(アガロースカラムがない半日以上の撮像期間に使用される場合)技術を実装から独立であるように見えるが、わずかにレーザ放射照度レベルの上昇に伴って減少します。追加の対照として、特に蛍光ライブイメージング又は包括的な実験シーケンスのための前駆体としての位相を確立するためのフレームワークカスタムメイドトランスジェニック系統の初期特性の間には、撮像されたと平行に非画像WTおよびトランスジェニック胚を実行することをお勧めします撮像された胚と同じ温度でインキュベートし、それらの開発時間及び形態65を比較している胚を、。
また、ライブイメージングを介して収差の表現型( 表4)を特徴付ける研究は、非罹患Cを実行しなければなりません並列にontrol胚。可能な限り類似の両方の胚の治療を維持することをお勧めしますが、これは各実験戦略のために、個別に考慮しなければならないされています。
ノックダウンRNA干渉を介し。
胚RNA干渉33、81のために、同じ産卵培養に由来胚のいずれかの機能的または制御する二本鎖RNAを注入しなければなりません。異なる注入した胚は、次いでアガロースカラムまたはクモの巣ホルダ技術のいずれかを使用して同じLSFMに同時に撮像されるべきです。親RNA干渉36、37、撮像培養は、二つの継代培養に分割しなければなりません。他のサブカルチャーを制御する二本鎖RNAを注入しなければならない、一方のサブカルチャーの雌蛹は、機能的な二本鎖RNAを注入しなければなりません。胚高専ectionは並列に実行されるべきであり、実験及び対照胚の両方がアガロースカラムまたはクモの巣ホルダー技術を使用して、同じ顕微鏡で同時に撮像することができます。
劣性胚致死変異株。
通常表現型目立たない劣性胚性致死変異体39、89、91、92、93、ヘテロ接合変異体の産卵培養での作業、収率理論的に25%のホモ接合性変異体子孫(時にはより少ないによる実用的な取り扱い89を発行します)そして表現型目立た子孫(50%のヘテロ接合性突然変異体および25%WTS)の75%。このような産卵培養物から、いくつかの胚をマウントする蜘蛛の巣ホルダー技術を使用することをお勧めします。ホモ接合変異体はIすることができ正常に発達した胚を対照とする一方で、表現型の現れでイメージングの過程を通じてdentified。イメージングおよび品質管理が完了したら、撮像された標本の遺伝子型を決定することができます。
外的要因の応用。
撮像バッファ83、85、 例えば同じLSFMに制御胚と共に生理活性または毒性物質、開発が検討されている上に、パラレルイメージング内の外部要因の影響は、典型的には可能ではない場合。したがって、撮像が順次実行されなければなりません。最適には、その後の実験の間の時間が最小化され、胚は同一の撮像培養物に由来します。あるいは、2つの同一に構成及び動作LSFMsを使用することができます。この場合、同じ産卵期から胚を使用する必要がありますが、それは目のことを非常に重要です結像特性が同等になるように、両方の顕微鏡の電子較正は注意深く行われます。クモの巣ホルダー技術を用いて、各条件のための複数の胚を一度に撮像することができます。アガロースカラムの技術では、外因性因子は胚に到達妨げられるかもしれません。
LSFMライブイメージングのアプローチの現在の制限
LSFMは、複数の幅広いスケールの次元で非侵襲的に胚の形態形成を分析するための強力なツールです。標準的な操作手順は、このプロトコルで提案されているように、発生生物学における標準ツールとして光シート技術を確立するためのプロセスをサポートします。しかし、アプローチは、多様な実験及び組織レベルでいくつかの要因によって制限されます。
当初、LSFMは、一度に一つの試料を分析するために開発されました。同じ顕微鏡Bの画像を同時に二つ以上の胚すべての現在のアプローチのみある程度アガロースカラムにy軸に沿った標本またはクモの巣ホルダアドレスこの問題を「積み重ねる」Y。マルチウェルプレート-およびカバースリップベースセットアップは94、95、96入手可能です。しかし、彼らは画質低下に苦しむと、このような複数の方向に沿って画像としてLSFMから必要不可欠な利益の一部を犠牲に。現在、最良のオプションは、レーザーのような高価な成分は、60を共有している場合、合理的に可能となる、並列に複数の顕微鏡で動作するようになります。
EFA-nGFP 57、65、84、FNL 86、聡明58、86、AGOC {ATub'H2B-mEmerald}#1、AGOC {ATub'H2B-mEmerald}#4およびグリア青と=「外部参照」> 58、長期的なライブイメージングに適した唯一の6カスタムメイドトランスジェニック系統は、現在利用可能です。また、HC079(羊膜)は、G12424(漿膜)およびG04609(心臓)エンハンサートラップライン51は LSFM 23と特徴づけられています。あるいは、蛍光胚はまた、mRNA 81によって生成または注入79を染色することができ、これらのアプローチは比較的単純であるが、制限86から受けます。さらにいくつかの規格はまだそのようなcytoskeletal-、特定の器官または組織のみを観察するために特定の非ユビキタスプロモーターの下でのフルオロフォアを発現organelle-、膜標識線または線として必要とされます。理想的には、これらの行は、異なる蛍光タンパク質でも利用可能です。
もう一つの課題は、LSFMによって生成されたデータ量です。 3つの空間次元と少なくとも三つのFUの情報の取得自由(時間、方向、蛍光チャネル)のrther度は、ライブイメージングデータセットのサイズは、簡単に数テラバイトに多くのギガバイトに達することができます。でも、3次元トリミングやTIFFコンテナのZIPベースの圧縮後、この研究に関連した3つの例示的なデータセットは、31.6、12.6および45.1ギガバイト、 すなわち 、合計89.3ギガバイトの大きさを持っています。 LSFMで作業するときは、データストレージおよび処理88、97のそれぞれのインフラを持っていることが必要です。
最高の画質は、胚の表面で得られるが、深さの増加に伴って、蛍光シグナルは、より多くのぼやけとなります。例えば、germbandの後方端部は原腸形成中に卵黄嚢倍で覆われてしまうと適切に解決することはできない( 図4C、第5列目まで)。複数の方向に沿ってイメージングは、少なくとも部分的にこの問題を解決しますially - すべての胚の周囲の表面からの高品質の情報が利用可能であるが、内側領域がファジー残ります。現在のところ、満足のいく解決策が用意されていませんが、長い目で見れば、赤外蛍光タンパク質98に、補償光学との遺伝的アプローチ99や顕微鏡のセットアップ100は、考えることができます。
他の種のための適応
今では、果実は、 キイロショウジョウバエ 61、62、101をフライすなわち LSFMが3昆虫種の胚発生を文書化するために使用されている、102とコクヌストモドキのモドキTribolium castaneumの 57 abdita Megaseliaフライ断念。実験的フレームワーク、ここでshoul記載されている標準的な操作手順と実装技術他の昆虫種に容易に適応をd。種々の順序に属する多くの昆虫のための生殖細胞形質転換プロトコルは、ミツバチ104、いくつかの鱗翅目105、106又は複数の蚊の種107、108、109のような経済的および/または医学的に重要な種を含む、103入手可能です。蛍光ライブイメージングに適した各トランスジェニック系統と、昆虫の胚の形態形成は、それらの進化の系統および/またはニッチを考慮して特徴づけることができます。約百万昆虫種が記載されており、さらに2000万昆虫種が最も可能性の高い進化2の400以上の万年をカバーし、110を存在します。唯一の比較アプローチは、そのターンの専らの情報が生成されます。唯一の単一の種の発達原則を研究することによって得ることができないデ洞察。
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Disclosures
著者は、開示することは何もありません。
著者の貢献
FSとEHKSは、研究を考案しました。 FSは、トランスジェニックAGOCラインを生成しました。光シートベースの蛍光イメージングは、FS及びSKによって行いました。 FSとEHKSはSKからの入力で原稿を書きました。
Acknowledgments
私たちは、技術サポートのためのスヴェン・プラス感謝します。グリア青いトランスジェニックラインは、グレゴール・ブッチャー(ゲッティンゲン、ドイツ)から寄贈されました。研究は、ゲーテのBuchmann分子生命科学研究所(BMLS、ディレクターエンリコ・シュリーフ)でEHKSに一部付与された高分子複合体(CEF-MC、EXC 115、スピーカーボルカー・ドッツチ)用のメイン午前優秀フランクフルトのクラスタによって賄われていました理学部フランクフルトはドイツForschungsgemeinschaft(DFG)によってメインです。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
full grain wheat flour | Demeter e.V. | 1.13E+08 | US: whole wheat flour, UK: whole meal flour |
405 fine wheat flour | Demeter e.V. | 1.13E+08 | US: pastry flour, UK: soft flour |
inactive dry yeast | Flystuff / Genesee Scientific | 62-106 | |
Phosphate-buffered Saine (PBS), pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 10010-023 | |
sodium hypochlorite, ~12% active Cl | Sigma Aldrich | 425044-250ML | Caution: sodium hypochlorite is corrosive |
low-melting agarose | Carl Roth | 6351.2 | |
6-well plate | Orange Scientific | 4430500 | |
24-well plate | Orange Scientific | 4430300 | |
glass capillaries, internal Ø 0.46 mm | Brand GmbH + Co KG | 7087 09 | |
SYTOX Green | Thermo Fisher Scientific | 57020 | Staining solution preparation is explained in Table 2 |
YOYO-1 Iodide | Thermo Fisher Scientific | Y3601 | Staining solution preparation is explained in Table 2 |
BOBO-3 Iodide | Thermo Fisher Scientific | B3586 | Staining solution preparation is explained in Table 2 |
Alexa Fluor 488 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A12379 | Staining solution preparation is explained in Table 2 |
Alexa Fluor 546 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A22283 | Staining solution preparation is explained in Table 2 |
sieve, 800 µm mesh size | VWR International | 200.025.222-051 | |
sieve, 710 µm mesh size | VWR International | 200.025.222-050 | for growth medium preparation (step 1.1) |
sieve, 300 µm mesh size | VWR International | 200.025.222-040 | |
sieve, 250 µm mesh size | VWR International | 200.025.222-038 | for egg laying medium preparation (step 1.2) |
glass dish, Ø 100 mm × 20 mm | Sigma Aldrich | CLS70165102 | |
cell strainer, 100 µm mesh size | BD Biosciences | 352360 | |
paint brush, head Ø 2 mm | VWR International | 149-2121 | |
syringe, 1.0 mL | B. Braun Medical AG | 9166017V | |
scintillation vials | Sigma Aldrich | M1152-1000EA | |
paraformaldehyde (PFA) | Sigma Aldrich | 158127 | Caution: paraformaldehyde is toxic and corrosive |
n-heptane ≥99% | Carl Roth | 8654.1 | Caution: n-heptane is flammable and toxic |
Triton X-100 | Sigma Aldrich | X100-100ML | Caution: Trition X-100 is corrosive |
References
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