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Bioengineering

타입-1 당뇨병에 대 한 의약품 후보 백신의 빨간 사탕 과도 식

Published: March 19, 2019 doi: 10.3791/59298
* These authors contributed equally

Summary

여기, 선물이 식용 식물에 타입 1 당뇨병에 대 한 경구 백신 후보자를 생산 하는 프로토콜.

Abstract

식물 분자 농업 관심사의 분자를 생산 하는 식물의 사용 이다. 이 관점에서 식물 사용할 수 있습니다 모두 생물 반응 기 생산 및 최종 제품의 후속 정화 및 분리 단백질의 직접 구두 전달에 대 한 식용 식물을 사용 하는 경우. 이 작품에서는, 우리는 진공 침투 전달 deconstructed 식물 바이러스-기반 재조합 DNA 기술을 사용 하 여 식용 식물 시스템에 타입-1 당뇨병 (T1D)에 대 한 후보 구강 백신의 개발 제시. 우리의 결과 빨간 사탕 T1D T1D 백신으로 유망한 후보 간주에 관련 된 인간의 파생된 autoantigen 과도 표현 위한 적합 한 호스트 보여줍니다. 위 소화에에 그들의 저항, 잔류 세균의 존재 및 사용 가능성에 대 한 프로세스 생산의 개요를 제공의 2 차 대사 프로필 있는 autoantigen 생산 잎 특징 철저 하 게 했다 분리 단백질의 직접 구두 전달 식물. 우리의 분석 시뮬레이션된 위 소화, 식물 유래 갓 백신의 제조에서 캡슐화 전략 필요 하다는 것을 제안에 따라 동결된 후보 구강 백신의 거의 완전 한 저하를 보였다.

Introduction

식물 분자 생물학 혁명 1980 년대에서 이후 바이오의 생산을 위한 공장 기반 시스템 미생물 및 포유류 세포1에 따라 기존 시스템의 대 안으로 여겨질 수 있다. 식물은 확장성, 비용 효율성 및 안전2가장 관련성이 높은 되 고 여러 장점이 전통적인 플랫폼을 표시 합니다. 재조합 제품 변형 된 식물 조직에서 정화를 다음 관리, 중 parenterally 또는 구두와, 또한, 변형 된 식용 식물 직접 구두 전달에 대 한 사용할 수 있습니다. 구강 경로 동시에 점 막 및 조직 면역을 촉진 하 고 그것은 바늘과 전문된 의료 인력에 대 한 필요성을 제거. 또한, 구두 전달 일반적으로 재조합 단백질3의 총 제조 비용의 80%를 차지 하는 복잡 한 다운스트림 처리를 제거 합니다. 그 모든 장점은 생산, 공급 및 노동 세계 인구의 대부분을 저렴 한 약을 만드는 각 복용량의 비용 절감으로 번역 될 수 있다.

여러 가지 전략, 모두 안정적인 변환 및 과도 식, 식물에서 재조합 단백질의 생산을 위해 개발 되었다. 그들 가운데, 높은 수율 deconstructed 식물 바이러스-기반 식 시스템 (예: magnICON) 상대적으로 짧은 날짜 표시줄4이상의 재조합 단백질의 높은 수익률을 선도 하는 우수한 성능을 제공 합니다. 과도 식 Nicotiana benthamiana 식물에서 식물 바이러스-기반 식 시스템을 사용 하 여의 많은 예제, 표준 생산 호스트 되 고 보고 됩니다. 그러나,이 모델 식물은 알 카 로이드 및 그것의 잎에 축적 된 다른 독성 대사 산물 식용 종으로 간주 되지.

이 작품에서는, 우리는 두 식용 식물 시스템, 레드 비트 간의 비교 설명 (베타 vulgaris 이력서 물 랑 루즈), 시금치 (Spinacea 올레라케아 이력서 산업), 글루탐산의 65 kDa isoform의 두 후보 형태의 표현에 대 한 decarboxylase (GAD65), 바이러스-기반 식물에 의해 실시5벡터 스 GAD65 타입-1 당뇨병 (T1D)에 관련 된 주요 autoantigen 이며 그것은 현재를 방지 하거나 허용 오차6유도 T1D 지연 인간 임상 시험에서 조사를 받고 있다. GAD65의 생산 공장에서 광범위 하 게 모델 식물 종에서 Nicotiana tabacum명 benthamiana4,5,,67로 공부 했다. 여기, 우리가 직접 구두 납품을 위해 의미 될 수 있다 조직에 분자의 생산을 위한 식용 식물의 사용을 설명 합니다. 기술적인 관점에서 우리는 공부 하 고 다른 매개 변수를 평가 하 여 공장 agroinfiltration에 대 한 시스템 및 GAD65 생산을 위한 식용 식물 플랫폼 선택: 재조합 형 단백질 표정 수준, 식물에서 잔여 미생물 충전 조직 구두 전달, 위 소화를 GAD65의 저항 및 야생 유형으로 변형 된 식물의 bioequivalence에 대 한 의미.

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Protocol

1. 붉은 사탕 무 우와 시금치 재배

  1. 붉은 사탕 무 우 성장 (B. vulgaris 이력서 물 랑 루즈), 시금치 (S. 올레라케아 이력서 산업) 식물 성장 챔버에 각각 23/21 ° C에서의 빛의 강도, 65% 상대 습도, 명암 주기 12 h 150 µE를 사용 하 여.
  2. 씨앗 발 아 후 거 름 식물 상용 비료 (자료 테이블)의 1 g/L 해결책으로 일주일에 두 번. Agroinfiltration에 대 한 5 주 된 시금치 및 6 주 오래 된 빨간 무 우 식물을 사용 합니다.

2. 과도 식 deconstructed 식물 바이러스 기반 기술을 통해

  1. 공장 식 벡터의 건설
    1. 벡터-5' 모듈 (pICH20111), 3' 모듈 (pICH31070.GAD65mut, pICH31070.∆87G65mut 및 pICH7410.eGFP), 앞에서 설명한1,,27, 준비 및 integrase 모듈 (pICH14011)-소개 Agrobacterium tumefaciens GV3101 변형 표준 기술을 사용 하 여. 28 ° c.에 2 일 동안 50 μ g/mL 리 팜 피신과 적절 한 벡터 특정 항생제 (50 μ g/mL carbenicillin pICH20111, pICH14011 및 pICH7410.eGFP), pICH31070에 대 한 50 μ g/mL 대를 포함 하는 파운드 매체에 성장
    2. 식민지 각 벡터에 대 한 다음과 같은 특정 뇌관을 사용 하 여 PCR에 의해 식민지 화면: 5'-ATCTAAGCTAGGGTACCTCG-3', 5'-ACACCGTAAGTCTATCTCTTC-3' 3' 모듈 pICH31070.GAD65mut 및 pICH31070.∆87G65mut, 55 ° C의 어 닐 링 온도 110의 신장 시간 s, 5'-TGAAGTTCATCTGCACCAC-3', 5'-ACACCGTAAGTCTATCTCTTC-3' 세 번째 3' 모듈 pICH7410.eGFP, 53 ° C의 어 닐 링 온도와 30의 신장 시간에 대 한 s, 5'-AATGTCGATAGTCTCGTACG-3', 5'-TCCACCTTTAACGAAGTCTG-3' 53 ° C의 어 닐 링 온도와 20 s와 5'-GGCAACCGTTATGCGAATCC-3의 신장 시간 5' 모듈 ' 및 5'-GATGCGTTCCGCAACGAACT-3' 57 ° C의 어 닐 링 온도와 45의 신장 시간 integrase 모듈에 대 한 s.
    3. 다음 특정 반응 주기를 사용 하 여 20 μ의 전체 볼륨에 PCR 반응을 수행: 5 분 초기 변성 95 ° C에서 30의 35 주기 s 95 ° C, 30에서 어 닐 링 온도 72 ° C에서 신장 단계에서 s (어 닐 링 온도 신장 시간을 다시 각 뇌관 커플에 대 한 특정) 및 72 ° c.에 7 분의 최종 신장 단계
  2. 주사기 agroinfiltration
    1. 3 A. tumefaciens transformants 파운드 중간 포함 50 μ g/mL 리 팜 피신 및 다음 적절 한 벡터 특정 항생제의 50 mL에 접종: A. tumefaciens pICH20111와 변형에 대 한 50 μ g/mL carbenicillin pICH14011 또는 pICH7410.eGFP, 또는 50 μ g/mL 대 A. tumefaciens pICH31070와 변형에 대 한. 28 ° c.에 하룻밤 떨고에 의해 성장
    2. 20 분 동안 4500 x g 에서 원심 분리 하 여 하룻밤 세균성 문화를 작은 고 10 m m 4-morpholineethanesulfonic 산 (MES, pH 5.5)을 포함 하는 침투 버퍼의 100 mL (또는 초기 세균성 문화의 두 개의 볼륨)에 그들을 resuspend 및 10 m m MgSO4, 마약을 고려 하지 않고600. 실 온 (RT) 3 h에서 정지를 품 어.
    3. 모듈 중 하나는 3, GAD65mut, ∆87GAD65mut 또는 eGFP 3', 5' 모듈 모듈과 integrase 모듈을 포함 하는 세균성 정지의 동등한 볼륨 믹스. 서 스 펜 션 믹스를 사용 하 여 붉은 사탕 무 우와 시금치 잎의 주사기 침투에 대 한.
    4. 바늘 없는 주사기에는 서 스 펜 션의 5 mL을 배치 합니다. 시금치와 붉은 사탕 무 우 식물, 나뭇잎의 밑면에 대 한 주사기의 끝을 누르고 한편 잎의 다른 쪽에 부드러운 counterpressure을 적용.
    5. 각 식물에 대 한 정점에서 시작 처음 세 완전히 확장 된 잎을 침투 하 고 잎 줄기에 종이 태그와 agroinfiltrated 잎 레이블을 지정 합니다. 표준 조건 하에서 성장 챔버에 식물을 반환 합니다.
      참고: 건강과 안전 이유를 위한 착용 장갑과 눈 보호 침투 과정.
    6. 수집 agroinfiltrated 14 일 게시 감염 (dpi) 액체 질소에서 그들을 고정 하는 4에서 출발 한다. -80 ° c.에 게 식물 조직
  3. 진공 agroinfiltration
    1. 28 ° c.에서 밤새 흔들어 파운드 매체 50 μ g/mL 리 팜 피신 및 적절 한 벡터-특정의 50 mL에 별도로 3 A. tumefaciens transformants 항생제 성장
    2. 20 분에 4500 x g 에서 원심 분리 하 여 펠 릿 하룻밤 세균성 문화 침투 버퍼 0.35의 OD600 의 1 L에 펠 릿을 Resuspend 고 3 h에 대 한 실시간에 정지를 품 어.
    3. 각 정지에 (폴 20) 세제의 0.01 %v / v를 추가 합니다. 모듈 중 하나는 3, GAD65mut, ∆87GAD65mut 또는 eGFP 3', 5' 모듈 모듈과 integrase 모듈을 포함 하는 세균성 정지의 동등한 볼륨 믹스.
    4. 삽입 한 공장 (6 주 오래 된 빨간 사탕 무 공장, 섹션 1을 참조) 소유자에서. 홀더를 반전 하 고 침투 목욕 잠수함 침투 정지에서 잎 (2 패)를 포함 하는 비 커 위에 배치 합니다.
      주: 모든 나뭇잎 세균 현 탁 액에 담근 완전히는 확인 하십시오. 필요한 경우 추가 침투 정지의 추가 레벨을 올립니다.
    5. 침수 식물 침투 목욕 침투 실로 전송 하 고 그것을 닫습니다. 진공 펌프를 켜고 침투 챔버에 진공 흡입구 밸브를 엽니다.
    6. 일단 90 mbar 침투 약 실에 있는 압력 감소 했다, 계속 3 분 출시에 대 한 진공 진공 45에 대 한 s. 침투 챔버는 대기압에 반환에, 일단 챔버를 열고 욕조에서는 세균 침투 식물을 제거 합니다.
    7. 표준 조건 하에서 성장 챔버에 식물을 반환 합니다.
    8. 재조합 단백질에 따라 최대 식 dpi에서 agroinfiltrated 잎을 수집 하 고 액체 질소에 그들을 동결. -80 ° c.에 게 식물 조직

3. 재조합 형 단백질 표정 분석

  1. 총 수용 성 단백질 (TSP) 추출
    1. 주사기를 갈기 또는 진공 침투 붉은 사탕 무 우와 시금치 잎, 2.2.6 단계와 단계에서 2.3.8, 박격포 및 방 앗 공이 사용 하 여 액체 질소에 정밀한 분말을 수집 합니다. 15 mL 플라스틱 튜브로 분말을 전송 하 고-80 ° c.에 있는 자료를 저장
    2. 잎 가루 300 밀리 그램을 추출 버퍼 (50 m m 인산 나트륨 pH 8.0, 20mm 나트륨 metabisulphite)의 900 µ L를 추가 합니다.
      참고: 버퍼 볼륨 (µ L)으로 식물 조직 무게 (mg) 사이의 선택한 비율 1:3입니다.
    3. 1 분에 대 한 vortexing에 의해 혼합 균질 다음 4 ° c.에 40 분 30000 x g 에서 원심
    4. 깨끗 한 튜브에 상쾌한 수집 하 고-80 ° c.에 그것을 저장합니다
  2. 식물 eGFP 시각화 및 정량화
    1. EGFP 96 잘 접시에 잎, 3 개의 기술 복제, 표현에서 얻은 각 TSP 추출의 100 µ L를 로드 합니다.
    2. 96 잘 접시를 형광 판독기에 넣고 측정 시작. 485/535 nm 필터 eGFP 형광 검출에 필요한 설정 사용.
    3. 절대 정량화에 대 한 같은 접시에 준비 보정 곡선 로드 다른 수량 (62.5, 125, 500, 750, 1000 ng) 순화 eGFP의.
  3. TSP 정량화에 대 한 Bicinchoninic 산 (BCA) 분석 결과
    1. (자료 테이블) 50 부분의 시 약 A 1 부분 시 약 B (자료 테이블)의 혼합. 샘플 분석 되 고 교정 표준에 대 한 충분 한 양의 신선한 BCA 작업 솔루션을 준비 합니다.
      참고: 각 샘플에 필요한 BCA 작업 솔루션의 볼륨은 1.9 mL. 9 표준 (를 포함 하 여 빈) 표준 절차, BCA 작업 솔루션의 17.1 mL이 필요 합니다.
    2. 각 표준 (를 포함 하 여 빈), 그리고 TSP 추출 물 이라는 관으로의 0.1 mL 플라스틱
      참고: 교정 표준으로 준비 신선한 집합이 소 혈 청 알 부 민 (BSA) 표준 샘플, 물 등으로 가급적 같은 희석제를 사용 하 여 10-1000 μ g/mL 범위에서. 교정 표준 및 샘플 준비에 사용 되는 희석제의 0.1 mL 빈에 의하여 이루어져 있다.
    3. 1.9 mL BCA 작업 솔루션을 추가 하 고 철저 하 게 혼합. 튜브를 커버 하 고 30 분 동안 37 ° C에서 품 어.
    4. 실시간 측정 562에서 흡 광도를 튜브 쿨 10 분 이내 모든 샘플의 nm.
      참고: RT, 에서도 색상 개발 계속 됩니다. 10 분 이내 모든 튜브의 흡 광도 측정 한다면 상당한 오류를 소개 합니다.
    5. 표준과 TSP 추출의 판독에서 빈의 562 nm 흡 광도 값을 뺍니다.
    6. 플롯 빈 수정 562 nm의 농도에 각 표준에 대 한 읽기. 각 TSP 추출의 단백질 농도 결정 합니다.
  4. Gecchele 외8앞에서 설명한 대로 얼룩 Coomassie 젤을 수행 합니다.
  5. 서쪽 오 점 분석
    1. Gecchele 외8앞에서 설명한 서쪽 오 점 분석을 수행 합니다.
    2. 단백질 전기 이동 별거 후에 니트로 막 표준 기술을 사용 하 여 전송. 인산 염 버퍼 식 염 수 (PBS) pH 7.4에에서 4% 우유를 혼합 하 여 차단 솔루션을 준비 합니다. 1 시간에 대 한 실시간에 차단 솔루션의 10 mL와 함께 막을 차단 합니다.
    3. 안티-GAD65/67 및 안티-LHCB2, 1:10,000 및 1:20,000 안티 eGFP 0.1% 세제로 차단 솔루션의 5 mL에 대 한 토끼 항 기본 체를 준비 합니다. 준비 된 1 차적인 항 체 솔루션 4 ° C에서 하룻밤 또는 일정 한 동요와 RT에 4 h 막 품 어.
    4. 1 차적인 항 체를 삭제 하 고 차단 솔루션 0.1% 세제를 포함 하 5 분에 대 한 3 번 막 씻어.
    5. 양 고추냉이 과산화 효소 (HRP) 준비-0.1% 세제 솔루션을 차단에 1:10,000에서 어원이 안티 토끼 항 체. 일정 한 동요와 RT에 1.5 h 막 품 어.
    6. 이차 항 체를 삭제 하 고 각 PBS-t (PBS 0.1% 세제로 보완) 5 분에 대 한 5 번 막 씻어.
    7. 제조업체의 지침에 따라 상용 luminol 솔루션 멤브레인을 품 어. 화학 이미징 시스템을 사용 하 여 신호를 감지 합니다.

4. 식물 소재 처리

  1. 수확 진공 agroinfiltrated ∆87GAD65mut 표현 빨간 무 우 식 피크 (11 dpi)에서 나뭇잎과 액체 질소에 그들을 동결.
  2. 0.04 mbar-50 ° C에서 72 h에 대 한 냉동된 잎 lyophilize -80 ° c.에서 그들을 저장합니다
  3. 정밀한 분말을 잎을 갈기 고 수 분을 제외 하 실리 카 겔 컨테이너를 밀봉된에 RT에 저장 합니다.

5. 위 소화 시뮬레이션 및 셀 무결성 분석

  1. 위 소화 시뮬레이션
    1. 6 mL PBS (pH 7.4)에 resuspend 및 grinded 동결된 붉은 사탕 무 우 잎의 100 밀리 그램 무게.
    2. 6 M HCl와 2 샘플 pH를 조정 합니다.
    3. 10 m m HCl 1 mg/mL의 펩 신 최종 농도 또는 1:20 총 수용 성 단백질의 비율을 돼지 위 점 막에서 4 mg/mL의 펩 신을 추가 합니다. 120 분 동안 37 ° C에서 샘플을 흔들어.
    4. 비활성화는 펩 신을 1 M NaOH로 pH 8에 샘플을 조정 합니다.
    5. 20000 x g 4 ° c.에 20 분에 각 샘플의 750 µ L aliquots 원심 상쾌한 별도로 수집 하 고 버퍼를 로드의 표면에 뜨는 볼륨 하나에 펠 릿을 resuspend (1.5 M Tris HCl, pH 6.8, 3 %SDS, 15% 글리세롤, 및 4 %2-mercaptoethanol).
      참고: 건강과 안전 이유를 위해 장갑을 착용 하 고 샘플 준비에 대 한 증기 두건에서 작동.
    6. 서쪽 오 점 분석8여는 상쾌한와 resuspended 펠 릿을 분석.
  2. 셀 무결성 분석
    1. Grinded 동결된 붉은 사탕 무 우 잎의 100 밀리 그램의 두 샘플을 준비 하 고 6 mL PBS (pH 7.4)에 둘 다 resuspend.
    2. 하나는 6 M HCl. 흔들어 2 120 분 동안 37 ° C에서 두 샘플 샘플만의 pH를 조정 합니다.
    3. 20000 x g 4 ° c.에 20 분에 각 샘플의 750 µ L aliquots 원심 상쾌한 별도로 수집 하 고 버퍼를 로드의 표면에 뜨는 볼륨 하나에 펠 릿을 resuspend.
    4. 서쪽 오 점 분석은 상쾌한 및 resuspended 펠 릿을 분석 합니다.

6. Bioburden 분석 결과

  1. 동결된 붉은 사탕 무 우 잎의 100 밀리 그램 무게. 8 mL의 멸 균 PBS (pH 7.4)에 1 분 동안 소용돌이 분말 resuspend
  2. 항생제 또는 (i) 50 µ g/mL 리 팜 피신, 리 팜 피신과 carbenicillin의 각 (ii) 50 µ g/m l, (iii) 50 µ g/mL 각 리 팜 피신과 대, 또는 (iv) 50 µ g/mL 각 리 팜 피신, carbenicillin, 고 대를 포함 하지 않고 파운드 매체를 준비 합니다.
  3. 플레이트 5 선택적 파운드 미디어 중에서 각 동결된 잎 homogenate의 1 mL.
  4. 28 ° c.에 3 일 동안 모든 접시를 품 어
  5. 각 접시에 성장 Agrobacterium 식민지를 계산 합니다.
  6. 계산 하 고 동결된 잎 homogenate (CFU/mL)의 mL 당 콜로 니 형성 단위 (CFU)의 수로 잔여 세균 전을 정의 합니다.

7. 대사 산물 추출

  1. 1 차 대사 산물 추출
    1. 저장-80 ° C의 30 밀리 그램의 무게, 진공 agroinfiltrated ∆87GAD65mut 표현 2 mL 플라스틱 튜브에 붉은 사탕 무 우 잎 가루.
    2. 2 시간 동안-20 ° C에서 30 미 품에 대 한 차가운 70/30 (v/v) 메탄올/클로 프롬 및 소용돌이의 750 µ L를 추가 합니다.
      참고: 모든 용 매와 첨가제 LC MS 학년 이어야 합니다.
    3. 새로운 2 mL 튜브에 냉 수와 10 분 수집에 대 한 17,900 x g 4 ° c에서 원심 분리기 및 전송의 600 µ L 위 hydroalcoholic 단계를 추가 합니다. 더 낮은 chloroformic 위상과 interphase를 삭제 합니다.
    4. 용 제 증발에 3 h에 대 한 진공 집중 장치에 샘플을 넣어.
    5. 50/50 (v/v) 이기/물 단계 7.1.4에서 300 µ L에서 얻은 펠 릿을 녹이 고 3 분에 대 한 샘플을 sonicate.
    6. 0.2 μ m 멤브레인 필터를 통해 솔루션을 전달 하 고는 투명 고정된 300 µ L 삽입 유리 튜브에 넣어.
  2. 2 차 대사 산물 추출
    1. -80 ° C 저장의 300 밀리 그램의 무게, 진공 agroinfiltrated ∆87GAD65mut 표현 15 mL 플라스틱 튜브에 붉은 사탕 무 우 잎 가루.
    2. 메탄올와 동 30의 3 개 mL를 추가 s, 그리고 15 분 동안 40 kHz에서 sonicate.
      참고: 모든 용 매와 첨가제 LC MS 학년 이어야 합니다.
    3. 10 분 동안 4 ° C에서 4500 x g 에서 샘플 원심 고 새로운 15 mL 튜브는 supernatants 전송.
    4. 희석 100 µ L의 추출 물으로 1:3 (v/v) 하 고 0.2 μ m 멤브레인 필터를 통해 솔루션을 전달 합니다.
    5. 투명 고정된 300 µ L 삽입 유리 튜브로 솔루션을 넣어.
  3. 극 지 지질 추출
    1. 저장-80 ° C의 200 밀리 그램의 무게, 진공 agroinfiltrated ∆87GAD65mut 표현 15 mL 플라스틱 튜브에 붉은 사탕 무 우 잎 가루.
    2. 물 200 µ L 그리고 메탄올의 2 개 mL를 추가 하 고 1 시간을 위한 얼음에 계속.
      참고: 모든 용 매와 첨가제 LC MS 학년 이어야 합니다.
    3. 30 대 한 소용돌이 s와 15 분 동안 40 kHz에서 sonicate.
    4. 원심 25 분 수집 4 ° C에서 4500 x g 에서 샘플 및 전송 클로 프롬 단계 2 mL 튜브로. 위 hydroalcoholic 위상과 interphase를 삭제 합니다.
    5. 용 매 증발에 3 h에 대 한 진공 집중 장치에 샘플을 넣어.
    6. 단계 7.3.5 오디오 메탄올의 600 µ L에서에서 얻은 펠 릿을 디졸브.
    7. 희석 100 µ L 1:5 (v/v) 메탄올 추출 하 고 0.2 μ m 멤브레인 필터를 통해 솔루션을 전달 합니다.
    8. 투명 고정된 300 µ L 삽입 유리 튜브로 솔루션을 넣어.

8. 액체 착 색 인쇄기 질량 분석 분석 및 데이터 처리

  1. 공급 업체에서 권장 하는 대로 LC-MS 시스템을 설정 합니다.
    참고: C18 열 (150 x 2.1 m m, 입자 크기 3 µ m) 앞 C18 가드 열 (75 x 2.1 m m, 입자 크기 5 µ m)의 2 차 대사 산물 및 극 지 지질 분석에 대 한 장착 HPLC 결합 한 autosampler LC 섹션 구성 반면 (150 x 2.1 m m, 입자 크기 2.7 µ m) HILIC 열 앞 HILIC 가드 열 (7.5 x 2.1 m m, 3 µ m). MS는 분무 이온화 (ESI) 또는 대기압 화학 이온화 (APCI) 소스와 함께 제공 되는 이온 트랩 질량 분석기 이다.
  2. HPLC 그라디언트에 대 한 적절 한 용 매를 준비 합니다. 주 대사 산물 분석에 대 한 사용 하 여 20 m m 염화 편대 용 매 a; 95% 이기, 5% 수 플러스 10 m m 염화 편대 용 매 b.로 2 차 대사 산물 분석 물 플러스 0.05% 개미 산 (A)와 이기 플러스 0.05% 개미 산 (B)를 사용 하 여. 극 지 지질 분석 물 플러스 0.05% 개미 산 (A) 및 100% 이기 (B)를 사용 하 여.
    참고: 용 제, 첨가제, LC-MS 학년 이어야 합니다.
  3. 대사 산물 차입에 대 한 표 1 에 보고 된 그라디언트를 사용 합니다. 반면 0.2 mL/분 주사 10 µ L의 2 차 대사 산물 및 극 지 지질, 각 샘플에는 흐름 속도 설정 기본 대사 산물에 대 한 5 µ L를 주사.
  4. 각 실험 조건의 대표적인 혼합 다른 샘플의 동등한 부분을 혼합 하 여 품질 관리 (QC) 샘플을 준비 합니다. 악기 효율성을 모니터링 하는 실험 중 QC 샘플을 분석. 특히, 각 10 샘플 배치 후 QC 샘플 분석을 삽입 합니다.
  5. 악기 기반 효과 피하기 위해 샘플을 무작위.
  6. 9 분석 후 청소 방법 및 빈 분석 열 삽입 후 즉시.
    참고: 강한 용 매의 높은 비율에 isocratic 차입과 두 용 매 사이 느린 그라데이션을 수행 합니다. 빈 순수한 메탄올의 주입으로 구성 됩니다: 다음 분석에 보존 시간 재현성을 향상 시키기 위해 물 (50/50, v/v).
  7. 표 2에 나열 된 매개 변수를 사용 하 여 다른 긍정적이 고 부정적인 이온화 모드에서 질량 스펙트럼을 취득 하는 악기를 설정 합니다.
    참고: 다른 매개 변수는 특정 플랫폼에 따라 달라 집니다.
  8. 달 산 외.9에 설명 된 대로 다음 데이터 처리를 수행 합니다.

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Representative Results

이 작품에서 식용 식물 조직에서 구강 백신의 개발에 대 한 워크플로 제공 됩니다. 이 작품의 초점은 식용 호스트 식물 종에 대상 단백질의 표현과 잠재적인 구강 백신의 특성 이다.

첫 번째 단계는 식용 식물 시스템에서 재조합 단백질을 생산 하는 식물 바이러스-기반 식 기술의 적합성의 평가 참여. 이 목표를 위해 우리가 먼저 사용는 eGFP 모델 단백질으로 하 고 우리 두 식용 잎이 많은 식물 시스템으로 표현: 붉은 사탕 무 우와 시금치. 식물은 수동으로 A. tumefaciens eGFP 재조합 식 벡터 운반의 정지 된 agroinfiltrated 이었다. 형광 단백질 표정 서쪽 오 점 분석 (그림 1A, B, D, E)에 의해 구상 되었고 자외선에서 계량. 결과 최대 eGFP 수준 (113.4 ± 0.3 µ g/g FLW) 11 dpi ( 에서 측정 되었다 시금치 보다 붉은 사탕 무 우 시스템 544.9 ± 10.9 µ g/g의 신선한 잎 무게 (FLW) 9 dpi (그림 1C)에 도달 높은 eGFP 식으로 특징은 나타났다 1 층 그림). 이러한 이유로 붉은 사탕 무 우 식 호스트 모든 후속 실험으로 선정 됐다.

첸 외10에 따르면 eGFP 과도 식 대규모 백신 생산을 위한 더 적당 한 침투에 대 한 진공 방법에 의해 시험 되었다. A. tumefaciens 문화, 10-1 에서 10-3및 세제의 다른 농도 이르기까지 하룻밤의 다른 희석 (0.005-0.05%) 최대 식 dpi (9 dpi)에서 eGFP 축적 수준을 비교 하 여 테스트 되었습니다. 결과 더 높은 세균성 titers 큰 eGFP 수확량을 생산 발견 (10-1 ~ 0.35). 그러나, 중요 한 차이가 다른 세제 농도 (데이터 표시 되지 않음)를 사용 하 여 발견 했다.

다음, 식물 진공 0.35 OD600 및 세제의 0.01%에는 A. tumefaciens 현 탁 액으로 침투 했다. 두 형태의 GAD65, GAD65mut는 N-말기의 표현 양식 (∆87GAD65mut), 잘린 식 플랫폼 및 배달 시스템 설치 되었다, 일단 최대 식의 날에 비교 했다 5와 11 dpi, 각각,로 이전 설립된11. Agroinfiltrated에서 TSP 추출 잎, 모든 샘플 서쪽 오 점 분석 했다 고 재조합 단백질은 비교적 densitometry 분석 (그림 2)에 의해 정량 합니다. 결과 GAD65mut 통해 ∆87GAD65mut 폼의 20-fold 고성능을 강조 했다. 잘린된 양식은 따라서 높은 201.4 29.3 ± µ g/g FLW 11 dpi에서 붉은 사탕 무 우 잎에 축적 선호 구강 백신 후보자로 선정 되었다.

마지막으로, 잠재적인 경구 백신의 개발에 대 한 매개 변수를 평가 했다. 재조합 형 단백질 무결성 동결 진공의 ∆87GAD65mut을 표현 하는 붉은 사탕 무 우 잎에 침투 후 치료 (만 언)와 비교에서 평가 되었다 서쪽 오 점 분석에 의해 조직. 그림 3A에서 같이, 대상 단백질 동결은 과정 후 안정적인 것으로 설명 했다.

위 소화의 시뮬레이션 또는 TSP 1시 20분의 비율로 1 mg/mL의 최종 농도에 돼지 위 효소 펩 신을 추가 하 여 동결된 자료에 실행 되었다. 서쪽 오 점 분석에 의해 입증으로 모두 소화 치료 조건 재조합 단백질 저하에서 결과 (그림 3C, D, E, 1 mg/mL의 펩 신 최종 농도 대해서만 데이터 보고). 펩 신 소화 (레인 펩 신, p 1-3), 동결 치료, 후 식물 세포 대상 단백질 저하로 이어지는 그들의 무결성 손실 제안 후 펠 렛 샘플에서 특정 신호의 부재.

셀 무결성의 평가 그 때 말린된 식물 조직 중립 ph (pH 7.4), ∆87GAD65mut 버퍼에 resuspended는 되었다 부분적으로 solubilized, 적어도 일부 셀 잎을 분쇄 하 고 건조 하는 동안 부서 졌다 하는 것을 건의 했다. 산 성 조건에서 말린된 식물 조직의 물의 resuspension 대신, 불용 성 부분에서 서만 ∆87GAD65mut의 검출 이끌어 냈다. 이것은 아마 손상 되지 않은 세포11의 단백질 콘텐츠 이외에 낮은 pH에 기인한 ∆87GAD65mut 강수량 때문 이었다. 이러한 분석을 동결 건조 백신 후보자의 준비에 대 한 치료로 서 선택할 수 있는 것을 나타냅니다.

또한, agroinfiltrated 붉은 사탕 무 우 잎에 잔류 미생물 충전 평가 했다.

Bioburden 분석 결과 후보 백신 준비에 대 한 악용 치료 세균성 부하11제거 표시 됩니다.

∆87GAD65mut 및 제어 붉은 사탕 무 우 식물의 대사 bioequivalence의 차 및 2 차 대사 산물 및 극 지 지질 9 붉은 사탕 무 우 식물 ∆87GAD65mut, 9 agroinfiltrated 컨트롤을 표현에서 LC-MS에 의해 생성 된 지문에 의해 평가 되었다 고 9 야생-타입 컨트롤입니다. PCA 통계 야생-타입 식물 클러스터를 다른 모든 샘플에서 분리 밝혔다. 상당한 차이가 대신 ∆87GAD65mut 및 침투 및 부정적인 제어 식물 사이 강조 했다. 또한, 극 지 지질 프로 파일의 관점에서 식물의 3 개 그룹 중 상당한 차이가 확인된11했다.

Figure 1
그림 1: 비교의 eGFP 식 수준 agroinfiltrated 붉은 사탕 무 우와 시금치 잎. 서쪽 오 점 분석 (A, D) 및 해당 로드 컨트롤 (RuBisCO 큰 소 단위) Coomassie 화려한 블루 (B, E)의 eGFP 표현에서 단백질 추출 물 묻은 잎 샘플 14 4에서 시간 코스 분석 중 수집 일 게시 감염 (dpi). 각 리프 단백질 추출의 eGFP 콘텐츠 형광 측정 (C, F)에 의해 정량 했다. Agroinfiltrated 붉은 사탕 무 우 잎 샘플에서 결과 agroinfiltrated 시금치 샘플 오른쪽에 표시 되어 있는 왼쪽된 패널에 표시 됩니다. 같은 양의 단백질 추출 되었습니다 로드, 서쪽 오 점을 위해 3.5 µ g과 30 µ g Coomassie 얼룩에 대 한 합니다. 안티 eGFP 항 체는 서쪽 오 점 분석에 프로브로 사용 되었습니다. 쪽 번호 kDa에 분자 질량 마커를 나타냅니다. 시공, 긍정적인 통제, 10 상업 재조합 인간 GAD65;의 ng 노스캐롤라이나, 부정적인 컨트롤 A. tumefaciens 들고 5'와 전적으로 침투 하는 잎에서 추출-integrase 모듈. 오차 막대는 3 개의 독립적인 실험에서 표준 편차를 나타냅니다. 이 그림은 Bertini 외.11에서 수정 되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

Figure 2
그림 2: 붉은 사탕 무 우 잎에 GAD65mut 및 Δ87GAD65mut 식 수준. 서쪽 오 점 분석 (A) 및 해당 로드 제어 (RuBisCo 큰 소 단위) Coomassie 화려한 블루 (B) Δ87GAD65mut (왼쪽)와 GAD65mut (오른쪽) 3 개의 붉은 사탕 무 우 잎에서 추출 물 단백질의 스테인드. 항 GAD 항 체는 서쪽 오 점 분석 (레인 GAD65mut에 대 한 추출의 20 μ와 Δ87GAD65mut에 대 한 추출의 1 μ 로드)에 프로브로 사용 되었습니다. 젤을 얼룩이 Coomassie 동일한 양의 단백질 추출 물 (10 μ/레인) GAD65mut 및 Δ87GAD65mut에 대 한 로드 되었습니다. 쪽 번호 kDa에 분자 질량 마커를 나타냅니다. 시공, 긍정적인 통제, 10 상업 재조합 인간 GAD65;의 ng 노스캐롤라이나, 부정적인 컨트롤, A. tumefaciens 들고 5' 만으로 침투 잎에서 얻은 추출 물-integrase 모듈. (C) 사용 하 여 서쪽 오 점 긍정적인 통제 densitometric 분석, 두 단백질 형태의 상대 식 수준에 대 한 참조로 구성 됩니다. 오차 막대는 3 개의 독립적인 실험에서 표준 편차를 나타냅니다. 이 그림은 Bertini 외.11에서 수정 되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

Figure 3
그림 3: 구강 백신 후보 평가. 왼쪽된 측에, 치료 (A, B) 동결 후 단백질 안정성의 분석. 서쪽 오 점 분석 (A) 및 해당 젤 Coomassie 화려한 블루 (B) 대표 하는 Δ87GAD65mut을 표현 하는 잎에서 3 개의 독립적인 추출 스테인드. 수확된 잎 직접 (신선한) 냉동 또는-50 ° C, 72 h (동결 건조) 0.04 mbar에서 동결 건조 된. 다른 조직: 버퍼 비율 TSP 추출 하는 동안 탈수로 인해 물 손실을 고려 하기 위하여 채택 되었다. 동일한 양의 추출 물 0.25와 서쪽 오 점 및 각각 얼룩 Coomassie 10 µ L 로드 되었습니다. 항 GAD 항 체는 사용 측면을 조사 하는 서쪽 오 점을 위해 숫자 kDa에 분자 질량 마커를 나타냅니다. 노스캐롤라이나, 부정적인 컨트롤 A. tumefaciens 들고 5'와 전적으로 잎 infiltrated에서 추출-integrase 모듈. 생체 외에서 오른쪽에 Δ87GAD65mut의 위 소화를 시뮬레이션 (C, D, E). 서쪽 오 점 분석 (C, D)와 해당 젤 Coomassie 화려한 블루 (전자) 대표 하는 시뮬레이션된 위 소화 후 Δ87GAD65mut을 표현 하는 나뭇잎의 3 개의 독립적인 추출 스테인드. 1 mg/mL의 펩 신 효소를 사용 하지 않고 동결 건조 된 조직, 컨트롤 샘플 동안 100 밀리 그램에 추가 되었습니다. 24 µ L과 supernatants (s) 및 펠 릿 (p) 각각 최종 원심 분리 단계에서 얻은 16 µ L SDS 페이지 분석을 위해 사용 되었습니다. 안티 갓 (C)와 안티-LHCB2 (D) 항 체는 서쪽 오 점 분석에 있는 조사로 사용 되었다. 쪽 번호 kDa에 분자 질량 마커를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.

주 대사 (100 분) 시간 (분) % A % B 기간 (분) 유형
초기 0 100 - 초기 조건
0 0 100 10 Isocratic
10 15 85 15 그라데이션
25 15 85 5 Isocratic
30 50 50 10 그라데이션
40 50 50 30 Isocratic
70 0 100 1 그라데이션
71 0 100 29 Isocratic (재 평형)
2 차 대사 산물 (60 분) 시간 (분) % A % B 기간 (분) 유형
초기 98 2 - 초기 조건
0 90 10 2 그라데이션
2 80 20 10 그라데이션
12 75 25 2 그라데이션
14 30 70 7 그라데이션
21 30 70 5 Isocratic
26 10 90 1 그라데이션
27 10 90 14 Isocratic
41 98 2 1 그라데이션
42 98 2 18 Isocratic (재 평형)
극 지 지질 (90 분) 시간 (분) % A % B 기간 (분) 유형
초기 50 50 - 초기 조건
0 0 100 10 그라데이션
10 0 100 65 Isocratic
75 50 50 1 그라데이션
76 50 50 14 Isocratic (재 평형)

표 1: LC MS 분석에서 대사 산물 차입에 대 한 그라데이션 조건.

질량 분석기 구성 요소 함수 매개 변수
1 차 대사 산물 2 차 대사 산물 극 지 지질
분무 이온화 (ESI) 소스 Nebulizing 가스 50 psi, 350 ° C 50 psi, 350 ° C -
가스 건조 10 L 분-1 10 L 분-1
대기압 화학 이온화 (APCI) 소스 Nebulizing 가스 - - 50 psi, 350 ° C
가스 건조 10 L 분-1
기화 기 450 ° C
이온 트랩 및 검출기 스캔 완전 한 스캔 모드 초당 13000 m/z 초당 13000 m/z 초당 13000 m/z
50-1500 m/z 50-1500 m/z 50-1500 m/z
스캔 범위 200 m/z 400 m/z 700 m/z
질량을 대상
충돌 가스 헬륨
진공 압력 1.4 x 10-5 mbar
모 세관 소스 +4,500 V +4,500 V +4,000 V
엔드 플레이트 오프셋 -500 V -500 V -500 V
제비 갈매기 40 V -40 V 40 V
모자 출구 106 V -121 V 143.5 V
10 월 1 일 DC 12 V -12 V 12 V
10 월 2 일 DC 1.7 V -1.7 V 2 V
렌즈 1 -5 V 5 V -5 V
렌즈 2 -60 V 60 V -60 V
긍정적인 이온화 모드에 대 한 ICC 20
부정적인 이온화 모드에 대 한 ICC 7

표 2: 다른 긍정적이 고 부정적인 이온화 모드에서 질량 스펙트럼 수집에 대 한 매개 변수입니다.

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Discussion

이 연구에서 우리는 자기 면역 당뇨병에 대 한 후보 구강 백신의 설계에 대 한 예비 분석을 보였다. 이 실험에 대 한 대상 단백질 돌연변이 형태의 인간의 65 kDa 조미료 Decarboxylase, 어떤 생산 및 기능은 쉽게 감지 하 고 측정 가능한12했다. 다른 식용 식물 조직에 그것의 식5벡터는 아주 짧은 시간 프레임에서 재조합 단백질 생산의 높은 수준에서 중재 중재 했다. 붉은 사탕 무 우에 eGFP 식에 따라 식용 호스트 수행한 최고의 후보 식물의 선택 하 고 수동 agroinfiltration에 의해 시금치 잎. 이 단계 수동 agroinfiltration의 시간이 걸리는 절차 및 시금치 잎 조직 침투에 경도 산업을 위한 중요 한 수 있습니다.

재조합 단백질에 대 한 최상위 재조합 단백질 축적을 주는 수확의 특정 dpi의 식별 중요 한 단계 이며 테스트 하 여 사건에-의해-사건을 기준으로 선택 해야 합니다. (4 ~ 12)에서 다른 dpi에 형광 단백질 표정 분석 각 공장 시스템에 최대 식의 하루를 식별 수 있습니다. 최대 식 요즘에서 eGFP 농도 (µ g/g FLW), 사이 비교 강조 그 빨간 사탕은 재조합 단백질 생산량 측면에서 플랫폼을 수행 하는 최고.

이러한 이유로, 붉은 사탕 무 우 더 백신 산업 대규모 생산13에 대 한 더 적합 한 것으로 간주 됩니다 진공 시스템에서 식물 바이러스-기반 벡터의 배달에 대 한 테스트 되었습니다.

그 담배 종5표준 진공 침투 프로토콜 최적화, 다양 한 식물 종으로 간주 절차 조정에 대 한 매개 변수 설정 중요 한 포인트입니다. 그런 다음, 빨간 무 우 진공 agroinfiltration 프로토콜 최적화 되었다. 우리의 증거 Agrobacterium 희석 리프 침투성 강화에 세제 농도 동안 단백질 식 수준 향상에 중요 한 보여주었다. 이 작업 목적에 맞는 기술과 공장 시스템 결과 보였다.

두 가지 형태의 GAD65, GAD65mut, ∆87GAD65mut, 이전 명. benthamiana7, 다른 하위 셀룰러 지역화를 표시에 그들의 표현에 대 한 특징은 붉은 사탕 무 우에 진공 침투에 의해 표현 되었다. 3 생물 복제는 모든 샘플에 대 한 준비가 되어 있었다. 각 생물 복제 GAD65 형태에 대 한 14 dpi로 2에서 샘플링 하는 다른 식물에서 3 침투 잎의 풀 구성. 그들의 식 수준 높은 축적 단백질 식물 조직에서 선택와 비교 되었다.

Densitometry 분석에 의해 상대 정량화는 ∆87GAD65mut 20-fold 높은 식 수준 그대로 보다는 설명 했다. 이 수 수 그것의 cytosolic 지역화로 인해 GAD65mut, 세포 막에이 양식을 앵커의 잔류물 때문에7, 수익률 낮은 하는 동안 반영 낮은 단백질 안정성. 붉은 사탕 무 우 잎 조직에서 ∆87GAD65mut 평균 축적 수준은 T1D 경구 백신 개발 시작 하기에 충분 한 201.4 29.3 ± µ g/g FLW, 이었다.

마지막으로, 가장 적합 한 플랫폼, 기술, 단백질 형태의 선택 후 우리는 감염 된 잎의 수확 후 처리를 설정 하 여 진행. 잎 조직이 95% 물로 구성 되어, 이후 탈수 처리는 미생물 오염을 방지 하기 위해 유용 합니다. 우리의 결과 동결 처리에 적용할 수 샘플, 잎에 있는 재조합 형 단백질 수준의 영향을 주지 않고 설명 했다. 동결은 여 10 물 제거 세균 오염 (bioburden), agroinfiltration 절차에 대 한 사용 재조합 A. tumefaciens 를 포함 하 여 제거 합니다.

또한, 단백질 바이오 캡슐의 분석은 ∆87GAD65mut 시뮬레이션된 위 소화 다음 소화 완전히는 보여주었다. 이 동결 처리 식물 세포 벽, 재조합 단백질의 위 환경 산 및 효소에 노출 피해 나왔다.

흡수의 사이트로 위장 전환을 통해 단백질 또는 펩 티 드 분자 무결성의 유지 관리 구강 약물 전달14에 대 한 문제를 나타냅니다. 따라서, 탈수 처리 후 잠재적인 백신 해야 제대로 책정의 무결성의 손실 없이 위 환경 극복 하. 식물 파생 된 갓 백신의 제조에서 상대적으로 안정적인 셸에서 캡슐화 그것을 보호 하 고 구강 배달 경로15에 따라 안정적인 수 있도록 효율성을 개선 하는 시스템으로 적용할 수 있습니다.

높은 캡슐화 효율을 보여준 인슐린과 신속한 인슐린 합성 하이드로 겔의 complexation에 최근 연구 등 고분자의 구두 납품과 관련 된 문제를 극복 하기 위해 다양 한 기술은 탐험 되어 pH 의존 방식으로16,17창에 놓습니다.

모두는 차 및 2 차 대사 산물 bioequivalence 침투 및 비 침투 컨트롤에 비해 ∆87GAD65mut을 표현 하는 식물의 PCA 통계를 사용 하 여 조사 했다. 비 침투 야생-타입 식물 별도 클러스터를 형성 하는 반면 ∆87GAD65mut와 침투 컨트롤 침투 식물의 차이점, 중요 한 되지 않았습니다. 이러한 결과 침투 식물 세균 대사 산물 또는 대사 산물과 같이 이미 문학13침투 때문에 식물에 의해 생산 덕분에 LC MS 분석 치료 식물에서 구별 됩니다 것이 좋습니다. 전반적으로이 분석 ∆87GAD65mut의 축적 전반적인 신진 대사에 거의 영향을 주지는 설명 했다.

이 결과 동결된 붉은 사탕 무 우 잎 조직 ∆87GAD65mut 식물 바이러스-기반 식 기술 이용 얻은 표현으로 표현 하는 잠재적인 구강 백신은 실험 T1D 구두 immunotherapy 적합 제안 하는 모두 재판입니다. 식물 바이러스 식 벡터 기술 과도 식 필드의 신속 하 고 높은 수준에서 외래 단백질을 생산 하는 능력 때문에 매우 매력적인 되고있다. 이 기술은 RNA 중 합 효소 RNA 의존 및 운동 단백질5 deconstructed 벡터 기반 되 고 따라서 그것은 그것의 infectivity 식물; 결과적으로, 인 간에 게 그것의 잠재적인 전송 제외 해야 합니다.

여기 보고 실험 프로토콜 많은 식용 종, 상 추, 등 명 capitatum번 expansa를 연장 될 수 있습니다. 붉은 사탕 무 우, 시금치를 포함 하 여,이 종의 잎부터 그 이전 좋은 식 공장 시스템5, 발견 되었다 요리 하지 않은 음식으로 사용할 수 있습니다., 그리고 여기에 제안 된 기술 제조 식용 백신 또는 사용 될 수 있습니다. 최소 가공된 기능성 식품 또는 사료의 생산입니다.

재조합 형 단백질/식물의 조합, 재조합 단백질 축적 최상위 주는 수확의 dpi 필요가 여전히 표현 재조합 단백질에 따라 케이스에 의해-사건을 기준 및 호스트에서 경험적으로 확인할 수 식물 종18.

구강 백신의 생산에 대 한이 기술의 응용 프로그램이 기존의 백신 가까운 장래에, 전투 oncolytic 바이러스, 림프 종 및 단단한 종양에 대 한 헌 백신 이외에 대안이 될 큰 잠재력이 고 대상 암19,20단일 클론 항 체.

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Disclosures

저자는 공개 없다.

Acknowledgments

이 작품은 공동 프로젝트 "자가 면역 당뇨병 식용 백신 (eDIVA)의 생산을 위한 식물의 사용"에 의해 지원 되었다 (프로젝트 ID: 891854) 베로나 대학 전화 2014의 프레임 워크에 의해 자금.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
0.2-μm Minisart RC4 membrane filters Sartorius-Stedim 17764
2–mercaptoethanol Sigma M3148 Toxic; 4 % to make loading buffer with glycerol, SDS and Tris-HCl
4-Morpholineethanesulfonic acid (MES) Sigma M8250 pH 5.5
96-well plate Sarstedt 833924
Acetic acid Sigma 27221 Corrosive
Acetonitrile LC-MS grade Sigma 34967
Acetosyringone Sigma D134406 Toxic – 0.1 M stock in DMSO
Agar Bacteriological Grade Applichem A0949 15 g/L to make LB medium (pH 7.5 with NaOH) with Yeast extract, NaCl and Tryptone
Ammonium formate Sigma 70221
Anti-eGFP antibody ABCam ab290
Anti-GAD 65/67 antibody Sigma G5163
Anti-LHCB2 antibody Agrisera AS01 003
Brilliant Blue R-250 Sigma B7920
C18 Column Grace    - Alltima HP C18 (150 mm x 2.1 mm; 3 μm) Column
C18 Guard Column Grace    - Alltima HP C18 (7.5 mm x 2.1 mm; 5 μm) Guard  Column
CalMag Grower Peter Excel 15-5-15 Fertilizer
Carbenicillin disodium Duchefa Biochemie C0109 Toxic
Chemiluminescence imaging system BioRad 1708370 ChemiDoc Touch Imaging System
Chloroform Sigma C2432
Detergent Sigma P5927 Polysorbate 20
Fluorescence reader Perkin-Elmer  1420-011 VICTOR Multilabel Counter
Formic acid LC-MS grade Sigma 94318
Glycerol Sigma G5516 15 % to make loading buffer with Tris-HCl, SDS and 2–mercaptoethanol
GoTaq G2 polymerase Promega M7841
HCl Sigma H1758 Corrosive
HILIC Column Grace    - Ascentis Express HILIC (150 mm x 2.1 mm; particles size 2.7 μm) Column
HILIC Guard Column Grace    - Vision HT HILIC (7.5 mm x 2.1 mm; 3 μm) Guard  Column
Horseradish peroxidase (HRP)-conjugate anti-rabbit antibody Sigma A6154 Do not freeze/thaw too many times
HPLC Autosampler Beckman Coulter    - System Gold 508 Autosampler
HPLC System Beckman Coulter    - System Gold 128 Solvent Module HPLC
Isopropanol Sigma 24137 Flamable
Kanamycin sulfate Sigma K4000 Toxic
KCl Sigma P9541 2 g/L with NaCl , Na2HPO4 and KH2PO4 to make PBS
KH2PO4 Sigma P9791 2.4 g/L with NaCl , Na2HPO4 and KCl to make PBS
Loading Buffer
Luminol solution Ge Healthcare RPN2232 Prepare the solution using the ECL Prime Western Blotting System commercial kit
Lyophilizator 5Pascal LIO5P0000DGT
Mass Spectometer Bruker Daltonics   - Bruker Esquire 6000; the mass spectrometer was equipped with an ESI source and the analyzer was an ion trap
Methanol Sigma 32213
MgSO4 Sigma M7506
Milk-blocking solution Ristora    - 3 % in PBS
Na2HPO4 Sigma S7907 Use with NaH2PO4 to make Sodium Phospate buffer
NaCl Sigma S3014 80 g/L with KCl, Na2HPO4 and KH2PO4 to make PBS; 10 g/L to make LB medium (pH 7.5 with NaOH) with Yeast extract, Tryptone and Agar Bacteriological Grade
NaH2PO4 Sigma S8282  Use with Na2HPO4 to make Sodium Phospate buffer; 14.4 g/L to make PBS
NaOH Sigma S8045
Nitrocellulase membrane Ge Healthcare 10600002
Pepsin from porcine gastric mucosa Sigma P7000
Peroxidase substrate ECL GE Healthcare RPN2235 Light sensitive material
Pump Vacuum Press VWR 111400000098
Reagent A Sigma B9643 Use 50 parts of this reagent with 1 part of reagent B to prepare BCA working solution
Reagent B Sigma B9643 Use 1 part of this reagent with 50 parts of reagent A to prepare BCA working solution
Rifampicin Duchefa Biochemie R0146 Toxic – 25 mg/mL stock in DMSO
SDS (Sodium dodecyl sulphate) Sigma L3771 Flamable, toxic, corrosive-10 % stock; 3 % to make loading buffer with Tris-HCl, Glycerol and 2–mercaptoethanol
Sodium metabisulphite Sigma 7681-57-4
Sonicator system Soltec 090.003.0003 Sonica® 2200 MH; frequency 40 khz
Syringe Terumo    -
Transparent fixed 300-µL insert glass tubes Thermo Scientific 11573680
Trizma Base Sigma T1503 Adjust pH with 1N HCl to make Tris-HCl buffer, use 1,5M Tris-HCl (pH 6.8) to make loading buffer with SDS, Glycerol and 2–mercaptoethanol
Tryptone Formedium TRP03 10 g/L to make LB medium (pH 7.5 with NaOH) with Yeast extract, NaCl and Agar Bacteriological Grade
Vacuum concentrator Heto 3878 F1-3 Speed-vac System
Water LC-MS grade Sigma 39253
Yeast extract Sigma Y1333 5 g/L to make LB medium (pH 7.5 with NaOH) with Tryptone, NaCl and Agar Bacteriological Grade

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References

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생명 공학 문제 145 과도 식 식용 식물 T1D 구두 관용 구강 백신 agroinfiltration 붉은 사탕 무 우 GAD65 bioequivalence 위 소화
타입-1 당뇨병에 대 한 의약품 후보 백신의 빨간 사탕 과도 식
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Santoni, M., Bertini, E., Zampieri, R., Cuccurullo, A., Commisso, M., Gecchele, E., Avesani, L. Transient Expression in Red Beet of a Biopharmaceutical Candidate Vaccine for Type-1 Diabetes. J. Vis. Exp. (145), e59298, doi:10.3791/59298 (2019).

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