Dette arbeidet beskriver protokoller for fremstilling av magnetiske nanopartikler, dets belegg med SiO2, etterfulgt av sin aminfunksjonalisering med (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) og dens bøyning med deferoksamin ved hjelp av en succinyl moiety som linker. En dyp strukturell karakteriseringsbeskrivelse og en fangstbakterieranalyse ved hjelp av Y. enterocolitica for alle mellomliggende nanopartikler og den endelige konjugaten er også beskrevet i detalj.
I det nåværende arbeidet, syntesen av magnetiske nanopartikler, dens belegg med SiO2, etterfulgt av sin aminfunksjonalisering med (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) og dens konjugering med deferoxamin, en siderophore anerkjent av Yersinia enterolitica, ved hjelp av en succinyl moiety som en linker er beskrevet.
Magnetiske nanopartikler (MNP) av magnetitt (Fe3O4) ble utarbeidet av solvotermisk metode og belagt med SiO2 (MNP@SiO2) ved hjelp av Stöber-prosessen etterfulgt av funksjonalisering med APTES (MNP@SiO2@NH2). Deretter ble feroxamin konjugert med MNP@SiO2@NH2 av karboksodiimidekobling for å gi MNP@SiO2@NH2@Fa. Morfologien og egenskapene til konjugat og mellomprodukter ble undersøkt av åtte forskjellige metoder, inkludert pulver X-Ray diffraction (XRD), Fourier forvandle infrarød spektroskopi (FT-IR), Raman spektroskopi, røntgen fotoelektronspektroskopi (XPS), overføring elektronmikroskopi (TEM) og energidispergering X-Ray (EDX) kartlegging. Denne uttømmende karakteriseringen bekreftet dannelsen av konjugatet. Til slutt, for å evaluere kapasiteten og spesifisiteten til nanopartiklene, ble de testet i en fangstbakterianalyse ved hjelp av Yersinia enterocolitica.
Bakteriedeteksjonsmetodene ved hjelp av MNP er basert på molekylær anerkjennelse av antistoffer, aptamers, bioprotein, karbohydrater konjugert til MNP av de patogene bakteriene1. Tatt i betraktning at siderophores er anerkjent av spesifikke reseptorer på den ytre membranen av bakterier, kan de også knyttet til MNP for å øke deres spesifisitet2. Siderophores er små organiske molekyler involvert i Fe3 + opptaket av bakterier3,4. Utarbeidelsen av konjugater mellom siderophores og MNP sammen med deres evaluering for fangst og isolering av bakterier er ennå ikke rapportert.
Et av de avgjørende trinnene i syntesen av konjugater av magnetiske nanopartikler med små molekyler er valg av type binding eller interaksjon mellom dem for å sikre at det lille molekylet er festet til overflaten av MNP. Av denne grunn var prosedyren for å forberede konjugaten mellom magnetiske nanopartikler og feroxamin – siderophore anerkjent av Yersinia enterocolitica– fokusert på generering av en modifiserbar overflate av MNP for å tillate å knytte den kovalent til siderophore av karmodiimidkjemi. For å få en jevn magnetitt nanopartikler (MNP) og for å forbedre kjernedannelse og størrelseskontroll, ble en solvolyse reaksjon med benzylalkohol båret i en termisk blokk uten å riste5. Deretter ble et silikabelegg generert av Stöber-metoden for å gi beskyttelse og forbedre stabiliteten til nanopartiklene suspensjon i vandige medier6. Med tanke på strukturen av feroxamin, er innføringen av amingrupper nødvendig for å produsere egnede nanopartikler (MNP@SiO2@NH2) som skal konjugeres med siderophore. Dette ble oppnådd ved kondens av (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) med alkoholgruppene tilstede på overflaten av silikamodifiserte nanopartikler (MNP@SiO2) ved hjelp av en sol-gel metode7.
Parallelt ble feroxaminjern(III)-komplekset utarbeidet ved kompleksisering av kommersielt tilgjengelig deferoksamin med jernacetylacetonat i vandig løsning. NN-succinylferoxamin, med ravngrupper som vil fungere som linkers, ble oppnådd ved reaksjonen av feroxamin med ravnanhydrid.
Bøyningen mellom MNP@SiO2@NH2 og N-succinylferoxamine for å gi MNP@SiO2@NH@Fa ble utført gjennom karboksodiimidkjemi ved hjelp av som koblingsreagenser benzotriazol-1-yl-oxy -tris-(dimethylamino)-fosfonium heksafluorofosfat (BOP) og 1-hydroxybenzotriazol (HOBt) i et mykt grunnleggende media for å aktivere terminalsyregruppen i N-succinylferoxamine8.
Når parlamentsmedlemmene ble karakterisert, evaluerte vi egenskapene til nakne og funksjonaliserte magnetiske nanopartikler for å fange villtype (WC-A) og en mutant av Y. enterocolitica som mangler feroxaminreseptor FoxA (FoxA WC-A 12-8). Vanlige parlamentsmedlemmer, funksjonaliserte parlamentsmedlemmer og konjugere MNP@SiO2@NH@Fa fikk lov til å samhandle med hver Y. enterocolitica stamme. Bakteriekonjugat aggregater ble skilt fra bakteriesuspensjon ved påføring av et magnetfelt. De separerte aggregatene ble skyllet to ganger med fosfatbufret saltvann (PBS), re-suspendert i PBS for å forberede seriefortynninger og deretter ble de belagt for kolonitelling. Denne protokollen demonstrerer hvert trinn i syntesen av MNP@SiO2@NH@Fa, strukturell karakterisering av alle mellomliggende og konjugat, og en bakteriefangstanalyse som en enkel måte å evaluere konjugatens spesifisitet i forhold til mellomliggendene. 9.
Denne protokollen beskriver syntesen av en konjugat mellom magnetiske nanopartikler og siderophore feroxamin ved kovalent binding. Syntesen av magnetitt ble utført ved hjelp av protokollen rapportert av Pinna et al.5 etterfulgt av silikabelegg for å beskytte den magnetiske kjernen av korrosjon i vandige systemer, for å minimere aggregeringen og for å gi en passende overflate for funksjonalisering6. Silikabeleggprosessen ble endret. I stedet for å utføre tre belegg som…
The authors have nothing to disclose.
Forfatterne anerkjenner takknemlig professor Klaus Hantke (Universitetet i Tübingen, Tyskland) for vennlig å levere Yersinia enterocolitica stammer som brukes i dette arbeidet. Dette arbeidet ble støttet av tilskudd AGL2015-63740-C2-1/2-R og RTI2018-093634-B-C21/C22 (AEI/FEDER, EU) fra State Agency for Research (AEI) i Spania, co-finansiert av FEDER-programmet fra EU. Arbeidet ved Universitetet i Santiago de Compostela og Universitetet i La Coruña ble også støttet av tilskudd GRC2018/018, GRC2018/039 og ED431E 2018/03 (CICA-INIBIC strategisk gruppe) fra Xunta de Galicia. Til slutt vil vi takke Nuria Calvo for hennes store samarbeid med å gjøre av denne videoprotokollen.
1-Hydroxybenzotriazole hydrate HOBT |
Acros | 300561000 | |
2,2′-Bipyridyl | Sigma Aldrich | D216305 | |
3-Aminopropyltriethoxysilane 99% | Acros | 151081000 | |
Ammonium hydroxide solution 28% NH3 | Sigma Aldrich | 338818 | |
Benzotriazol-1-yloxytris(dimethylamino)-phosphonium hexafluorophosphate BOP Reagent | Acros | 209800050 | |
Benzyl alcohol | Sigma Aldrich | 822259 | |
Deferoxamine mesylate salt >92,5% (TLC) | Sigma Aldrich | D9533 | |
Ethanol, anhydrous, 96% | Panreac | 131085 | |
Ethyl Acetate, Extra Pure, SLR, Fisher Chemical | |||
Iron(III) acetylacetonate 97% | Sigma Aldrich | F300 | |
LB Broth (Lennox) | Sigma Aldrich | L3022 | |
N,N-Diisopropylethylamine, 99.5+%, AcroSeal | Acros | 459591000 | |
N,N-Dimethylformamide, 99.8%, Extra Dry, AcroSeal | Acros | 326871000 | |
Pyridine, 99.5%, Extra Dry, AcroSeal | Acros | 339421000 | |
Sephadex LH-20 | Sigma Aldrich | LH20100 | |
Succinic anhydride >99% | Sigma Aldrich | 239690 | |
Tetraethyl orthosolicate >99,0% | Sigma Aldrich | 86578 |