Summary

Syntes av funktionaliserade magnetiska nanopartiklar, deras konjugation med Siderophore Feroxamine och dess utvärdering för bakterier upptäckt

Published: June 16, 2020
doi:

Summary

Detta arbete beskriver protokoll för beredning av magnetiska nanopartiklar, dess beläggning med SiO2, följt av dess amin funktionalisering med (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) och dess konjugation med deferoxamin med hjälp av en succinyl moiety som en länker. En djup strukturell karakterisering beskrivning och en fånga bakterier analys med Y. enterocolitica för alla mellanliggande nanopartiklar och den slutliga konjugat beskrivs också i detalj.

Abstract

I det nuvarande arbetet, syntesen av magnetiska nanopartiklar, dess beläggning med SiO2, följt av dess amin funktionalisering med (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) och dess konjugation med deferoxamin, en siderophore erkänns av Yersinia enterocolitica, med hjälp av en succinyl moiety som en länkare beskrivs.

Magnetiska nanopartiklar (MNP) av magnetit (Fe3O4) har utarbetats med solvotermisk metod och belagda med SiO2 (MNP@SiO2) med stöberprocessen följt av funktionalisering med APTES (MNP@SiO2@NH2). Sedan var feroxamin konjugerad med MNP@SiO2@NH2 av carbodiimide koppling för att ge MNP@SiO2@NH2@Fa. Konjugatens och intermediärernas morfologi och egenskaper undersöktes av åtta olika metoder, inklusive pulverröntgendiffraktion (XRD), Fourier transform infrared spektroskopi (FT-IR), Raman spektroskopi, röntgenfotoelektronspektroskopi (XPS), transmissionselektronmikroskopi (TEM) och energidispersive X-Ray (EDX) kartläggning. Denna uttömmande karakterisering bekräftade bildandet av konjugat. Slutligen, för att utvärdera nanopartiklarnas kapacitet och specificitet, testades de i en analys av avskiljningsbakterier med hjälp av Yersinia enterocolitica.

Introduction

De metoder för detektion av bakterier som använder MNP baseras på molekylär igenkänning av antikroppar, aptamerer, bioprotein, kolhydrater som konjugerats till MNP av de patogena bakterierna1. Med hänsyn till att sideroforer känns igen av specifika receptorer på bakteriernas yttre membran, kan de också kopplas till MNP för att öka deras specificitet2. Siderophores är små organiska molekyler som deltar i Fe3 + upptag av bakterier3,,4. Beredningen av konjugat mellan siderophores och MNP tillsammans med deras utvärdering för fångst och isolering av bakterier har ännu inte rapporterats.

Ett av de avgörande stegen i syntesen av konjugat av magnetiska nanopartiklar med små molekyler är valet av typ av bindning eller interaktion mellan dem för att säkerställa att den lilla molekylen är fäst vid MNP:s yta. Av denna anledning var förfarandet för att förbereda konjugatet mellan magnetiska nanopartiklar och feroxamin-siderophore erkänns av Yersinia enterocolitica-fokuseradepå generering av en modifierbar yta av MNP att tillåta att koppla den kovalent till siderofor av karbodiimid kemi. För att få en enhetlig magnetit nanopartiklar (MNP) och för att förbättra kärnbildning och storlekskontroll, en solvolys reaktion med bensylalkohol bars i ett termiskt block utan skakning5. Därefter genererades en kiseldioxidbeläggning med Stöber-metoden för att ge skydd och förbättra stabiliteten hos nanopartiklarnas suspension i vattenhaltigt medium6. Med hänsyn till feroxaminens struktur är införandet av amingrupper nödvändigt för att producera lämpliga nanopartiklar (MNP@SiO2@NH2) som skall konjugeras med sideroforen. Detta uppnåddes genom kondensering av (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) med de alkoholgrupper som finns på ytan av de kiseldioxidmodifierade nanopartiklarna (MNP@SiO2) med hjälp av en sol-gel metod7.

Parallellt med detta har feroxaminjärn(III) komplexet utarbetats genom complexation av kommersiellt tillgängliga deferoxamin med järn acetylactonat i vattenlösning. N-succinylferoxamine, med succinyl grupper som kommer att fungera som länkare, erhölls genom reaktionen av feroxamin med succinic anhydride.

Konjugationen mellan MNP@SiO2@NH2 och N-succinylferoxamin för att ge MNP@SiO2@NH@Fa utfördes genom karbodiimidkemi med hjälp av som kopplingsreagenser benzotriazole-1-yl-oxy-tris-(dimetylamino)-fosfonium hexafluorophosphate (BOP) och 1-hydroxybenzotriazole (HOBt) i en mjuk basmedia för att aktivera terminalsyragruppen i N-succinylferoxamin8.

När MNPs karakteriserades, utvärderade vi funktionerna hos nakna och funktionella magnetiska nanopartiklar för att fånga vilda typer (WC-A) och en mutant av Y. enterocolitica saknar feroxaminreceptor FoxA (FoxA WC-A 12-8). Vanliga parlamentsledamöter, funktionaliserade parlamentsledamöter och konjugat MNP@SiO2@NH@Fa fick interagera med varje Y. enterocolitica stam. Bakteriekonjugataggregaten separerades från bakterieupphängningen genom tillämpning av ett magnetfält. De separerade aggregat sköljdes två gånger med fosfat buffrad saltlösning (PBS), åter avbrytas i PBS att förbereda seriell utspädningar och sedan var de pläterade för kolonin räkna. Detta protokoll visar varje steg i syntesen av MNP@SiO2@NH@Fa, den strukturella karakterisering av alla intermediärer och konjugat, och en bakterie fånga analys som ett enkelt sätt att utvärdera specificitetkonjugat i förhållande till intermediärer. 9.

Protocol

OBS: För de reaktioner som utfördes under inert atmosfär villkor, var alla glas tidigare torkas i en ugn vid 65 °C, förseglade med en gummi septum och rensas med argon tre gånger. 1. Syntes av magnetiska nanopartiklar konjugerade med feroxamin Syntes av Fe3O4 magnetiska nanopartiklar (MNPs) Tillsätt 0,5 g Fe(acac)3 i en 20 ml glasflaska och blanda sedan med 10 ml bensylalkohol. Sonicate denna blandning i 2 min, sedan överfö…

Representative Results

En uttömmande strukturell karakterisering utförs för att bestämma morfologi och egenskaperna hos varje mellanliggande och den slutliga konjugat. För detta ändamål används teknikerna XRD, FT-IR, Raman spektroskopi, TGA, TEM, EDX-kartläggning och XPS för att påvisa konjugatets bildande. Atomernas oxidationstillstånd vid ytan av de nanopartiklar som förvärvats genom röntgenfotoelektronspektroskopi (XPS) är de mest relevanta uppgifterna för att bekräfta bildandet av kovalenta bindningar mellan nanopartikeln…

Discussion

Detta protokoll beskriver syntesen av en konjugat mellan magnetiska nanopartiklar och siderophore feroxamin genom kovalent bindning. Syntesen av magnetit utfördes med hjälp av det protokoll som rapporterats av Pinna et al.5 följt av kiseldioxidbeläggning för att skydda korrosions magnetiska kärna i vattensystem, för att minimera aggregering och för att ge en lämplig yta för funktionalisering6. Kiseldioxidbeläggningsprocessen ändrades. Istället för att utföra …

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Författarna erkänner tacksamt professor Klaus Hantke (Universitetar av Tübingen, Tyskland) för vänligt tillförsel Yersiniaen enterocolitica anstränger använt i detta arbete. Detta arbete stöddes av bidragen AGL2015-63740-C2-1/2-R och RTI2018-093634-B-C21/C22 (AEI/FEDER, EU) från den statliga forskningsbyrån (AEI) i Spanien, som medfinansieras av Feder-programmet från Europeiska unionen. Arbetet vid universitetet i Santiago de Compostela och universitetet i A Coruña stöddes också av bidrag GRC2018/018, GRC2018/039 och ED431E 2018/03 (CICA-INIBIC strategisk grupp) från Xunta de Galicien. Slutligen vill vi tacka Nuria Calvo för hennes stora samarbete gör voice-off detta videoprotokoll.

Materials

1-Hydroxybenzotriazole hydrate
HOBT
Acros 300561000
2,2′-Bipyridyl Sigma Aldrich D216305
3-Aminopropyltriethoxysilane 99% Acros 151081000
Ammonium hydroxide solution 28% NH3 Sigma Aldrich 338818
Benzotriazol-1-yloxytris(dimethylamino)-phosphonium hexafluorophosphate BOP Reagent Acros 209800050
Benzyl alcohol Sigma Aldrich 822259
Deferoxamine mesylate salt >92,5% (TLC) Sigma Aldrich D9533
Ethanol, anhydrous, 96% Panreac 131085
Ethyl Acetate, Extra Pure, SLR, Fisher Chemical
Iron(III) acetylacetonate 97% Sigma Aldrich F300
LB Broth (Lennox) Sigma Aldrich L3022
N,N-Diisopropylethylamine, 99.5+%, AcroSeal Acros 459591000
N,N-Dimethylformamide, 99.8%, Extra Dry, AcroSeal Acros 326871000
Pyridine, 99.5%, Extra Dry, AcroSeal Acros 339421000
Sephadex LH-20 Sigma Aldrich LH20100
Succinic anhydride >99% Sigma Aldrich 239690
Tetraethyl orthosolicate >99,0% Sigma Aldrich 86578

References

  1. Pan, Y., Du, X., Zhao, F., Xu, B. Magnetic nanoparticles for the manipulation of proteins and cells. Chemical Society Reviews. 41 (7), 2912-2942 (2012).
  2. Zheng, T., Nolan, E. M. Siderophore-based detection of Fe(III) and microbial pathogens. Metallomics. 4, 866-880 (2012).
  3. Hider, R. C., Kong, X. Chemistry and biology of siderophores. Natural Product Reports. 27 (5), 637-657 (2010).
  4. Sandy, M., Butler, A. Microbial Iron Acquisition: Marine and Terrestrial Siderophores. Chemical Reviews. 109 (10), 4580-4595 (2010).
  5. Pinna, N., Grancharov, S., Beato, P., Bonville, P., Antonietti, M., Niederberger, M. Magnetite Nanocrystals : Nonaqueous Synthesis, Characterization. Chemistry of Materials. 17 (15), 3044-3049 (2005).
  6. Li, Y. S., Church, J. S., Woodhead, A. L., Moussa, F. Preparation and characterization of silica coated iron oxide magnetic nano-particles. Spectrochimica Acta – Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. 76 (5), 484-489 (2010).
  7. Chen, J. P., Yang, P. C., Ma, Y. H., Tu, S. J., Lu, Y. J. Targeted delivery of tissue plasminogen activator by binding to silica-coated magnetic nanoparticle. International Journal of Nanomedicine. 7, 5137-5149 (2012).
  8. El-Boubbou, K., Gruden, C., Huang, X. Magnetic glyco-nanoparticles: a unique tool for rapid pathogen detection, decontamination, and strain differentiation. Journal of the American Chemical Society. 129 (44), 13392-13393 (2007).
  9. Martínez-Matamoros, D., et al. Preparation of functionalized magnetic nanoparticles conjugated with feroxamine and their evaluation for pathogen detection. RSC Advances. 9 (24), 13533-13542 (2019).
  10. Cozar, O., et al. Raman and surface-enhanced Raman study of desferrioxamine B and its Fe(III) complex, ferrioxamine B. Journal of Molecular Structure. 788 (1-3), 1-6 (2006).
  11. Shebanova, O. N., Lazor, P. Characterisation of a-C:H and oxygen-containing Si:C:H films by Raman spectroscopy and XPS. Journal of Solid State Chemistry. 174 (4), 424-430 (2003).
  12. González, P., Serra, J., Liste, S., Chiussi, S., León, B., Pérez-Amor, M. Raman spectroscopic study of bioactive silica based glasses. Journal of Non-Crystalline Solids. 320 (12), 92-99 (2003).
  13. Veres, M., et al. Characterisation of a-C:H and oxygen-containing Si:C:H films by Raman spectroscopy and XPS. Diamond and Related Materials. 14 (3-7), 1051-1056 (2005).
  14. You, Y., et al. Visualization and investigation of Si-C covalent bonding of single carbon nanotube grown on silicon substrate. Applied Physics Letters. 93 (10), 103111-103113 (2008).
  15. Graf, N., et al. XPS and NEXAFS studies of aliphatic and aromatic amine species on functionalized surfaces. Surface Science. 603 (18), 2849-2860 (2009).
  16. Michaeli, W., Blomfield, C. J., Short, R. D., Jones, F. R., Alexander, M. R. A study of HMDSO/O2 plasma deposits using a high-sensitivity and -energy resolution XPS instrument: curve fitting of the Si 2p core level. Applied Surface Science. 137 (1-4), 179-183 (2002).
  17. Liana, A. E., Marquis, C. P., Gunawan, C., Gooding, J. J., Amal, R. T4 bacteriophage conjugated magnetic particles for E. coli capturing: Influence of bacteriophage loading, temperature and tryptone. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 151, 47-57 (2017).
  18. Fang, W., Han, C., Zhang, H., Wei, W., Liu, R., Shen, Y. Preparation of amino-functionalized magnetic nanoparticles for enhancement of bacterial capture efficiency. RSC Advances. 6, 67875-67882 (2016).
  19. Zhan, S., et al. Efficient removal of pathogenic bacteria and viruses by multifunctional amine-modified magnetic nanoparticles. Journal of Hazardous Materials. 274, 115-123 (2014).

Play Video

Cite This Article
Martínez-Matamoros, D., Castro-García, S., Ojeda Romano, G., Balado, M., Rodríguez, J., Lemos, M. L., Jiménez, C. Synthesis of Functionalized Magnetic Nanoparticles, Their Conjugation with the Siderophore Feroxamine and its Evaluation for Bacteria Detection. J. Vis. Exp. (160), e60842, doi:10.3791/60842 (2020).

View Video