Detta arbete beskriver protokoll för beredning av magnetiska nanopartiklar, dess beläggning med SiO2, följt av dess amin funktionalisering med (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) och dess konjugation med deferoxamin med hjälp av en succinyl moiety som en länker. En djup strukturell karakterisering beskrivning och en fånga bakterier analys med Y. enterocolitica för alla mellanliggande nanopartiklar och den slutliga konjugat beskrivs också i detalj.
I det nuvarande arbetet, syntesen av magnetiska nanopartiklar, dess beläggning med SiO2, följt av dess amin funktionalisering med (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) och dess konjugation med deferoxamin, en siderophore erkänns av Yersinia enterocolitica, med hjälp av en succinyl moiety som en länkare beskrivs.
Magnetiska nanopartiklar (MNP) av magnetit (Fe3O4) har utarbetats med solvotermisk metod och belagda med SiO2 (MNP@SiO2) med stöberprocessen följt av funktionalisering med APTES (MNP@SiO2@NH2). Sedan var feroxamin konjugerad med MNP@SiO2@NH2 av carbodiimide koppling för att ge MNP@SiO2@NH2@Fa. Konjugatens och intermediärernas morfologi och egenskaper undersöktes av åtta olika metoder, inklusive pulverröntgendiffraktion (XRD), Fourier transform infrared spektroskopi (FT-IR), Raman spektroskopi, röntgenfotoelektronspektroskopi (XPS), transmissionselektronmikroskopi (TEM) och energidispersive X-Ray (EDX) kartläggning. Denna uttömmande karakterisering bekräftade bildandet av konjugat. Slutligen, för att utvärdera nanopartiklarnas kapacitet och specificitet, testades de i en analys av avskiljningsbakterier med hjälp av Yersinia enterocolitica.
De metoder för detektion av bakterier som använder MNP baseras på molekylär igenkänning av antikroppar, aptamerer, bioprotein, kolhydrater som konjugerats till MNP av de patogena bakterierna1. Med hänsyn till att sideroforer känns igen av specifika receptorer på bakteriernas yttre membran, kan de också kopplas till MNP för att öka deras specificitet2. Siderophores är små organiska molekyler som deltar i Fe3 + upptag av bakterier3,,4. Beredningen av konjugat mellan siderophores och MNP tillsammans med deras utvärdering för fångst och isolering av bakterier har ännu inte rapporterats.
Ett av de avgörande stegen i syntesen av konjugat av magnetiska nanopartiklar med små molekyler är valet av typ av bindning eller interaktion mellan dem för att säkerställa att den lilla molekylen är fäst vid MNP:s yta. Av denna anledning var förfarandet för att förbereda konjugatet mellan magnetiska nanopartiklar och feroxamin-siderophore erkänns av Yersinia enterocolitica-fokuseradepå generering av en modifierbar yta av MNP att tillåta att koppla den kovalent till siderofor av karbodiimid kemi. För att få en enhetlig magnetit nanopartiklar (MNP) och för att förbättra kärnbildning och storlekskontroll, en solvolys reaktion med bensylalkohol bars i ett termiskt block utan skakning5. Därefter genererades en kiseldioxidbeläggning med Stöber-metoden för att ge skydd och förbättra stabiliteten hos nanopartiklarnas suspension i vattenhaltigt medium6. Med hänsyn till feroxaminens struktur är införandet av amingrupper nödvändigt för att producera lämpliga nanopartiklar (MNP@SiO2@NH2) som skall konjugeras med sideroforen. Detta uppnåddes genom kondensering av (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES) med de alkoholgrupper som finns på ytan av de kiseldioxidmodifierade nanopartiklarna (MNP@SiO2) med hjälp av en sol-gel metod7.
Parallellt med detta har feroxaminjärn(III) komplexet utarbetats genom complexation av kommersiellt tillgängliga deferoxamin med järn acetylactonat i vattenlösning. N-succinylferoxamine, med succinyl grupper som kommer att fungera som länkare, erhölls genom reaktionen av feroxamin med succinic anhydride.
Konjugationen mellan MNP@SiO2@NH2 och N-succinylferoxamin för att ge MNP@SiO2@NH@Fa utfördes genom karbodiimidkemi med hjälp av som kopplingsreagenser benzotriazole-1-yl-oxy-tris-(dimetylamino)-fosfonium hexafluorophosphate (BOP) och 1-hydroxybenzotriazole (HOBt) i en mjuk basmedia för att aktivera terminalsyragruppen i N-succinylferoxamin8.
När MNPs karakteriserades, utvärderade vi funktionerna hos nakna och funktionella magnetiska nanopartiklar för att fånga vilda typer (WC-A) och en mutant av Y. enterocolitica saknar feroxaminreceptor FoxA (FoxA WC-A 12-8). Vanliga parlamentsledamöter, funktionaliserade parlamentsledamöter och konjugat MNP@SiO2@NH@Fa fick interagera med varje Y. enterocolitica stam. Bakteriekonjugataggregaten separerades från bakterieupphängningen genom tillämpning av ett magnetfält. De separerade aggregat sköljdes två gånger med fosfat buffrad saltlösning (PBS), åter avbrytas i PBS att förbereda seriell utspädningar och sedan var de pläterade för kolonin räkna. Detta protokoll visar varje steg i syntesen av MNP@SiO2@NH@Fa, den strukturella karakterisering av alla intermediärer och konjugat, och en bakterie fånga analys som ett enkelt sätt att utvärdera specificitetkonjugat i förhållande till intermediärer. 9.
Detta protokoll beskriver syntesen av en konjugat mellan magnetiska nanopartiklar och siderophore feroxamin genom kovalent bindning. Syntesen av magnetit utfördes med hjälp av det protokoll som rapporterats av Pinna et al.5 följt av kiseldioxidbeläggning för att skydda korrosions magnetiska kärna i vattensystem, för att minimera aggregering och för att ge en lämplig yta för funktionalisering6. Kiseldioxidbeläggningsprocessen ändrades. Istället för att utföra …
The authors have nothing to disclose.
Författarna erkänner tacksamt professor Klaus Hantke (Universitetar av Tübingen, Tyskland) för vänligt tillförsel Yersiniaen enterocolitica anstränger använt i detta arbete. Detta arbete stöddes av bidragen AGL2015-63740-C2-1/2-R och RTI2018-093634-B-C21/C22 (AEI/FEDER, EU) från den statliga forskningsbyrån (AEI) i Spanien, som medfinansieras av Feder-programmet från Europeiska unionen. Arbetet vid universitetet i Santiago de Compostela och universitetet i A Coruña stöddes också av bidrag GRC2018/018, GRC2018/039 och ED431E 2018/03 (CICA-INIBIC strategisk grupp) från Xunta de Galicien. Slutligen vill vi tacka Nuria Calvo för hennes stora samarbete gör voice-off detta videoprotokoll.
1-Hydroxybenzotriazole hydrate HOBT |
Acros | 300561000 | |
2,2′-Bipyridyl | Sigma Aldrich | D216305 | |
3-Aminopropyltriethoxysilane 99% | Acros | 151081000 | |
Ammonium hydroxide solution 28% NH3 | Sigma Aldrich | 338818 | |
Benzotriazol-1-yloxytris(dimethylamino)-phosphonium hexafluorophosphate BOP Reagent | Acros | 209800050 | |
Benzyl alcohol | Sigma Aldrich | 822259 | |
Deferoxamine mesylate salt >92,5% (TLC) | Sigma Aldrich | D9533 | |
Ethanol, anhydrous, 96% | Panreac | 131085 | |
Ethyl Acetate, Extra Pure, SLR, Fisher Chemical | |||
Iron(III) acetylacetonate 97% | Sigma Aldrich | F300 | |
LB Broth (Lennox) | Sigma Aldrich | L3022 | |
N,N-Diisopropylethylamine, 99.5+%, AcroSeal | Acros | 459591000 | |
N,N-Dimethylformamide, 99.8%, Extra Dry, AcroSeal | Acros | 326871000 | |
Pyridine, 99.5%, Extra Dry, AcroSeal | Acros | 339421000 | |
Sephadex LH-20 | Sigma Aldrich | LH20100 | |
Succinic anhydride >99% | Sigma Aldrich | 239690 | |
Tetraethyl orthosolicate >99,0% | Sigma Aldrich | 86578 |