Ein Abonnement von JoVE ist erforderlich, um diesen Inhalt anzuzeigen. Melden Sie sich an oder beginnen Sie noch heute mit einer kostenlosen Testphase.

Methodenartikel

Analyse der mechanoenzymatischen Eigenschaften prozessiver Myosine mit ultraschneller Kraftklemmenspektroskopie

1.4K Aufrufe

⸱

DOI:

10.3791/62388

⸱

1. Juli 2021

 ,  ,  , 

In diesem Artikel

Erratum-Hinweis

Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice

Zusammenfassung

Hier wird ein umfassendes Protokoll zur Durchführung von ultraschnellen Kraftklemmexperimenten an prozessiven Myosin-5-Motoren vorgestellt, das leicht auf die Untersuchung anderer Klassen von prozessiven Motoren ausgeweitet werden könnte. Das Protokoll beschreibt alle notwendigen Schritte, von der Einrichtung der Versuchsapparatur über die Probenvorbereitung bis hin zur Datenerfassung und Analyse.

Zusammenfassung

Die Ultrakurzzeit-Kraftklemmenspektroskopie (UFFCS) ist eine auf einer Laserpinzette basierende Einzelmolekültechnik, die es ermöglicht, die Chemomechanik sowohl konventioneller als auch unkonventioneller Myosine unter Last mit bisher unerreichter Zeitauflösung zu untersuchen. Insbesondere die Möglichkeit, Myosinmotoren direkt nach der Aktin-Myosin-Bindungsbildung unter konstanter Kraft zu untersuchen, hat zusammen mit der hohen Rate der Kraftrückkopplung (200 kHz) gezeigt, dass UFFCS ein wertvolles Werkzeug ist, um die Lastabhängigkeit schneller Dynamiken wie des Myosin-Arbeitsschlags zu untersuchen. Darüber hinaus ermöglicht UFFCS die Untersuchung, wie prozessive und nicht-prozessive Myosin-Aktin-Wechselwirkungen durch die Intensität und Richtung der angewendeten Kraft beeinflusst werden.

Durch die Befolgung dieses Protokolls wird es möglich sein, ultraschnelle Kraftklemmexperimente an prozessiven Myosin-5-Motoren und an einer Vielzahl von unkonventionellen Myosinen durchzuführen. Durch einige Anpassungen konnte das Protokoll auch leicht auf die Untersuchung anderer Klassen von Prozessmotoren wie Kinesine und Dyneine ausgedehnt werden. Das Protokoll umfasst alle notwendigen Schritte, vom Aufbau der Versuchsapparatur über die Probenvorbereitung bis hin zu Kalibrierverfahren, Datenerfassung und Analyse.

Einleitung

In den letzten Jahrzehnten waren optische Pinzetten ein wertvolles Werkzeug, um die Mechanochemie von Proteininteraktionen auf Einzelmolekülebene aufzuklären, da sie die Möglichkeit der gleichzeitigen Manipulation und Messung von Konformationsänderungen und enzymatischer Kinetik auffallen lassen 1,2. Insbesondere die Fähigkeit, Kräfte im Bereich molekularer Motoren in der Zelle aufzubringen und zu messen, sowie die Fähigkeit, Konformationsänderungen im Sub-Nanometer-Bereich zu messen, machten optische Pinzetten zu einem einzigartigen Einzelmolekülwerkzeug, um die chemomechanischen Eigenschaften von Motorprotei....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Protokoll

1. Optischer Aufbau

HINWEIS: Der Versuchsaufbau besteht aus einer doppelten optischen Pinzette mit Nanometer-Ausrichtungsstabilität und < 1% Laserintensitätsschwankungen. Unter diesen Bedingungen ist die Stabilität der Hantel auf Nanometerebene unter typischer Fallensteifigkeit (0,1 pN/nm) und Spannung (1 pN - einige zehn pN) gewährleistet. Abbildung 2 zeigt ein detailliertes Schema des optischen Aufbaus.

  1. Design und Konstruktion einer optischen Pinzette 9,10,11.
    1. Platzieren Sie alle Komponenten des Auf....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Ergebnisse

Repräsentative Daten bestehen aus Positionsdatensätzen im Zeitverlauf, wie in Abbildung 4 dargestellt. In der Positionsaufzeichnung sind zwei Arten von Verschiebungen sichtbar. Erstens, wenn der Myosinmotor nicht mit dem Aktinfilament wechselwirkt, bewegen sich die gefangenen Kügelchen mit konstanter Geschwindigkeit gegen die viskose Widerstandskraft der Lösung und zeigen eine lineare Verschiebung, die innerhalb des vom Bediener in einer Dreieckswelle3 eingestellten S.......

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Diskussion

Obwohl Einzelmolekültechniken, wie der Drei-Perlen-Assay, technisch anspruchsvoll sind und einen geringen Durchsatz haben, verbessert UFFCS die Detektion molekularer Wechselwirkungen dank des hohen Signal-Rausch-Verhältnisses der Daten. UFFCS ermöglicht die Untersuchung der Lastabhängigkeit von Motorproteinen mit den Hauptvorteilen, dass die Kraft bei der Bindung des Motors an das Filament sehr schnell angewendet wird, um frühe und sehr schnelle Ereignisse in der Krafterzeugung und schwache Bindungszustände unter kontrol.......

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Offenlegungen

Die Autoren erklären, dass keine Interessenkonflikte im Zusammenhang mit diesem Artikel bestehen.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde durch das Forschungs- und Innovationsprogramm Horizon 2020 der Europäischen Union im Rahmen der Finanzhilfevereinbarung Nr. 871124 Laserlab-Europe, durch das italienische Ministerium für Universität und Forschung (FIRB "Futuro in Ricerca" 2013 Grant No. RBFR13V4M2) und durch die Ente Cassa di Risparmio di Firenze unterstützt. A.V. Kashchuk wurde vom Human Frontier Science Program Cross-Disciplinary Fellowship LT008/2020-C unterstützt.

....

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
  Aliphatische Amin-Latex-PerlenThermoFisherA373621.0-μ m Durchmesser, 2% (w/v)
AcetonSigma32201
Aktin-PolymerisationspufferZytoskelettBSA0210X
AODs (akustooptische Deflektoren)AA Opto ElectronicDTS-XY 250Laserstrahldeflektoren
ATPSigmaA7699
Biotinyliert-BSAThermoFisher29130
BSASigmaB4287
Calmodulin aus Schweinehirn (CaM)Merck Millipore208783
Katalanie aus RinderleberSigmaC40
KondensatorOlympusOlympusU-AAC, Aplanat, AchromatNA 1.4, Ölimmersion
Kreatinphosphat DinatriumsalztetrahydratSigma27920
Kreatinphosphokinase aus KaninchenmuskelSigmaC3755
DDsAA Opto ElectronicAA. DDS. XXZweikanaliger digitaler Synthesizer
DL-Dithiothreitol (DTT)/td>Sigma43819
EGTASigmaE4378
G-Aktin-ProteinZytoskelettAKL99
GlukoseSigmaG7528
Glukoseoxidase aus Aspergillus nigerSigma  G7141
HaloTag Succinimidylester O2-LigandPromegaP1691
Hochvakuum-Silikonfett schwerMerck Millipore107921
KClSigmaP9541
KH2PO4/K2HPO4SigmaP5379/ P8281
LabviewNational InstrumentsVersion 8.1Datenerfassung
Labview FPGA-ModulNational InstrumentsVersion 8.1Fast Force-Clamp
MatlabMathWorks2016Datenanalyse
MgCl2Fluka63020
Mikroskop ObjektivNikonPlan-Apo 60XNA 1.2, WD 0.2 mm, Wasser imm.
MOPSSigmaM1254
NitrocelluloseSigmaN82670,45 Porengröße
PentylacetatlösungSigma46022
Reines Ethanol Sigma2860
QPDsUDTDLS-20D Position Detecto
Rhodamin BSAMolekulare SondenA23016
Rhodamin Phalloidin  SigmaP1951
Silica KügelchenBangslabsSS04N1,21 mm, 10% Feststoffe
Natriumazidnbsp; SigmaS2002
Streptavidin-Protein  Sigma189730
&

Referenzen

  1. Ashkin, A., Dziedzic, J. M., Bjorkholm, J. E., Chu, S. Observation of a single-beam gradient force optical trap for dielectric particles. Optical Angular Momentum. 11 (5), 196-198 (2016).
  2. Capitanio, M., Pavone, F. S.

Zugriff eingeschränkt. Bitte melden Sie sich an oder starten Sie eine Testversion, um diesen Inhalt anzuzeigen.

Nachdrucke und Genehmigungen

Erratum


Formal Correction: Erratum: Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultra Force-Clamp Spectroscopy
Posted by JoVE Editors on 8/25/2021. Citeable Link.

An erratum was issued for: Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultra Force-Clamp Spectroscopy. The title was updated.

The title was updated from:

Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultra Force-Clamp Spectroscopy

to:

Dissecting Mechanoenzymatic Properties of Processive Myosins with Ultrafast Force-Clamp Spectroscopy

Weitere Artikel entdecken

LaserpinzettenEinzelmolekültechnikMyosin-ArbeitsschlagAktin-Myosin-InteraktionKraftrückkopplungKalibrierung der optischen Fallebiotinyliertes Myosin-5Bakusto-optische Deflektoren