Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Bioengineering

تضخيم الإشريكية القولونية في رقاقة الموائع الدقيقة PCR ذات التدفق المستمر واكتشافها باستخدام نظام الرحلان الكهربائي الشعري

Published: November 21, 2023 doi: 10.3791/63523

Summary

يصف هذا البروتوكول كيفية بناء نظام سلسلة بوليميراز التدفق المستمر على أساس شريحة الموائع الدقيقة وكيفية بناء نظام الرحلان الكهربائي الشعري في المختبر. يقدم طريقة بسيطة لتحليل الأحماض النووية في المختبر.

Abstract

تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) هو طريقة تقليدية تستخدم لتضخيم الجين المستهدف الذي لعب دورا مهما في التشخيص الجزيئي الحيوي. ومع ذلك ، فإن تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدي يستغرق وقتا طويلا للغاية بسبب كفاءة تباين درجات الحرارة المنخفضة. يقترح هذا العمل نظام تفاعل البوليميراز المتسلسل المستمر التدفق (CF-PCR) على أساس شريحة الموائع الدقيقة. يمكن تقليل وقت التضخيم بشكل كبير عن طريق تشغيل محلول PCR في قناة صغيرة موضوعة على سخانات مضبوطة في درجات حرارة مختلفة. علاوة على ذلك ، نظرا لأن الرحلان الكهربائي الشعري (CE) هو طريقة مثالية للتمييز بين منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل الإيجابية والكاذبة ، فقد تم بناء نظام CE لتحقيق الفصل الفعال لشظايا الحمض النووي. تصف هذه الورقة عملية تضخيم الإشريكية القولونية (E. coli) بواسطة نظام CF-PCR المدمج داخليا والكشف عن منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل بواسطة CE. تظهر النتائج أن الجين المستهدف من E. coli قد تم تضخيمه بنجاح في غضون 10 دقائق ، مما يشير إلى أنه يمكن استخدام هذين النظامين للتضخيم السريع والكشف عن الأحماض النووية.

Introduction

تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) هو تقنية بيولوجيا جزيئية تستخدم لتضخيم شظايا معينة من الحمض النووي ، وبالتالي تضخيم كميات ضئيلة من الحمض النووي مئات الملايين من المرات. لقد تم استخدامه على نطاق واسع في التشخيص السريري ، والبحوث الطبية ، وسلامة الأغذية ، وتحديد الطب الشرعي ، وغيرها من المجالات. تتكون عملية تفاعل البوليميراز المتسلسل بشكل أساسي من ثلاث خطوات: تمسخ عند 90-95 درجة مئوية ، والتلدين عند 50-60 درجة مئوية ، والتمديد عند 72-77 درجة مئوية. تعد الدورة الحرارية جزءا مهما من عملية تفاعل البوليميراز المتسلسل ؛ ومع ذلك ، فإن جهاز تدوير الدراجات الحرارية PCR التقليدي ليس ضخما فحسب ، بل غير فعال أيضا ، ويتطلب حوالي 40 دقيقة لإكمال 25 دورة. للتغلب على هذه القيود ، تم بناء نظام تفاعل البوليميراز المتسلسل المستمر التدفق (CF-PCR) داخليا ، استنادا إلى شريحة الموائع الدقيقة. يمكن أن يوفر CF-PCR الوقت بشكل كبير عن طريق دفع حل PCR إلى القنوات الدقيقة الموضوعة على السخانات في درجات حرارة مختلفة1،2،3،4،5.

نظرا لأن الرحلان الكهربائي الشعري (CE) له العديد من المزايا ، مثل الدقة العالية والسرعة العالية والتكاثر الممتاز6،7،8،9،10،11 ، فقد أصبح أداة شائعة في المختبر لتحليل الأحماض النووية والبروتينات. ومع ذلك ، فإن معظم المختبرات ، وخاصة المختبرات في العالم النامي ، لا تستطيع تحمل تكلفة هذه التكنولوجيا بسبب ارتفاع سعر أداة CE. هنا ، حددنا بروتوكولات لكيفية تصنيع رقاقة الموائع الدقيقة CF-PCR وكيفية بناء نظام CE متعدد الاستخدامات في المختبر. نوضح أيضا عملية تضخيم الإشريكية القولونية بواسطة نظام CF-PCR هذا واكتشاف منتجات PCR بواسطة نظام CE. باتباع الإجراءات الموضحة في هذا البروتوكول ، يجب أن يكون المستخدمون قادرين على تصنيع رقائق الموائع الدقيقة ، وإعداد حلول تفاعل البوليميراز المتسلسل ، وبناء نظام CF-PCR لتضخيم الحمض النووي ، وإنشاء نظام CE بسيط ، حتى مع الموارد المحدودة ، لفصل شظايا الحمض النووي.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

ملاحظة: راجع جدول المواد للحصول على التفاصيل المتعلقة بجميع المواد والكواشف والمعدات المستخدمة في هذا البروتوكول.

1. تصنيع رقاقة الموائع الدقيقة CF-PCR

  1. سخني رقاقة السيليكون على حرارة 200 درجة مئوية لمدة 25 دقيقة لإزالة الرطوبة.
  2. الاستغناء عن 1 مل من SU-8-2075 مقاوم للضوء لكل بوصة من الرقاقة. قم بتدويرها على رقاقة السيليكون باستخدام طبقة دوران عند 500 دورة في الدقيقة لمدة 5-10 ثوان مع تسارع 100 دورة في الدقيقة / ثانية ، ثم عند 2000 دورة في الدقيقة لمدة 30 ثانية مع تسارع 500 دورة في الدقيقة / ثانية.
  3. تخبز رقاقة السيليكون على حرارة 65 درجة مئوية لمدة 3 دقائق ، ثم على حرارة 95 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة.
  4. اضبط 150 - 215 مللي جول / سم² كطاقة تعرض لآلة الطباعة الحجرية الضوئية ، وقم بنقش النمط المصمم على مقاوم الضوء باستخدام قناع الطباعة الحجرية الضوئية. ضع رقاقة السيليكون والقناع جاهزين للتعرض.
  5. بعد التعرض ، اخبز رقاقة السيليكون على حرارة 65 درجة مئوية لمدة 2 دقيقة ، ثم على حرارة 95 درجة مئوية لمدة 7 دقائق.
  6. اغمر رقاقة السيليكون في محلول المطور لإزالة المقاومة الزائدة للضوء وإخراجها عندما يمكن رؤية القنوات الدقيقة (الشكل 1). استخدم الأيزوبروبانول لشطف محلول المطور المتبقي.
  7. امزج بولي ثنائي ميثيل سيلوكسان (PDMS) وعامل المعالجة بنسبة 10: 1. صب محلول PDMS المختلط في قالب النسخة المتماثلة وقم بتثبيته عند 80 درجة مئوية لمدة 60 دقيقة.
  8. قم بربط شريحة الموائع الدقيقة PDMS على شريحة بعد التنشيط باستخدام منظف البلازما ، وقم بتثبيتها عند 80 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة في أسرع وقت ممكن (الشكل 2).
    ملاحظة: الأبعاد الخارجية للرقاقة هي 80.0 مم × 30.0 مم × 0.4 مم. هناك 40 قناة اعوج (100 ميكرومتر × 1.46 مم × 100 ميكرومتر ، عرض × طول × عمق) في رقاقة الموائع الدقيقة.

2. إعداد حل PCR

  1. قم بإذابة الكواشف تماما قبل التكوين. استخدم خلاط دوامة وأجهزة طرد مركزي لضمان خلط الكواشف جيدا.
  2. قم بإعداد أنبوب طرد مركزي ، مع إضافة المكونات التالية بهذا الترتيب: 33.75 ميكرولتر من الماء ، 1.0 ميكرولتر من قالب الحمض النووي ، 0.5 ميكرولتر من التمهيدي ، 5.0 ميكرولتر من المخزن المؤقت ، 4.0 ميكرولتر من خليط dNTP ، 1.5 ميكرولتر من توين 20 ، 3.5 ميكرولتر من PVP ، وأخيرا 0.25 ميكرولتر من بوليميراز الحمض النووي.
    ملاحظة: هنا ، قالب الحمض النووي المستخدم هو E. coli. يتم سرد الاشعال للإشريكية القولونية ومكونات محلول PCR في الجدول 1 والجدول 2 ، على التوالي.
  3. خلط الحل عن طريق دوامة.

3. بناء نظام CF-PCR

  1. قم بإعداد سخانين من السيراميك بمعامل درجة الحرارة الموجبة (PTC) ، ومرحلين للحالة الصلبة ، وجهازي تحكم في درجة الحرارة PID ، ومستشعرين لدرجة الحرارة ، وسلك طاقة.
    ملاحظة: يعتمد حجم سخانات السيراميك PTC على حجم رقاقة الموائع الدقيقة ؛ يجب أن يكون الطول أكبر من طول الشريحة - الطول والعرض والارتفاع لسخانات السيراميك PTC المستخدمة هنا هو 10 سم × 2 سم × 0.4 سم.
  2. قم بتوصيل السخان بمرحل الحالة الصلبة.
  3. قم بتوصيل مرحل الحالة الصلبة بجهاز التحكم في درجة الحرارة PID.
  4. قم بتوصيل مسبار مستشعر درجة الحرارة بأسفل السخانين وقم بتوصيل الطرف بجهاز التحكم في درجة الحرارة PID.
  5. قم بتوصيل مرحلتين من الحالة الصلبة في سلسلة وقم بتوصيل سلك الطاقة.
  6. اطبع 3D فتحة للسخانين واحتفظ بالسخانات على نفس المستوى (انظر الملف التكميلي 1 لملفات STL المطلوبة للطباعة ثلاثية الأبعاد).
    ملاحظة: اترك فجوة هوائية 12 مم بين السخانين.
  7. ضع شريحة الموائع الدقيقة على السخانين.
  8. قم بإعداد مضخة حقنة ومحقنة ، وقم بتثبيت المحقنة على مضخة المحقنة ، وقم بتوصيل أنبوب سيليكون (قطر داخلي 0.8 مم [ID]) بحقنة ، وقم بتوصيل إبرة فولاذية (معرف 0.7 مم) بأعلى أنبوب السيليكون (الشكل 3).
  9. أدخل الإبرة الفولاذية في مدخل رقاقة الموائع الدقيقة.
  10. ضع طرف ماصة عند مخرج الشريحة لجمع منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل.

4. بناء نظام CE

  1. استخدام مصدر طاقة عالي الجهد لتوليد مجال كهربائي نابض ؛ لاحظ الأقطاب الموجبة والسالبة.
  2. استخدم مصباح الزئبق كمصدر للضوء وقم بتصفية الطول الموجي للإثارة من مصباح الزئبق من خلال مرشح.
  3. ضع الشعيرات الدموية على مرحلة المجهر.
  4. اجمع انبعاث التألق مع الهدف ، ثم اكتشفه باستخدام أنبوب المضاعف الضوئي R928 (PMT). مراقبة المجهر والشعيرات الدموية. قم بتشغيل الضوء في ظل ظروف الغرفة المظلمة ؛ يتم جمع ضوء الإثارة حسب الهدف.
  5. استخدم برنامج LABVIEW المطور ذاتيا للتحكم في مصدر الطاقة وإكمال الحصول على البيانات (الموضح في الخطوات 6.3-6.6). انظر https://github.com/starliyan/labview/blob/main/CZE20170723.vi.
    ملاحظة: تم إجراء جميع التجارب في غرفة مظلمة ، ويظهر الرسم التخطيطي لنظام CE في الشكل 4.

5. قم بتشغيل حل PCR

  1. اضبط مسبقا درجة حرارة سخانات نظام CF-PCR على 65 درجة مئوية و 95 درجة مئوية.
  2. ضع رقاقة الموائع الدقيقة على كتلتي التسخين.
  3. أدخل طرف أنبوب السيليكون في أنبوب طرد مركزي يحتوي على 50 ميكرولتر من محلول تفاعل البوليميراز المتسلسل (من الخطوة 2.3). اسحب مكبس المحقنة لسحب المحلول ببطء. ثبت المحقنة على مضخة حقنة. أدخل الإبرة الفولاذية في مدخل رقاقة الموائع الدقيقة.
  4. اضبط معدل تدفق المضخة على 10 ميكرولتر / دقيقة واضغط على زر البدء لدفع المحلول في القناة الدقيقة عند مدخل الرقاقة.
  5. جمع منتجات PCR عند مخرج رقاقة الموائع الدقيقة.
    ملاحظة: شطف القناة بالماء عالي النقاء قبل وبعد تفاعل البوليميراز المتسلسل لإزالة الشوائب.

6. الكشف عن منتجات PCR بواسطة نظام CE المدمج في المنزل

  1. تحضير الشعيرات الدموية بطول إجمالي 8 سم وطول فعال 6 سم.
  2. قم بإعداد مخزن الفصل المؤقت عن طريق خلط 100 ميكرولتر من 1٪ هيدروكسي إيثيل سلولوز (HEC ، w / v) ، 2 ميكرولتر من 100x SYBR Green I ، و 98 ميكرولتر من الماء عالي النقاء للحصول على 0.5٪ HEC (w / v) يحتوي على 1x SYBR Green I.
  3. املأ الشعيرات الدموية بمخزن الفصل المحضر باستخدام مضخة تفريغ.
  4. أدخل جهد الحقن (800 فولت) ووقت الحقن (2.0 ثانية) على واجهة البرنامج ، وانقر فوق زر البدء ، وانتظر حتى يتم إدخال منتجات PCR كهروديناميكيا في الشعيرات الدموية عند 100 فولت / سم (2.0 ثانية).
    ملاحظة: في هذه الخطوة ، يتم وضع منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل على القطب السالب ويتم وضع المخزن المؤقت على القطب الموجب.
  5. أدخل جهد التيار المستمر (800 فولت) على واجهة البرنامج ، وانقر فوق زر البدء ، وقم بتشغيل الرحلان الكهربائي عند 100 فولت / سم من شدة المجال الكهربائي.
    ملاحظة: في هذه الخطوة، يتم وضع كل من الأقطاب الكهربائية الموجبة والسالبة مع المخزن المؤقت.
  6. انقر فوق زر التوقف بعد فصل جميع أجزاء الحمض النووي (DNA) في الشعيرات الدموية.
  7. اغسل الشعيرات الدموية بالماء المعقم لمدة 1 دقيقة بعد كل تشغيل.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

يمثل الشكل 5 مخطط كهربية لمنتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل وعلامات الحمض النووي. التتبع (الشكل 5A) هو نتيجة CE للمنتج المضخم CF-PCR ، والتتبع (الشكل 5B) هو نتيجة CE للمنتج المضخم بواسطة الدورة الحرارية ، والتتبع (الشكل 5C) هو نتيجة CE لسلم الحمض النووي 100 bp. قمنا أولا بتضخيم الجين المستهدف للإشريكية القولونية في نظام CF-PCR. استغرق حل PCR ~ 10 دقائق و 30 ثانية من المدخل إلى مخرج الشريحة. كان حجم الأمبليكون المستهدف للإشريكية القولونية 544 نقطة أساس. تم تحليل منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل المضخم في نظام CE ، كما تم إجراء CE لسلم الحمض النووي 100 bp في ظل نفس الظروف التجريبية. يمكن تقييم حجم منتج PCR وفقا لمخطط كهربية سلم الحمض النووي. تم إجراء كل تجربة ثلاث مرات للتكاثر. تظهر البيانات الواردة في الشكل 5 أن القمم المقابلة لمنتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل للإشريكية القولونية لوحظت بعد الانفصال ، وكانت أوقات هجرة منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل في رقاقة الموائع الدقيقة متسقة مع تلك الموجودة في دورة حرارية.

Figure 1
الشكل 1: رقاقة السيليكون النظيفة. شريط المقياس = 1 سم. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

Figure 2
الشكل 2: رقاقة الموائع الدقيقة CF-PCR المصنوعة باستخدام PDMS. كانت القنوات الصغيرة مملوءة بالحبر الأحمر للتصور. شريط المقياس = 1 سم. الاختصارات: CF-PCR = التدفق المستمر PCR ؛ PDMS = بوليديميثيسيلوكسان. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 3
الشكل 3: نظام CF-PCR. (1) رقاقة ميكروفلويديك ، (2) سخان سيراميك PTC ، (3) حقنة ، (4) مضخة ، (5) أنابيب سيليكون ، (6) فتحة ، (7) إبرة فولاذية ، (8) طرف ماصة ، (9) جهاز تحكم في درجة الحرارة PID ، (10) مستشعر درجة الحرارة ، (11) مرحل الحالة الصلبة. اختصار: CF-PCR = التدفق المستمر PCR. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 4
الشكل 4: بناء نظام CE. الاختصارات: CE = رحلان كهربائي شعري. PMT = أنبوب المضاعف الضوئي ؛ A1 ، A2 = مرشحات ؛ ب = عدسة المجال ؛ C = مرآة ثنائية اللون. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 5
الشكل 5: مخطط كهربية الإشريكية القولونية. التضخيم بواسطة (أ) رقاقة الموائع الدقيقة CF-PCR ، (ب) الدورة الحرارية التقليدية PCR ، و (ج) علامات الحمض النووي. اختصار: CF-PCR = التدفق المستمر PCR. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

هدف تسلسل 5 ′ ...... 3′ أمبليكون (بي بي)
إي سي إف GGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGCTGAC 544
إي سي آر AGCCCGGGGATTTCACATCTGACTTA

الجدول 1: الاشعال المستخدمة في الإشريكية القولونية. الاختصارات: EC = الإشريكية القولونية. F = إلى الأمام ؛ R = عكس.

10x المخزن المؤقت السريع I 5.0 ميكرولتر
خليط dNTP (2.5 ميكرومتر) 4.0 ميكرولتر
سبيد ستار HS DNA بوليميراز 0.25 ميكرولتر
البولي فينيل بيروليدون (PVP) 3.5 ميكرولتر
توين 20 1.5 ميكرولتر
قالب 1.0 ميكرولتر
إي سي إف 0.5 ميكرولتر
إي سي آر 0.5 ميكرولتر
مياه فائقة النقاء 33.75 ميكرولتر

الجدول 2: مكونات حل تفاعل البوليميراز المتسلسل. الاختصارات: EC = الإشريكية القولونية. F = إلى الأمام ؛ R = عكس.

الملف التكميلي 1: ملف STL للطباعة ثلاثية الأبعاد. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

كل من PCR و CE هما تقنيتان حيويتان شائعتان في تحليل الأحماض النووية. تصف هذه الورقة تضخيم الإشريكية القولونية والكشف عن منتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل باستخدام أنظمة CF-PCR و CE ، وكلاهما مدمج داخليا. تم تضخيم الجين المستهدف من الإشريكية القولونية بنجاح في غضون 10 دقائق بسبب ارتفاع معدلات نقل الحرارة. تم فصل شظايا الحمض النووي الأصغر من 1500 نقطة أساس في غضون 8 دقائق (الشكل 5). الميزة الكبيرة لهاتين التقنيتين هي أنه يمكن أن يوفر الوقت بشكل كبير مقارنة بطرق الرحلان الكهربائي التقليدية PCR وهلام البلاطة. يجب على الباحثين أن يضعوا في اعتبارهم أن رقاقة الموائع الدقيقة CF-PCR تحتاج إلى التنظيف بعد الاستخدام ، ويجب بناء نظام CE في منزل نظيف وأسود لتجنب تلوث العينات. من السهل تصنيع نظام CF-PCR القائم على رقاقة الموائع الدقيقة ونظام CE الذي تم تقديمه في هذا العمل وقد يوفر طريقة بسيطة لتحليل الأحماض النووية في المختبر. ومع ذلك ، فإن أحد قيود CF-PCR هو أنه لا يمكنه سوى تضخيم واكتشاف عينة واحدة فقط في كل مرة ، مما قد يحد من تطبيقه على نطاق واسع ؛ لمواجهة هذا ، يمكن للمستخدمين تطوير رقاقة الموائع الدقيقة CF-PCR و CE المتكاملة لحل هذه المشكلة. المنصة المذكورة في هذا العمل لها تطبيق محتمل كبير في مجال التشخيص السريري للأمراض المعدية وأبحاث الحمض النووي.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

ليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للإعلان عنه.

Acknowledgments

تم دعم هذا العمل من قبل لجنة العلوم والتكنولوجيا التابعة لبلدية شنغهاي ، الصين (رقم 19ZR1477500 ورقم 18441900400). نعترف بامتنان بالدعم المالي من جامعة شنغهاي للعلوم والتكنولوجيا (رقم 2017KJFZ049).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
100 bp DNA ladder Takara Bio Inc. 3422A
10x Fast Buffer I Takara Bio Inc. RR070A
10x TBE Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. T1051
developer solution Alfa Aesar, USA L15459
dNTP mixture (2.5 μM) Takara Bio Inc. RR070A
EC-F Sangon Biotech, Shanghai, China
EC-R Sangon Biotech, Shanghai, China
HEC,1300K Sigma-Aldrich, USA 9004-62-0
isopropanol Aladdin, Shanghai, China 67-63-0
microscope Olympus, Japan BX51
photolithography  SUSS MicroTec, Germany MJB4
photomultiplier tube  Hamamatsu Photonics, Japan R928
photoresist MicroChem, USA SU-8 2075
PID temperature controllers  Shanghai, China XH-W2023
plasma cleaner  Harrick Plasma PDC-32G-2
polyvinyl pyrrolidone (PVP) Aladdin, Shanghai, China P110608
pump Harvard Apparatus PHD2000
silicone tubing  BIO-RAD,USA 7318210
solid-state relays KZLTD, China KS1-25LA
SpeedSTAR HS DNA Polymerase  Takara Bio Inc. RR070A
steel needle zhongxinqiheng,Suzhou,China
SYBR GREEN Equation 1 Solarbio, Beijing, China SY1020
temperature sensors EasyShining Technology, Chengdu, China TCM-M207
Template (E. coli) Takara Bio Inc. AK601
Tween 20 Aladdin, Shanghai, China T104863
voltage power supply  Medina, NY, USA TREK MODEL 610E

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Li, Z., et al. All-in-one microfluidic device for on-site diagnosis of pathogens based on an integrated continuous flow PCR and electrophoresis biochip. Lab on a Chip. 19 (16), 2663-2668 (2019).
  2. Crews, N., Wittwer, C., Gale, B. Continuous-flow thermal gradient PCR. Biomedical Microdevices. 10 (2), 187-195 (2008).
  3. Li, Z., et al. Design and fabrication of portable continuous flow PCR microfluidic chip for DNA replication. Biomedical Microdevices. 22 (1), 5 (2019).
  4. Kim, J. A., et al. Fabrication and characterization of a PDMS-glass hybrid continuous-flow PCR chip. Biochemical Engineering Journal. 29 (1-2), 91-97 (2006).
  5. Shen, K., Chen, X., Guo, M., Cheng, J. A microchip-based PCR device using flexible printed circuit technology. Sensors and Actuators B: Chemical. 105 (2), 251-258 (2005).
  6. Harstad, R. K., Johnson, A. C., Weisenberger, M. M., Bowser, M. T. Capillary Electrophoresis. Analytical Chemistry. 88 (1), 299-319 (2016).
  7. Redman, E. A., Mellors, J. S., Starkey, J. A., Ramsey, J. M. Characterization of intact antibody drug conjugate variants using microfluidic capillary electrophoresis-mass spectrometry. Analytical Chemistry. 88 (4), 2220-2226 (2016).
  8. Britz-Mckibbin, P., Kranack, A. R., Paprica, A., Chen, D. D. Quantitative assay for epinephrine in dental anesthetic solutions by capillary electrophoresis. Analyst. 123 (7), 1461-1463 (1998).
  9. Maeda, H., et al. Quantitative real-time PCR using TaqMan and SYBR Green for Actinobacillus actinomycetemcomitans, Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, tetQgene and total bacteria. FEMS Immunology and Medical Microbiology. 39 (1), 81-86 (2003).
  10. Hajba, L., Guttman, A. Recent advances in column coatings for capillary electrophoresis of proteins. TrAC Trends in Analytical Chemistry. 90, 38-44 (2017).
  11. Kleparnik, K. Recent advances in combination of capillary electrophoresis with mass spectrometry: methodology and theory. Electrophoresis. 36 (1), 159-178 (2015).

Tags

الهندسة الحيوية، العدد 201،
تضخيم <em>الإشريكية القولونية</em> في رقاقة الموائع الدقيقة PCR ذات التدفق المستمر واكتشافها باستخدام نظام الرحلان الكهربائي الشعري
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Dong, W., Tao, C., Yang, B., Miyake, More

Dong, W., Tao, C., Yang, B., Miyake, E., Li, Z., Zhang, D., Yamaguchi, Y. Amplification of Escherichia coli in a Continuous-Flow-PCR Microfluidic Chip and Its Detection with a Capillary Electrophoresis System. J. Vis. Exp. (201), e63523, doi:10.3791/63523 (2023).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter