Fremskritt innen massespektrometri har tillatt høy gjennomstrømning analyse av protein uttrykk og modifikasjon på en rekke vev. Kombinert med subcellulære fraksjonering og sykdom modeller, kvantitative massespektrometri og bioinformatikk kan avsløre nye egenskaper i biologiske systemer. Metoden er beskrevet her analyserer kromatin-assosierte proteiner i innstillingen av hjertesykdom og er lett anvendelig til andre<em> In vivo</em> Modeller av sykdom hos mennesker.