Journal
/
/
Истощение рибосомальной РНК для Mosquito метагеномных Gut РНК-сл
JoVE Journal
Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

, ,

Chapters

  • 00:02Title
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

Рибосомной РНК (рРНК) истощение протокол был разработан для обогащения РНК (мРНК), РНК-след от комаров metatranscriptome кишечника. Примеры специфических зондов рРНК, которые были использованы для удаления рРНК через вычитание, были созданы из комара и его микробами кишечника. Выполнение протокола может привести к удалению примерно 90-99% рРНК.

Related Videos

Read Article