A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:02Title
- 00:08Introduction
- 00:48Mosquito Rearing
- 01:31Mosquito gut dissection
- 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
- 02:27Ribosomal RNA depletion
- 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
- 02:48In vitro transcription of rRNA probes
- 03:19rRNA subtraction
- 03:39Removal of rRNA
- 05:07Representative results
- 05:48Conclusion
Een ribosomaal RNA (rRNA) uitputting protocol werd ontwikkeld om messenger RNA (mRNA) voor RNA-seq van de mug darm metatranscriptome verrijken. Voorbeeld specifieke rRNA probes die werden gebruikt om rRNA verwijderen via aftrekcircuit werden gemaakt van de mug en gut microben. Uitvoering van het protocol kan resulteren in de verwijdering van ongeveer 90-99% van rRNA.
