Journal
/
/
Sivrisinek Gut Metagenomic RNA-seq Ribozomal RNA tükenmesi
JoVE Journal
Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

, ,

Chapters

  • 00:02Title
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

A ribozomal RNA (rRNA) azalması protokolü sivrisinek bağırsak metatranscriptome RNA-seq mesajcı RNA (mRNA) zenginleştirmek için geliştirilmiştir. Çıkarma yoluyla rRNA kaldırmak için kullanılan örnek belirli rRNA probları, sivrisinek ve onun bağırsak mikropları oluşturulmuş. Protokol performans rRNA yaklaşık olarak% 90-99 arasında kaldırma neden olabilir.

Related Videos

Read Article