Journal
/
Biology
/
פרוטוקול להצפנה באמצעות גנים להגדיר העשרה ניתוח כדי לזהות את המודל החייתי המתאים עבור המחקר Translational
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

פרוטוקול להצפנה באמצעות גנים להגדיר העשרה ניתוח כדי לזהות את המודל החייתי המתאים עבור המחקר Translational

DOI:
10.3791/55768-v

•

09:35 min

•

August 16, 2017

•

, , , , ,
1Department of Experimental Toxicology and ZEBET,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Department of Clinical Pharmacology and Toxicology,Charité-Universitätsmedizin Berlin

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:54Performing the Game Set Enrichment Analysis (GSEA)
  • 05:46Comparing the GSEA Results and Identifying the Optimal Animal Model
  • 07:55Results: Overlap of Pathway Regulation Identifies Suitable and Unsuitable Animal Models
  • 08:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

אנו מספקים פרוטוקול מתוקננת לשימוש של העשרה קבע מפענוח transcriptomic נתונים כדי לזהות מודל העכבר אידיאלי עבור המחקר translational.
פרוטוקול זה ניתן להשתמש עם DNA microarray ו- RNA רצף נתונים, עוד יותר ניתן להאריך לנתונים אחרים טכנולוגיות אם נתונים זמינים.

Tags

Gene Set Enrichment AnalysisAnimal ModelTranslational ResearchGenome DataMouse ModelsInflammatory DiseasesGene Expression StudiesGene Expression DataPhenotype FileMolecular Signature DatabaseDNA Chip AnnotationsGSEA SoftwareGene SymbolsPermutations

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

בדיקת רגישות חזותית על מהירות ועל כיוון התנועה של לטאות

מחשב שנוצר מודל החיה גירויים

שימוש ג'ין Pulser מערכת MXcell electroporation כדי Transfect תאים ראשוניים עם יעילות גבוהה

הגנום כולו ניתוח באמצעות שבב זיהוי איזופורם ספציפי מטרות ג'ין

שיטת התרבות העובר שלמים מכרסמים באמצעות Rotator מסוג התרבות מערכת בקבוק

הבידוד של הריבוזום פוליפפטידים המתהווה כרוכים<em> במבחנה</em> כדי לזהות אתרים השהה של תרגום לאורך ה-mRNA

באמצעות רצף מעצר SecM ככלי לבודד פוליפפטידים כרוכים הריבוזום

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

Xenopus laevis כמודל לזיהוי תרגום ירידת ערך

Workflow השלם עבור ניתוח שלאחר translational שינויים היסטון שימוש מלמטה למעלה ספקטרומטריית מסה: מתוך הפקת היסטון כדי ניתוח נתונים

Read Article