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Un protocolo para el uso de gen Set enriquecimiento análisis para identificar el modelo Animal adecuado para la investigación traslacional
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A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research
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Un protocolo para el uso de gen Set enriquecimiento análisis para identificar el modelo Animal adecuado para la investigación traslacional

DOI:
10.3791/55768-v

•

09:35 min

•

August 16, 2017

•

, , , , ,
1Department of Experimental Toxicology and ZEBET,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Department of Clinical Pharmacology and Toxicology,Charité-Universitätsmedizin Berlin

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:54Performing the Game Set Enrichment Analysis (GSEA)
  • 05:46Comparing the GSEA Results and Identifying the Optimal Animal Model
  • 07:55Results: Overlap of Pathway Regulation Identifies Suitable and Unsuitable Animal Models
  • 08:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Proporcionamos un protocolo estandarizado para el uso del gen enriquecimiento conjunto análisis transcriptómico datos para identificar un modelo de ratón ideal para la investigación traslacional.
Este protocolo se puede utilizar con microarrays de ADN y datos de la secuencia de RNA y puede ampliarse aún más a otros datos ómicos si se dispone de datos.

Tags

Gene Set Enrichment AnalysisAnimal ModelTranslational ResearchGenome DataMouse ModelsInflammatory DiseasesGene Expression StudiesGene Expression DataPhenotype FileMolecular Signature DatabaseDNA Chip AnnotationsGSEA SoftwareGene SymbolsPermutations

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