Проточная цитометрия в сочетании с визуального кластеризации предлагает простой в использовании и быстрый метод для изучения водных биопленки. Он может использоваться для определения характеристик биопленки, обнаружения изменений в структуре сообществ биопленки и абиотических частиц, встроенных в биопленки.