Denne protokol beskriver teknikker, der anvendes til at bestemme ion-kanal strukturer af kryo-elektronmikroskopi, herunder en baculovirus, der anvendes til effektivt express gener i pattedyrceller med minimalt besvær og toksicitet, protein udvinding, rensning, og kvalitet kontrol, gitter forberedelse af prøver og screening, samt indsamling af data og forarbejdning.