Aminosyren nivå signal-til-støy analyse bestemmer utbredelsen av genetisk variasjon på en gitt aminosyre posisjon normalisert til bakgrunnen genetisk variasjon av en gitt befolkning. Dette gir identifikasjon av variant "hotspots" i en sekvens med protein (signal) som stiger over frekvensen av sjeldne varianter i en befolkning (støy).