Análise de sinal-ruído nível de aminoácidos determina a prevalência da variação genética em uma posição de determinado aminoácido normalizada a variação genética de fundo de uma dada população. Isto permite a identificação de variantes "hotspots" dentro de uma sequência da proteína (sinal) que se eleva acima da frequência das variantes raras encontradas em uma população (ruído).