Journal
/
Genetics
/
Изучение пространства последовательности для определения связывающих сайтов для регулятивных РНК-связывающих белков
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Exploring Sequence Space to Identify Binding Sites for Regulatory RNA-Binding Proteins
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Изучение пространства последовательности для определения связывающих сайтов для регулятивных РНК-связывающих белков

DOI:
10.3791/59635-v

•

11:34 min

•

August 09, 2019

•

1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado at Boulder

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:11Generation of DNA Random Library Pool
  • 02:14Synthesis of Pool 0 RNA
  • 04:58RNA-Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:35Reverse Transcription, PCR Amplification, and Protein Binding
  • 09:47Results: Enrichment of PTB-binding RNAs and Splice Site Switching Assay
  • 10:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Специфика последовательности имеет решающее значение для регуляции генов. Регуляторные белки, распознающие определенные последовательности, важны для регуляции генов. Определение функциональных связывающих участков для таких белков является сложной биологической проблемой. Итеративный подход к идентификации связывающего участка для РНК-связывающего белка описан здесь и применим ко всем БЕЛКАм-связывающим РНК.

Tags

Sequence SpaceBinding SitesRegulatory RNA-binding ProteinsSaturation MutagenesisProtein-binding SiteDisease DiagnosisTherapyRandom LibraryRNA PoolBinding ReactionHigh AffinitySpecific BindersPCRT7 RNA PolymeraseTranscriptionGel PurificationAutoradiography

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Метил-связывающий захват Секвенирование ДНК для ТКАНЕЙ Patient

Novel Выделение РНК-связывающих белков Стремительное Методология

Конъюгативных Спаривание Анализы для последовательности конкретного анализа переноса белков, участвующих в конъюгации бактерий

Пептид происхождения Метод к транспорту генов и белков через клеточные и органелл барьеры в растений

Анализ Cap-связывающих белков в человеческих клетках, подвергнутых Физиологические кислорода Условия

Ретровирусное сканирование: определение сайтов интеграции MLV для определения регуляторных областей, специфичных для клеток

Анализ в реальном времени транскрипционного фактора привязки, транскрипция, перевод и оборот для отображения глобальных событий в процессе активации клеточного

При содействии формальдегида изоляции нормативных элементов для измерения доступности хроматина в клетках млекопитающих

Роман насыщения мутагенеза подхода: Один шаг характеристика регламентационный протеин привязки сайтов в РНК с помощью кислота

Высок объём идентификации генов регулирования последовательностей с использованием следующего поколения последовательности круговой хромосома конформации захвата (4C-seq)

Read Article