Discovering CsgD Regulatory Targets in <em>Salmonella</em> Biofilm Using Chromatin Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing (ChIP-seq)

Melissa  B. Palmer; Yejun Wang; Aaron P. White

doi:10.3791/60736

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Entdeckung von CsgD-Regulierungszielen im Salmonellen-Biofilm mit Chromatin-Immunpräzipitation und Hochdurchsatz-Sequenzierung (ChIP-seq)

JoVE Journal
Genetics
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Discovering CsgD Regulatory Targets in Salmonella Biofilm Using Chromatin Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing (ChIP-seq)

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Entdeckung von CsgD-Regulierungszielen im Salmonellen-Biofilm mit Chromatin-Immunpräzipitation und Hochdurchsatz-Sequenzierung (ChIP-seq)

DOI:

10.3791/60736-v

•

13:48 min

•

January 18, 2020

•

Melissa B. Palmer², Yejun Wang, Aaron P. White²

¹Vaccine and Infectious Disease Organization-International Vaccine Centre, ²Department of Biochemistry, Microbiology and Immunology,University of Saskatchewan, ³Department of Cell Biology and Genetics,Shenzhen University Health Science Center

Chapters

00:00Title
02:01Protocol
12:04Results
12:41Conclusion

Summary

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Chromatin-Immunpräzipitation in Verbindung mit der Sequenzierung der nächsten Generation (ChIP-seq) ist eine Methode, die verwendet wird, um Wechselwirkungen zwischen Transkriptionsfaktoren und den von ihnen kontrollierten genomischen Sequenzen herzustellen. Dieses Protokoll skizziert Techniken zur Durchführung von ChIP-seq mit bakteriellen Biofilmen, wobei Salmonella enterica serovar Typhimurium bakterieller Biofilm als Beispiel verwendet wird.

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