Journal
/
/
Kvantifiera Fibrillar Collagen Organization med Curvelet Transform-baserade verktyg
JoVE Journal
Bioengineering
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Bioengineering
Quantifying Fibrillar Collagen Organization with Curvelet Transform-Based Tools
DOI:

07:58 min

November 11, 2020

,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:43CT-FIRE Fiber Extraction and Region of Interest (ROI) Analysis
  • 02:34Advanced CT-FIRE Post-Processing
  • 04:09CurveAlign Fiber Analysis: CT Mode Without Boundary
  • 05:03CurveAlign Fiber Analysis: CT-FIRE Mode with Boundary
  • 06:14CurveAlign Region of Interest (ROI) Analysis
  • 06:56Results: Representative Tumor-Associated Human Breast Cancer Tissue Microarray (TMA) Collagen Signatures
  • 07:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Här presenterar vi ett protokoll för att använda ett curvelet transform-baserat MATLAB-mjukvaruverktyg med öppen källkod för kvantifiering av fibrillär kollagenorganisation i den extracellulära matrisen av både normala och sjuka vävnader. Detta verktyg kan appliceras på bilder med kollagenfibrer eller andra typer av linjeliknande strukturer.

Related Videos

Read Article