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Ein integrierter Workflow zur Identifizierung und Quantifizierung von FDR-Kontroll-basierten, ungezielten Metabolomen
JoVE Journal
Biochemistry
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JoVE Journal Biochemistry
An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome
DOI:

05:35 min

September 20, 2022

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Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:07Preparing Metabolomics Datasets
  • 02:21Metabolite Identification and Differential Analysis
  • 03:49Results: Quantitative Analysis by MetaX
  • 04:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Wir haben einen ungezielten metabolomischen Workflow entwickelt, der XY-Meta und metaX zusammen integriert. In diesem Protokoll zeigten wir, wie XY-Meta verwendet werden kann, um eine Lockvogel-Spektralbibliothek aus der Open-Access-Spektrenreferenz zu generieren, und führten dann eine FDR-Kontrolle durch und verwendeten das metaX, um die Metaboliten nach der Identifizierung der Metabolomik-Spektren zu quantifizieren.

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