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Industrialisierte, von künstlicher Intelligenz gesteuerte Laser-Mikrodissektion zur mikroskaligen proteomischen Analyse der Tumormikroumgebung
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1Women’s Health Integrated Research Center, Gynecologic Cancer Center of Excellence, Department of Obstetrics and Gynecology,Uniformed Services University and Walter Reed National Military Medical Center, 2The Henry M. Jackson Foundation for the Advancement of Military Medicine, 3The John P. Murtha Cancer Center Research Program, Department of Surgery,Uniformed Services University, 4Women’s Health Integrated Research Center, Inova Women’s Service Line,Inova Health System
Chapters
- 00:04Introduction
- 01:07LMD Slide(s) Preparation
- 01:58Automated Feature Selection Using Image Analysis Software
- 06:58Laser Microdissectionvvv
- 09:41Protein Digestion by Pressure-Cycle Technology (PCT) and Sample Analysis Using Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS)
- 10:55Results: Analysis of the Proteins in LMD-Enriched and Whole Tumor Samples
- 12:09Conclusion
Dieses Protokoll beschreibt einen Hochdurchsatz-Workflow für die künstliche Intelligenz-gesteuerte Segmentierung von pathologiebestätigten Regionen von Interesse aus gefärbten, dünnen Gewebeschnittbildern zur Anreicherung von histologieaufgelösten Zellpopulationen mittels Laser-Mikrodissektion. Diese Strategie beinhaltet einen neuartigen Algorithmus, der die Übertragung von Demarkationen, die Zellpopulationen von Interesse bezeichnen, direkt auf Lasermikroskope ermöglicht.
