Microscopía de la levadura de fisión del ciclo de vida sexual

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Vjestica, A., Merlini, L., Dudin, O., Bendezu, F. O., Martin, S. G. Microscopy of Fission Yeast Sexual Lifecycle. J. Vis. Exp. (109), e53801, doi:10.3791/53801 (2016).

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Abstract

Introduction

Aunque el intercambio genético entre dos células es el evento central en la reproducción sexual, que se basa en una cadena de eventos que promueven la diferenciación celular, permiten la elección de pareja, llevan a cabo la fusión célula-célula y mantener la estabilidad genómica. Así, el ciclo de vida sexual se presenta como un sistema modelo para estudiar una serie de cuestiones biológicas en conmutación de desarrollo, respuesta a estímulos extrínsecos, la fusión de la membrana plasmática, la segregación de cromosomas, etc. Exploración de la levadura de fisión ciclo sexual para estudiar estos fenómenos aporta los beneficios de la poderosos genética del modelo de sistema, bien establecidos enfoques de alto rendimiento y microscopía sofisticado. Sexo en la levadura de fisión es un evento heterotípicos entre una célula P y una de las células M de los tipos de apareamiento diferentes. Los dos tipos de células expresan diferencialmente una serie de genes, incluidos los 1,2 para la producción del P- secretada y M-feromonas, receptores de feromonas y map3 MAM2 así como feromonas proteases Sxa1 y Sxa2. Cepas homotálicos, tales como la cepa H90 de uso común, llevan la información genética para los dos tipos de apareamiento en un único genoma y las células se someten a un complejo patrón de conmutación de tipo de apareamiento en todo el ciclo de vida mitótico (revisado en Ref. 3). Varias cepas de levadura de fisión heterotálico que cambian rara vez o nunca tipo de apareamiento también se utilizan comúnmente 4, lo más prominente de H + N (tipo P) y h -S (M-tipo) de las cepas.

En la levadura de fisión, la entrada en el ciclo de vida sexual es bajo una estricta regulación nutricional. Sólo las células de levadura de fisión nitrógeno hambre detienen la reproducción mitótico y producen feromonas difusibles para indicar la presencia de una pareja sexual y promover nuevas medidas del ciclo sexual (revisado en Ref. 5). privación de nitrógeno de-reprime el regulador transcripcional clave de Ste11 de acoplamiento que actúa como un interruptor de desarrollo y promueve eXpression de apareamiento genes específicos que incluyen el receptor de feromonas y la feromona genes de producción de 6,7. El compromiso de feromonas-receptor activa la proteína del receptor acoplado a G-alfa y la señalización de MAPK aguas abajo que mejora aún más la actividad de transcripción Ste11 8-10, lo que aumenta la producción de feromonas en una retroalimentación positiva entre compañeros de apareamiento. Los niveles de feromonas son cruciales para inducir diferentes estados de polarización de células, regulando el organizador principal de la polaridad celular, la Rho GTPasa Cdc42 familiar 11. Tras la exposición a bajas concentraciones de feromonas, activa Cdc42 se visualiza en parches dinámicos que exploran la periferia de la célula, y no el crecimiento celular se observa en esta etapa. Aumento de los niveles de feromonas promueven la estabilización de la actividad Cdc42 a una sola zona y el crecimiento de una proyección polarizada, denominado el shmoo, que trae las células asociadas en contacto. Posteriormente, los dos socios de apareamiento haploides se fusionan para formar un cigoto diploide. Un trabajo reciente revela THe existencia de una estructura de actina novela esencial para la fusión que se monta por el formin apareamiento inducida FUS1 12. Este enfoque de fusión concentra procesos dependientes de tipo V de miosina y posiciona la maquinaria de degradación de la pared celular, lo que permite la remodelación de la pared celular para permitir el contacto de la membrana plasmática sin lisis celular 12. Tras la fusión célula-célula, los núcleos entran en contacto y se someten a la cariogamia. Un prominente movimiento hacia atrás y hacia adelante dineína dependiente del núcleo dentro del cigoto (el movimiento de la cola de caballo), entonces promueve el emparejamiento de cromosomas homólogos 13,14, que es seguido por meiosis. Por último, los cuatro productos de la meiosis se empaquetan en esporas individuales durante la esporulación.

Debido a su complejidad y los numerosos pasos a seguir, un seguimiento detallado de acoplamiento ha sido un reto. Dos dificultades notables son que todo el proceso se lleva bien más de quince horas y que las células son difíciles de sincronizar. estos droblemas son eludidas por los enfoques de microscopía de una sola célula. Aquí un protocolo general para investigar se presenta el ciclo de vida sexual en la levadura de fisión. Con ajustes menores, este protocolo permite el estudio de todos los diferentes pasos del proceso, a saber, la inducción de producto génico de apareamiento, la polarización celular y el apareamiento entre hermanos células tras el cambio al tipo de apareamiento y entre los socios no hermanas, la fusión célula-célula, y después de la fusión de la cola de caballo movimiento, la meiosis y esporulación. Este método permite a 1) visualizar fácilmente las proteínas etiquetadas con fluorescencia con el tiempo antes, durante y después de la fusión; 2) discriminar el comportamiento de las células de tipo de apareamiento opuesto; y 3) la medida y cuantificación de parámetros tales como shmooing, el apareamiento, la fusión o la eficiencia esporulación.

Protocol

análisis de microscopía de la reproducción sexual levadura de fisión

1. Preparación de Medios

  1. Preparar medio de esporulación mínima (MSL-N) 15 mediante la mezcla de los siguientes componentes: glucosa: 10 g / L, KH 2 PO 4: 1 g / L, NaCl: 0,1 g / L, MgSO 4 · 7H 2 O: 0,2 g / L. Añadir elementos traza (10.000 veces): 100 l / L, vitaminas (1,000x): 1 ml / L y 0,1 M de CaCl2   ml / L. Filtrar esterilizar utilizando un filtro de 0,22 micras de tamaño de poro y se almacena a temperatura ambiente (RT).
    1. Utiliza el siguiente Vitaminas (1,000x) stock: pantotenato: 1 g / l, ácido nicotínico: 10 g / L, inositol: 10 g / l, Biotina: 10 mg / L. Filtrar esterilizar utilizando un filtro de 0,22 micras de tamaño de poro y se almacena a 4 ° C.
    2. Utilice los siguientes elementos traza (10,000x) stock: Ácido bórico: 5 g / l, MnSO4: 4 g / L, ZnSO4 · 7H 2 O: 4 g / L, FeCl2 · 6H 2 O: 2 g / L , MoO3: 0,4 g / l, KI: 1 g / L, CuSO4· 5H 2 O: 0,4 g / L, ácido cítrico: 10 g / L. Filtrar esterilizar utilizando un filtro de 0,22 micras de tamaño de poro y se almacena a 4 ° C.
  2. Preparar MSL-N de agarosa al 2% (utilizado para hacer las cámaras del cojín de agarosa) mediante la combinación de 10 ml de MSL-N con 0,2 g de agarosa. Derretir de ~ 2 minutos a alta potencia en un horno de microondas hasta que se disuelva agarosa y alícuotas de 0,5 ml en tubos de microcentrífuga. Almacenar a temperatura ambiente.
  3. Preparar medio de esporulación mínimo con nitrógeno (MSL + N) de MSL-N mediante la adición de (NH 4) 2 SO 4: 1 g / L, leucina: 0,225 g / L, adenina: 0,225 g / L, uracilo: 0,225 g / L . Filter-esterilizar utilizando un filtro de tamaño de poro 0,22 micras. Almacenar a temperatura ambiente.
    Nota: leucina, adenina y uracilo se añaden a este medio para permitir el crecimiento de las cepas auxotróficas. Suplemento de aminoácidos adicional debe incluirse si la cepa utilizada lleva una auxotrofıa distinta (por ejemplo his3Δ). Tenga en cuenta también que el trabajo con cepas totalmente prototroph se recomienda, ya que sólotales cepas permitirán una alta eficiencia de acoplamiento.
  4. Preparar 200 ml valap para el sellado de la cámara. En un vaso de precipitados añadir pesos iguales de lanolina, vaselina (u otra jalea de petróleo), y la parafina. Calentar la mezcla a baja temperatura y se agita de vez en cuando hasta que se mezclen bien. Alícuota de la mezcla en varias pequeñas placas de Petri. Almacenar a temperatura ambiente.

2. El cultivo de fisión cepas de levadura para experimentos de apareamiento (Figura 1).

  1. Día 1, de noche:
    Inocular cepas recién rayadas de medios sólidos en tubos de cultivo que contenían 3 ml de N + MSL. Utilice tubos de fondo plano de un diámetro de unos 2,5 cm. Utilizar otros tubos de cultivo o frascos con volumen de cultivo adaptado. Incubar durante la noche (O / N) con agitación a 25 ° C, 200 rpm. Si se trabaja con cepas heterotálicas, inocular por separado.
    1. Diluir las suspensiones de células en medios de la mañana siguiente para asegurarse de que los cultivos tienen una densidad óptica medida a 600 nm (OD 600) de 0,4-,8 por la noche.
      Nota:OD 600 mediciones como un proxy de la concentración celular de la levadura de fisión son lineales en el intervalo de aproximadamente 0,1 a 1,0. Para nuestro OD espectrofotómetro 600 = 0,1 corresponde a 1,4 x 10 6 células por ml. Por lo tanto, si se lee DO inicial 600 se encuentran fuera de este rango de muestras necesitan ser diluidas / concentrada para mediciones fiables.
  2. Día 2, de noche:
    Diluir las células en 20 ml de MSL + N los medios de comunicación a OD 600 = 0,025 en matraces de 100 ml. Incubar las cepas O / N a 30 ° C, 200 rpm.
    Nota: Los cultivos de células de tipo salvaje deben llegar a OD 600 ~ 0,8 a la mañana siguiente (15 horas después). Si se trabaja con cepas con tiempo de generación ya ajustar dilución en consecuencia.
  3. Día 3, por la mañana:
    Medir OD 600 para verificar que las culturas tienen densidad celular de OD 600 ~ 0,8. Si se trabaja con cepas heterotálicas, mezclar el mismo número de células asociadas. Precipitar las células a 1.000 xg y transferir a un 1,5 mltubo. Lavar las células tres veces en 1 ml de medio MSL-N. Células Vuelva a suspender en 3 ml de medio de MSL-N y diluir las células a OD 600 = 1,5.
    1. Para supervisar el apareamiento entre las células hijas se montan directamente en las células de formación de imágenes (véase el Protocolo Sección 2.4). Utilizar cepas H90 homotálicos, en el que se llevará a cabo el apareamiento tipo de conmutación durante las divisiones mitóticas que se producen después de la privación de nitrógeno. montaje inmediata de las células en la almohadilla de agarosa asegura que, después de la división celular, la hermana células se mantienen uno junto al otro.
    2. Para controlar la polarización celular (dinámica de exploración y shmooing) incubar 1-3 ml de cultivo celular a 30 ° C, 200 rpm durante 3-4 horas antes de la células de montaje para la imagen. Dentro de estos 3-4 horas, se habrá producido la última división mitótica. Unas pocas células se han puesto en marcha la polarización, pero la mayoría solo pueden iniciar sus dinámicas de polarización exploratorios.
    3. Para supervisar la fusión célula-célula se incuba 1-3 ml de cultivo celular a 30 ° C, 200 rpm durante 4-6 hr prio a las células de montaje para la imagen.
    4. Para supervisar eventos post-fusión incuban 1-3 ml de cultivos de células a 30 ° C, 200 rpm durante 8 horas antes de las células de montaje para la imagen.
    5. Para controlar la respuesta a una concentración de feromona específica (sólo para las cepas heterotálica) incubar 3 ml de cultivo celular a 30 ° C, 200 rpm durante 3-4 horas antes de la células de montaje para la imagen.
      1. Retire el tubo de microcentrífuga MSL-N que contiene desde el bloque de calor 95 ° C (véase la sección 2.4.1 Protocolo. Abajo). Añadir P-factor o factor M a la concentración deseada directamente en la agarosa MSL-N derretido. Mezclar bien por agitación antes de la preparación de la almohadilla inmediata.
      2. Después de montar celular, incubar la almohadilla durante 15-30 minutos a 25 ° C antes de la imagen. Factor P y M-factor de feromonas se utilizaron a partir de una solución madre de 1 mg / ml en metanol.
        Nota: Si se trabaja con cepas mutantes tiempos de incubación pueden variar. Agrupación de células puede ocurrir después de una incubación prolongada en m líquidaedios y puede ser particularmente fuerte en algunas cepas mutantes. células agrupadas no se pueden observar en las almohadillas de agarosa en una sola capa y por lo tanto son difíciles de enfoque automático y la imagen. En el caso de la formación de grumos de células extensa montar células en agarosa almohadillas inmediatamente después de los lavados y resuspensión en medios que carecen de nitrógeno (como en el Protocolo de la sección 2.3.1.) Y incubarlos a 30 ° C antes de la imagen.
  4. Las células para el montaje de imagen:
    1. Preparar MSL-N agarosa almohadillas 16 por la fusión de una parte alícuota en un calor de bloque 95 ° C durante 10-15 minutos y la adición de 200 l entre dos placas de vidrio separadas por espaciadores (Figura 1B). Utilice espaciadores con un espesor de ~ 0,5 mm. Para hacer espaciadores, bandas Uso cortan de cartón, tal como el suministrado con enzimas de restricción.
    2. Se precipitan 100 l de células a 1.000 xg durante 1 min, eliminar el sobrenadante y las células en medio residual de 2-4 l volver a suspender. No vuelva a suspender en medio fresco ya que retrasaapareamiento.
    3. Después de 2-3 minutos y retirar con cuidado los separadores de la placa de vidrio superior. Si varias cepas se van a montar, preparar la célula se concentra antes de la preparación de la almohadilla de agarosa.
    4. Añadir 1 l de células a la plataforma y esperar hasta que la gota se inicia el secado (~ 1 min) antes de ponerse la hoja de la cubierta y de sellado con valap.
    5. Deje que la almohadilla reposar durante al menos 30 minutos antes de exponer a 25 ° C o RT.
    6. Para obtener una mezcla de células en diversas etapas de apareamiento, hacer una almohadilla inmediatamente después de lavados en MSL-N (véase la Sección 2.3.) Y se incuba a 18 ° CO / N (~ 15 h). Este enfoque es útil para obtener imágenes de las células en las etapas de acoplamiento distintos con alta resolución temporal o muestras con señal débil.

Imagen 3. Células vivas de células de levadura de apareamiento

  1. Ajuste de los ajustes de adquisición.
    Nota: Los valores de adquisición de imágenes que aquí se presentan han sido optimizados para la plataforma DeltaVision compuesto por una personalizada Olympus IX-71microscopio invertido con el Plan Apo 60X / 1.42 NA o U-Plan Apo 100X / 1.4 NA objetivos, una cámara y un CoolSNAP HQ2 Insight SSI 7 colores unidad combinada iluminador. El hardware es controlado por SoftWorx v4.1.2 que también permite un enfoque automático digital.
    1. Asegúrese de que los intervalos de autoenfoque no excedan de 15 minutos desde que el Z-deriva con el tiempo más largo puede superar la capacidad del sistema de enfoque automático de software. Si se utiliza un sistema de enfoque automático basado en hardware, usar intervalos más grandes.
    2. Ajustar el intervalo de imagen. Tomar imágenes cada 10 min durante ~ 15 h como punto de partida cuando se trabaja con un etiquetado con fluorescencia de proteína por primera vez. Este intervalo proporciona una buena visión general de todo el proceso de apareamiento sin blanquear extensa.
      1. Imagen con intervalos de 5 minutos o menos a los acontecimientos del tiempo con mayor precisión como la fusión. intervalos más cortos requieren fluoróforos fuertes que permiten tiempos de exposición bajos y poco blanqueo. Para imágenes con intervalos de por debajo de 1 min evitar O / N microscopíay en lugar de preparar una mezcla de todas las etapas de acoplamiento tal como se detalla en la Sección 2.4.6 Protocolo.
    3. Ajustar el tiempo de exposición de la imagen. tiempos de exposición de prueba entre 50 y 300 ms. Trate de encontrar un equilibrio entre la razón y photobleaching-señal-ruido que se consiga un gran número de puntos de tiempo con una señal discernible (generalmente más de 100).
    4. Ajuste Z-seccionamiento. Las secciones que cubren cada 0,3 micras 5 micras proporcionan una buena profundidad de imagen. Tenga en cuenta que seccionamiento Z nuevos aumentos foto-daño, que puede ser minimizado mediante el uso de la OAI (integración eje óptico - una única adquisición de barrido de la profundidad de la muestra total). Buen sistema de enfoque automático reduce la necesidad de muchos Z-secciones y es muy recomendable.
  2. Consejos para estudiar comportamientos de acoplamiento específicas del tipo:
    1. Para las cepas heterotálica, use h- y H + células que expresan fluoróforos distintos, de modo que los dos tipos de células se pueden distinguir. Utilice cualquier fluoropho codificado genéticamentere expresado como una versión citosólica o fusión de una proteína endógena, aunque hemos tenido buen éxito con sfGFP, una variante de plegado rápido de GFP 17. Proteínas endógenas son generalmente etiquetados en su locus genómico endógeno por recombinación homóloga 14.
    2. Para las cepas homotálicos, expresar una proteína fluorescente citosólica genéticamente codificado bajo el control de promotores específicos de tipo de apareamiento, tales como los de los genes de los receptores de feromonas map3 y MAM2 para conducir la expresión en las células P y M, respectivamente. Los promotores de map3 y MAM2 están inactivos durante el crecimiento vegetativo y se inducen a la inanición de nitrógeno 18,19. Las construcciones que impulsan la expresión de GFP citosólica o mCherry bajo el control de estos promotores están típicamente integrados en un locus genómico (ura4, leu1) que no interfiera con la progresión normal del ciclo de vida sexual 12.
    Uso de tipo de apareamiento fluoróforos citosólicas específicos (como en la Sección 3.2.2 Protocolo) para determinar la sincronización exacta de la fusión celular visualizado como la transferencia de la señal fluorescente de una célula a la otra pareja.

4. Cuantificación de acoplamiento y fusión Eficiencias

  1. Para cuantificar el apareamiento y la eficiencia de fusión 11,12, células contado directamente después de MSL-N lavar a MSL-N agarosa almohadillas, como en el paso 2.3.1 anterior, y se deja durante 24 horas a 25 ° C antes de la imagen (Figura 1A). El uso de este protocolo homothallic una de tipo salvaje cepa eficiencia de acoplamiento alcanza ~ 60% y la eficacia de la fusión el 99%. Para probar si cualquier reducción de estos valores observados en cepas mutantes reflejan un fenotipo terminal o un retraso, repetir el experimento con un tiempo de incubación 36 h.
  2. Calcular la eficiencia de acoplamiento como ecuación1 parejas de apareamiento incluyen cigotos, ascos y parejas de células no fusionadas identificados a partir desu posición y crecimiento hacia los demás.
  3. Calcular la eficiencia de fusión como Equation2
    Nota: apareamiento de pares fusionadas se identifican por su capacidad de formar esporas si se sabe que el mutante en estudio no influye en la esporulación. Si la esporulación no se puede utilizar como lectura de, la fusión se determina mediante la observación de la difusión de un marcador citosólico expresado en una sola pareja de acoplamiento en ambos socios.

Representative Results

La fisión crecimiento de la levadura y el apareamiento Dinámica Tras la eliminación de una fuente de nitrógeno
Como el hambre de nitrógeno es un requisito previo para el inicio de la reproducción sexual en la levadura de fisión, cepa de tipo salvaje H90 homothallic se controló a cambio de rico en nitrógeno a un medio de nitrógeno-privada (Figura 2), siguiendo el protocolo descrito en la Figura 1. Brevemente, las células se cultivaron O / N a la fase exponencial (OD 600 = 0,5) en medio MSL + N, recogió, se lavó y resuspendió en medio líquido MSL-N a 600 DO final = 1,5. Cada 2 hr alícuotas de células fueron calco flúor-manchada y la imagen (Figura 2 A - D).

Calcofluor tinción (Figura 2A) reveló que en medio rico en nitrógeno ~ 21% de las células fueron septating (n> 300, la figura 2B) y que la longitud de celda promedio en diviSion era 15,2 ± 1,4 m (n = 50, la Figura 2C). Las células que no se dividen mostraron una amplia distribución de longitudes de células (8-14 micras; n> 200, Figura 2D). Sin embargo, dos horas después del cambio de medio MSL-N hubo un cambio drástico en la distribución de la longitud de las células que no se dividen, con más del 60% de las células son más cortos que 9 m (n> 200, Figura 2D). Tabicación de la célula también se detectó en la longitud reducida de 9,8 ± 0,8 m (n = 50, la Figura 2A, 2C). También se observó una reducción adicional en la longitud de los dos no se dividen y células que se dividen, como el tiempo en MSL-N aumentó. De hecho, después de 8 horas el índice de tabicación de la cultura disminuyó por debajo de 2% (n> 300) y más de 85% de las células detenido su ciclo celular en longitudes más cortas de 7 m (n> 200, Figura 2D).

Las células empezaron a formar apareamiento pares de cuatro horas después del cambio a líquido MSL-Nmedio (<1%, figura 2A). Posteriormente el número de pares de apareamiento aumentó rápidamente y 8 hr después del cambio de 10% de las células dedica un socio de acoplamiento (n> 200, la Figura 2B).

Para supervisar la dinámica de apareamiento, 6 horas después de la inducción de hambre, una alícuota de células fue también monta sobre MSL-N almohadilla de agarosa para la imagen. Las células se sometieron a shmooing, la fusión y la esporulación (Figura 2E, 2F) en el subsiguiente 21 horas sin ningún aparente sincronía (Película S1). La eficacia de acoplamiento depende de la posición relativa y la densidad de las células en un campo de visión dado, con más del 60% de las células dedica un socio cuando se encuentra densamente en una monocapa (Figura 2G y de la película S1).

Las cepas de tipo salvaje heterotálico H + y levadura de fisión h- también fueron sometidos al mismo protocolo con unapaso n adicional de mezclar h células H- + y en una relación de uno a uno en el momento de la eliminación de nitrógeno. Se observaron la dinámica de hambre y de acoplamiento similares, pero la eficacia de apareamiento fue ligeramente inferior (Figura 2G, Película S2).

Monitorización Dinámica de marcado con fluorescencia proteínas en células de levadura de fisión apareamiento
Células H- Para controlar la dinámica de tipo V-miosina Myo52 (Ref 20) en el apareamiento células, de manera exponencial cultivadas que expresan Myo52-3GFP del locus nativo se mezclaron con + h las células de manera similar que expresa Myo52-tdTomato, así como GFP citosólica de la P las células beta promotor map3 específica. La suspensión de células se lavó, se diluyó en medio MSL-N y se incubaron durante 6 horas a 30 ºC, 200 rpm antes de células montaje en MSL-N agarosa almohadillas de O de imágenes / N a intervalos de 10 min.

Como se informó anteriormente 11,12 Myo52 zonas dinámicas inicialmente formado a lo largo de la corteza de células (Figura 3A, puntas de flecha y de la película S3). A continuación, Myo52 señal se estabilizó (Figura 3A, flechas y de la película S3) en un solo foco justo antes del evento de fusión, que se visualizó mediante la transferencia de la señal de GFP citosólica de la h + en la célula h- (Figura 3A y de la película S3) . La señal Myo52-tdTomato también se pudo observar en el cuello de fusión durante su expansión, pero no hay señal discernible era evidente a medida que el cigoto se procedió a la esporulación (Figura 3A y la película S3).

El control de la conducta de las células de levadura de fisión heterotálico Expuestos a las feromonas externos
H- células heterotálicas que carecen de la proteasa que degrada Sxa2 P-factor para la desensibilización responden rápidamente al factor P sintético. un h- sxa2Δ, expresando SCD2-GFP como un marcador para Cdc42 activa 11, se cultivó en medio MSL + N, en consecuencia con el protocolo descrito. Las células se lavaron en medio MSL-N y se incubaron durante 4 horas a 30 ºC. MSL-N almohadillas de agarosa que contiene metanol (datos no mostrados), 0,1 mg / ml (bajo feromona, Figura 3B) o 1 mg / ml (alta feromona, la Figura 3C) de factor P se prepararon, cortar y posicionados en una nueva diapositiva para generar mini-pastillas que contienen diferentes cantidades de feromonas. 0,5 l de suspensión de células se montan en cada mini-cojines de O de imágenes / N en intervalos de 5 minutos.

En concordancia con los resultados publicados 11, los bajos niveles de P-factor de promovieron la formación de zonas dinámicas SCD2 sin crecimiento (Figura 3B, la película S4), mientras que altos niveles de P-factor de estabilizaron una sola zona SCD2, induciendo así la elongación shmoo de polo una célula (Figura 3C, Película S5).

Figura 1
Figura 1:.. Representación esquemática del protocolo (A) Descripción esquemática de los protocolos que se utilizan para controlar la levadura de fisión ciclo de vida sexual y (B) para preparar las muestras de levadura de fisión para la imagen a largo plazo Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura .

Figura 2
Figura 2:. El crecimiento y la dinámica de inserción de células de levadura de fisión pasado de MSL + N para MSL-N Medios micrografías (A) epifluorescencia de células calcofluor manchados desplazó a los medios MSL-N para los períodos de tiempo indicados. (B) Porcentajecélulas de septating (línea azul oscuro, n> 300 por cada punto de tiempo) y el apareamiento (línea azul claro, n> 300 por cada punto de tiempo) cambiaron a medios MSL-N para los períodos de tiempo indicados. (C) Duración media de las células septating desplazó a los medios MSL-N para los períodos de tiempo indicados (n = 50 por punto de tiempo, excepto punto de tiempo de 8 horas donde n = 20). (D) Distribución de la longitud de las células que no se dividen cambió a medio MSL-N para los períodos de tiempo indicados (n> 200 por cada punto de tiempo). (E) Fracción media de no fusionada (línea azul oscuro), fusionado (línea azul claro) y la esporulación (línea de color negro) células en una población de levadura de tipo salvaje H90 desplazó a los medios MSL-N para los períodos de tiempo indicados y montado en una almohadilla de agar a punto de tiempo de 6 horas (n> 900 células por punto de tiempo de tres timelapses diferentes). Se consideraron las células fusionadas cuando no hay pared celular de refracción entre socios era visible en las micrografías DIC y la formación de la pared celular de esporas se utilizó para marcar para sporulating células. Micrografías (F) de las células de acoplamiento DIC cambiaron a medios MSL-N para los períodos de tiempo indicados. (G) la eficiencia de acoplamiento como una función de la densidad celular de agarosa almohadillas para H90 (puntos de color azul oscuro) y las células H + / h- (puntos de color azul claro) cambiaron a medios MSL-N durante 24 horas. La densidad de las células más adecuado para la formación de imágenes a largo plazo se consigue a aproximadamente 25.000 células / mm 2. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2
Figura 3:. Dinámica de localización de proteínas fluorescentes durante el apareamiento de levadura de fisión (A) deconvolved individuales micrografías plano z de epifluorescencia de células con los genotipos indicados pasaron de MSL + N para los medios de comunicación MSL-N durante 6 horas y se montaron enMSL-N almohadilla de agarosa durante el tiempo indicado. Las puntas de flecha indican zonas Myo52-3GFP dinámicas y la flecha señala Myo52 localización en el foco de fusión. (B), (C) deconvolved solo plano z micrografías de epifluorescencia de células con genotipos indicados pasaron de MSL + N para los medios de comunicación MSL-N durante 4 horas y se montaron en MSL-N mini-agarosa almohadillas que contengan 0,1 mg / ml (B) o 1 mg / ml (C) del factor P durante el tiempo indicado. Las puntas de flecha indican dinámica (B) o zonas (C) SCD2-GFP estables. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Película1
Película Suplementaria 1: Timelapse DIC de tipo salvaje ce la levadura de fisión h90 LLS, que eran de nitrógeno de hambre durante 6 horas antes de la imagen. (Haga clic derecho para descargar).

movie2
Suplementario Película 2: . Timelapse DIC de tipo salvaje células de levadura de fisión h h- + y que se mezclaron y nitrógeno de hambre durante 6 horas antes de la imagen (Haga clic derecho para descargar).

Movie3
"> Película Suplementario 3: deconvolved epifluorescencia solo plano z y DIC Timelapse de las células que expresan h- Myo52-3GFP del locus nativo mezclado con h + células que expresan Myo52-tdTomato del locus nativo y citosólica de GFP a partir del promotor específico de la célula map3 P . las células fueron cultivadas en medio MSL-N durante 6 horas a 30 ° C antes de la imagen. la transferencia de las buenas prácticas agrarias citosólico en la célula h- define el tiempo de fusión. (Haga clic derecho para descargar).

Movie4
Película suplementario 4: deconvolved epifluorescencia solo plano z y DIC Timelapse de h- células sxa2 expressing SCD2-GFP de su promotor nativo tratados con 0,1 mg / ml de factor P. Las células fueron cultivadas en medio MSL-N durante 4 horas a 30 ºC antes de exponer. (Haga clic derecho para descargar).

Movie5
Película Suplementario 5: . Deconvolved epifluorescencia solo plano z y DIC timelapse de las células que expresan sxa2 H- SCD2-GFP a partir de su promotor nativo tratado con / ml de factor de P-1 g Las células se cultivaron en medio MSL-N durante 4 horas a 30 ºC antes de exponer. (Haga clic derecho para descargar).

YSM995 h- en peso
YSM1371 h + peso
YSM 1396 h90 en peso
YSM2534 h- myo52-3GFP :: kanMX
YSM2730 h + myo52-tdTomato :: natMX
Pmap3: GFP :: ura4 + @ ura4locus
YSM2731 h- SCD2-GFP :: :: natMX sxa2Δ kanMX

Tabla S1: Las cepas utilizadas en este estudio.

Discussion

Las condiciones ambientales, y la disponibilidad de nutrientes, en particular, afectan en gran medida la fisiología de la levadura de fisión. Hambre de nitrógeno es necesaria para el compromiso de la reproducción sexual e inicialmente da lugar a notables cambios en la progresión del ciclo celular mitótico (Ref. 21 y Figura 2). Tras la eliminación de nitrógeno de crecimiento exponencial de la población, el tamaño de celda en la división disminuye rápidamente (Figura 2C) y la mayoría de las células detener la progresión mitótica más corta que la longitud de recién nacidos células cultivadas de forma exponencial (Ref. 21 y en la Figura 2D). Como las células de tipos de apareamiento opuestos detener la progresión mitótico se involucran socios de apareamiento y proceden a formar cigotos y esporular (Figura 2B, 2E, 2F). En el caso de una monocapa de dos dimensiones de las células de tipo salvaje, más del sesenta por ciento de las células H90 se acoplará un socio, y casi todos se someterá a la fusión de células (Figura 2G (Figura 2G). Uno de los aspectos más críticos de este protocolo para obtener altas eficiencias de acoplamiento es asegurar que las células se mantengan dentro de las densidades indicadas a lo largo. Seguimiento de los parámetros del tamaño celular y la eficiencia de acoplamiento como se muestra en la Figura 2 a continuación, proporciona un control simple que las células están entrando en la reproducción sexual de manera eficiente.

Observamos que, dado que la falta de apareamiento medio de cualquier fuente de nitrógeno (incluso pequeñas cantidades de aminoácidos y bases nitrogenadas son excluidos), altas eficiencias de acoplamiento tales como los que se presentan en la Figura 2E y 2G solamente se obtienen con cepas totalmente prototrophic. cepas auxotróficas se pueden utilizar, pero requieren un cuidado adicional para asegurar que las células están en todo momento que estén dentro de las densidades celulares indicadas en el protocolo. Incluso con cuidado, la únicaSe observaron menores eficiencias de acoplamiento. eficiencia de acoplamiento también está influenciada por la temperatura, con eficiencias más bajas observadas a temperatura elevada, que pueden limitar el uso de alelos mutantes sensibles a la temperatura durante el proceso de apareamiento.

El método que aquí se presenta se utiliza sobre todo para la imagen a largo plazo de los reporteros fluorescentes. Debido a formación de imágenes se lleva a cabo durante un período de tiempo largo, de formación de imágenes con éxito de apareamiento de levadura de fisión depende de la configuración de microscopía disponible altamente. Para ello, la estabilidad del microscopio configuración, su sensibilidad y el acceso a un sistema de enfoque automático son críticos. Ya sea basado en software o son posibles sistemas de enfoque automático de hardware incorporadas. Además, para aumentar el rendimiento, una etapa motorizada que permite la adquisición multipunto es otra cualidad importante.

la calidad de imagen está limitada por las propiedades del fluoróforo de interés. Los tiempos de incubación distintas en medio MSL-N líquido se detalla en protocol Sección 2.3 están dirigidos a la optimización de la fluorescencia de proteínas etiquetadas con feromonas inducida y reducir al mínimo el blanqueo innecesaria por imágenes etapas única apareamiento de interés. Mientras que las proteínas abundantes o altamente focalizados marcado con fluorescencia permiten la adquisición de cientos de puntos de tiempo a lo largo de todo el ciclo de vida sexual (Película S3), otras proteínas son un reto a la imagen a través de estos tiempos largos debido a la foto-blanqueo. La calidad de imagen también depende del fluoróforo elegido, típicamente un derivado de GFP. Hemos observado repetidamente que sfGFP 17 (superfolder GFP), que se pliega con una cinética rápida, siempre y superior de la señal durante el proceso de apareamiento, posiblemente debido a una fuerte autofagia induce un rápido recambio de las proteínas. Es importante destacar que no controlamos la disponibilidad de oxígeno necesario para la maduración de la proteína fluorescente 17,22. Por lo tanto, se recomienda tener cuidado en el uso de medidas de fluorescencia para cuantificar los niveles de proteínas expresadas después de las células son mounted en portaobjetos, o el uso de dispositivos de microfluidos permeables al oxígeno alternativos para llevar a cabo tales experimentos. Además, agarosa almohadillas manchadas de células en la noche y se mantuvieron a 18 ºC O / N han sido muy útiles para obtener imágenes de los reporteros débiles como tales almohadillas contienen una mezcla de células en todas las etapas de la reproducción sexual.

El apareamiento en la levadura de fisión no presenta sincronía y las células se puede ver fácilmente iniciar shmooing junto con otras células ya esporulación (Películas S1, S2). Tales dinámica de la población renders clásicos, técnicas bioquímicas granel difícil de usar, por lo que la microscopía de células individuales se describe aquí un método de elección. Todos los enfoques basados ​​en la microscopía pueden en principio ser aplicados a las células preparadas con el protocolo descrito aquí. Es importante destacar que estos enfoques pueden monitorear los procesos de apareamiento que exhiben la dinámica de tipos específicos tales como la fusión célula-célula descrito por Dudin y sus colegas 12. Para supervisar la asimetría, los reporteros de tipo de apareamientohan sido particularmente útiles (Figura 3A). La diferenciación entre los dos tipos de apareamiento se consigue fácilmente cuando se trabaja con cepas heterotálica mediante el empleo de fluoróforos diferentes para etiquetar proteínas en el h- y H + células. Sin embargo, esto no es factible para las cepas homotálicos. Un enfoque desarrollado para diferenciar el tipo de apareamiento de las células H90 es expresar proteínas fluorescentes citosólicas bajo el control de promotores específicos de tipo de apareamiento. En particular, se utilizaron los promotores de los genes map3 y MAM2 receptor de feromonas para conducir la expresión de las proteínas GFP o mCherry en P y las células M, respectivamente. Además, estos marcadores permite la sincronización exacta de la fusión célula-célula, visualizada como la transferencia de la señal fluorescente de una célula a la otra pareja.

Feromonas de apareamiento son determinantes cruciales para progresar a través de las distintas etapas de la reproducción sexual en la levadura 11,23. Diferentes niveles de feromona sintética plomo a estados de polarización de células distintas en la levadura de fisión (Figura 3B, 3C y Ref. 11). El protocolo incluyó anteriormente permite la evaluación de cómo los niveles de feromonas exógenos distintos afectan a la fisiología celular. Debido a que la proteasa feromona Sxa2 degrada rápidamente factor P, una cepa mutante heterotálico donde se ha eliminado se utilizó para obtener resultados reproducibles la proteasa. Sin embargo, en las mezclas de células de tipos de apareamiento opuestos, no sólo los niveles, sino también la distribución espacial de las feromonas emitidas por un socio de acoplamiento es probable que sean importantes. El análisis de los efectos de la distribución espacial de feromonas en la respuesta celular requerirá el desarrollo de las configuraciones más sofisticadas, tales como dispositivos de microfluidos empleadas en la levadura en ciernes 24,25.

En resumen, presentamos un método básico para la microscopía a largo plazo del ciclo de vida sexual de la levadura de fisión. pequeños ajustes a este protocolo permiten research centrarse en las respuestas celulares a las distintas etapas del ciclo de vida sexual. La combinación de este método con herramientas de bioquímica celular individuales y dispositivos de microfluidos promoverá aún más la levadura de fisión reproducción sexual como un poderoso sistema modelo.

Acknowledgments

AV fue apoyado por una beca postdoctoral largo plazo EMBO. La investigación en el laboratorio de Martin está financiado por una subvención de inicio del CEI (GeometryCellCycle) y una subvención Swiss National Science Foundation (31003A_155944) para SGM.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Glucose Sigma-Aldrich G8270-10KG
KH2PO4 Sigma-Aldrich 1.05108.0050
NaCl Sigma-Aldrich 71381
MgSO4•7H2O Sigma-Aldrich 63140
CaCl2 Sigma-Aldrich 12095
Pantothenate AppliChem A2088,0025
Nicotinic Acid AppliChem A0963,0100
Inositol AppliChem A1716,0100
Biotin AppliChem A0967,0250
Boric Acid Sigma-Aldrich B6768-1KG
MnSO4 AppliChem A1038,0250
ZnSO4•7H2 Sigma-Aldrich Z4750
FeCl2•6H2O AppliChem A3514,0250
Molybdenum oxide (VI) (MoO3) Sigma-Aldrich 69850
KI AppliChem A3872,0100
CuSO4•5H2O AppliChem A1034,0500
Citric Acid  AppliChem A2344,0500
Agarose Promega V3125
(NH4)2SO4  Merck 1.01217.1000
L-Leucine Sigma-Aldrich L8000-100G
Adenine Hemisulfat Salt, mini 99% Sigma-Aldrich A9126-100G
Uracil  Sigma-Aldrich U0750
Lanolin Sigma-Aldrich L7387
Vaseline Reactolab 92045-74-4
Paraffin Reactolab 7005600

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References

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