Цифровой Microfluidics автоматизированного протеомных Обработка
Summary
Цифровой Microfluidics это техника характеризуется манипуляции дискретных капель (~ NL – мл) на массив электродов с применением электрических полей. Она хорошо подходит для проведения быстрых, последовательных, миниатюрных автоматизированных биохимических анализов. Здесь мы сообщаем платформы, способной автоматизировать несколько протеомных шагов обработки.
Abstract
Клиническая протеомика стала важной новой дисциплиной, обещая открытию биомаркеров, которые будут полезны для ранней диагностики и прогноза заболевания. Хотя клинические протеомных методы отличаются друг от друга, общая характеристика необходимости (я) экстракция белков из очень разнородных жидкостей (например, сыворотки, цельной крови и др.) и (II), обширные биохимические обработки до анализа. Здесь мы сообщаем о новых цифровых микрофлюидики (DMF) метод, основанный на интеграции нескольких этапов обработки, используемые в клинической протеомики. Это включает в себя белок добычи, resolubilization, сокращение, алкилирования и ферментативного пищеварения. Цифровой микрофлюидики является микромасштабной жидкости обработки техника, в которой nanoliter-микролитр размера капель манипулируют на открытой поверхности. Капли расположены на верхней части массив электродов, покрытых слоем диэлектрика – когда электрический потенциал прикладывается к капле, расходы накапливаются по обе стороны от диэлектрика. Обвинения служить электростатическая ручки, которые могут быть использованы для контроля капли позиции, и смещение последовательности электродов в серии, капли можно обойтись, перемещение, слияние, соединение, и разделить на поверхности. Таким образом, DMF является естественным, пригодный для проведения быстрых, последовательных, многоступенчатое, миниатюрных автоматизированных биохимических анализов. Это представляет собой значительный шаг вперед по сравнению с традиционными методами (опираясь на Руководство пипетки или роботов), и имеет потенциал, чтобы быть полезным новым инструментом в клинической протеомики.
Маис Дж. Джебраил, Вивьен Н. Лук, и Стив CC Ши способствовали в равной степени к этой работе.
Текущий адрес Серджио LS Фрейре является в университете наук в Филадельфии расположен в 600 Юг 43-й улицы, Philadelphia, PA 19104.
Protocol
Discussion
Отсутствие стандартизированных обработки образцов и обработки в протеомики является основным ограничением для поля. Кроме того, обычные макромасштабе обработки образцов включает в себя несколько контейнеров и решение переводы, которые могут привести к потере образца и загрязнения. …
Acknowledgements
Мы благодарим естественным наукам и инженерным исследованиям Совета (NSERC) и Канадского общества рака за финансовую поддержку. SCCS благодаря NSERC и VNL благодаря Онтарио Высшее стипендии (ОГС) программы для выпускников стипендии. ARW благодаря CRC для председателя исследованиям Канады.
References
- Abdelgawad, M., Wheeler, A. R. The Digital Revolution: A New Paradigm for Microfluidics. Adv. Mat. 21, 920-925 (2009).
- Jebrail, M., Wheeler, A. R. A Digital Microfluidic Method for Protein Extraction by Precipitation. Anal. Chem. 81, 330-335 (2009).
- Luk, V. N., Wheeler, A. R. A Digital Microfluidic Approach to Proteomic Sample Processing. Anal. Chem. 81, 4524-4530 (2009).
