Nöral devreler topografik spesifik moleküler profilleri ile fonksiyonel bölme halinde düzenlenmiştir. Burada, çok yönlü bir wholemount immünohistokimyasal yaklaşımını kullanarak global beyin topoğrafya ortaya çıkarılması için pratik ve teknik adımları sağlar. Bu iyi anlaşılmış cytoarchitecture ve beyincik devre kullanarak yöntemin yardımcı göstermektedir.
Serebellumun tekrarlanan ve iyi anlaşılmış hücresel mimarisi beyin topoğrafya keşfetmek için ideal bir model sistem haline getirmektedir. Nispeten homojen cytoarchitecture altında yatan gen ve protein ifade parasagital etki karmaşık bir dizidir. Serebellumun moleküler kompartımanlara afferent liflerin anatomik ve fonksiyonel organizasyon tarafından yansıtılır. Tam serebellar organizasyonun karmaşıklığını anlamak için, daha önce fare serebellumda desenlendirme kusurları yüksek verimlilik analizi için wholemount boyama yaklaşım rafine. Bu protokol ayrıntılı reaktiflerin, alet ve başarıyla wholemount immun kullanarak erişkin fare beyincik protein ekspresyonu ortaya çıkarmak için yararlı olan pratik adımları açıklar. Adımları burada beyin ince topografisi ile ortaya edilebilir bir örnek olarak zebrinII / aldolaseC ifadesi kullanılarak bu yöntemin yardımcı sergilemektediryerli üç boyutlu yapı. Ayrıca açıklanan moleküler topografya karşılaştırmalı çalışmalar için afferent projeksiyonları ve büyük cerebella protein ifade görselleştirme izin protokolü için uyarlamaları vardır. Bu uygulamaları göstermek için, sıçan serebellumun afferent boyama veri dahildir.
Biz gelişmekte olan ve yetişkin beyninde açığa protein ekspresyonu için çok yönlü bir immunohistokimyasal yaklaşımı kullanarak başarılı wholemount boyanması için gerekli teknik detayları tarif var. Bu yaklaşım kullanılarak, karmaşık moleküler salgılanma modellerini analiz edilebilir ve beyin topografisi zahmetli ve zaman alıcı bir doku kesit prosedürler için gerek olmaksızın takdir.
Bu protokol, yetişkin 1,2,8,9 ve erken doğum sonrası fare serebel…
The authors have nothing to disclose.
RVS Yeshiva Üniversitesi Albert Einstein Tıp Koleji start-up fonları yeni araştırmacı tarafından desteklenmektedir.
Materials | Function in protocol |
Perfusion pump (Fisher Scientific/13-876-2) | Allows for consistent and slow perfusion. |
Sharp-tip Scissors (FST/14081-08) | General use in perfusion and dissection. |
Blunt-tip Forceps (FST/91100-12) | To stabilize the heart for insertion of the perfusion needle. |
Forceps (FST by Dumont AA/11210-10) | For use during dissection of the brain from the skull and to separate the cerebellum from the rest of the brain. These are essential because they have a slightly rounded tip that helps minimize damage to the cerebellum during dissection. |
Nutator (Fisher Scientific) | Used to keep tissue in motion during incubation periods. |
1.5 mL tube (Sarstedt/Screw Cap Micro Tube) | All steps of the histochemistry protocol take place in these microtubes. The rounded bottom ensures that the cerebellum stays in motion. |
Perforated spoon (FST/10370-17) | Used to keep wholemounts in the microtubes while gently decanting out the spent solution. |
Leica MZ16 FA microscope | Used to examine wholemount staining. |
Leica DFC3000 FX camera | Used to capture wholemount images. |
Table 1.
Example calendar for a typical wholemount experiment | ||||||||
Day 1 | Dent’s fix, room temperature, 8 hrs | Dent’s bleach, 4°C, overnight | ||||||
Day 2 | 100% MeOH, room temperature, 2x, 30 min each | 100% MeOH, Freeze/thaw, 4x, 30 min/15 min |
100% MeOH, -80°C, overnight | |||||
Day 3 | 50% MeOH/50% PBS, room temperature, 60-90 min | 15% MeOH/ 85% PBS, room temperature, 60-90 min | 100% PBS, room temperature, 60-90 min | 10μg/mL Proteinase K in PBS, room temperature, 2-3 min | 100% PBS, room temperature, 3x, 10 min each | PMT, 4°C, overnight | ||
Day 4-5 | PMT + 1° antibody + 5% DMSO, 4°C, 48 hrs | |||||||
Day 6 | PMT, 4°C, 2-3x, 2-3 hrs each | PMT + 2° antibody + 5% DMSO, 4°C, 24 hours (Or begin amplification steps with ABC complex) | ||||||
Day 7 | PMT, 4°C, 2-3x, 2-3 hrs each | PBT, room temperature, 2 hrs | Incubate in fresh DAB in PBS until optimal staining is visualized |
Table 2.
Recipes (*=prepare fresh every time) | |
PBS (phosphate buffered saline) | 0.1M phosphate buffered saline in deionized water. pH 7.2 (Sigma tablets; P4417) |
PFA (Paraformaldehyde) | Made and stored frozen as a 20% solution and then diluted to 4% in PBS for the working solution (Fisher Scientific; T353) |
Dent’s Fixative3* | 4 parts methanol 1 part dimethylsulfoxide (DMSO; Fisher Scientific; D159-4) |
Dent’s Bleach3* | 4 parts methanol 1 part dimethylsulfoxide (DMSO; Fisher Scientific; D159-4) 1 part 30% hydrogen peroxide |
Enzymatic Digestion | 10 μg/ml of Proteinase K (Roche Diagnostics; 03115828001) in PBS. |
PBST | PBS containing: 0.1% Tween-20 (Fisher Scientific, BP337; Triton can also be used in place of Tween-20 in all instances.) |
PMT25* | PBS containing: 2% nonfat skim milk powder (Carnation preferred) 0.1% Tween-20 (Fisher Scientific; BP337) |
PBT25* | PBS containing: 0.2% bovine serum albumin (Sigma; B9001S) 0.1% Tween-20 (Fisher Scientific; BP337) |
DAB* | Dissolve one 10-mg tablet of 3,3-diaminobenzidine (Sigma-Aldrich; D5905) in 40 ml of PBS. Add 10 μl of 30% hydrogen peroxide to initiate reaction). |
ABC Complex Solution | Vectastain kit (Vector laboratories, Inc; PK-4000) |
Table 3.