وقد أبلغ الكيسي تصرف عبر الغشاء منظم التليف (CFTR)، وقناة كلوريد الظهارية، للتفاعل مع مختلف البروتينات وتنظيم العمليات الخلوية الهامة، من بينها قد تم PDZ CFTR عزر بوساطة التفاعلات موثقة توثيقا جيدا. يصف هذا بروتوكول طرق التي قمنا بتطويرها لتجميع الجزيئات CFTR PDZ التي تعتمد على إشارات معقدة<em> في المختبر</em>.
الكيسي تصرف عبر الغشاء منظم التليف (CFTR)، وهي قناة كلوريد تقع في المقام الأول على الأغشية قمية من الخلايا الظهارية، يلعب دورا حاسما في توازن السوائل بطريق الظهارة 1-3. وقد تورط CFTR في اثنين من أهم الأمراض: التليف الكيسي (CF) (4) وإفرازي الإسهال 5. في قوات التحالف، ويتم تقليل توليف أو النشاط الوظيفي للقناة الكلور CFTR. هذا الاضطراب يصيب حوالي 1 في 2500 القوقازيين في الولايات المتحدة 6. كما تم الإفراط في النشاط CFTR المتورطين في حالات السموم التي يسببها الاسهال إفرازي (على سبيل المثال، بواسطة بكتيريا الكوليرا والحرارة كولاي معوي مستقر) الذي يحفز المخيم أو إنتاج المركب في القناة الهضمية 7.
تراكم الأدلة تشير إلى وجود تفاعلات المادية والوظيفية بين CFTR وعدد متزايد من البروتينات الأخرى، بما في ذلك شركات النقل، والقنوات الأيونية، والمستقبلات، كاينيسات، phosphatases، إشارةوقد تبين أن الجزيئات جي، وعناصر هيكل الخلية، وهذه التفاعلات بين CFTR وبروتينات لها ملزم للمشاركة حاسمة في تنظيم CFTR بوساطة نقل أيون بطريق الظهارة في المختبر، وأيضا في الجسم الحي 8-19. في هذا البروتوكول، ونحن نركز فقط على الطرق التي تساعد في دراسة التفاعلات بين ذيل CFTR محطة الكربوكسيل، التي تمتلك عزر بروتين ملزمة [يشار إلى PSD95/Dlg1/ZO-1 (PDZ) عزر]، و وأشار مجموعة من البروتينات سقالة، والتي تحتوي على وحدة نمطية محددة وملزمة لمثل المجالات PDZ. حتى الآن، تم الإبلاغ عن عدة بروتينات مختلفة PDZ سقالة لربط محطة الذيل الكربوكسيل من CFTR مع الانتماءات المختلفة، مثل NHERF1، NHERF2، PDZK1، PDZK2، CAL (CFTR المرتبطة يجند)، Shank2، وغراسب 20-27. وعزر PDZ ضمن CFTR معترف بها من قبل البروتينات سقالة PDZ هو آخر أربعة الأحماض الأمينية في محطة C (أي، 1477، DTRL-1480 في CFTR الإنسان) 20. ومن المثير للاهتمام،يمكن CFTR ربط أكثر من واحد PDZ نطاق كل من NHERFs وPDZK1، وإن كان ذلك بدرجات متفاوتة من الانتماءات 22. وقد تبين أن هذا multivalency فيما يتعلق ملزم CFTR أن تكون ذات أهمية وظيفية، مما يوحي بأن PDZ البروتينات سقالة قد تسهل تشكيل الجزيئات CFTR يشير مجمعات لإشارات محددة / انتقائي وفعال في الخلايا 16-18.
وقد وضعت فحوصات الكيمياء الحيوية متعددة لدراسة CFTR، التي تنطوي على تفاعلات البروتين، مثل مناعي المشترك، فحص المنسدلة، زوج من الحكمة فحص ملزم، اللونية الزوج الحكيم فحص ملزمة، وفحص الجزيئات المعقدة الجمعية 16-19،28،29 . هنا نركز على الإجراءات التفصيلية لتجميع عزر التي تعتمد على PDZ CFTR المحتوية على الجزيئات المعقدة في المختبر، والذي يستخدم على نطاق واسع من قبل مختبر لدينا لدراسة البروتين البروتين أو المجال نطاق التفاعلات التي تنطوي على CFTR 16-19،28،29.
في هذا البروتوكول أثبتنا وسيلة لتجميع في المختبر والكشف عن CFTR التي تحتوي على مجمع الجزيئات يشير الى استخدام البروتين النقي (أو أجزاء بروتين) و / أو lysates خلية كما ذكرت سابقا 16-19،29،30. لتحقيق أفضل النتائج في النقاط التالية الحاسمة خلال عملية الإعداد تتطلب اهتم?…
The authors have nothing to disclose.
وقد تم دعم عملنا من المنح المقدمة من جمعية القلب الأميركية (جنوب شرق الكبرى التابعة ل) 0765185B البداية للمنح في والمعونة، وU. باردي إلسا مؤسسة منح البحوث، وجامعة واين ستيت صندوق بدء التشغيل ضمن الجدران والقلب والأوعية الدموية بحوث مبادرة إيزيس جائزة المعهد. وكان في الأصل هذه الطريقة في المختبر من الجزيئات CFTR الجمعية المعقدة التي بدأها الدكتور AP نارين (جامعة تينيسي مركز علوم الصحة).
Name of the reagent | Company | Catalog number | Comments |
pGEX4T-1 vector | GE Healthcare | 28-9545-49 | formerly Amersham Biosciences |
pMAL-C2 vector | New England BioLabs | ||
pET30 vector | EMD Chemicals | 69077-3 | formerly Novagen |
Glutathione agarose beads | BD Biosciences | 554780 | |
Amylose resin | New England BioLabs | E8021S | |
Talon beads | Clontech | 635501 | |
reduced glutathione | BD Biosciences | 554782 | |
imidazole | Fisher | BP305-50 | |
maltose | Fisher | BP684-500 | |
S-protein agarose | EMD Chemicals | 69704-3 | formerly Novagen |
Anti-Flag HRP | Sigma | A8592 | |
Anti-CFTR IgG | Custom-made | R1104 | mAb recognizing CFTR epitope at a.a. 722-734 |
Anti-MRP2 IgG | Chemicon International | MAB4148 | Now a part of Millipore |
Table 2. Specific reagents and equipment.