Summary

Экспрессия рекомбинантных Целлюлаза Cel5A от<em> Trichoderma reesei</em> В растениях табака

Published: June 13, 2014
doi:

Summary

Растения табака были использованы для получения грибковые целлюлазы, TrCel5A, через систему переходных экспрессии. Выражение может контролироваться с использованием флуоресцентного слитый белок и белок активность характеризовалась после выражение.

Abstract

Целлюлоза разрушающие ферменты, целлюлозы, являются объектами как исследований, так и промышленных интересов. Преобладание этих ферментов в трудных для культуры организмов, таких как гифы потенциала грибков и анаэробных бактерий, поспешил использование рекомбинантных технологий в этой области. Методы выражения завод являются желательным система для крупномасштабного производства ферментов и других промышленно полезных белков. При этом способы временной экспрессии грибковых эндоглюканазы, Trichoderma reesei Cel5A, в Nicotiana аЬасит демонстрируются. Выражение Успешное белок показано, контролируется флуоресценции с использованием гибридного белка mCherry-фермента. Кроме того, набор базовых тестов используются для изучения деятельности временно выраженной Т. reesei Cel5A, в том числе в ДСН-ПААГ, Вестерн-блоттинга, зимографии, а также флуоресценции и на основе красителя подложки деградации анализов. Система, описанная здесь, могут использоваться для получения активной ячейкиÜlase в течение короткого периода времени, с тем, чтобы оценить потенциал для дальнейшего производства в растениях через учредительных или индуцибельных систем экспрессии.

Introduction

Деградация лигноцеллюлозной биомассы и ее преобразования в жидкое топливо было предусмотрено в качестве метода для уменьшения зависимости от ископаемых видов топлива. Одним из важных препятствием в установлении экономически обоснованных систем обработки биомассы в ферментативного расщепления целлюлозы и гемицеллюлозы 1. Системы экспрессии растений показывают большой потенциал для производства ферментов в промышленном масштабе. Сельскохозяйственные системы для сбора растений экономически и в объеме уже установлены, так как они были в течение тысяч лет. Производство целлюлаз в растениях желательно из-за таких факторов, как легкость автогидролиза 2, и потенциал для максимального использования более низких уровнях ферментов, увеличивая усвояемость клеточных стенок растений 1. Наконец, системы растений позволяют адресности рекомбинантных белков в конкретных областях растительных клеток и способны посттрансляционно изменить ферменты, где необходимые 3.

ve_content ">

Nicotiana аЬасит (табак) очень широко используется в качестве модельного организма для гетерологичными исследований экспрессии белка в растениях, в связи с его быстрым ростом и биомассы особенностей накопления 4. Переходный экспрессии рекомбинантных белков является метод, который позволяет производство белка в короткие периоды времени 5, при сохранении гибкости в отношении локализации и, таким образом посттрансляционной модификации выбранных белков, т.е. целлюлазы. Это позволяет производить целлюлазы (ы) для базового анализа, в то же время заложить основу для дальнейших стратегий экспрессии в растениях. Использование такого переходную стратегию экспрессии, эндоглюканазы из гликозилгидролаз семейства 5, Cel5A, полученного из грибка Trichoderma reesei хоста (Hypocrea jecorina) 6 производится (далее по тексту TrCel5A). TrCel5A является 42 кДа белок, который изначально гликозилирован и очень активен в гидравлическиеroylzing целлюлозных цепей 7.

Методика переменной экспрессии описано здесь, основаны на сравнительно обычно используемой системе, проникают листьев растений с Agrobacteria, несущий ген интереса в соответствующий вектор экспрессии. Для обеспечения быстрого анализа успеха в выражении Планта, TrCel5A также может быть выражено в виде слитого белка с mCherry, мономерного флуоресцентного белка первоначально полученных от Discosoma зр. Белок DsRed 8, с дополнительными шестью остатками гистидина (His-тегов), слитых с С-конец (TrCel5A-mCherry). Экспрессия гетерологичного слитого белка, TrCel5A-mCherry, таким образом, может контролироваться в рамках растущего растения с помощью зеленый свет для изучения mCherry разгон. При желании тонкие слои растительного материала может быть рассмотрен в зеленом свете под микроскопом, чтобы установить конкретную локализацию белка. За эту работу сигнала и переходовсидят пептиды были включены в конструкцию, чтобы локализовать гетерологичный экспорт белка в эндоплазматический ретикулум 9.

Чтобы проанализировать деятельность растений, выраженных целлюлазы, в том числе TrCel5A, ряд тестов активность целлюлазы может быть запущен. После экстракции от общего растворимых белков растений, TrCel5A может быть частично очищен с использованием метода термической инкубации. Белок размер устанавливается с помощью SDS-PAGE с последующим вестерн-блоттинга. Зимографии могут быть использованы для анализа активностью в отношении субстратов, например целлюлозы который был карбокси-метилированный (изготовление карбоксиметилцеллюлозу: CMC) на растворимость 10. Целлюлазы и глюкозидазы можно контролировать с помощью флуорофора 4-метилумбеллиферил (4-MU), связанное с β-D-целлобиозида (комбинированный: 4-MUC). Другой метод для оценки эндоглюканазы деятельность включает в себя спектрометрический анализ CMC который был связан с азо-двы (Remazolbrilliant Голубой R) 11. Кроме того, белок активность обоих эндоглюканаз и ряд целлюлазы можно контролировать с помощью теста на анализ сахара, такие как гидразида р-гидрокси бензойной кислоты (PAHBAH) анализа 12. Эти методы могут быть использованы для выяснения и количественной оценки активности экспрессированного целлюлазы, представляющего интерес.

Protocol

1. Рост дикого типа N. Tabacum растений Чтобы вырастить N. аЬасит Л. резюме. Petit Havana SR1 растений на почве, поместите семена табака на соответствующих горшки с нормальной почвой для прорастания. Через 2 недели, передать саженцев отдельные горшки. Выдержите заводы в теплице с посто…

Representative Results

TrCel5A и TrCel5A-mCherry были успешно экспрессированы в растениях табака с использованием переходных системы экспрессии (фиг.1А и 1В). Экспертиза паттерном экспрессии слитого белка TrCel5A-mCherry показал здоровые листья (рис. 1в), который показал, выражение широкое белка в зе?…

Discussion

Рекомбинантной экспрессии целлюлазы является полем большой интерес, в связи с желанием более эффективных систем производства биотоплива 1. Растения предлагают много возможностей для успешного производства целлюлазы, с такими функциями, как методы экономического уборки и метод…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Эта работа была поддержана БМБФ Forschungsinitiative "Bioenergie 2021 – Forschung für умереть Nutzung фон BIOMASSE" и кластера к совершенству "Персонализированные сделал топлива из биомассы», который финансируется в рамках инициативы совершенства немецкими федерального правительства и правительств, чтобы содействовать развитию науки и исследования в немецких университетах.

Materials

4-methylumbelliferyl β-D-cellobioside SIGMA-ALDRICH M6018
Acetic acid ROTH 3738
Acetosyringon (concentrated) ROTH 6003
Antibiotic – kanamycin ROTH T832
Antibiotic – rifampicin ROTH 4163
Antibiotic – carbenicillin ROTH 6344
Antibody – rabbit anti His(6) pAb ROCKLAND 600-401-382
Antibody – goat anti rabbit AP, FC pAb DIANOVA 111-055-008
Azo-carboxymethyl cellulose MEGAZYME S-ACMC
β-cyclodextrin SIGMA-ALDRICH C4805
Calcium chloride dihydrate SIGMA-ALDRICH C5080
Carboxymethyl cellulose ROTH 3333.1
Cellulase from Trichoderma reesei ATCC 26921 SIGMA-ALDRICH C2730
Congo red SIGMA-ALDRICH 75768
Coomasie brilliant blue G 250 ROTH 9598.2
D(+)-glucose ROTH 8337
Ethanol ROTH K928
Filter paper – Rotilabo blotting paper ROTH CL67
NBT/BCIP SIGMA-ALDRICH 72091
MES buffer ROTH 4256
Methanol ROTH 8388
Sodium citrate ROTH 3580
Sodium dodecylsulfate SERVA 20765
Sodium hydroxide ROTH 6771
Soil, Einheitserde classic  PATZER GMBH
Spectrometer – Infinite M200 TECAN
Sucrose SIGMA-ALDRICH S-5390
4-Hydroxy benzhydrazide  SIGMA-ALDRICH H9882
Phosphate buffered saline ROTH 1058
UV light source – BLAK RAY UVP
Vibratome – VT1000S Leica

References

  1. Garvey, M., Klose, H., Fischer, R., Lambertz, C., Commandeur, U. Cellulases for biomass degradation: comparing recombinant cellulase expression platforms. Trends in Biotechnology. 31, 581-593 (2013).
  2. Klose, H., Günl, M., Usadel, B., Fischer, R., Commandeur, U. Ethanol inducible expression of a mesophilic cellulase avoids adverse effects on plant development. Biotechnology for Biofuels. 6, 53 (2013).
  3. Klose, H., Röder, J., Girfoglio, M., Fischer, R., Commandeur, U. Hyperthermophilic endoglucanase for in planta lignocellulose conversion. Biotechnology for Biofuels. 5, 63 (2012).
  4. Sharma, A. K., Sharma, M. K. Plants as bioreactors: recent developments and emerging opportunities. Biotechnology Advances. 27 (6), 811-832 (2009).
  5. Tremblay, R., Wang, D., Jevnikar, A. M., Ma, S. Tobacco, a highly efficient green bioreactor for production of therapeutic proteins. Biotechnology Advances. 28 (2), 214-221 (2010).
  6. Lee, T. M., Farrow, M. F., Arnold, F. H., Mayo, S. L. A structural study of Hypocrea jecorina Cel5A. Protein Science. 20, 1935-1940 (2011).
  7. Saloheimo, M., et al. EGIII, a new endoglucanase from Trichoderma reesei: the characterization of both gene and enzyme. Gene. 63, 11-21 (1988).
  8. Davidson, M. W., Campbell, R. E. Engineered fluorescent proteins: innovations and applications. Nature Methods. 6, 713-717 (2009).
  9. Pelham, H. R. The retention signal for soluble proteins of the endoplasmic reticulum. Trends in Biochemical Sciences. 15, 483-486 (1990).
  10. Béguin, P. Detection of cellulase activity in polyacrylamide gels using Congo red-stained agar replicas. Analytical Biochemistry. 131, 333-336 (1983).
  11. Jørgensen, H., Mørkeberg, A., Krogh, K. B. R., Olsson, L. Growth and enzyme production by three Penicillium species on monosaccharides. Journal of Biotechnology. 109, 295-299 (2004).
  12. Lever, M. A new reaction for colorimetric determination of carbohydrates. Analytical Biochemistry. 47, 273-279 (1972).
  13. Maclean, J., et al. Optimization of human papillomavirus type 16 (HPV-16) L1 expression in plants: comparison of the suitability of different HPV-16 L1 gene variants and different cell-compartment localization. Journal of General Virology. 88, 1460-1469 (2007).
  14. Munro, S., Pelham, H. R. A C-terminal signal prevents secretion of luminal ER proteins. Cell. 48, 899-907 (1987).
  15. Laemmli, U. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 227, 680-685 (1970).
  16. Burnette, W. N. “Western Blotting”: Electrophoretic transfer of proteins from sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gels to unmodified nitrocellulose and radiographic detection with antibody and radioiodinated protein A. Analytical Biochemistry. 112, 195-203 (1981).
  17. Towbin, H., Staehelin, T., Gordon, J. Elelctrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets – procedure and some applications. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 76, 4350-4354 (1979).
  18. Blake, M. S., Johnston, K. H., Russell-Jones, G. J., Gotschlich, E. C. A rapid, sensitive method for detection of alkaline phosphatase-conjugated anti-antibody on Western blots. Analytical Biochemistry. 136, 175-179 (1984).
  19. Yamamoto, E., Yamaguchi, S., Nagamune, T. Effect of β-cyclodextrin on the renaturation of enzymes after sodium dodecyl sulfate–polyacrylamide gel electrophoresis. Analytical Biochemistry. 381, 273-275 (2008).
  20. Fischer, R., Vaquero-Martin, C., Sack, M., Drossard, J., Emans, N., Commandeur, U. Towards molecular farming in the future: transient protein expression in plants. Biotechnology and Applied Biochemistry. 30 (2), 113-116 (1999).
  21. Sammond, D. W., et al. Cellulase linkers are optimized based on domain type and function: Insights from sequence analysis, biophysical measurements, and molecular simulation. PLoS One. 7, (2012).
  22. Boonvitthya, N., Bozonnet, S., Burapatana, V., O’Donohue, M. J., Chulalaksananukul, W. Comparison of the heterologous expression of Trichoderma reesei endoglucanase II and cellobiohydrolase II in the yeasts Pichia pastoris and Yarrowia lipolytica. Molecular Biotechnology. 54, 158-169 (2013).

Play Video

Cite This Article
Garvey, M., Klinger, J., Klose, H., Fischer, R., Commandeur, U. Expression of Recombinant Cellulase Cel5A from Trichoderma reesei in Tobacco Plants. J. Vis. Exp. (88), e51711, doi:10.3791/51711 (2014).

View Video