Summary
Zinkfingerdomänen sind eigen zellpermeablen und fähig zur Vermittlung Proteinabgabe in einem weiten Bereich von Säugetierzelltypen. Hier wird eine detaillierte Schritt-für-Schritt-Protokoll zur Durchführung Zinkfinger-Technologie für die intrazelluläre Proteinabgabe dargestellt.
Introduction
Hoch effizient und vielseitig Protein Lieferstrategien sind entscheidend für viele der Grundlagenforschung und therapeutische Anwendungen. Die direkte Lieferung von gereinigten Proteinen in Zellen ist eine der sichersten und einfachsten Methoden, um dies zu erreichen. Im Gegensatz zu 1,2-Strategien, die auf die Genexpression von Nukleinsäuren beruhen, stellt 3-5 Protein Liefer kein Risiko einer Insertionsmutagenese, ist unabhängig von der zelluläre Transkriptions / Translations-Maschinen und ermöglicht eine sofortige Wirkung. Jedoch das Fehlen einfacher und verallgemeinerbar Methoden auszustatten zellpenetrierenden Aktivität an Proteine routine confounds ihrer direkten Eintritt in die Zellen. Aktuelle Verfahren zur Erleichterung der intrazellulären Proteinabgabe auf der Verwendung von natürlich vorkommenden oder 6-8 ausgebildet zellpenetrierenden Peptide 9-12 aufgeladenen Transduktion Domänen 13,14 Nanopartikel 15 und Liposomen, 16 virusähnlichen Partikeln 17,18 basierend 19. Leider sind viele dieser Ansätze zeichnen sich durch geringe zelluläre Aufnahme Tarife, 20,21 schlechte Stabilität, 22 unbeabsichtigte Zelltyp-Spezifität, 23 Low endosomalen Flucht Objekte 24 und 25 neben Toxizität. behindert, viele Protein Übertragungstechnologien reduzieren die Bioaktivität der Proteine geliefert. 14
In unserem Labor wurde gezeigt, dass Zinkfinger-Nuclease (ZFN) Proteine - chimären Restriktionsendonukleasen aus einem programmierbaren Cys 2 -His 2 Zinkfinger-DNA-Bindungsprotein und die Spaltdomäne des FokI Restriktionsendonuklease 26-28 - inhärent zell- durchlässig. Es wurde gezeigt, 29 Diese überraschende zellpenetrierenden Aktivität eine intrinsische Eigenschaft des kundenspezifischen Zinkfinger-Domäne, einer DNA-bindenden Plattform, die als ein leistungsfähiges Werkzeug für die gezielte Genom en hervorgegangen sein,Engineering, 30-32 und als das Ergebnis der Konstellation von sechs positiv geladene Reste auf der Proteinoberfläche sein. Tatsächlich haben mehrere DNA-bindenden Proteinen, einschließlich c-Jun und N-DEK wurde gezeigt, dass eine angeborene Fähigkeit, Zellmembranen zu durchqueren besitzen. 33 In jüngerer Zeit haben unser Labor auf diese Ergebnisse und zeigten, dass die Zellen eindringende Aktivität zink- Finger (ZiF) Domains können für den intrazellulären Proteintransport genutzt werden. Genetische Fusion von entweder einem oder zwei Finger ZiF Domänen an spezifische Proteinfracht, ergab einen Wirkungsgrad, die viele herkömmliche zellpenetrierende Peptid Abgabesysteme überschritten Aufnahme. 34 Vor allem ZiF-vermittelte Abgabe nicht beeinträchtigen die Aktivität des fusionierten enzymatische Ladung und erleichtert hohe cytosolische Lieferung. Zusammen zeigen diese Ergebnisse zeigen das Potenzial der ZiF Domäne zur Erleichterung der effizienten und einfachen Verabreichung von Proteinen und möglicherweise mehrere verschiedene Arten von MakroMoleküle, in Zellen.
Hier wird eine detaillierte Schritt-für-Schritt-Protokoll zur Implementierung ZiF Technologie für Proteintransport in Säugerzellen präsentiert. Wir zuvor konstruierten eine Reihe von ein-, zwei-, drei-, vier-, fünf- und sechs Finger ZiF Domänen, die die Fähigkeit zur Bindung von DNA, durch Substitution von jeder der α-helicalen DNA-bindenden Reste fehlen, aber fähig sind, liefert Proteine in Zellen 34 (Abbildung 1). Die Herstellung und die Transduktion von Smaragd GFP (EmGFP) in HeLa-Zellen unter Verwendung eines Zwei-Finger-Domäne ZiF beschrieben. Dieses Protokoll ist erweiterbar, um fast jedes Protein in der Lage, lösliche Expression in Escherichia coli und fast jedem Säugerzelltyp. Erwartete Ergebnisse werden bereitgestellt und Strategien für die Maximierung der Leistung des Systems ausgelegt werden ebenfalls diskutiert.
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Protocol
1. Klonierung
- Erhalten Alanin-substituierten Zwei-Finger-ZiF Domänen, die in den pET-28 Expressionsvektorsystem subkloniert haben und sind auf Anfrage erhältlich (pET-2F-ZiF). 34
- PCR zu amplifizieren EmGFP aus dem Plasmid pBAD-Smaragd mit den Primern 5 'XmaI-EmGFP (5'-GGAAATTG CCCGGG ATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCAC-3'; XmaI Website in fett) und 3'-SacI-EmGFP (5'-CGGATCT GAGCTC TTACTTGTACAGCTCGTCCATGCCGAG-3 ' ; SacI-Stelle fett gedruckt).
- Verwenden 5 ng Template-DNA, 10 ul 10x-Polymerasepuffer, 1-Einheiten (U) Taq DNA-Polymerase, 0,2 mM von jedem dNTP und 0,2 & mgr; M von jedem Primer in 100 & mgr; l Lösung mit dem Restvolumen bis destilliertem / deionisiertem Wasser . Verwenden Sie die Zyklusbedingungen: 95 ° C für 5 min; 30 Zyklen von 95 ° C für 30 sec, 55 ° C für 30 sec und 72 ° C für 1 min; 72 ° C für 10 min. Ein Reinigen des PCR-Produkts durch Gel extractiauf und bestimmen, DNA-Konzentration unter Verwendung eines Spektrophotometers Mess Abs 260 x 50 & mgr; g / ml.
- Digest pET-2F ZIF und das Insert EmGFP mit den Restriktionsenzymen Xma kodiert I und Sac I in empfohlenen Puffer für 3 h bei 37 ° C unter Verwendung von 10 U Enzym pro 1 ug DNA. Visualisieren DNA durch Agarose-Gelelektrophorese unter Verwendung eines fluoreszierenden interkalierenden Farbstoff wie Ethidiumbromid.
- Reinige den verdauten DNA durch Gelextraktionskit und bestimmen, DNA-Konzentration mit einem Spektrophotometer Mess Abs 260 x 50 & mgr; g / ml.
- Ligation der gereinigten EmGFP kodierenden DNA in 50 bis 100 ng pET-2F-ZiF mit 1 U T4-DNA-Ligase für mindestens 1 h bei RT. Die besten Ergebnisse erzielen, führen Sie die Ligationsreaktion mit einem 6: Einsatz-zu-Vektor-Molverhältnis 1.
- Thaw 50 ul aller chemisch kompetente XL-1 Blue E. coli Zellen auf Eis geben und vorsichtig mischen mit 10-20 ng ligierte pET-2F-ZiF-EmGFP.
- Halten Sie auf Eis für 30 min. Hitzeschock die Mischung bei 42 ° C für 90 sec und erholen sich die Zellen in 2 ml SOB-Medium mit Katabolitrepression (SOC) für 1 Stunde bei 37 ° C unter Schütteln.
- Verbreiten Sie 100 ul der Erholung Kultur auf einem LB-Medium (LB) Agar-Platte mit 50 ug / ml Kanamycin und Inkubation O / N bei 37 ° C.
- Am folgenden Tag inokulieren 6 ml Super Broth (SB) oder LB-Kultur, die 50 ug / ml Kanamycin mit einer Kolonie von der LB-Agar-Platte und Kultur O / N bei 37 ° C.
Hinweis: Kolonie-PCR unter Verwendung der Primer 5 'XmaI-EmGFP und 3'-SacI-EmGFP könnte verwendet werden, um positive Klone zu identifizieren, bevor Miniprep werden. - Reinige pET-2F ZIF-EmGFP durch Miniprep und Plasmid bestätigt durch DNA-Sequenzierung mit T7-Promotors (5'-TAATACGACTCACTATAGGG-3 ').
2. Expression und Reinigung
- Auftauen 50 ul chemisch kompetente BL21 E. coli-Zellen auf Eis geben und vorsichtig mischen mit 100 ng pET-2F-ZiF-EmGFP plasmid. Transform wie in Schritten von 1,7 bis 1,8 beschrieben.
- Am folgenden Tag impfen 10 ml LB-Medium, das 50 ug / ml Kanamycin mit einer Einzelkolonie und wachsen O / N bei 37 ° C unter Schütteln.
- Am folgenden Tag, verdünnt den 10 ml des O / N-Kultur in 1 l LB-Medium mit 50 ug / ml Kanamycin, 0,2% Glucose und 100 & mgr; M ZnCl 2 ergänzt. Die Kultur bei 37 ° C unter Schütteln bis zu einer optischen Dichte bei 600 nm (OD 600) von 0,8 und induzieren Proteinexpression mit 2 mM Isopropyl-β-D-1-thiogalactopyranosid (IPTG). Nach 6 Stunden Wachstum bei 37 ° C, Ernten der Zellen durch Zentrifugation bei 5.000 × g für 10 min bei 4 ° C.
Anmerkung: Induktionsbedingungen sind sehr variabel und hängt von der Stabilität der Proteine exprimiert. Überwachen der OD 600 alle 30 Minuten, bis eine OD 600 von 0,8 erreicht wird. - Zellpellet in 5 ml Lysepuffer (50 mM Tris-HCl, 500 mM NaCl, 100 & mgr; M ZnCl 2, 1 mM Dithiothreitol (DTT), 1 mM MgCl 2, 1 mM Phenylmethylsulfonylfluorid (PMSF) und 10 mM Imidazol, pH 8,0). Lyse der Zellen auf Eis durch Ultraschallbehandlung mit folgender Einstellung: 50% der Leistung, 4 min Prozesszeit mit 5 s an / 10 sec aus Intervallen. Vermeiden Sie eine Überhitzung der Lösung.
- Zentrifugieren Sie das Zelllysat bei 25.000 · g für 30 min bei 4 ° C und den Überstand in ein frisches Collection Tube. Die besten Ergebnisse erzielen, führen Sie alle folgenden Schritte bei 4 ° C.
- Führen des Überstandes durch eine Säule mit 1 ml äquilibriert Ni-NTA Aufschlämmung vorverpackt. Mit 20 ml Waschpuffer (50 mM Tris-HCl, 500 mM NaCl, 100 & mgr; M ZnCl 2, 1 mM DTT, 1 mM MgCl 2 und 30 mM Imidazol, pH 8,0) Waschen des Harzes.
- Eluieren des Proteins mit 5 ml Elutionspuffer (50 mM Tris-HCl, 500 mM NaCl, 100 & mgr; M ZnCl 2, 1 mM DTT, 1 mM MgCl 2 und 300 mM Imidazol, pH 8,0).
- Buffer tauschen die eluierte Protein mit Speicherpuffer (50 mMTris-HCl, 500 mM NaCl, 100 & mgr; M ZnCl 2, 1 mM DTT, 1 mM MgCl 2 und 10% Glycerin, pH 8,0) und konzentriere das Protein zu mindestens 40 um unter Verwendung einer Spin-Konzentrator durch Zentrifugation gemäß den Anweisungen des Herstellers.
- Bestimmen der Proteinkonzentration von BCA oder Bradford-Test. Mix 2 ul gereinigte Proteine mit 2 & mgr; l 2 × SDS-PAGE-Ladepuffer, Kochen bei 95 ° C für 10 min und dann auf 4% zu lösen -20% Tris-Glycin-SDS-PAGE, um die Proteinreinheit (2) zu bewerten.
3. Protein Lagerung
- Aliquot des konzentrierten Protein, Flash Einfrieren in flüssigem Stickstoff und bei -80 ° C. Für EmGFP Fusionsproteine umfassen das Röhrchen mit Aluminiumfolie, um das Protein vor Licht zu schützen.
- Vermeiden Sie wiederholtes Einfrieren und Auftauen der Proteinlösung. Hinweis: ZiF-Fusionsproteine sind für mindestens 1 Monat unter diesen Bedingungen stabil. Brachte oder> 4 Monate Lagerung führen kannum Proteinfällung oder Bleichen von EmGFP.
4. Protein Transduction
- Pflegen HeLa-Zellen in Dulbeccos modifiziertem Eagle-Medium (DMEM), das 10% (v / v) fötalem Rinderserum (FBS) und 1% Antibiotikum-Antimykotikum bei 37 ° C in einer vollständig befeuchteten Atmosphäre mit 5% CO 2.
Anmerkung: Die Zellen passagiert mehr als 30 Mal werden für Proteintransduktionsdomäne empfohlen. - Vorbeschichtung eine Platte mit 24 Vertiefungen mit 500 ul von 50 ug / ml poly-Lysin für 30 bis 60 min bei 25 ° C. Saatgutzellen auf eine Platte mit 24 Vertiefungen in einer Dichte von 2 × 10 5 Zellen pro Vertiefung. Bei 24 Stunden nach dem Aussäen oder einmal Zellen zwischen 80% -90% konfluent, entfernen Medien aus jeder Vertiefung und Waschen mit 500 ul vorgewärmtem serumfreiem DMEM (SFM).
- Zu jeder Vertiefung, fügen Sie 250 ul SFM mit 2 uM ZiF-EmGFP Protein und 100 uM ZnCl 2. Zellen bei 37 ° C für 1 Stunde. Hinweis: ZiF Domains in die Zellen primarily durch Makropinozytose, 34, die eine energieabhängige Mechanismus ist. Daher müssen die Zellen bei 37 ° C für eine effiziente Protein Internalisierung inkubiert werden.
- Entfernen Medien von Zellen, und dreimal mit 500 ul calcium- und magnesiumfreien Dulbeccos phosphatgepufferter Salzlösung (DPBS) mit 0.5 mg / ml Heparin ergänzt. Hinweis: Heparin ist notwendig, um oberflächengebundene Protein, das Downstream-Analysen erschweren könnten, zu entfernen.
- (Optional) Wiederholen Sie die Behandlung bis zu dreimal für erhöhte Auslieferung.
- Isolieren behandelten Zellen unmittelbar nach Heparin Wasch durch Verdau mit 0,05% Trypsin-EDTA bei 37 ° C für 2 min. Resuspendieren abgelösten Zellen in 0,5 ml DPBS mit 1% FBS ergänzt.
- Messen der Fluoreszenzintensität jeder Probe durch Flusszytometrie 35 mit der Fluorescein-Isothiocyanat (FITC) Kanal (Abbildung 3). Stellen Sie die Vorwärtsstreuung (FSC) und Seitwärtsstreuung (SSC), die Bevölkerung zu platzierenInteresse auf der Skala, um sicherzustellen, dass Populationen mit unterschiedlichen Eigenschaften voneinander gelöst.
- Sammle 10.000 Live-Veranstaltungen für jede Probe und die Daten mit Hilfe der Durchflusszytometrie Datenanalyse-Software. 36 Normalisieren Fluoreszenz von HeLa-Zellen mit ZiF-EmGFP auf diese Zellen nur mit SFM behandelten analysieren.
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Representative Results
Zwei-Finger-ZiF-EmGFP Fusionsproteine in E. ausgedrückt werden coli mit> 95% Homogenität und hoher Ausbeute (> 25 mg / ml) (Abbildung 2). Im allgemeinen Ein- und Zwei-Finger kann in Mengen nahezu identisch mit denen des Wildtyp-unmodifizierte Protein ZiF Fusionsproteine hergestellt werden. Jedoch in einigen Kontexten sind fünf- und sechs Finger ZiF Fusionsproteine nicht in Ausbeuten hoch genug für nachfolgende Anwendungen hergestellt werden.
Direkte Anwendung von Zwei-Finger-ZiF EmGFP Proteins auf HeLa-Zellen für 90 min bei 37 ° C führt zu einer dosisabhängigen Zunahme EmGFP Fluoreszenz (Figur 3A). Kritisch wird keine Fluoreszenz in Abwesenheit des ZiF Domäne beobachtet. Wir haben früher festgestellt, dass fast 100% der Zellen nach der Behandlung mit nur 2 & mgr; M von zwei Fingern ZiF-EmGFP Protein fluoreszierend ist und dass HeLa-Zellen mit ZiF Fusionsprotein behandelten positiv EmGFP Fluoreszenz bei Proteinkonzentrationen nur 0,25 uM (3B).
Abbildung 1. Struktur und Sequenz der Zinkfinger-Protein. (Top) Kristallstruktur eines einzelnen Zinkfinger (ZiF) Domäne. Die Seitenketten der konservierten Cys und His-Reste mit dem Zn 2+ Ionen koordiniert werden als Sticks (PDB ID: 2I13). 37 gezeigt (unten) Reihenfolge der ZiF-Domäne. Arrows und Zylinder zeigen Β-Blatt und α-Helix-Sekundärstrukturen auf. Die α-Helix-DNA-Bindungsreste, die mit Alanin substituiert worden sind, sind pink markiert. Positiv geladene Reste voraussichtlich Zell Internalisierung vermitteln hervorgehoben hellblau. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieses Bild anzuzeigen.
Abbildung 2. SDS-PAGE von gereinigtem Ein-, Zwei-, Drei- und Vier-Finger-ZiF-EmGFP Fusionsproteine. ZiF-EmGFP Fusionsproteine wurden in E. ausgedrückt coli und durch Ni-NTA-Agarose-Harz gereinigt. Eluierte Protein Reinheit durch SDS-PAGE unter Verwendung einer 4% -20% Tris-Glycin-Gel analysiert. Kein signifikanter Abbau oder Verkürzungen der ZiF-EmGFP Fusionsproteine beobachtet.
Abbildung 3. ZiF-vermittelte Proteintransport in HeLa-Zellen. (A) Die Fluoreszenzintensität von HeLa-Zellen mit steigenden Mengen von zwei Fingern ZiF-EmGFP Protein behandelt. HeLa-Zellen mit EmGFP Protein behandelt allein überlappen vollständig mit unbehandelten Zellen. (B) normalisierte Fluoreszenzintensität von HeLa-Zellen nacheinander mit 2 uM o behandeltf Zwei-Finger-ZiF-EmGFP Protein. Die Fluoreszenzintensität wurde durch Flusszytometrie bestimmt.
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Discussion
Hier wird ein Schritt-für-Schritt-Protokoll für Proteinabgabe mit zellpermeablen Zinkfinger (ZIF) Domänen dargestellt. Das ZiF Domain nicht senken die Aktivität verschmolzen enzymatische Fracht 34; erlaubt die Herstellung und Reinigung von Proteinen in Ausbeuten fast identisch mit denen mit unmodifizierten Protein beobachtet; und kann Proteine und Enzyme mit Wirkungsgraden, die traditionelle zellpenetrierenden Peptid oder Proteintransduktionsdomäne Systeme übersteigen, in einer Vielzahl von Zelltypen zu transportieren. Zusammen zeigen diese Ergebnisse, das große Potential des Domänen ZiF zum Vermitteln direkte Proteintransport in Zellen für eine Vielzahl von Anwendungen.
Maximale Proteintransport wurde zuvor nur mit einem Zwei-Finger-ZiF Domain erreicht, trotz der Tatsache, dass Arrays von Drei- und Vier-Finger-ZiF Domänen tragen größere positive Ladung verlängert. Diese Ergebnisse zeigen, dass ZiF-vermittelten Zelleintritt könnte durch andere Mittel als Ladung, inc Faktoren beeinflusst werdenLuding Proteinstabilität oder starre Konformation. ZiF Domäne vermittelten Protein Liefer wurde auch gefunden, energieabhängige und somit erfordert, daß alle mit Protein behandelten Zellen bei 37 ° C inkubiert werden. Durch die Verwendung von kleinmolekularen Inhibitoren verschiedener endozytischen, Makropinozytose, und in einem geringeren Ausmaß Caveolin Endocytose wurden bestimmt, um die Hauptwege für ZiF vermittelten Zelleintritt sein. 34 Bemerkenswert ist, im Gegensatz zu anderen Protein-Transduktion Systemen sind ZiF Domänen in der Lage, effizient zu entkommen Endosomen, um ein hohes Maß an cytosolische Lieferung des geschmolzenen makromolekularen Ladung zu vermitteln, unterstreichen das Potenzial dieser Bereiche zum Erreichen robuster Protein Lieferung.
Nach unserer Erfahrung ist die Aussaatdichte von Zellen ein kritischer Schritt für das Erreichen einer hohen Proteintransduktionsdomäne. Es wird empfohlen, die Behandlung von Zellen, wenn sie 80% -90% Konfluenz erreichen und zuvor beobachtet, dass Zellen bei> 95% Konfluenz zeigen Unter ausgesätoptimale Transduktionsfähigkeit, während Zellen bei niedrigen Dichten (<50%) beimpft sind anfällig für die Toxizität Protein induziert. Wichtig ist, dass für die Zelltypen mit hoher Ablösetendenzen, Zellkulturplatten mit Poly-Lysin vorbeschichtet werden empfohlen. Poly-Lysin erleichtert Zellhaftung durch elektrostatische Wechselwirkungen mit negativ geladenen Zelloberflächen-Komponenten. Obwohl die α-helikale DNA-bindenden Reste jedes ZiF Domäne entfernt wurden, um das Potenzial für eine DNA-Erkennung zu eliminieren, die Cystein und Histidin-Resten, die mit der Zn 2+ -Ionen, um die Koordinaten ΒΒα ZiF Domäne fachen Stabilisierung intakt. So empfehlen wir, dass jede Speicherpuffer mit zumindest 100 & mgr; M ZnCl 2 ergänzt werden, um die Proteinintegrität aufrechtzuerhalten.
Obwohl die ZiF Domäne wurde zuvor gezeigt, dass Proteine und Enzyme in eine Vielzahl von Zelltypen zu liefern, könnte die Effizienz der ZiF Lieferung auch abhängig von dem sowohl sein macromomolekulare Fracht und Proteinkonzentration. Zum Beispiel werden Zellen, die mit zwei Fingern ZiF-Luciferase-Fusionsprotein behandelt wurden, beobachtet, um eine maximale Lumineszenz angezeigt wird, wenn mit 0,5 & mgr; M-Protein in höheren Konzentrationen behandelt, mit verminderter Aktivität, während Zellen mit zwei Fingern behandelt EmGFP zeigte eine Dosis-abhängige Zunahme der Fluoreszenz Stärke bis zu 8,0 & mgr; M-Protein und auf aufeinanderfolgenden Proteinbehandlungen. Wir empfehlen daher die Beurteilung der Zelle durchdringende Fähigkeit jedes einzigartige ZiF Domain-Fusion über einen Bereich von Konzentrationen.
Schließlich, wenn auch noch nicht nachgewiesen, erwarten wir, dass ZiF Domain Lieferung ist eine hochflexible Plattform der Lage, eine Vielfalt von Makromolekülen in Zellen. Beispielsweise kann es möglich sein, sowohl DNA als auch RNA an chemisch an die Oberfläche des ZiF Domäne über eine hydrolysierbare Linker funktionalisiert werden oder transient durch Verkapselung ZiF Domänen in Zellen transfiziert. Zusätzlich kann die efficiparenz des ZiF Proteintransport könnte durch rationale Design Anstrengungen auf die Oberflächenladung Optimierung konzentriert verbessert werden.
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Disclosures
Die Autoren haben nichts zu offenbaren.
Acknowledgments
Diese Arbeit wurde von den National Institutes of Health (DP1CA174426 Carlos F. Barbas) und ShanghaiTech Universität, Shanghai, China (JL) unterstützt. Molekulare Grafiken wurden mit PyMol erzeugt.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| XmaI | New England Biolabs | R0180L | |
| SacI | New England Biolabs | R0156L | |
| Expand High Fidelity PCR system | Roche | 11759078001 | |
| dNTPs | New England Biolabs | N0446S | |
| 4%-20% Tris-Glycine Mini protein gels, 1.5 mm, 10 wells | Life Technologies | EC6028BOX | |
| 2x Laemmli Sample Buffer | BioRad | 161-0737 | |
| T4 DNA Ligase | Life Technologies | 15224-017 | |
| BL21 (DE3) Competent E. coli | New England Biolabs | C2527I | |
| IPTG | Thermo Scientific | R0391 | |
| Zinc Chloride | Sigma-Aldrich | 208086-5G | |
| Kanamycin Sulfate | Fisher Scientific | BP906-5 | |
| Glucose | Sigma-Aldrich | G8270-100G | |
| Tris Base | Fisher Scientific | BP152-25 | |
| Sodium Chloride | Sigma-Aldrich | S9888-25G | |
| DTT | Fisher Scientific | PR-V3151 | |
| PMSF | Thermo Scientific | 36978 | |
| Ni-NTA Agarose Resin | QIAGEN | 30210 | |
| Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516-500ML | |
| Imidazole | Sigma-Aldrich | I5513-25G | |
| Amicon Ultra-15 Centrifugal Filter Units | EMO Millipore | UFC900324 | |
| DMEM | Life Technologies | 11966-025 | |
| Fetal Bovine Serum | Life Technologies | 10437-028 | |
| Antibiotic-Antimycotic | Life Technologies | 15240-062 | |
| 24-Well Flat Bottom Plate | Sigma-Aldrich | CLS3527-100EA | |
| Poly-Lysine | Sigma-Aldrich | P7280 | |
| DPBS, No Calcium, No Magnesium | Life Technologies | 21600010 | |
| Heparan Sulfate | Sigma-Aldrich | H4777 | |
| Trypsin | Life Technologies | 25300054 | |
| HeLa cells | ATCC | CCL-2 | |
| Nano Drop ND-1000 spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific | ||
| QIAquick PCR Purification Kit | QIAGEN | 28104 | |
| QIAquick Gel Extraction Kit | QIAGEN | 28704 |
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