Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Biology

Çoklanmış Immuno-histokimyasal boyanması ve Multispektral Görüntüleme kullanma Protein Ekspresyonu ve Co-lokalizasyon Kantifikasyonu

doi: 10.3791/53837 Published: April 8, 2016

Introduction

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

İmmünohistokimya (IHC) doku içinde proteinin tespit edilmesi için standart bir laboratuar tekniğidir ve IHC hala yaygın olarak araştırma ve teşhis patoloji hem de kullanılır. İHK boyama değerlendirme sonuçlarının yorumlanması içine potansiyel önyargı tanıtan genellikle yarı-kantitatif olduğunu. Birçok yarı nicel yaklaşımlar son tanıya 1-4 içine boyanma yoğunluğu ve boyama ölçüde hem dahil olan geliştirilmiştir. Diğer sistemler daha iyi ifade 5. lokalize etmek için puanlama yoğunluğu ve hücre içi konumunu içerir. Birden fazla izleyiciler ortalama puanları Ortaklığın genellikle tek izleyici önyargı 6 etkilerini en aza indirmek için kullanılmaktadır. Bu çabalara rağmen, analiz öznellik hala 7 boyanma ölçüde değerlendirirken, özellikle kalır. İnsan girişten Protokol standardizasyon ve minimize öznellik doğru, tekrarlanabilir İHK sonuçlar yaratmak için her şeyden önemlidir.

içerik "> dokular içinde protein ifadesini belirlemek için İHK yanı sıra diğer seçenek vardır. Böyle immunoblotting gibi diğer teknikler, protein ifadesini araştırmak için altın standart olarak görülüyor ise araştırma ayarı içinde, immünhistokimya geleneksel, protein lokalizasyonu 8 incelemek için bir araç olarak görülmüştür . belirlenmesi doku veya hücre bölmesi özgü ifade doku slaytlar üzerinde floresan antikor kullanımı makul bir uzlaşma vardır. hücre parçalanması veya lazer yakalama mikrodiseksiyon 9,10 olarak gelişmiş teknikler içeren olmadan zordur, ama nedeniyle NADPH arka plan otofloresansı, lipofuscins, retiküler lifler, kollajen, elastin ve 11 doğru niceleme zorlaştırabilir.

Otomatik hesaplama patoloji platformları patoloji boyaması 12-15 daha objektif kantitatif için umut verici yönü vardır. Doku mikrodizinlerinde ile çok bantlı görüntüleme birleştirenbüyük örnek boyutlarda protein ekspresyonu yüksek verimli analizini kolaylaştırır. Kategorik biçimi 16 yerine, sürekli bir veri dönerken esas içsel hatalar ve analizi için gerekli zamanı hem de azaltarak, bu teknikler ile, protein, eş-lokalizasyonu, boyama heterojenliği ve doku ve hücre içi lokalizasyonu analizi mümkündür. Bu nedenle, bu çalışmanın amacı, çok bantlı görüntüleme yazılımı kullanılarak analiz ile çoklanmış immünohistokimyasal gerçekleştirmek için yararını ve metodolojisini göstermekti.

Bu protokol, dört optimize monoklonal antikorlar ile tek bir doku bölüm slayt kılavuzu, multipleks immünohistokimyasal için yazılmıştır. bir temsili olarak, çekirdek anti-tavşan östrojen reseptörü alfa (ÖRa) ve androjen reseptörü (AR) zara-bağlı anti-fare CD147 ve membrana bağlı anti-fare E-kaderin ile çoklanır. tercih edilen herhangi bir antikorun substitut edilebilirBurada listelenen antikorlar için ed, ancak antikorların her kombinasyonu ayrı optimizasyon gerektirir. Tüm antikorlar için ön işleme tabi tutulması aynı olmalıdır. AR ve CD147 antikorlar, bir kokteyl olarak ayrı ayrı ve optimize edilmelidir. Her antikor, biyotin-bir polimer sistemi ve 4 benzersiz kromojenler biri kullanılarak tespit edilir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Not: protokolü, burada daha önce tarif edilen 12,17,18 boyama ve doku mikrodizisi (TMA) analizini tarif eder. 4 um kalınlığında TMA bölümü, standart bir mikrotom kullanılarak parafin bloğu elde edilmiştir.

NOT: 4 kromojenlerin ve karşıt için spektral kütüphane görüntü kantitatif için oluşturulmalıdır. Bunu yapmak için, her bir antikor için optimize protokol bir slayt başına antikor, eksi son counterstain ile çalıştırılmalıdır. Beşinci slayt spektral kütüphane oluşturmak için gerekli 5 görüntüleri oluşturmak için hematoksilen ile boyanmış olmalıdır.

1. Multiplex İmmunohistokimya

  1. 20 dakika boyunca 60 ° C'lik bir fırında kayar. Bir kimyasal davlumbaz kullanarak,% 100 ksilen slayt batırmayın. ksilen 2 değişiklikler için tekrarlayın. 5 dakika boyunca% 100 etanol içinde slayt bırakın. Taze% 100 etanol ile tekrarlayın.
  2. 3 dakika boyunca% 95 etanol içinde slayt bırakın. Taze tekrarlayın% 95 etanol. 3 dakika boyunca% 70 etanol içinde slayt bırakın. 3 dakika için damıtılmış su içinde slayt bırakın. taze damıtılmış su ile tekrarlayın. Tap slayt dikey slayt suyu tahliye etmek. 5 dakika için hazır kullanım endojen peroksidaz engelleyici 200 ul uygulanır.
  3. slayt peroksidaz engelleyici boşaltın ve (7.0 daha az pH) 45 ml hazır kullanıma alma tampon batırmayın. bir düdüklü tencere koyun slayt konteyner ve başlangıç ​​programı 4 dakika boyunca 124 ° C'ye kadar ayarlayın. düdüklü tencere 20 dakika soğumasını bekleyin. açmadan önce.
  4. alma tampon kabını çıkarın ve ek 10 dakika soğumasını bekleyin. 10 dakika için damıtılmış su içinde slayt durulayın. slayt suyu boşaltın ve dikkatli hidrofobik bir bariyer kalem ile slayt doku tasvir.
  5. Nemli gazlı bez içeren kapak (kuluçka bölme) ile düz bir hazne için fosfat tampon salin (PBS) .Transfer sürgünün 200 ul ekle.
  6. 1x 1 litre hazırlamak 50 m seyreltilerek Tween-20 (TBST) ile tuzlu su Tris tamponlu20x Tris L% 1 Tween-20 ve 950 ml damıtılmış su ihtiva eden tamponlu tuz.
  7. slayt PBS boşaltın ve 1x TBST 200 ul geçerlidir. 2 dakika kuluçkalayın. slayt TBST boşaltın ve kuluçka odasına slayt dönün. Ready-to-üniversal proteini blok yakın odasının 200 ul uygulayın ve 7 dakika boyunca inkübe edin.
  8. Protein bloğu boşaltın ve kuluçka odasına slayt dönün. Anti-ÖRa antikoru 1 seyreltin: 400 antikoru seyreltici 239,4 ul antikor 0.6 ul ekleyerek. slayt seyreltilmiş antikor ve yakın odasının 200 ul uygulayın.
  9. 2 saat için oda sıcaklığında slayt inkübe edin. slayt antikor boşaltın ve TBST içinde 5 dakika için daldırma ile, ardından TBST ile yıkayın.
  10. slayt TBST boşaltın ve kuluçka odasına slayt dönün. Hazır kullanımlı keçi anti-tavşan yaban turpu peroksidaz polimer ve kapalı bölmenin 200 ul uygulanır. 30 dakika boyunca inkübe edin. oda sıcaklığında. 5 dakika boyunca TBST kabın içinde TBST ve yer slayt ile durulayın slayt. </ Li>
  11. 250 ul DAB substrat tamponuna DAB kromojeninin 8 ul ekleyerek ve iyi karıştırılarak kromojen kahverengi yaban turpu peroksidaz-3,3'-diaminobenzidin (HRP-DAB) hazırlayın.
  12. kuluçka odasına slayt, dönüş slayt TBST boşaltın ve 6 dakika süreyle kahverengi HRP-DAB kromojeninin 200 ul geçerlidir. İyice damıtılmış su bir kap içinde damıtılmış su ve yer slayt slayt yıkayın.
  13. ikinci tampon reaktif 150 ul birinci yıkama reaktif 50 ul birleştirerek denatüre çözüm karıştırın. slayt kapalı suyu boşaltın ve 3 dakika boyunca slayt seyreltilmiş denatüre çözümü uygulayın. oda sıcaklığında. Süzün ve TBST ile reaktif denatüre yıkayın. 5 dakika boyunca TBST slayt daldırın.
  14. Anti-AR antikoru 4.2 ul ve antikor seyreltici 203 ul anti-CD147 antikor 2.8 ul seyreltilmesi ile AR / CD147 antikor kokteyli hazırlanır. , Slayt TBST boşaltın kuluçka odasına slayt dönmek ve AR / CD147 c 200 ul uygulamakslayta ocktail. Yakın odası ve oda sıcaklığında 1 saat boyunca inkübe edilir. 5 dakika boyunca TBST içinde durulayın TBST ile slayt ve batırmayın.
  15. TBST, kuluçka odasına geri dönüş slayt boşaltın ve hazır-to-use keçi anti-tavşan alkalin fosfataz polimerin 200 ul geçerlidir. Yakın odası ve 30 dakika inkübe slayt. oda sıcaklığında. 5 dakika boyunca TBST içinde durulayın TBST ile slayt ve batırmayın.
  16. 250 ul kırmızı kromojen tampon kırmızı kromojeninin 3.2 ul ekleyerek kromojen kırmızı alkalin fosfataz hazırlayın ve iyice karıştırın.
  17. slayt TBST boşaltın ve kuluçka odasına slayt dönün. Slayt yakın bölmeye seyreltildi kırmızı alkalin fosfataz kromojen 200 ul uygulayın ve 7 dakika boyunca inkübe edin.
  18. kromojen boşaltın ve iyice distile su ile slayt durulayın. 5 dakika için damıtılmış su içinde, bir kap içinde slayt yerleştirin. , Slayt suyu boşaltın TBST ile yıkayın ve kuluçka odasına geri dönün. slayt ve Clos'a 200 ul keçi anti-fare-HRP polimer uygulanırE odası. 30 dakika boyunca inkübe edin. oda sıcaklığında.
  19. slayt polimeri boşaltın ve TBST ile yıkayın. 5 dakika boyunca TBST Place slayt. tampon 250 ul stabilize edici reaktif 3.2 ul ekleyerek mor HRP-bağlı kromojen 200 ul hazırlayın ve iyice karıştırın. mor kromojeninin 3.2 ul ekleyin ve sonra, iyi hidrojen peroksit reaktif 3.2 ul karıştırın ve iyice karıştırın.
  20. slayt TBST boşaltın ve slayt ve 7 dakika inkübe hazırlanan mor kromojeninin 200 ul geçerlidir. oda sıcaklığında. 5 dakika boyunca distile su bir kap içinde saf su ve yer kaydırağı ile durulayın slayt.
  21. ikinci tampon reaktif 150 ul birinci yıkama reaktif 50 ul karıştırılarak denatüre çözüm karıştırın. slayt kapalı suyu boşaltın ve 3 dakika boyunca slayt seyreltilmiş denatüre çözümü uygulayın. oda sıcaklığında.
  22. TBST ile ayıraç kapalı denatüre durulayın. 5 dakika süreyle TBST içinde kapta slayt yerleştirin. Anti-e-kaderin antikor sulandırmakAntikor seyreltici ul 218.9 1.1 ul antikor eklenerek 200: 1. kuluçka odasına slayt, dönüş slayt TBST boşaltın ve slayt E-kaderin 200 ul geçerlidir. Yakın odası ve 30 dakika kuluçkalayın. oda sıcaklığında.
  23. 5 dakika boyunca TBST kabın içinde TBST ve yer slayt ile durulayın slayt. kuluçka odasına slayt dönmek, slayt TBST boşaltın ve 200 ul keçi anti-fare HRP polimer uygulayın. 30 dakika için oda sıcaklığında inkübe edilir. 5 dakika boyunca TBST kabın içinde TBST ve yer slayt ile durulayın slayt.
  24. Siyah 250 ul tampon kromojeninin 8 ul ekleyerek kromojen HRP-bağlantılı hazırlayın. slayt ve 2 dakika için geliştirmek kromojen 200 ul uygulanır. Damıtılmış su ile iyice yıkayın ve bir slayt damıtılmış su konteyner içinde bırakın.
  25. distile su 200 ul 40 ul hematoksilin ekleyerek hematoksilin sulandırmak. slayt suyu boşaltın ve 30 saniye boyunca slayt seyreltilmiş hematoksilen 200 ul geçerlidir. durulama slaytİyice 2 dakika için akan musluk suyu., daha sonra, 30 saniye için damıtılmış su içinde durulanır. 15-30 dakika süreyle, 60 ° C fırına yerleştirilmiştir kayar.
  26. 30 saniye taze hazırlanmış% 100 ksilen slayt daldırın aşırı ksilen silin ve kalıcı montaj medya bir damla ekleyin. Bir numaralı 1.5 lamel ile lamel.

2. Otomatik Görüntü Alma ve Analiz

  1. otomatik slayt tarayıcı üzerine lekeli slaytlar yükleyin. TTB çekirdek çapı, ayrılık ve sayısına bağlı, üreticinin kılavuzuna göre otomatik tarama protokolü oluşturun.
  2. Açık multispektral görüntüleme yazılımı bireysel kromojenlerin ve hematoksilen lekeli slayt ile boyanmış kontrol slaytlar bir spektral kütüphane kurmaya. Bir kontrol slayt alınan bir görüntü küpü açın ve optik o kromojen tanımlamak için dört beş olumlu boyanan alanları seçin. Tam bir spektral kütüphane representi kadar diğer kontrol slaytlar görüntü küpleri ile tekrarlayınTüm kromojenleri ng oluşturulan ve daha sonra spektral kütüphane tasarruf edilir.
  3. multispektral görüntüleme yazılımı içinde yeni bir projeye başlamak. Seç "Multispektral (.im3)" örnek biçimi için görüntü formatı seçeneği ve "Aydınlık" için. "Skor", "fenotiplendirme" "Özellikler Find", "Segment Dokusu" ve "İhracat": Birincisi, istenen seçenekleri seçerek projeyi yapılandırın. Bu noktada, resim çözünürlüğü istenirse analiz süresini hızlandırmak için değiştirilebilir.

3. Doku Segmentasyon

  1. Önceden oluşturulan spektral kütüphane İthalat ve analize dahil edilecek tüm kromojenleri seçin.
  2. Açık görüntü küpleri "Görüntü Aç Cube" seçeneğini seçerek belirlenen eğitim verilerine dahil edilecek. Eğitim doğruluğunu sağlamak için, görüntülerin toplam sayısının en az% 18 oranında seçmek analiz edilecek. segmentasyon doğruluğunu artırmak için tüm hastalık durumlarını temsil görüntüleri seçin. Görüntülerin bu kısmı is görüntülerinin eğitim seti çağırdı.
  3. göz damlası aracı seçerek ve beyaz bir görüntüdeki bir alanı seçerek belirlenen eğitim beyaz dengesi görüntüler.
  4. Doku segmentasyonu geçmek için "Advance" düğmesini seçin. Doku tiplerini seçmek için "Doku Kategoriler" paneli kullanın (yani "doku" ve "non-doku") analiz edilecek. Daha doğru bir protein doku lokalizasyonu için, birden fazla doku kategoriler (yani. "Epitel", "stroma" ve "non-doku") kullanılabilir.
  5. algoritması oluşturma ve eğitim görüntülerin içindeki hücrelerin grupları etrafında çizerek doku kategorilerini tanımlayan başlayın. bir doku kategorisinde bittiğinde, diğer doku kategorileri için tekrarlayın. Bu doku kategorisi Çeşidi karakteristik görüntülerin içindeki hücrelerin gruplarını seçmek için emin olun.
  6. görüntülerinin eğitim seti içindeki tüm görüntüler için bu işlemi tekrarlayın.
  7. Seçin parçaları (kromojenleri) trai dahil edilecek"Doku segmenter" için ning. aydınlık immünohistokimya görüntü analizi yaparken, tüm bileşenler, normal olarak eğitim dahildir. Bu aşama sırasında önyargı önlemek için ayarlanmış eğitim bol negatif boyama görüntüleri içerir.
  8. Doku segmentleştiriciyi eğitimi için uygun bir "Desen Ölçeği" seçiniz. 20X büyütme altında, bir büyük model ölçeği genellikle uygundur. yüksek büyütme altında ince bir mimariye sahip dokular ile çalışırken, daha küçük bir model ölçeği daha uygundur.
  9. Doku segmentleştiriciyi eğitim başlatmak için "Tren Doku segmenter" düğmesini seçin. Düzgün sınıflandırılır eğitim bölgeleri içindeki piksellerin oranını yansıtan bir pop-up kutusu görüntüleyen doğruluğunu gözlemleyin.
    NOT: Yazılım sürekli elle durdurulana kadar algoritmanın doğruluğunu geliştirmek için çalışır. Biz daha önce% 97 eğitim doğruluk 12 görüntüler sonuçların% 18 o eğitimi göstermiştir. Doku segmenter eğitimli sonra, uygun bir segment çözünürlüğü seçin. Segment çözünürlüğü daha az zaman ve para cezası çözünürlük daha fazla zaman gerektiren gerektiren kaba çözünürlükte segment görüntüleri için gerekli süreye karşılık gelir.
  10. Segment "Segment Görüntüleri" tıklayarak görüntülerin tüm eğitim seti. Yazılım yeterli zaman tüm eğitim görüntüleri algoritması uygulamak için izin verir. Bittiğinde, mevcut eğitim algoritması ile herhangi Yanlış sınıflandırılmış doku bulmak için ayarlanmış eğitim gözden geçirin.
  11. ince ayar yapmak için doku segmentasyon işlemi, eklemek, düzenlemek veya doku eğitim bölgeleri kaldırın. piksel başka bir bir doku kategorisinde kenarlarında uzatmak durumunda "süs kenarları" seçeneğini kullanın. piksel küçük gruplar Sınıflandırılmamış ise, asgari bölüm boyutu eşiği ayarlayın.
  12. düzenlemeler, seçme "Segment Görüntüler" tamamlandığında, bu doku segmentasyonu için yeni bir algoritma oluşturmak için doku segmentleştiriciyi yeniden eğitecek. Bir önceki algoritmaotomatik olarak kaydedilir ve gerekirse iade edilebilir.
  13. Ne zaman emin doku segmentasyon algoritması sonuçları, "Advance" düğmesini seçerek hücre segmentasyon ilerlemek.

4. Hücre Segmentasyon

  1. Seç hücre içi bölmeleri hücre segmentasyon dahil edilecek. "Çekirdekler" zaten "Sitoplazma" ya da "Membran" seçmek için seçili olduğundan emin olun.
    Not: bir zar-özgü protein işaret, E-kadherin gibi IHC dahil edildiğinde "Membran" segmentasyon yalnızca seçilmelidir.
  2. "Çekirdekler" sekmesine içinde, çeşitli seçenekler vardır. Nükleer segmentasyon için uygun ayarları seçerek başlayın (adım 4.3). bireysel ya da tüm doku kategorileri segmentasyon dahil edilecektir seçin.
  3. Nükleer segmentasyon için bir yaklaşım seçin
    1. İyi elde edilmesi için basit bir yöntem için counterstain "piksel-esaslı (eşik)" yaklaşımı seçmekgörüntü işleme ayarları hakkında çok bilmeden sonuçları.
      NOT: Bu genellikle iyi bir ilk seçim yapar. bir yaklaşım, "Pixel Tabanlı (Eşik)" seçerken, güvenilir bir nükleer karşı-leke olduğunda tutarlı nükleer karşıt eksikliği varsa "Tabanlı Object" kullanılması gerektiğini ise, daha uygundur.
    2. güvenilir bir nükleer counterstain olduğunda "Pixel Tabanlı (Eşik)" yaklaşımı seçin.
      NOT: Bu yaklaşım tamamen piksel tabanlı olduğunu. Bu yaklaşım, aynı zamanda, bir IHC leke pozitif leke doku kategori içindeki bütün pikseller tespit gibi basit bir eşik değeri ile memnun diğer görüntü analiz ihtiyaçları için kullanılabilir.
    3. Nükleer counterstain nükleer nesnelerin tutarlı ve özel boyama sağlamaması halinde Nesne Tabanlı yaklaşım seçin ve daha gelişmiş morfometri-temelli yaklaşımlar çekirdekleri tespit etmek için ihtiyaç vardır.
    4. "Nucl" Nükleer segmentasyonu için Bileşenleri "seçinKulak Boyut "ve" Temizlik-up "kullanıcı daha çekirdekler segmentasyon ayarlarını tanımlamak istiyorsa.
  4. sitoplazma şekil parametreleri seçin
    1. sitoplazma segmentasyon geçmek için "Advance" düğmesini seçin.
      NOT: Seçim için sitoplazma segmentasyon içinde çeşitli seçenekler vardır. "Çekirdeğe iç mesafe" olarak adlandırılan bir seçenek piksel tabanlı. Bu çekirdeğin dış ve sitoplazma içi arasındaki mesafe yansıtır. Bu değeri artırmak nükleer sinyal sitoplazma bölmeye üzerine çarpılar olasılığını azaltır.
    2. Sonraki seçeneğini, "dış mesafe çekirdeğine".
      Not: Bu aynı zamanda, piksel tabanlı. çekirdeğin dış mesafeden çekirdeğinin dış ve hücre dışı arasındaki mesafe yansıtır. Bu değeri ya da istenirse membran sinyallerini hariç tutmak için büyük veya küçük yeterli ayarlanabilir.
    3. Sonraki seçeneğini "minimum boyutu".
      NOT: Minimum boyut, PIXEtemelli l analize dahil edilecek asgari sitoplazma örneklem büyüklüğü yansıtır. sitoplazma boyutu tür hücreler sıkı birlikte paketlenmiştir olduğu gibi belirli bir hücrede küçükse, bu sitoplazma segmentasyon analize dahil edilmiştir.
    4. Bir sonraki seçenek, "İlköğretim", "İkincil" ile "Bileşeni" seçin ve ikincil seçenekleri olarak "üçüncül" seçeneğini seçin.
      NOT: Burada biri belirli bir sitoplazma işaretleyici seçebilirsiniz. Belirli bir sitoplazmik IHC markör kullanılmış ise nükleer segmentasyon benzer bir şekilde, bu bileşen, bir asgari eşik değerini bularak sitoplazma tanımlamak için kullanılabilir. Bu sitoplazma tanımlanmasında yardımcı ama kabul edilebilir doğruluk için gerekli değildir.
    5. Üç sekmeli seçeneklerin son taşıma "Membran" dir. Burada kullanıcı bir protein işaretleyici ile membran yuvasını tanımlar. , "Primary" Seç "İkincil" ve / veya kullanılan her zar özel bir belirteç için "Tersiyer". Ayarlayın "Tam Ölçekli OD "asgari eşik veya hücre zarlarının her işaretleyici için olumlu bulmak için.
    6. "Membran" sekmesi altında devam eden ve seçeneği "Maksimum Hücre Boyutu" seçeneğini seçin.
      NOT: Bu hücrelerin en büyük boyutunu belirtir piksel membran değerine mesafe vardır. 12 değeri 20X büyütmede çekilen görüntüler için normalde uygundur.
    7. tüm seçenekleri seçtikten sonra, "Segment Image" veya "Segment All" seçeneğini seçin. Görüntülere ayarları uygula ve "bireysel" ya da "Galeri" modunda onları gözlemlemek.
      NOT: Gerekirse ayarları ve eşikleri ayarlayın ve görüntülerinin eğitim seti hücre segmentasyon sonuçlarından memnun kadar yeniden segmenti.

Hücrelerin 5. fenotipleme

Not: Doğru hücre parçalara ayırma, doğru hücre fenotiplendirilmesini elde edilmesi için gerekli olan ve fenotipleme özelliği öğretilebilir mesafesindedir.

  1. Kullan "Ekle &# 34; düğmesi "Fenotipleri" listesine fenotipleri ekleyin. Kullanıcılar fenotip için bir renk seçebilirsiniz.
  2. Bir hücreye bir fenotip atamak için "Düzenle fenotipleri" üzerine tıklayın. fenotip belirledikten sonra taşımak için kullanıcı sağlayan bir açılır menü getirmek için belirli bir hücreyi tıklayın. devam etmek için, her bir fenotipi en az beş (5) hücreleri tanımlamak. Her bir fenotip 25 ya da daha fazla hücre seçimi en iyi sonuçları elde etmek için gereklidir.

6. Puanlama İHK ve Co-Yerelleştirme

  1. Adım "Skor İHK veya IF" geçmek için "Advance" i seçin. gol "Doku Kategori" seçiniz.
    NOT: Sadece bir doku kategori, belirli bir analiz sırasında atılır, ancak başka bir doku kategorisinde skorlama sonuçları isteniyorsa, analiz daha sonra farklı ayarlarla tekrar edilebilir.
  2. istenen "Puanlama" türünü seçin.
    NOT: Pozitiflik ilgi bileşeni için (olumlu ve olumsuz) iki depo oluştururÇift pozitifliği co-lokalizasyon analizi için kullanıldı ise. Diğer seçenekler 4-bin, 10 bin ve 50 bin seçim marker için analiz içerir.
  3. analizi puanlama kullanılacak hücrenin "Bölme" seçiniz.
  4. Primer nükleer bileşen için asgari eşik bulma benzer şekilde, "Görünümü Bileşen Verileri" seçin ve ilgi bileşen (ler) için pozitif hücreler için boyama uygun optik yoğunluk minimum eşikleri bulmak için eğitim görüntüleri üzerine imleci.
  5. yoğun lekeli hücrelerin hariç tutulacak ise, uygun bir seviyeye eşik max indirin. Aksi takdirde, analiz için bir eşik maksimum seçmek için otomatik düğmesini kullanın.
  6. eşikleme değerlerini doğrulamak için puan görüntüleri eğitim seçin.
    NOT: Belirli bir çöp kutusu içinde hücrelerin yüzdesi iade edilecektir ve görsel denetim veya manuel sayımı ile mukayese edilebilir. Tamamlandığında, "İhracat" aşamasına geçmek için "Advance" i seçin.
<p class = "jove_title"> 7. Algoritma ve Toplu Analizi uygulamak

  1. Eğitim kümesi için veri ihraç ederek doku segmentasyonu, hücre segmentasyonu ve puanlama değerleri yoluyla oluşturulan algoritma test edin. ihracat dizini için yeni bir klasör oluşturmak için yönergeleri izleyin. Seç resimler ve tablolar oluşturulmuş ve analize dahil edilecek. "Herkes için Export" seçerek analiz gerçekleştirin.
  2. Tablolar sekmesi ayrılmış metin dosyaları ihraç edilmektedir ve çoğu veri analiz programları açılabilir.
  3. Analiz tamamlandığında, ayarların doğruluğunu değerlendirmek için yüksek ve düşük lekelenme hem görüntüler için hücre parçalama ve puanlama verilerini görüntülemek.
  4. ayarlarla memnun olduğunuzda, toplu analizi yoluyla görüntüleri tüm dizi görüntülerinin eğitim setinden oluşturulan algoritma uygulanır. "Toplu Analizi" sekmesine tıklayın ve açılan algoritmanın etkin bir projeden kopyalanmış olacaktır.
  5. Yeni ihracat dizini seçin ve hangi görüntü ve tabl seçines analize dahil edilecektir. girdi dosyaları seçeneği altında, seçme "Resim Ekle" ve tüm görüntüleri toplu analize dahil edilecek seçin.
  6. "Çalıştır" seçeneğini seçerek analiz gerçekleştirin. Eğitim setinin analizi ile olduğu gibi, bu adımı belirli ayarları ve analize dahil görüntülerin sayısına bağlı olarak, bir zaman değişken miktarda gerektirir.
  7. Tamamlandığında, "Değerlendirme / Merge" sekmesine ilerlemek. istenirse toplu analizi ihracat dizin ve toplu dizin varsayılan değiştirilebilir. Seç "Tüm Dahil" ve analiz için özet verileri ile veri sayfaları oluşturmak için "Birleştirme" seçeneğini seçin.

İhraç Verilerin 8. Analiz

  1. veri analizi yazılımı ihraç tabloları açın ve kaldırmak veya bu tür her bir bileşen için minimum ve maksimum değerler olarak analiz alakasız veri sütunları gizlemek. Analizlerde kullanılan birincil veri ortalama optik yoğunluk C olanHer bir bileşen için olumn.
  2. İnceleme ihraç segmentasyon Haritaları ve ham görüntüleri analiz dışında edilecek olan numune veya TMA çekirdekleri belirlemek için. Doku yüzde değerleri dışlama kriterleri için en sık kullanılan <% 5 keyfi bir kesme ile, bir örnek dahil edilmelidir belirlerken ya da yardımcı olur.
  3. alakasız veri veya örnekleri içeren satırlar veri analiz dışında olması çıkarın.
  4. Hastalık durumunda değişiklik ya da hastalık 12,18-21 bir klinik-patolojik özellikleri ile ilişkisini araştırmak protein ölçümü verileri kullanın.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Şekil 1 'de, bir eğitim olmayan doku bölümünde birlikte, stromal ve epitelyal kısımlarına kademeli görüntüleri prostat dokuları üzerinde gerçekleştirilir. Epitelyal membran markör E-kadherin kullanarak, hücre parçalara ayırma, Şekil 2'de gösterilen çekirdek, sitoplazma ve membran kısımları, ayrı yapıldı.

Bir deneyde, Şekil 3'te gösterildiği gibi, AR ve ÖRa, E-kadherin ve CD147 ekspresyonunu ve sınırlandırılmasını araştırmak için birden fazla mesaj göndermiş IHC kullanılır. Bu teknikler kullanılarak, ÖRa ve her iki nükleer ekspresyonu için pozitif hücrelerin tespit edebilmek AR (Şekil 3B - 3C) Şekil 3A yeşil oklarla gösterildiği gibi, kolorimetrik sinyaller örtüşen rağmen. Biz pr farklı devletler içinde çift pozitif stromal hücrelerin oranında belirgin farklar bulunduostate hastalığı (Şekil 3D). Biz bir işaretleyici protein (Şekil 3A kırmızı oklar) olarak E-kaderin kullanarak CD147 hücre zarı spesifik ifadesini sayısal ve biz prostat dokularında membran özel CD147 ifadesini araştırmak için ilk grup oldu. Biz prostat kanseri ilerlemesi (Şekil 3E) ile birlikte CD147 ekspresyonu anlamlı azalma bulundu ve ameliyat sonrası prognozu 19 ile önemli bir ilişki bulunmuştur.

yoksul deney tasarımı yanlış doku segmentasyonu yol açabilir örnekleri vardır. Şekil 4'te, algoritma dokuların bir dizi tatbik yoktu doğru kademeli bir stromal ve epitelyal bölmeleri (Şekil 4C). Bu deneyde, α-düz kas aktini (α-SMA) stromal bölmesi işaretlemek için kullanılmıştır. Α-SMA ve düz kas Figu (bazı tümörlerde azaldığı ya da kayıp olduğundan) 4A yeniden doku segmentasyonu (Şekil 4B) ile oluşturulan algoritma doğru tek başına morfometrik verilerin epitelyal ve stromal bölmeleri ayırt edemedi. doku ya da hücre bölmelerine protein işaretleri seçerken dikkatli olunmalıdır.

Şekil 1
Şekil 1: Multispektral Görüntüleme Yazılımı Kullanma Doku Segmentasyon. Bir prostat dokusu mikrodizisi androjen reseptörü (AR), östrojen reseptörü-alfa (ÖRa), E-kadherin ve CD147 için birden fazla mesaj immünohistokimya kullanılarak boyandı. Eğitim görüntüleri bir dizi doku tiplerini ve görüntülerin tamamı seti (A) hastalık durumları temsil eden çok bantlı görüntüleme yazılımı ithal edildi. Doku kategorileri stroma (yeşil), epitel (kırmızı) ve non-doku (mavi) olmak üzere oluşturulan ve kategoriler el üstünde çizerek tanımlananeğitim görüntüleri (B). Eğitim görüntülerde çizdikten sonra doku segmentasyonu için bir algoritma oluşturulmuş ve görüntüleri (C) eğitim seti uygulanır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

şekil 2
Şekil 2: Nükleer, Sitoplazmik ve Membran Bölmeler içine Hücre Segmentasyon. Nükleer bölme hematoksilen counterstaining (A) için asgari eşik belirleyerek hücre segmentasyonu için tanımlanmıştır. Sitoplazma yazılımı (B) içinde önceden ayarlanmış algoritmaları kullanarak çekirdeğine göre tanımlandı. E-kadherin bir membran belirteci olarak kullanıldı ve en az OD eşik membran yuvasını (C) belirlenmesi için kullanılmıştır anlamına gelir. Bu teknik, tümTüm hücre içi bölmeleri (D) protein ifade eşzamanlı kantitatif akımları. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 3,
Şekil 3: eş-lokalizasyonu ve Zar-özgü protein ekspresyonunun analizi. Çoklanmış IHC androjen reseptörü (AR), östrojen reseptörü-alfa (ÖRa), E-kadherin ve CD147 (A) ekspresyonu ve lokalizasyon araştırmak için kullanıldı. DAB (kahverengi kromojen) Ar, (B) ve ÖRa (C) işaretlemek için kullanılan kırmızı bir kromojen işaretlemek için kullanılmıştır. Biz ÖRa ve AR nükleer işbirliği yerleşimli hücrelerin oranını (A yeşil oklar) uzamsal örtüşen Biyobelirteçleri tanımlamak ve (D) ölçmek için başardıkProstat stroma içinde. Plazma membranı (A kırmızı oklar) tanımlamak için E-kadherin (siyah kromojen) kullanarak, prostat dokuları (E) 19 olan CD147 membran özgü ifade ölçülmüştür. Varyans analizi (ANOVA) istatistiksel analiz için kullanıldı tek yönlü, hata çubukları ortalamanın standart hatasını yansıtır ve yıldızlarla p <0.05 temsil etmektedir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 4,
Şekil 4: Deney Tasarımı Kaynaklanan Yetersiz Doku Segmentasyon. Androjen reseptörü (kırmızı kromojen) ve androjen reseptörü varyantı 7 (DAB kromojen) iyi ve kötü huylu prostat dokuları α-düz kas aktin (yeşil kromojen α-SMA) için boyandı. a-SMA olarak kullanılmıştırBir stroma markör ve prostat (A) dahil olmak üzere, bazı tümörlerde azaltılır. Eğitim yapıldı (B) ve doku bölütleme algoritması uygulandığında, stromal ve epitelyal bölmeleri nedeniyle α-SMA boyama (C) yokluğu yetersiz parçalı idi. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Protein ifade değerlendirmek için geleneksel immunohistokimyasal kullanımı analizi 22,23 öznel, yarı nicel yöntemler ile sınırlıdır. Peşin platformları biyobelirtecin ifade ve lokalizasyon yüksek verimlilik analizi için yaratılmıştır. doku ve hücre içi bölmeleri hem Detaylı segmentasyon kullanıcıları diğer ilgi işaretleri ile biyobelirteç ifade, yerelleştirme ve ko-lokalizasyon çalışma sağlar. Daha önceki çalışmalarda, aynı hücresel bölme 18,20,21 lokalize proteinler incelemek için kullanılan, özellikle İHK ve multispektral görüntüleme, yararını göstermiştir. Doku mikrodizileri 24 ile birleştirildiği zaman, bu tekniklerin bir patolog tarafından el analizi tarafından izin verilenden daha protein ekspresyonu, daha hızlı ve daha objektif miktar tayini için izin verir.

Protein tayininde için immünhistokimya kullanımı ile bir sorunu nedeniyle subjec sonuçların irreproducibility olduğunuanaliz ve teknik ve reaktifler doğasında farklılıklar tive doğası. Protein ifadesini ölçmek için çok bantlı görüntüleme gibi platformlar kullanılmasının önemli bir avantajı, sonuçların tekrar üretilebilirliği olan. 12,16,25 boyutları sürekli biçimde veri dönen ve büyük ölçüde özellikle büyük numune ile çalışırken, çalışma süresini azaltırken bilgisayarlı patoloji platformlardan veri bir patolog tarafından manuel analizi ile son derece ilişkilidir. Çalışmalar değişik bantlı platformlar 14 arası sonuçlarında yüksek genel uyumunu göstermektedir. Ayrıca, daha önce proteinleri sayısı 12 incelenmiştir olarak değişkenlik olsa bile boyama sonuçları yüksek oranda tekrarlanabilir olduğunu göstermiştir. boyama ve analiz hem de otomatik patoloji platformları kullanımı, farklı epitoplarına karşı oluşturulan antikorların kaynaklanan gibi sonuçlar, tüm tutarsızlıkları ortadan kaldırmaz, ancak bu platformlar önyargı ve ir azaltmak önemli ölçüde yoktekrarlanabilirlik yaygın immünhistokimya ile ilişkili.

Doğru, tekrarlanabilir sonuçlar döndürmek için gerekli olan protokol çerçevesinde belirli adımlar vardır. doku ya da hücre içi belirteçler doğru segmentasyon için önemli olduğu gibi proteinlerin seleksiyon yoluyla uygun deneysel tasarım dahil edilecek. pozitifliği analizi yaparken, pozitif boyama için bir alt eşiğin seçimi kesin sonuçlar üzerinde büyük bir etkiye sahiptir. için bir eşik seçerken nükleer transkripsiyon faktörleri gibi proteinlerin "açık / kapalı" daha heterojen ifade proteinler için bir eşik zordur bulma, oldukça basittir. Bu ideal bir kurul sertifikalı genitoüriner patolog veya analizi için ideal eşiği bulmak için birden fazla gözlemci arasında bir ortalama puan olarak işbirliği içinde yapılmalıdır.

Teknolojinin güncel sürümleri bazı sınırlamaları tanımak önemlidir. de zamansitoplazma bölmesi durultma, üç yaklaşım kullanılabilir: (1) (2) bir zar özel markör ile boyama, bir sitoplazma özgü işaretleyici ile boyanıp çekirdeği arası zar sitoplazma marker mesafe ile ve (3) ile bir çizim yaklaşımı elle çekirdeğe ilişkin sitoplazmanın sınırlarını tanımlamak için kullanılır. Bizim deneyim, bir zar özgü kalem kullanarak en doğru yöntemdir. çekirdek merkezi bir konumda yer ise veya ilgi biyobelirteç eşit sitoplazma boyunca dağıtılan eğer elle çizim yaklaşımı normalde doğrudur. Doğru fibroblastlar ve düz kas hücreleri gibi stromal hücrelerin sitoplazması oluşturan zor olması ve bir deney tasarımı dikkate alınmalıdır.

Teknolojinin başka sınırlama hücre segmentasyonu çekirdekleri üzerine bağımlılığıdır. bölümün düzlemi belirli bir hücre çekirdeği hariç, bu hücre analizi dahil edilmez. yok iseBitişik çekirdeklerin veya çekirdeklerin kümeleri arasındaki görünür sitoplazma, bunlar genellikle oldukça farklı çekirdeklerin daha büyük bir nükleer yumru olarak kabul edilmektedir. Genel olarak konuşursak, hematoksilen counterstain nükleer segmentasyon en sorunları çözebilirsiniz nukleus boyutunda maksimum eşik olarak kabul edilebilir nükleer segmentasyon ve yazılım ayarları manipülasyonu için normalde yeterlidir.

Otomatik patoloji platformları son bir sınırlama fakir deneysel tasarım kaynaklanan dokuların güvenilmez segmentasyon olduğunu. ilgi soruya cevap için uygun doku ve hücre biyobelirteçlerini seçiminin önemi göz ardı edilemez. Bizim temsilcisi sonuçları gösterildiği gibi doku segmentasyonu için bir algoritma oluştururken, önemli ölçüde hastalık durumları arasındaki ifadesini değiştiren bir epitel ve stroma işaretleyici sorunları yaratabilir. Bu zor bu ortaya gibi analizler zaman alternatif seçenek vardır fazlalaştı. Örneğin, tek tek IMAGES yerine el görüntülerin bir eğitim seti bir algoritma uygulanarak daha tüm doku bölmeleri çizim ile analiz edilebilir. Bu mükemmel kullanıcı istediği şeylere uygun olduğunu segmentasyon avantajı sağlar, ama aynı zamanda öznelliği tanıtır ve anlamlı bir analiz tamamlamak için gereken süreyi artırabilir. Uygun deneysel tasarım analizi hızlandırmak ve doku ve hücre bölümleme doğruluğunu en üst düzeye çıkarmak için en kolay yoludur.

Bu teknoloji ve protokol birçok gelecekte uygulamaları var. Belirli hastalık durumları için çok sayıda biyolojik göstergeler tespit ancak doğrulanmamıştır edilmiştir. bantlı platformlarla yüksek verim objektif bir analiz bu biyomarkerların doğrulama kolaylaştırır. Dahası, ifade ve çoklu proteinlerin ortak lokalizasyon değerlendirilmesi kötü anlaşılmış sinyal yolları içgörü sağlayabilir. Kuşkusuz, immünohistokimyasal staini analizi ile ilişkili içsel öznelliği azaltılmasıng protein belirteçleri geniş ekspresyonunu ve sınırlandırılmasını anlamak için değerlidir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Yazarlar hiçbir rakip mali çıkarları olduğunu beyan ederim.

Acknowledgments

Yazarlar kendi imkanları ve hizmetlerin kullanımı için, Patoloji ve Laboratuar Tıp UW Bakanlığı tarafından desteklenen bir parçası ve UWCCC hibe P30 CA014520 olarak, Patoloji laboratuvarında Wisconsin çeviriyle ilgili araştırma Girişimleri Üniversitesi teşekkür ederim.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Xylene Fisher Chemical X3F1GAL NFPA rating: Health – 2, Fire – 3 , Reactivity – 0
Ethyl Alcohol-200 proof Fisher Scientific 4355223 NFPA rating: Health – 0, Fire – 3 , Reactivity – 0
Tris Base Fisher Scientific BP152-500 NFPA rating: Health – 2, Fire – 0 , Reactivity – 0
Tris Hydroxymethyl aminomethane HCl Fisher Scientific BP153-1 NFPA rating: Health – 2, Fire – 0 , Reactivity – 0
Tween 20 Chem-Impex 1512 NFPA rating: Health – 0, Fire – 1 , Reactivity – 0
Phosphate-buffered saline Fisher Scientific BP2944-100 NFPA rating: Health – 1, Fire – 0 , Reactivity – 0
Peroxidazed Biocare Medical PX968 Avoid contact with skin and eyes. May cause skin irritation and eye damage.
Estrogen Receptor alpha Thermo Fisher Scientific-Labvision RM9101 Not classified as hazardous
Androgen Receptor SCBT sc-816 Not classified as hazardous
CD147 Biodesign P87535M Not classified as hazardous
E-cadherin Dako M3612 Not classified as hazardous
Renoir Red Andibody Diluent Biocare Medical PD904 It is specially designed to work with Tris-based antibodies
DeCloaking Chamber  Biocare Medical Model DC2002 Take normal precautions for using a pressure cooker
Barrier pen-Immuno Edge  Vector Labs H-4000
Denaturing Kit-Elution step Biocare Medical DNS001H Not classified as hazardous
Mach 2 Goat anti-Rabbit HRP Polymer Biocare Medical RHRP520 Not classified as hazardous
Mach 2 Goat anti-Rabbit AP Polymer Biocare Medical RALP525 Not classified as hazardous
Mach 2 Goat anti-Mouse HRP Polymer Biocare Medical M3M530 Not classified as hazardous
Betazoid DAB Chromogen Kit Biocare Medical BDB2004 1. DAB is known to be a suspected carcinogen.
2. Do not expose DAB components to strong light or direct sunlight.
3. Wear appropriate personal protective equipment and clothing.
4. DAB may cause sensitization of skin. Avoid contact with skin and eyes.
5. Observe all federal, state and local environmental regarding disposal
Warp Red Chromogen Kit Biocare Medical WR806 Corrosive. Acid that may cause skin irritation or eye damage. 
Vina Green Chromogen Kit Biocare Medical BRR807 Harmful if swallowed
Bajoran Purple Chromogen Kit Biocare Medical BJP807 Flammable liquid. Keep away from heat, flames and sparks. Harmful by ingestion or absorption. Avoid contact with skin or eyes, and avoid inhalation.
Cat Hematoxylin Biocare Medical CATHE Purple  solution  with  a  mild  acetic  acid  (vinegar)  scent.  May  be
 irritating  to  skin  or  eyes.  Avoid  contact  with  skin  and  eyes.  Avoid  ingestion.
XYL Mounting Media Richard Allen 8312-4 NFPA rating: Health – 2, Fire – 3 , Reactivity – 0
1.5 Coverslips Fisher Brand 22266858 Sharp edges
Incubation (Humidity)Chamber obsolete obsolete Multiple vendors available
Convection Oven Stabil- Therm C-4008-Q
Background Punisher Blocking Reagent Biocare Medical BP974 This product is not classified as hazardous. 
inForm software PerkinElmer CLS135781 Primary multispectral imaging software used in manuscript
Nuance software PerkinElmer Nuance EX Software used for making spectral libraries within manuscript
Vectra microscope and slide scanner PerkinElmer VECTRA Automated slide scanner and microscope for obtaining IM3 image cubes

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Valdman, A., et al. Expression of redox pathway enzymes in human prostatic tissue. Anal Quant Cytol Histol. 31, (6), 367-374 (2009).
  2. Rimm, D. L., Camp, R. L., Charette, L. A., Olsen, D. A., Provost, E. Amplification of tissue by construction of tissue microarrays. Exp Mol Pathol. 70, (3), 255-264 (2001).
  3. Jonmarker, S., et al. Expression of PDX-1 in prostate cancer, prostatic intraepithelial neoplasia and benign prostatic tissue. APMIS. 116, (6), 491-498 (2008).
  4. McCarty, K. S., Miller, L. S., Cox, E. B., Konrath, J., McCarty, K. S. Sr Estrogen receptor analyses. Correlation of biochemical and immunohistochemical methods using monoclonal antireceptor antibodies. Arch Pathol Lab Med. 109, (8), 716-721 (1985).
  5. Volante, M., et al. Somatostatin receptor type 2A immunohistochemistry in neuroendocrine tumors: a proposal of scoring system correlated with somatostatin receptor scintigraphy. Mod Pathol. 20, (11), 1172-1182 (2007).
  6. Muris, J. J., et al. Immunohistochemical profiling of caspase signaling pathways predicts clinical response to chemotherapy in primary nodal diffuse large B-cell lymphomas. Blood. 105, (7), 2916-2923 (2005).
  7. Jaraj, S. J., et al. Intra- and interobserver reproducibility of interpretation of immunohistochemical stains of prostate cancer. Virchows Arch. 455, (4), 375-381 (2009).
  8. Nakane, P. K., Pierce, G. B. Enzyme-labeled antibodies: preparation and application for the localization of antigens. J Histochem Cytochem. 14, (12), 929-931 (1966).
  9. Peters, T. J. Investigation of tissue organelles by a combination of analytical subcellular fractionation and enzymic microanalysis: a new approach to pathology. J Clin Pathol. 34, (1), 1-12 (1981).
  10. Emmert-Buck, M. R., et al. Laser Capture Microdissection. Science. 274, (5289), 998-1001 (1996).
  11. Waters, J. C. Accuracy and precision in quantitative fluorescence microscopy. J Cell Biol. 185, (7), 1135-1148 (2009).
  12. Huang, W., Hennrick, K., Drew, S. A colorful future of quantitative pathology: validation of Vectra technology using chromogenic multiplexed immunohistochemistry and prostate tissue microarrays. Hum Pathol. 44, (1), 29-38 (2013).
  13. Rimm, D. L. C-Path: A Watson-Like Visit to the Pathology Lab. Science Translational Medicine. 3, (108), (2011).
  14. Fiore, C., et al. Utility of multispectral imaging in automated quantitative scoring of immunohistochemistry. J Clin Pathol. 65, (6), 496-502 (2012).
  15. Stack, E. C., Wang, C., Roman, K. A., Hoyt, C. C. Multiplexed immunohistochemistry, imaging, and quantitation: A review, with an assessment of Tyramide signal amplification, multispectral imaging and multiplex analysis. Methods. 70, (1), 46-58 (2014).
  16. Rizzardi, A. E., et al. Quantitative comparison of immunohistochemical staining measured by digital image analysis versus pathologist visual scoring. Diagn Pathol. 7, 42 (2012).
  17. Bauman, T. M., et al. Characterization of fibrillar collagens and extracellular matrix of glandular benign prostatic hyperplasia nodules. PLoS One. 9, (10), e109102 (2014).
  18. Bauman, T. M., et al. Beta-catenin is elevated in human benign prostatic hyperplasia specimens compared to histologically normal prostate tissue. Am J Clin Exp Urol. 2, (4), 313-322 (2014).
  19. Bauman, T. M., Ewald, J. A., Huang, W., Ricke, W. A. CD147 expression predicts biochemical recurrence after prostatectomy independent of histologic and pathologic features. BMC Cancer. 15, (1), 549 (2015).
  20. Bauman, T. M., et al. Finasteride treatment alters tissue specific androgen receptor expression in prostate tissues. Prostate. 74, (9), 923-932 (2014).
  21. Nicholson, T. M., Sehgal, P. D., Drew, S. A., Huang, W., Ricke, W. A. Sex steroid receptor expression and localization in benign prostatic hyperplasia varies with tissue compartment. Differentiation. 85, (4-5), 140-149 (2013).
  22. Taylor, C. R., Levenson, R. M. Quantification of immunohistochemistry--issues concerning methods, utility and semiquantitative assessment II. Histopathology. 49, (4), 411-424 (2006).
  23. Matos, L. L., Trufelli, D. C., de Matos, M. G., da Silva Pinhal, M. A. Immunohistochemistry as an important tool in biomarkers detection and clinical practice. Biomark Insights. 5, 9-20 (2010).
  24. Kononen, J., et al. Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. Nat Med. 4, (7), 844-847 (1998).
  25. Ong, C. W., et al. Computer-assisted pathological immunohistochemistry scoring is more time-effective than conventional scoring, but provides no analytical advantage. Histopathology. 56, (4), 523-529 (2010).
Çoklanmış Immuno-histokimyasal boyanması ve Multispektral Görüntüleme kullanma Protein Ekspresyonu ve Co-lokalizasyon Kantifikasyonu
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Bauman, T. M., Ricke, E. A., Drew, S. A., Huang, W., Ricke, W. A. Quantitation of Protein Expression and Co-localization Using Multiplexed Immuno-histochemical Staining and Multispectral Imaging. J. Vis. Exp. (110), e53837, doi:10.3791/53837 (2016).More

Bauman, T. M., Ricke, E. A., Drew, S. A., Huang, W., Ricke, W. A. Quantitation of Protein Expression and Co-localization Using Multiplexed Immuno-histochemical Staining and Multispectral Imaging. J. Vis. Exp. (110), e53837, doi:10.3791/53837 (2016).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
simple hit counter