Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Chemistry

Капиллярный электрофорез Контролировать Peptide прививкой на хитозана пленок в режиме реального времени

Published: October 26, 2016 doi: 10.3791/54549

Abstract

Свободное решение капиллярный электрофорез (CE) отделяет аналитов, как правило, заряженные соединения в растворе за счет применения электрического поля. По сравнению с другими аналитическими методами разделения, такими как хроматография, CE является дешевым, надежным и эффективным не требует подготовки образца (для ряда сложных природных матриц или полимерных образцов). CE быстро и может быть использован , чтобы следить за эволюцией смесей в реальном времени (например, кинетика химического реакции), а сигналы , наблюдаемые для отделенных соединений прямо пропорциональны их количеству в растворе.

При этом эффективность CE продемонстрирована для мониторинга ковалентной прививание пептидов на хитозана пленок для последующих биомедицинских применений. противомикробные и биосовместимые свойства хитозана делают его привлекательным материалом для биомедицинских применений, таких как субстратов для роста клеток. Ковалентно прививкой пептидные Rgds (аргинин - глицин -аспарагиновая кислота - серин) на поверхность хитозана пленок направлена ​​на улучшение прикрепление клеток. Исторически сложилось так, хроматография и аминокислотного анализа были использованы для обеспечения непосредственного измерения количества привитого пептида. Тем не менее, быстрое разделение и отсутствие подготовки образцов, представленной CE позволяет осуществлять мониторинг равноточными еще в режиме реального времени процесса шунтирования пептида. СЕ способен отделить и количественно определить различные компоненты реакционной смесь: (непривитого) пептида, так и химических связующие агенты. Таким образом, использование СЕ приводит к улучшению пленок для последующих применений.

Хитозана пленки были охарактеризованы с помощью твердотельного ЯМР (ядерно-магнитный резонанс) спектроскопии. Эта техника более отнимает много времени и не могут быть применены в реальном масштабе времени, но дает прямое измерение пептида и, таким образом, подтверждает технику CE.

Introduction

Бесплатное решение капиллярного электрофореза (CE) представляет собой метод , который отделяет соединений в растворах на основе их заряда к трению отношением 1,2. Отношение заряда к размеру часто упоминается в литературе, но это упрощение не относится к полиэлектролитов, в том числе полипептидов в этой работе, а также было показано , чтобы не подходить для небольших органических молекул 3. СЕ отличается от других методов разделения, в том, что она не имеющих стационарной фазы, только фоновый электролит (обычно буфер). Это позволяет технику быть устойчивой в своей способности анализировать широкий спектр образцов со сложными матрицами 4 , таких как растительные волокна 5, брожения варит 6 прививаемых на синтетических полимеров 7, образцы пищи 8, и практически не растворимые пептиды 9 без утомительной подготовки образцов и очистки. Это особенно важно для сложных полиэлектролитов, которые имеют проблемы растворения (ыUCH как хитозан 10 и геллановой камеди 11) и , следовательно , существуют в виде агрегированных или осаждают в растворе и успешно проанализированы без фильтрации проб. Кроме того, анализ сахара в сухих завтраках участвует инъекционного образцов с частицами образцов злаковых завтрака осаждают в воде 8. Это также распространяется на анализ разветвленных полиэлектролитов или сополимеров 12,13. Обширная работа также была завершена в разработке методов CE специально для анализа белков для протеомики 14 хирального разделения природных или синтетических пептидов 15 и микрочипов разделений белков и пептидов 16. Поскольку разделение и анализ происходят в капилляр, только небольшие объемы пробы и растворители используют , что позволяет CE иметь более низкую стоимость , чем другие бега методами разделения , в том числе хроматографии 5,6,17. Поскольку разделение с помощью CE быстро, это позволяет Monitoкольцо кинетики реакции. Это было продемонстрировано в случае прививкой пептидов на хитозана пленок для улучшения адгезии 18 клеток.

Хитозан представляет собой полисахарид , полученный из N -deacetylation хитина. Хитозан пленки могут быть использованы для различных биомедицинских применений , таких , как Биоадгезивы 19 и субстратов для роста клеток 18,20, вследствие биосовместимости хитозаном в 21. Прикрепление клеток к специфическим белкам внеклеточного матрикса, таких как фибронектин, коллагены и ламинин, напрямую связана с выживанием клеток 22. Следует отметить, что различные типы клеток, часто требуют прикрепление к различным белкам внеклеточного матрикса для выживания и нормальной работы. Прикрепление клеток к хитозана пленок было показано, повышена за счет прививке фибронектина 23; Тем не менее, подготовка, очистка и прививка таких больших белков не является экономически жизнеспособным. В качестве альтернативы ряд небольших пептидов ВГАе было показано, чтобы иметь возможность имитировать свойства больших белков внеклеточного матрикса. Например, пептиды , такие как фибронектин миметики RGD (аргинин - глицин - аспарагиновая кислота) и RGDS (аргинин - глицин - аспарагиновая кислота - серин), были использованы для облегчения и увеличения прикрепление 24 изолята. Ковалентная прививка RGDS на хитозана пленок приводит к улучшению прикрепление клеток для клеток , известных прикрепиться к фибронектина в естественных условиях 18. Подставив более крупные белки любит фибронектин с меньшими пептидами, которые имеют ту же функциональность обеспечивает значительное снижение затрат.

Здесь пептид прививкой к хитозана проводили , как ранее опубликованную 18. Как было показано ранее, этот подход обеспечивает простую и эффективную прививка с использованием сочетающих агентов EDC-HCl (1-этил-3- (3-диметиламинопропил) карбодиимида) и НГС (N -hydroxysuccinimide) для функционализации карбоновой кислоты RGDS быть привитыхитозан фильм. Два преимущества этого метода является то, что прививка не требует какой - либо модификации хитозана или пептида, и оно осуществляется в водной среде , чтобы максимизировать совместимость с будущими приложениями для культивирования клеток 18,20. Как можно заряжать сочетающие агенты и пептид, СЕ является подходящим методом для анализа кинетики реакции. Важно отметить, что анализ кинетики реакции через CE позволяет осуществлять мониторинг в режиме реального времени реакции прививки, и, таким образом, позволяет одновременно оптимизировать и количественной оценки степени прививки.

В то время как это обычно не нужно, результаты анализа CE могут быть проверены в автономном режиме с помощью прямого измерения пептида прививкой на хитозана пленок с использованием твердотельного ЯМР (ядерный магнитный резонанс) спектроскопии 25,26 , чтобы продемонстрировать ковалентной прививание пептида на пленку 18. Тем не менее, по сравнению с твердотельной ЯМР-спектроскопии, в реальном масштабе времени анализ, представленныйCE позволяет количественно оценить потребление пептида в реальном времени и, таким образом, способность оценивать кинетику реакции.

Вышеупомянутый способ прост и позволяет проводить анализ в режиме реального времени пептида прививки на хитозана пленок с непрямым квантификации степени прививки. Продемонстрированный метод может быть расширен, чтобы в реальном масштабе времени количественной оценки различных химических реакций, как долго, как реагентов или продуктов для анализа могут быть заряжены.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. Получение хитозана пленок

  1. Взвешивают 2 г ледяной уксусной кислоты, полный до 100 мл сверхчистой воды.
  2. Отвешивают 1,7 г хитозана порошка, добавляют 100 мл 2% м / м уксусной кислоты водного раствора. Смесь перемешивают в течение 5 дней с мешалкой и магнитной мешалки при комнатной температуре либо покрытой алюминиевой фольгой или в темноте.
  3. Центрифуга хитозана дисперсии при 1076 х г при 23 ° С в течение 1 часа. Собирают супернатант с помощью шприца и удалите осадок.
  4. Для каждого фильма, аликвоты 10 мл хитозана суспензии в 9 см пластиковой чашке Петри при комнатной температуре. Оставьте фильмы, покрытые высохнуть в течение не менее 7 дней.
  5. С помощью ножниц вырезать сухие пленки в 1 х 1 см квадратов. Примечание: Эксперимент может быть приостановлена ​​на данном этапе.

2. Подготовка фосфатно-буферном солевом растворе (ФБР)

  1. Взвесить 8 г хлорида натрия, 0,2 г хлорида калия, 1,44 г фос динатрия водородаФейт и 0,24 г дигидрофосфата калия.
  2. Растворите эти химикаты отвешивают в 800 мл сверхчистой воды и титруют раствор концентрированной соляной кислотой до рН 7,4.
    Примечание: Эксперимент может быть приостановлена ​​на данном этапе.

3. Приготовление 75 мМ бората натрия с буфером при рН 9,2

  1. Взвесить 3.0915 г борной кислоты. Растворите его в 75 мл сверхчистой воды.
  2. Титрование раствора борной кислоты до рН 9,2 с помощью раствора гидроксида натрия в концентрации 10 мкМ или выше.
    Внимание: концентрированные растворы гидроксида натрия являются коррозионными и должны работать в перчатках.
  3. В комплекте с сверхчистой водой, чтобы получить 100 мл раствора. Это дает 500 мМ бората натрия буфера при рН 9,2.
  4. Развести 500 мМ бората натрия буфера с сверхчистой водой до 75 мМ буфера бората натрия. Примечание: Эксперимент может быть приостановлена ​​на данном этапе.

4. Получение хитозана Fiдля LMS реакции привитой сополимеризации

  1. Полоскание 10 квадратных хитозана пленок (1 х 1 см) в 5 мл PBS в течение 2 ч в чашке Петри при комнатной температуре.
  2. За это время подготовить и утвердить капиллярный электрофорез инструмента (этап 5).

5. Подготовка и проверка на капиллярный электрофорез Инструмента

  1. Приготовьте 43,5 см голую кварцевую капиллярную с внутренним диаметром 50 мкм (43,5 см является общая длина, эффективная длина для окна обнаружения, как правило, 35 см) путем ослабления полимера наружное покрытие из капилляра на заданной длине с тупые утвари затем щелкать капилляр.
    1. Создать окно для капилляра с помощью зажигалки для сжигания полимерного покрытия на 8,5 см от входа и после того, как он остынет протрите его с этанолом. Ожог покрытие капилляра на каждом конце в течение нескольких миллиметров с зажигалкой, и после того, как он остынет протрите его с этанолом.
    2. Место капиллярная ИНСИде окна обнаружения и установить его в капиллярной кассете, поместив его на равных длинах в входе и выходе и наматывая его шпинделей кассеты. Затем установите кассету в капиллярный электрофорез инструмента.
  2. Установка параметров для каждого метода разделения. В программном меню выберите пункт "метод", затем "редактировать весь метод". Установите температуру, время, напряжение и чаш, используемые для разделения (например, 25 ° C, 10 мин, 30 кВ).
    1. В разделе предобуславливание установите последовательные притоки: 10 мин с помощью 1 М гидроксида натрия (в воде), 5 мин с помощью 0,1 М гидроксида натрия (в воде), 5 мин сверхчистой водой и 5 мин с 75 мМ буфера бората натрия при рН 9,2 в течение первого способа серии анализов.
    2. Для последующих методов, установить набор последовательные притоки в секции предварительного кондиционирования: 1 мин с помощью 1 М гидроксида натрия (в воде), 5 мин с 75 мМ буфера бората натрия при рН 9.2.
    3. В разделе впрыска, установить параметры для гидродинамической инъекции с давлением 30 мбар в течение 10 сек для всех методов. В секции разделения, устанавливают условия разделения до 30 кВ при 25 ° С в течение 9 мин для всех методов.
      Примечание: Обратитесь к руководству пользователя конкретного инструмента CE в качестве процедуры для работы с прибором CE может отличаться у разных производителей. Готовят раствор гидроксида натрия 1 М в день.
  3. Вводить и отделить нейтральный внутренний стандарт (10 мкл 10% об / об диметилсульфоксид (ДМСО), в водном растворе в 450 мкл 75 мМ буфера бората натрия). Затем вводят и разделить таким же образом стандарт oligoacrylate (растворенного в сверхчистой воде при 10 г ∙ л -1, см Перечень материалов) , чтобы проверить правильность капилляра. Пауза последовательность здесь, пока реакция прививка не готов к запуску.

6. Прививка RGDS на Хитозан Film

  1. Взвесить пептида (1 мг УВАЖЕНИЕМ)и соединительные средства (3 мг EDC-HCl и 2 мг NHS).
  2. 2 ч после начала хитозана замачивания пленки в PBS, растворить пептид и сочетающих агентов в 5 мл PBS.
    1. Возьмите 50 мкл аликвоты этого раствора. Добавляют 2 мкл 10% об / об ДМСО в воде в качестве внутреннего стандарта нейтрального в аликвоту. Анализ аликвоты с CE (см шаг 7).
  3. Удалите 5 мл PBS использовали для промывки хитозана пленок из чашки Петри. Добавляют 5 мл раствора пептида и связывающих агентов в чашку Петри, содержащую хитозана пленок.
  4. Накройте чашку Петри с парафиновой пленкой и поместить его на орбитальном шейкере при комнатной температуре. Принимать по 50 мкл аликвоты реакционной среды в установленное время.
    Примечание: Общее время анализа с CE составляет 15 мин, при этом аликвота можно принимать каждые 15 мин (или каждые 30 мин , если две реакции отслеживаются параллельно, и т.д.).
    1. Добавляют 2 мкл 10% об / об ДМСО в воде в качестве внутреннего стандарта нейтрального к каждому Aliquot.
      Примечание: аликвоты должны быть проанализированы с CE, как только они будут приняты (этап 7).
  5. Через 4 часа тряски и удаления аликвоты, удалите чашку Петри из шейкера. Удалите реакционную среду из чашки Петри. Добавьте 5 мл PBS для промывания хитозана пленок.
  6. Удалите PBS из чашки Петри, промойте хитозана пленку с сверхчистой водой и дайте им высохнуть в течение ночи. Удалите сверхчистой воды и хранить пленки при -20 ° С в пластиковом Петри.

7. Мониторинг прививкой реакции с использованием CE

  1. Вдохнуть и отдельные аликвоты реакционной среды немедленно после извлечения из чашки Петри, используя условия анализа, как и в разделе 5.2.
  2. После завершения разделений промыть капилляр сверхчистой водой в течение 10 мин. Сушат ее через вровень с пустой флакон (воздух) в течение 10 мин.
    Примечание: Эксперимент может быть приостановлена ​​на данном этапе.

8. Треа данных tment для CE

  1. Проверьте правильность каждого разделения, проверяя, что и ток во время разделения и время миграции электроосмотического маркера подвижности (ДМСО в данном случае) сходны с теми, которые использовались дл стандартного разделения oligoacrylate.
    Примечание: до 10-15% вариации приемлемо от ожидаемого значения тока около 50 мкА и миграции временной стоимости 1,3 мин (электрофоретические значения подвижности следует использовать вместо того, чтобы время миграции, если требуется более высокая повторяемость).
  2. Для каждого успешного разделения, экспортировать необработанные данные из электрофорез программного обеспечения капиллярного путем выбора определенного набора данных, щелкнув правой кнопкой мыши на экспорт и выбрав соответствующий сигнал.
  3. Преобразование исходных данных, записанных с помощью CE (представлены в виде УФ-поглощения в зависимости от времени миграции). Преобразование X-ось (временная миграция т м) в электрофоретической подвижности ц следующим уравнением 1:
    п 1 "SRC =" / файлы / ftp_upload / 54549 / 54549eq1.jpg "/> (1)
    где L D длина до детектора, L T является общая длина капилляра, V является напряжение, и т EO время миграции нейтрального монете (внутренний стандарт ДМСО в данном случае) 27.
    Преобразование Y-ось необработанных данных (поглощение в а.е.) к распределению электрофоретических подвижностей W (i) следующим уравнением 2: 28
    Уравнение 2 (2)

9. Дополнительная характеристика пептидных привитым пленок 18

  1. Вставьте пептидные привитым хитозана пленок, свернутые вокруг себя, в 4 мм твердотельного ЯМР ротора. Наполните ротор с фосфатным буферным солевым раствором для набухания пленок, и закройте ротор. Подождите несколько часов.
  2. Анализ фильма с 13 </ SUP> С ЯМР - спектроскопии 18.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

CE хорошо подходит для мониторинга прививка пептидов (например, УВАЖЕНИЕМ) на хитозана пленок. Подходящие связующие агенты включают в себя EDC-HCl и НГС , которые активируют пептидом привит на хитозана (рисунок 1). СЕ способен отделить различные молекулы, представляющие интерес из реакционной среды. Для назначения пиков на electropherogram, чистые УВАЖЕНИЕМ, EDC-HCl и НГС были распущены, впрыскивают и разделяют по отдельности. После пика задания, реакционную среду вводят и различные реагенты были идентифицированы (рисунок 2). ВДГ-HCl , реагирует в виде побочного продукта ЭДГ-HCl (3 - (((этиламино) (гидрокси) метилен) амино) - N, N -dimethylpropan-1-амин). Диметилсульфоксиде (ДМСО), используется в качестве внутреннего стандарта для цветоделения CE. Хитозан присутствует в привитой эксперименте в виде нерастворимых пленок и, таким образом, не вводили или наблюдается в СЕ. Обратите внимание, что для всех исходных данных, тон записал ось времени миграция превращается в электрофоретической подвижности оси (уравнение 1) , а ось поглощения УФ в распределении электрофоретической подвижности W (i) (уравнение 2).

По мере того как аликвоты берутся из реакционной среды, их помещают в прибор CE и впрыскивают. Степень реакции контролируют путем уменьшения пика , связанного с RGDS (рисунок 3). Кроме того, можно видеть, что пик EDC-HCl, уменьшается, а пик увеличивается ЭДГ-HCl в течение долгого времени. Важно отметить, что нет никакого сигнала, который может быть назначен к продукту из боковой реакции пептида, таким образом, предполагается, что УВАЖЕНИЕМ удаляется из реакционной среды, в настоящее время прививают на хитозана пленку. Наложенные электрофореграммы (фиг.3А) позволяют количественно оценить потребление пептида от начала до конца реакции. Следует отметить, чтохотя кинетика первоначально была измерена в течение 18 часов (рис 3б), 4 ч, является достаточной для реакции протекать в его максимальной степени. Для того, чтобы позволить количественному оптимальный объем впрыска необходим для обеспечения сигнала к шуму , достаточно высока , в то время как предотвращение перегрузки (фиг.4А) и в случае RGDS, инъекции должны быть завершены в режиме реального времени , чтобы предотвратить поликонденсации (фиг.4В ).

Методика CE на основе описанной здесь, чтобы проанализировать пептид прививкой к хитозана пленок быстро и просто; Тем не менее, это не количественную оценку процесса прививки непосредственно. ЯМР-спектроскопии используется для демонстрации прививка; Это измерение не может быть сделано в режиме реального времени (как правило, это занимает несколько часов), и должна быть завершена постреакционной. Качественное сравнение хитозана пленок до и после прививки показывает успешную прививку пептидов Throтьфу появление сигнала на 70 частей на миллион в привитых пленках , соответствующих амидной связи между хитозаном и пептида (рисунок 5).

Рисунок 1
Рисунок 1. Схема реакции прививки. Химическая схема реакции , показывающая активацию EDC-HCl и НГС кислотной функциональной группы карбоновой RGDS с последующим его прививка на поверхности пленки хитозана в. Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть большую версию этой фигуры ,

фигура 2
Рисунок 2. Назначение Пик частиц , присутствующих в реакционной среде. А. Разделение и пик назначение для решений частично гидролизованного EDC -HCl (Розовый), УВАЖЕНИЕМ (красный), ГСЗ (синий), а также для PBS (фиолетовый) и реакционную среду (черный). B. электрофореграммы из реакционной среды (черный) , представленный как функция времени миграции (электрофоретическая мобильность должна быть использована для преодоления плохой повторяемости во времена миграции). Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 3
Рисунок 3. Контроль CE потребления УВАЖЕНИЕМ. (A) , облицованная пептидные пики при времени реакции 30 мин (фиолетовый сплошная линия), 60 мин (пурпурного прерывистая линия), 90 мин (синяя сплошная линия), 120 мин (зеленая пунктирная линия), 150 мин (красная сплошная линия) и (в) кинетика прививкой завершена в течение 18 часов в повторах (квадрат и круг).pload / 54549 / 54549fig3large.jpg "целевых =" _blank "> Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 4
Рисунок 4. Наложенные пептидные пики в реакционной среде , показывающие результаты неоптимальные (А) Различная (гидродинамическая) время впрыска:. 5 сек (синяя линия), 10 сек (черная линия), 20 сек (красная линия) и 30 сек (пурпурная линия) , (B) реакционной среды остаются во флаконе CE в течение длительного периода времени перед инъекцией: 30 мин . (Красная линия) и 90 мин (синяя линия) Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 5
Рисунок 5. 13C опухшие состояния ЯМР - спектры пленок хитозана. Сравнение пленок до (черная линия) и после (синяя линия) пептида прививка. Сигналы , присутствующие только в спектре , зарегистрированного после прививки обозначены звездочками. Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Простота протокола, описанного здесь, делает его идеально подходит для широкого применения. Тем не менее, особое внимание должно быть обращено на следующие основные шаги.

Подготовка Правильное CE инструмент

Важно отделить известный стандарт непосредственно перед разделением неизвестных образцов (а также в конце серии разделений), чтобы проверить правильность капилляра и инструмента на день. Этот стандарт может быть oligoacrylate 27 или любой образец , как известно, дают множество пиков в широком диапазоне времени миграции. Контроль тока во всех разделений и анализа миграции нейтрального маркера в каждом разделении являются ключевыми шагами для выявления проблем. Нестабильный ток, или значительные изменения (более чем на 10-15%) в значение плато тока может быть из-за несогласованности в буфере (рН или концентрации). Если это сопровождается задержкой migratioN время нейтрального производителя оно также может быть связано с капилляр не является достаточно чистым. Проводить периодический контроль рН буфера и дополнительной промывки капилляра в течение 10 мин с помощью 1 М гидроксида натрия (свежеприготовленный) может быть использован для предотвращения / изменить эту проблему. В ходе эксперимента, могут быть использованы дополнительные этапы очистки, чтобы обеспечить оптимальное разделение, как правило, в том числе или удлиняя флаш с концентрированного водного раствора гидроксида натрия для регенерации поверхности запал кварцевую капиллярную.

Правильное лечение данных

По завершении эксперимента, соответствующая обработка исходных данных имеет важное значение при сравнении результатов. Это включает в себя преобразование X и Y-оси, полученной от прибора CE (этап 8.3). Время миграции определяется в СЕ имеют относительно плохую воспроизводимость и мы рекомендуем использовать электрофоретических подвижностей вместо этого, что приводит к гораздо лучшей повторяемостью. Значение правильного т ОЗДАНИЕ данных было показано ранее с разделением и характеристики хитозана 10, поли (акриловая кислота) 29, блок - сополимеры , 13 и обнаружение сахара в сухих завтраках 8 через меньшие стандартные отклонения (RSD) , наблюдаемые между экспериментами по подвижностей , чем за время миграции , Кроме того, СЕ было показано, что более надежными , чем ВЭЖХ при разделении моносахаридов в сложных матрицах 5. Другие этапы оптимизации могут включать в себя регулировать объем впрыска (время впрыска), чтобы обеспечить разделение с хорошей чувствительностью, не вызывая перегрузок, которые препятствовали бы количественно оценить. Время впрыска 10 сек считается оптимальным при 30 мбар (Рисунок 4б): более короткое время впрыска приводит к снижению чувствительности в то время как более длительное время впрыска приводит к искажению формы пика , указывающего капиллярной перегрузки.

Важность мониторинга в режиме реального времени

ove_content "> Критическая сила этого метода CE основе является способность контролировать реакции в режиме реального времени. Это требует оптимальных условий CE для обнаружения и разделения соответствующего реагента (ов) и / или продукта (ов). Кроме того, для анализ химических реакций соответствующий момент времени ноль должны быть приняты в качестве ориентира реакции; это, как правило, заключается в разделении отмерили реагентов непосредственно перед реакцией, начиная Это можно сделать, например, перед одной конкретной реагент вводится, прежде. с повышением температуры, или до УФ-облучения запускается, чтобы вызвать реакцию.

В случае прививка пептидных RGDS (на хитозан или на другой субстрат), пептид способен реагировать с собой , чтобы произвести линейные олигомеры или разветвленные структуры через поликонденсации 18. Это происходит потому, что УВАЖЕНИЕМ содержит как амин и карбоксильных функциональных групп. Эти пептидные олигомеры не имеют один и тот же еlectrophoretic мобильность в качестве исходных пептидных RGDS и, следовательно, может привести к неточной квантификации, с помощью, например, совместно миграции с другими видами. Поэтому очень важно , чтобы гарантировать , что аликвоты реакционной среды впрыскивают и разделяют в течение нескольких минут, принимаемых из реакционной среды (фиг.4В).

Правильная подготовка хитозана пленок

Когда конкретно имеем дело с хитозана фильмов существует целый ряд шагов, чтобы придерживаться. В процессе производства хитозана пленок, пленки должны быть оставлены, чтобы высохнуть в течение по крайней мере 7 дней (желательно больше). Если это не будет завершена, когда пленки помещаются в буфер PBS, чтобы ополоснуть они будут растворяться, а не образуют набухшую пленку, которая затем предотвращает последующие шаги. Кроме того, важно, чтобы нейтрализовать пленку до реакции привитой сополимеризации для удаления остатков уксусной кислоты, которая может быть получена выщелачиванием из пленки и конкурировать спептид для реакции прививки 18. Это может быть сделано путем замачивания в разбавленном водном растворе гидроксида натрия или в PBS. Значение рН буфера, используемого в качестве растворителя для реакции прививки также имеет важное значение: если она слишком кислая пленки будут частично или полностью растворяются. Во время реакции прививки, важно, чтобы пленка может иметь максимальный контакт с реакционным раствором. Таким образом, чашку Петри, содержащую пленки и реакционную смесь помещают на качалку. Важно также, чтобы предотвратить испарение реакционной смеси, чтобы предотвратить неконтролируемые изменения концентраций, приводящие к неточным количественными; использование парафиновой пленки для покрытия чашку Петри было эффективным, чтобы предотвратить его.

Основным ограничением метода является то, что СЕ по отдельности не в состоянии подтвердить процесс прививки. В контексте процесса химического сшивающего упоминалось выше, определение количества пептида прививкой является косвенным. Этамогут быть преодолены с использованием дополнительной техники, такой как твердотельного ЯМР-спектроскопии, как упоминалось ранее. Другие ограничения методики включают в себя CE, что она требует соединение интерес быть заряжена. Поэтому нейтральные частицы будут мигрировать в то же время. В некоторых случаях это может быть преодолен, если соединение процентных комплексов с борат. И, наконец, если интерес соединение не содержит хромофоров обнаружения, кроме УФ, таких как электропроводность, возможно, должны быть использованы. Это требует дополнительной покупки детектора проводимости, которая требует оптимизации.

Преимущества анализа пептидной прививке через CE против других аналитических методов

Метод СЕ имеет ряд преимуществ по сравнению с альтернативными косвенными методами, включая высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ), аминокислотного анализа (ААА) и прямым методом ЯМР-спектроскопии. По сравнению с ААА это с высокой пропускной способностью, надежный метод whicч позволяет эффективно анализировать сложные образцы без утомительной подготовки образцов. Это выгодно, особенно при анализе химических реакций в режиме реального времени. ВЭЖХ использовался ранее для пептидный прививкой анализа 30, однако это было признано только полуколичественный. CE имеет более низкую стоимость , чем бега ВЭЖХ и не требует фильтрации пробы перед проведением анализа, сводя к минимуму риск потери образца 5. Хотя 13 С - ЯМР - спектроскопия позволяет непосредственно измерить интересующий продукт, это дорогостоящий метод , и не в состоянии измерить его в режиме реального времени.

Протокол здесь описано обеспечивает быстрый, эффективный, недорогой и надежный способ оптимизации пептида пересаживания хитозана пленки. Таким образом, этот новый подход обеспечивает значительные преимущества для адаптации свойств прикрепление клеток хитозана пленок по сравнению с традиционно используемыми способами, такими как хроматография и AAA. Этот метод CE может быть использован для мониторинга рядадругих химических реакций в режиме реального времени, как правило, реакции, происходящие на сроки нескольких часов, в течение которых реагенты / продукты интереса может быть предъявлено обвинение. В этом случае, однако, важно отметить, что метод СЕ должен быть оптимизирован до анализа различной химической реакции, чтобы позволить успешного анализа. Это включает в себя анализ чистых реагентов и продуктов перед реакцией, чтобы позволить им быть идентифицированы и гарантировать, что они могут быть обнаружены и отделены, а также, чтобы гарантировать, что никакие примеси не могут предотвратить квантификации. Разделение может быть улучшена, и общее время анализа изменен путем изменения длины капилляров, буферный состав и напряжение, и потенциально используя капилляр со стенами покрытием. Детектирование может быть улучшена путем модификации условий, в которых образец впрыскивается в пользу заряженных реагирующих веществ или путем введения большего количества пробы в капилляр. Кроме того, другие детекторы отдельно от УФ-детектированием можно бе применяется в том числе флуоресценции, кондуктометрического детектора бесконтактные или СЕ может быть соединен с масс-спектрометром. Возможность мониторинга реакции в реальном масштабе времени позволяет реакции прививки, которые должны выполняться непосредственно в ампулу CE, если субстрат находится в растворе и может быть проанализирована с помощью CE. Это может происходить непосредственно внутри инструмента CE, как мы недавно проводили его для протезирования аминоантипирином на поли (акриловая кислота) 7 Кроме того, подход не ограничивается реакции прививки , но может быть расширен , чтобы контролировать различные другие химические реакции. Кроме того, мониторинг реакций позволяет оптимизировать реакцию и может также использоваться для проверки продукта реакции. До тех пор пока соединение может быть растворено и заряженным, метод CE позволяет быстро, дешево и надежное разделение, обнаружение и количественное определение.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Авторы заявляют, что у них нет конкурирующих финансовых интересов.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Water Millipore All water used in the experiment has to be of Milli-Q quality
Chitosan powder (medium molecular weight) Sigma-Aldrich 448877 lot MKBH1108V was used. Significant batch-to-batch variations occur with natural products such as polysaccharides
Acetic acid - Unilab Ajax Finechem 2-2.5L GL laboratory reagent
Dimethylsulfoxide Sigma-Aldrich D4540 laboratory reagent, slightly hazardous to skin, hazardous if ingested
Sodium hydroxide  Sigma-Aldrich 221465  laboratory reagent, corrosive 
1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide  Sigma-Aldrich D80002 Irritant to skin 
N-hydroxysuccinimide  Sigma-Aldrich 130672 Irritant to skin
Sodium chloride  Ajax Finechem 466-500G laboratory reagent
Potassium chloride - Univar Ajax Finechem 384-500G analytical reagent, slight skin irritant
Disodium hydrogen phosphate - Unilab Ajax Finechem 1234-500G laboratory reagent, slight skin irritant
Potassium dihydrogen phosphate - Univar Ajax Finechem 4745-500G analytical reagent, slight skin irritant
Oligoacrylate standard custom made See reference for synthetic protocol: Castignolles, P.; Gaborieau, M.; Hilder, E. F.; Sprong, E.; Ferguson, C. J.; Gilbert, R. G. Macromol. Rapid Commun. 2006, 27, 42-46
Boric acid  BDH AnalR, Merck Pty Ltd 10058 Corrosive
Hydrochloric acid - Unilab Ajax Finechem A1367-2.5L laboratory reagent, corrosivie
Fused silica tubing Polymicro (Molex) TSP050375 Flexible fused silica capillary tubing with standard polyimide coating, 50 µm internal diameter, 363 µm outer diameter 
Agilent 7100 CE Agilent Technologies G7100CE Capillary electrophoresis instrument
Orbital shaker  IKA KS260
Electronic balance Mettler Toledo MS204S
Milli-Q Synthesis  Millipore ZMQS5VF01 Ultrapure water filtration system
Parafilm  Labtek PM966 Parrafin wax

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Muthukumar, M. Theory of electrophoretic mobility of a polyelectrolyte in semidilute solutions of neutral polymers. Electrophoresis. 17, 1167-1172 (1996).
  2. Barrat, J. L., Joanny, J. F. in Advances in Chemical Physics, Vol Xciv Vol. 94 Advances in Chemical Physics. , John Wiley & Sons Inc. 1-66 (1996).
  3. Fu, S. L., Lucy, C. A. Prediction of electrophoretic mobilities. 1. Monoamines. Anal. Chem. 70, 173-181 (1998).
  4. Harvey, D. Modern Analytical Chemistry. , McGraw Hill. (2000).
  5. Oliver, J. D., Gaborieau, M., Hilder, E. F., Castignolles, P. Simple and robust determination of monosaccharides in plant fibers in complex mixtures by capillary electrophoresis and high performance liquid chromatography. J. Chromatogr. A. 1291, 179-186 (2013).
  6. Oliver, J. D., Sutton, A. T., Karu, N., Phillips, M., Markham, J., Peiris, P., Hilder, E. F., Castignolles, P. Simple and robust monitoring of ethanol fermentations by capillary electrophoresis. Biotechnology and Applied Biochemistry. 62, 329-342 (2015).
  7. Thevarajah, J. J., Sutton, A. T., Maniego, A. R., Whitty, E. G., Harrisson, S., Cottet, H., Castignolles, P., Gaborieau, M. Quantifying the Heterogeneity of Chemical Structures in Complex Charged Polymers through the Dispersity of Their Distributions of Electrophoretic Mobilities or of Compositions. Anal. Chem. 88, 1674-1681 (2016).
  8. Toutounji, M. R., Van Leeuwen, M. P., Oliver, J. D., Shrestha, A. K., Castignolles, P., Gaborieau, M. Quantification of sugars in breakfast cereals using capillary electrophoresis. Carbohydr. Res. 408, 134-141 (2015).
  9. Miramon, H., Cavelier, F., Martinez, J., Cottet, H. Highly Resolutive Separations of Hardly Soluble Synthetic Polypeptides by Capillary Electrophoresis. Anal. Chem. 82, 394-399 (2010).
  10. Mnatsakanyan, M., Thevarajah, J. J., Roi, R. S., Lauto, A., Gaborieau, M., Castignolles, P. Separation of chitosan by degree of acetylation using simple free solution capillary electrophoresis. Anal. Bioanal. Chem. 405, 6873-6877 (2013).
  11. Taylor, D. L., Ferris, C. J., Maniego, A. R., Castignolles, P., in het Panhuis, M., Gaborieau, M. Characterization of Gellan Gum by Capillary Electrophoresis. Australian Journal of Chemistry. 65, 1156-1164 (2012).
  12. Thevarajah, J. J., Gaborieau, M., Castignolles, P. Separation and characterization of synthetic polyelectrolytes and polysaccharides with capillary electrophoresis. Adv. Chem. 2014, 798503 (2014).
  13. Sutton, A. T., Read, E., Maniego, A. R., Thevarajah, J., Marty, J. -D., Destarac, M., Gaborieau, M., Castignolles, P. Purity of double hydrophilic block copolymers revealed by capillary electrophoresis in the critical conditions. J. Chromatogr. A. 1372, 187-195 (2014).
  14. Righetti, P. G., Sebastiano, R., Citterio, A. Capillary electrophoresis and isoelectric focusing in peptide and protein analysis. Proteomics. 13, 325-340 (2013).
  15. Ali, I., Al-Othman, Z. A., Al-Warthan, A., Asnin, L., Chudinov, A. Advances in chiral separations of small peptides by capillary electrophoresis and chromatography. J. Sep. Sci. 37, 2447-2466 (2014).
  16. Kasicka, V. Recent developments in capillary and microchip electroseparations of peptides (2011-2013). Electrophoresis. 35, 69-95 (2014).
  17. JoVE Science Education Database. Capillary Electrophoresis (CE). Essentials of Analytical Chemistry. , JoVE. Cambridge, MA. Available from: http://www.jove.com/science-education/10226/capillary-electrophoresis-ce (2016).
  18. Taylor, D. L., Thevarajah, J. J., Narayan, D. K., Murphy, P., Mangala, M. M., Lim, S., Wuhrer, R., Lefay, C., O'Connor, M. D., Gaborieau, M., Castignolles, P. Real-time monitoring of peptide grafting onto chitosan films using capillary electrophoresis. Anal. Bioanal. Chem. 407, 2543-2555 (2015).
  19. Rinaudo, M. Chitin and chitosan: Properties and applications. Prog. Polym. Sci. 31, 603-632 (2006).
  20. Li, Z., Leung, M., Hopper, R., Ellenbogen, R., Zhang, M. Feeder-free self-renewal of human embryonic stem cells in 3D porous natural polymer scaffolds. Biomaterials. 31, 404-412 (2010).
  21. Domard, A. A perspective on 30 years research on chitin and chitosan. Carbohydr. Polym. 84, 696-703 (2011).
  22. Shekaran, A., Garcia, A. J. Nanoscale engineering of extracellular matrix-mimetic bioadhesive surfaces and implants for tissue engineering. Biochim. Biophys. Acta Gen. Subj. 1810, 350-360 (2011).
  23. Custodio, C. A., Alves, C. M., Reis, R. L., Mano, J. F. Immobilization of fibronectin in chitosan substrates improves cell adhesion and proliferation. J. Tissue Eng. Regen. Med. 4, 316-323 (2010).
  24. Boateng, S. Y., Lateef, S. S., Mosley, W., Hartman, T. J., Hanley, L., Russell, B. RGD and YIGSR synthetic peptides facilitate cellular adhesion identical to that of laminin and fibronectin but alter the physiology of neonatal cardiac myocytes. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 288, C30-C38 (2005).
  25. Lefay, C., Guillaneuf, Y., Moreira, G., Thevarajah, J. J., Castignolles, P., Ziarelli, F., Bloch, E., Major, M., Charles, L., Gaborieau, M., Bertin, D., Gigmes, D. Heterogeneous modification of chitosan via nitroxide-mediated polymerization. Polym. Chem. 4, 322-328 (2013).
  26. Gartner, C., Lopez, B. L., Sierra, L., Graf, R., Spiess, H. W., Gaborieau, M. Interplay between Structure and Dynamics in Chitosan Films Investigated with Solid-State NMR, Dynamic Mechanical Analysis, and X-ray Diffraction. Biomacromolecules. 12, 1380-1386 (2011).
  27. Castignolles, P., Gaborieau, M., Hilder, E. F., Sprong, E., Ferguson, C. J., Gilbert, R. G. High resolution separation of oligo(acrylic acid) by capillary zone electrophoresis. Macromol. Rapid Commun. 27, 42-46 (2006).
  28. Chamieh, J., Martin, M., Cottet, H. Quantitative Analysis in Capillary Electrophoresis: Transformation of Raw Electropherograms into Continuous Distributions. Anal. Chem. 87, 1050-1057 (2015).
  29. Maniego, A. R., Ang, D., Guillaneuf, Y., Lefay, C., Gigmes, D., Aldrich-Wright, J. R., Gaborieau, M., Castignolles, P. Separation of poly(acrylic acid) salts according to topology using capillary electrophoresis in the critical conditions. Anal. Bioanal. Chem. 405, 9009-9020 (2013).
  30. Chung, T. W., Lu, Y. F., Wang, S. S., Lin, Y. S., Chu, S. H. Growth of human endothelial cells on photochemically grafted Gly-Arg-Gly-Asp (GRGD) chitosans. Biomaterials. 23, 4803-4809 (2002).

Tags

Химия выпуск 116 капиллярный электрофорез мониторинг реакции в реальном масштабе времени прививка пептид хитозан пленки эпителиальные клетки твердотельные ядерного магнитного резонанса (ЯМР)
Капиллярный электрофорез Контролировать Peptide прививкой на хитозана пленок в режиме реального времени
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Thevarajah, J. J., O'Connor, M. D.,More

Thevarajah, J. J., O'Connor, M. D., Castignolles, P., Gaborieau, M. Capillary Electrophoresis to Monitor Peptide Grafting onto Chitosan Films in Real Time. J. Vis. Exp. (116), e54549, doi:10.3791/54549 (2016).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter