Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
JoVE Journal Biochemistry
Click here for the English version

Biochemistry

قياس الألوان فحوصات من داخل الخلايا لاكتات الصغيرة وبيروفات في السلكية ايليجانس كاينورهابديتيس

Published: October 15, 2018 doi: 10.3791/57807
Automatic Translation
1,2, 3, 3
1Department of Health Science, School of Sports & Health Science, Daito Bunka University, 2Department of Molecular Life Science, School of Medicine, Tokai University, 3Department of Health Management, School of Health Study, Tokai University

Summary

يصف لنا استخراج معدلة على نطاق ضيق وفحوصات اللونية لاكتات وبيروفات في ديدان أسطوانية C. ايليجانس. عند استخدام أدوات التحليل التجاري، المهم التطور التقني الحساسية والدقة. ترسيب البروتين في استخراج هي الخطوة الأكثر أهمية لتحديد الكمية من نواتج الأيض داخل الخلايا.

Abstract

لاكتات وبيروفات وسيطة رئيسية للطاقة داخل الخلايا الأيضية. رصد نسبة لاكتات/بيروفات في الخلايا يساعد على تحديد ما إذا كان هناك اختلال في الأيض الطاقة المرتبطة بالسن بين المتقدرية الفسفرة وتحلل الهوائية. هنا، علينا أن نبدي الاستفادة مجموعات تجارية مقايسة اللونية لاكتات وبيروفات في نموذج الكائن الحي C. ايليجانس. في الآونة الأخيرة، بحساسية ودقة من أطقم مقايسة اللونية/فلوريميتريك قد تحسنت إلى حد كبير بالبحث والتطوير التي تقوم بها الشركات المصنعة للكاشف. ومكنت الكواشف تحسين استخدام فحوصات صغيرة الحجم مع لوحة 96-جيدا في C. ايليجانس. بشكل عام، الإنزيم فلوريميتريك متفوقة في مجال التوعية مقايسة اللونية؛ ومع ذلك، نهج قياس الألوان أكثر مناسبة للاستخدام في المختبرات المشتركة. مسألة هامة أخرى في هذه الاختبارات لتحديد الكمية ترسيب البروتين المتجانس C. ايليجانس العينات. في أسلوبنا ترسيب البروتين، بريسيبيتانتس مشتركة (مثلاً.، حمض التريكلوروسيتيك، وحمض بيرتشلوريك وحمض ميتافوسفوريك) وتستخدم لإعداد نموذج. بإضافة مباشرة مرسب الباردة (تركيز النهائي 5%) خلال التجانس بإعداد عينة فحص خالية من البروتين.

Introduction

تركيزات لاكتات وبيروفات تعتبر على نطاق واسع كوسيطة استقلاب الطاقة، وهي تتصل بالدول من تحلل، ودورة حمض تريكاربوكسيليتش (TCA)، وسلسلة نقل الإلكترون في خلايا الكائنات الحية الهوائية. سلسلة من ردود الفعل في تحلل أكسدة الجلوكوز إلى بيروفات، التي تقع في مفترق طرق الأيض ويمكن تحويلها إلى الكربوهيدرات عن طريق جلوكونيوجينيسيس، الأحماض الدهنية والايض الطاقة عن طريق البيروفات، والأنين من الأحماض الأمينية. دورة TCA يحدث تحت وجود الأوكسجين الذائب كافية، وهو أمر أساسي لتحويل الجلوكوز إلى طاقة. خاصة، هو تغيير الأيض الثانوية ظاهرة مثيرة لاهتمام التي تحلل يستخدم أساسا لإنتاج الطاقة والتنفس المتقدرية الهوائية، والذي يتضمن بدوره TCA وسلسلة نقل الإلكترون، دوونريجولاتيد في الثدييات سرطان الخلايا1،2. وأظهرت لنا مؤخرا أن مستويات اللاكتات ونسبة ما يترتب عليها من لاكتات/بيروفات (L/P) انخفض خلال الشيخوخة في الكائن الحي النموذجي ايليجانس كاينورهابديتيس (C. ايليجانس). وبالمثل، وجدنا أن القامع الورم الثدييات أورثولوج p53 المجلس الانتخابي المؤقت-1 في C. ايليجانس دوراً هاما في التعديلات المتعلقة بالسن في استقلاب الطاقة من خلال تفعيل أهداف النسخي3.

في فحوصات بيولوجية، مثل قياس تركيزات لاكتات وبيروفات في الخلايا، والحساسية، ودقة وحجم العينة، ووقت الحضانة لمجموعات مقايسة اللونية/فلوريميتريك قد تحسنت جذريا. ونظرا للابتكارات التكنولوجية، ونحن الآن قادرة على تحليل مختلف نواتج الأيض ونواتج الأيض الوسيطة دون ثقافة واسعة النطاق من C. ايليجانس، هو أمر صعب نظراً لصغر حجمه. وبصفة عامة، حساسية مقايسة اللونية أمر من حجم أصغر من أن الإنزيم فلوريميتريك؛ بيد أن النهج اللونية أكثر ملاءمة في الإعداد لمختبرات مشتركة. وعلاوة على ذلك، أسلوب استخراج تتضمن ترسيب البروتين وتجانس حاسمة لتحديد كمية تركيزات لاكتات وبيروفات في الخلايا C. ايليجانس نظراً لديدان أسطوانية هذا مضمن في الهيكل الخارجي ودعا بشرة، خلافا لخلايا الثدييات خطوط4،5. هنا، يمكننا وصف بروتوكول تحليل تركيزات لاكتات وبيروفات باستخدام مجموعات مقايسة اللونية التجارية بما في ذلك النصائح لاستخراج عينة من C. ايليجانس.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1-تزامن ثقافة C. ايليجانس

  1. قبل البذر، سلالة الثقافة الإشريكيّة القولونية (كولاي) OP50 بين عشية وضحاها في 37 درجة مئوية في 300 مل مرق لوريا بيرتاني (رطل) متوسطة السائل. متجر OP50 مثقف-4 درجة مئوية.
    1. جعل رطل مرق المتوسطة السائل، استخدام 10 جرام تريبتوني، 5 غ خميرة استخراج، 10 غم من كلوريد الصوديوم و 1.5 مل من 1 N هيدروكسيد الصوديوم، وإضافة إلى 1 لتر مع المياه. اﻷوتوكﻻف.
      ملاحظة: تتوفر سلالات OP50 و C. ايليجانس من مركز علم الوراثة كاينورهابديتيس (جامعة مينيسوتا، سانت بول، مينيسوتا، الولايات المتحدة الأمريكية).
  2. جعل نمو السلكية أجار المتوسطة (NGM)، استخدام الجيل الثالث 3g من كلوريد الصوديوم 2.5 g من ببتون، ز 17 من أجار ومل 975 من المياه. اﻷوتوكﻻف. كول إلى 55 درجة مئوية، ثم ستيريليلي إضافة، في الترتيب، 1 مل 1 م MgSO4، 1 مل كاكل 1 م2، 1 مل 5 ملغ/مل الكولسترول في EtOH، و 25 مل من م 1 البوتاسيوم الفوسفات pH 6.0 في 90-أطباق بيتري ملم.
    1. م 1 فوسفات البوتاسيوم pH 6.0، استخدم 108.3 ز خ2ص4 و 46.6 ز ك2مكتب البراءات الهنغاري4، وإضافة المياه. 1 اﻷوتوكﻻف ل.6.
  3. 1-2 مل OP50 المستزرعة على لوحات أجار NGM تنتشر. جعل طبقة رقيقة من OP50، احتضان لوحات بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة قبل إضافة أي الديدان الخيطية.
    ملاحظة: NGM أجار لوحات OP50 الملقحين يمكن تخزينها في درجة حرارة الغرفة لمدة 2-3 أسابيع.
  4. أضف الديدان على الأقل 100 على صفيحة أجار NGM مع OP50، والثقافة في 20 درجة مئوية حتى مرحلة الكبار. مطلوبة على الأقل ثلاث لوحات.
  5. جمع البيض في الرحمونقل جرابيد المنحرفين من ثلاثة NGM أجار لوحات كل مع 5 مل من المخزن المؤقت S في أنبوب مخروطي 15 مل، وتغسل الديدان 3 مرات مع 15 مل من المخزن المؤقت S باستخدام الطرد المركزي في 300 x ز لمدة 30 ثانية في درجة حرارة الغرفة.
    1. لجعل المخزن المؤقت S، استخدم 5.9 غرام من كلوريد الصوديوم و 50 مل من م 1 البوتاسيوم الفوسفات pH 6.0، إضافة إلى 1 لتر مع المياه. اﻷوتوكﻻف6.
  6. حل الديدان في حلاً تحت كلوريت قلوية أكسينيزيشن وعزل البيض بالجملة (0.5 مل من التبييض الطازجة أو ما يعادلها: هيبوكلوريت الصوديوم 5-6%، 0.1 مل من 10 M هيدروكسيد الصوديوم، حوالي 4.5 مل من المخزن المؤقت S)6، والوقوف الحل لمدة 10-15 دقيقة في درجة حرارة الغرفة مع الاختلاط بعكس.
    ملاحظة: خلال 15 دقيقة، الديدان الكبار ينبغي أن يحل، ترك حل ضبابي من البيض المحررة من جثث بهم (البيض المحررة ينبغي تأكيد استخدام مجهر مجسم). بدلاً من 0.1 مل من هيدروكسيد الصوديوم ن 10، يمكن أيضا استخدام 0.2 مل من هيدروكسيد الصوديوم N 5.
  7. وبعد العلاج تحت كلوريت، يغسل بيليه البيض 3 مرات مع 15 مل من المخزن المؤقت S، وريسوسبيند في 5-6 مل من المخزن المؤقت S. تفقس البيض تم إصدارها خلال حضانة بين عشية وضحاها في 20 درجة مئوية في المخزن المؤقت S دون كولاي لثقافة عصر متزامن ليرقات المرحلة L1.
  8. لتحديد العدد التقريبي ليرقات المرحلة L1، تعول الديدان باستخدام مجهر مجسم في 10 ميليلتر من المخزن المؤقت S بعد ريسوسبيندينج اليرقات 3 مرات على الأقل، وحساب المتوسط. ثم نقل اليرقات المرحلة L1 إلى خمس لوحات أجار NGM مع OP50 (الديدان 1,500-3,000 كل لوحة باستخدام طبق بيتري 90 ملم)، والثقافة في 20 درجة مئوية إلى حين نمت إلى مرحلة الكبار الصغار، وعندما يبدأ الإخصاب ويتم وضع عدد قليل من البيض (عادة بعد 3 د آيس).

2-استخراج "جزء الخلوية" من C. ايليجانس

  1. جمع الشباب مرحلة الكبار (عمره 5 أيام الحيوانات) الديدان من خمس لوحات أجار NGM مع المخزن المؤقت S (الشكل 1A).
    1. لتحديد الديدان الحية فقط استخدام الأسلوب السكروز6 للتعويم في محلول السكروز 30% (w/v)، مزيج من الديدان قد علقت في 3-4 مل من المخزن المؤقت S مع حجم متساوية من المثلج السكروز 60% (w/v) في أنبوب مخروطي 15 مل. تدور الأنبوب في س 1,500 ز لمدة 15 ثانية في 4 درجات مئوية وإزالة العائمة الديدان في أنبوب جديد بنقلها قبالة جدار الأنبوبة مع ماصة باستور.
  2. أغسل الديدان 3 مرات مع المخزن المؤقت S باستخدام الطرد المركزي في س 1,500 ز لمدة 30 ثانية في 4 درجات مئوية. فحص وحدة التخزين الرطب من الديدان غسلها بعد الطرد المركزي باستخدام تلميح ميكروبيبيتي 1,000 ميليلتر (الشكل 1B).
  3. إضافة الديدان غسلها على حجم متساوية من حمض التريكلوروسيتيك 10% (w/v) المثلج (كلورفورم الميثيل؛ والتركيز النهائي من 5 في المائة) لترسيب البروتين (الشكل 1). بدلاً من كلورفورم الميثيل، يمكن استخدام حمض ميتافوسفوريك أو حمض بيرتشلوريك (PCA).
  4. مجانسة الديدان مع مرسب استخدام 40 ضربات المدقة في الخالطون تفلون (طاحونة الأنسجة بوتر-ألفهيم) مع دوران يصل إلى 1,300 لفة في الدقيقة على الجليد.
  5. نقل هوموجيناتي في microtube 1.5 مل طازجة مع ماصة باستور، و sonicate باستخدام الخالطون الموجات فوق الصوتية لمدة 3 دقيقة (3 مرات من 1 دقيقة) مع دورة عمل 20% على الجليد.
  6. توضيح هوموجيناتي بالطرد المركزي في س 8,000 ز لمدة 10 دقائق في 4 درجات مئوية. تحييد supernatants مع 4 م كوه (حجم 0.25% 10 TCA) لمدة 20 دقيقة على الجليد، وأجهزة الطرد المركزي في 8,000 س ز لمدة 10 دقائق في 4 درجات مئوية. ويمكن تخزين المادة طافية (كعينة اختبار) في-80 درجة مئوية حتى الاختبارات التالية.

3-لاكتات الفحص باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية

  1. قياس تركيز لاكتات في عينات الاختبار باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية (جدول المواد). القيام بفحوصات المزدوجة لعينات الاختبار. إضافة 5 أو 10 ميليلتر من عينات الاختبار لصفيحة 96-جيدا، وضبط حجم الصوت إلى 50 ميليلتر الواحدة وكذلك مع "اكتات الإنزيم المخزن المؤقت" المقدمة مع عدة.
  2. للمنحنى المعياري لاكتات، تمييع 100 مم L (+)-"لاكتات القياسية" إلى 1 ملم مع "المخزن المؤقت للمقايسة لاكتات". أضف 0، 2، 4، 6 و 8 و 10 ميليلتر مم 1 L (+)-"لاكتات القياسية"، التي يتم توفيرها مع هذه المجموعة، إلى سلسلة من الآبار.
  3. إضافة 50 ميليلتر من مزيج التفاعل (التي تحتوي على 46:2:2 "لاكتات المخزن المؤقت المقايسة" ومزيج إنزيم لاكتات لاكتات التحقيق في [دمس]، لا مائي؛ وترد جميع الكواشف مع عدة) أو مزيج التحكم الخلفية (التي تحتوي على 48:2 "لاكتات المخزن المؤقت المقايسة" ولاكتات Probe) في كل بئر واحتضان في درجة حرارة الغرفة لمدة 30-60 دقيقة بينما تتم حماية العينات من الضوء.
  4. قياس امتصاص لكل بئر في 570 نانومتر باستخدام قارئ ميكروسكوبية وطرح امتصاص مزيج التحكم الخلفية من امتصاص هذا المزيج الرد.
  5. ارسم المنحنى القياسي لاكتات. حساب تركيزات لاكتات عينات الاختبار من المنحنى المعياري لاكتات.

4-بيروفات الفحص باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية

  1. قياس تركيز بيروفات في supernatants (عينات الاختبار) باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية (جدول المواد). القيام بفحوصات المزدوجة لعينات الاختبار. إضافة 10 ميليلتر من عينات الاختبار وميليلتر 90 من "الكاشف العامل" (التي تحتوي على 94:1 "ميكس الإنزيم" و "كاشف صبغ"، التي يتم توفيرها مع عدة) في لوحة 96-جيدا واحتضان في درجة حرارة الغرفة لمدة 30 دقيقة بينما تتم حماية العينات من الضوء.
  2. قياس امتصاص لكل بئر في 570 نانومتر باستخدام قارئ ميكروسكوبية.
  3. ارسم المنحنى القياسي بيروفات. حساب تركيزات بيروفات عينات الاختبار من المنحنى المعياري بيروفات.

5-البروتين المقايسة للتطبيع مع محتوى البروتين

  1. قياس تركيز البروتين في supernatants (عينات الاختبار) باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية (جدول المواد). بيد أن هذه الخطوة لا يقتصر على وضع مجموعة من أدوات تحليل، ونهج أخرى يمكن أن تستخدم لقياس تركيز البروتين.
  2. تطبيع قيم تركيزات لاكتات وبيروفات بين عينات الاختبار باستخدام كل تركيز البروتين الكلي.
    ملاحظة: تركيز البروتين في عينات الاختبار هو الكشف بما فيه الكفاية حتى بعد ترسيب البروتين ويستخدم لخطوة التطبيع بين العينات.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

استخدام الاختبارات اللونية لتحديد كمية تركيزات لاكتات وبيروفات، أظهرنا دقة هذه الاختبارات مقارنة بالتقارير السابقة في7، ايليجانس جيم-8. هنا، كانت عملية ترسيب البروتين أثناء استخراج عينة أن الخطوة الأكثر أهمية لتوليد قيم صحيحة. لترسيب البروتين، بريسيبيتانتس المشتركة (على سبيل المثال-، TCA، محكمة التحكيم الدائمة، أو حمض ميتافوسفوريك) يمكن استخدامها لتحضير عينات الاختبار (الشكل 1). ومع ذلك، من الضروري في C. ايليجانس، أداء ترسيب البروتين خلال تجانس الديدان (الجدول 1). بالإضافة إلى الدقة، هذه فحوصات كانت حساسة بما فيه الكفاية لقياس تركيزات لاكتات وبيروفات في عينات صغيرة، وتمكنوا من الكشف عليهم في فترة قصيرة من الوقت (وقت رد الفعل حضانة كلا فحوصات 30 دقيقة على الأقل) ( الشكل 2-3). في الواقع، قدمنا البيانات في تقرير الأخير3. وهكذا، نحن يمكن أن الكشف عن التعديلات الأيضية المرتبطة بالسن مشيراً إلى أن الخلوي لاكتات مستويات وانخفضت نسبة L/P ما يترتب عليها من خلال الشيخوخة، واظهرنا استقلاب الطاقة المختلفة أيضا في المجلس الانتخابي المؤقت-1 3متحولة.

Figure 1
الشكل 1 . عملية لاستخلاص نواتج الأيض الخلوية. (A) 1,500-3,000 الديدان وضعت على صفيحة أجار NGM (طبق بيتري 90 ملم). استخراج من الديدان على خمس لوحات كان كافياً لفحوصات اللونية. (ب) الديدان التي جمعت من خمس لوحات من الديدان 3,000 و 1500 للوحة الواحدة مبينة على اليسار والجانب الأيمن من لوحة، على التوالي. وحدات تخزين الرطب في كل أنبوبة 15 مل < 0.5 مل، التي كانت كافية للكشف. (ج) البروتين هطول الأمطار باستخدام 10% كلورفورم الميثيل خلال تجانس الديدان. وقد TCA في الخالطون التي يتعين القيام بها قبل أن يتم تجانس الديدان إضافة الديدان في المثلج 10%. وبخلاف ذلك، لا يمكن كشفها لاكتات الخلوية وبيروفات في عينات الاختبار باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية (يتم عرض البيانات في الجدول 1). الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-

Figure 2
الشكل 2 . أنماط تصبغ قياس الألوان من المعايير لاكتات باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية. (أ) آبار لصفيحة 96-كذلك تستخدم في مقايسة اللونية، وسلسلة تمييع L (+)-مستوى لاكتات. زيادة تركيز لاكتات أسفرت عن لون وردي أكثر كثافة. ويشير إلى حرس الحدود خلفية التحقيق لاكتات ضد سلسلة تمييع. (ب) لاكتات المنحنى المعياري مقايسة اللونية. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-

Figure 3
الشكل 3 . أنماط تصبغ قياس الألوان من المعايير بيروفات باستخدام مجموعة أدوات مقايسة اللونية. (أ) آبار لصفيحة 96-جيدا باستخدام مقايسة اللونية، وتمييع سلسلة بيروفات القياسية. زيادة تركيز بيروفات أسفرت عن زيادة التلوين الوردي الخفيفة. (ب) بيروفات المنحنى المعياري مقايسة اللونية. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-

اختبار العينات لاكتات (مم) بيروفات (مم)
عينات عجلت البروتين خلال التجانس 3.07 ± 0.94 0.22 ± 0.08
عينات عجلت البروتين بعد التجانس وفيات المواليد وفيات المواليد
كسر سيتوسوليك سليمة بعد التجانس وتنبيذ فائق 1.12 0.06

الجدول 1- آثار ترسب البروتين في توقيتات مختلفة للكشف عن لاكتات الخلوية وبيروفات في عمره 5 أيام الحيوانات البرية من نوع N2. وتشير البيانات إلى وسائل + الانحراف المعياري (SD) من قرارات ثلاثة على الأقل. ويشير إلى ND غير المكتشفة. * وأجرى عملية الاستخراج مبدئياً باستخدام تنبيذ فائق دون ترسيب البروتين.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

عند استخدام هذه المجموعات اللونية المقايسة، الخطوة الأكثر أهمية في استخراج عينة للكشف عن لاكتات الخلوية وبيروفات بدقة في C. ايليجانس هي عملية ترسيب البروتين خلال التجانس (الشكل 1). ليس من الضرورة القصوى لاستخدام الخالطون تفلون، كسائر أجهزة المجانسة (مثلاً.، دونس ومدبب المطاحن الأنسجة، أو حبة ميلز) هي أيضا مناسبة لاستخراج الديدان الصغيرة. ونحن لم يكتشف لاكتات الخلوية وبيروفات في اختبار العينات التي استخرجت باستخدام الخالطون قبل ترسيب البروتين. وعلاوة على ذلك، انخفضت مستويات اللاكتات وبيروفات جذريا في الكسر سيتوسوليك مفصولة باستخدام تنبيذ فائق بدلاً من البروتين هطول الأمطار (الجدول 1). وهذه تشير إلى أن استخراج عينة حاسم للكشف عن نواتج الأيض الخلوية في المنهجية البيوكيميائية باستخدام ديدان أسطوانية C. ايليجانس. لترسيب البروتين، يمكن أن تستخدم كلورفورم الميثيل ليس فقط ولكن أيضا عدة أخرى بريسيبيتانتس (محكمة التحكيم الدائمة أو حمض ميتافوسفوريك) إلى منهجية البيوكيميائية7،9. ووفقا لتقرير سابق، أدى استخدام TCA اختفاء ما يقرب من 12 في المائة NADH في قياس لاكتات الدم وبيروفات الانزيمية. ولذلك استنتج المؤلفون أن حمض ميتافوسفوريك 5% يجب تحديد البروتين مرسب لاكتات وبيروفات عند استخدام الانزيمية فحوصات9. وهي تقترح أن كلورفورم الميثيل ديناتوريس جزئيا البروتينات بما في ذلك العديد من الإنزيمات. ومع ذلك، كان لدينا أية مشاكل فيما يتعلق ب precipitants البروتين عند استخدام الاختبارات اللونية للكشف عن لاكتات الخلوية وبيروفات.

في هذه الدراسة، كنا مجموعات تجارية مقايسة اللونية لتحديد الكمية لاكتات وبيروفات (الشكل 2 والشكل 3 ). عن الحساسيات وأحجام العينات كانت متفوقة مقارنة بالتحليل السابق مجموعات7؛ ولذلك إعداد عينات الاختبار استخدام استخراج مقياس أصغر والإبلاغ عن الاختلافات في تركيزات لاكتات وبيروفات الخلوية في ايليجانس جيم-3. نحن كشف انخفاض نسبة L/P لاكتات وما يترتب عليها من المرتبطة بالسن في البرية من نوع C. ايليجانس ووجدت أن p53/المجلس الانتخابي المؤقت-1 دوراً هاما في تغيير الأيض الطاقة من خلال تفعيل أهدافها النسخي المتعلقة بالعمر 2 , 3-وهكذا، تحليل استقلاب الطاقة في ديدان أسطوانية C. ايليجانس عائدات مفيد نظراً لاستخدام أدوات محسنة مقايسة اللونية، على الأقل في الجزء.

كما هو موضح في الشكل 3، أن تركيز لاكتات أدناه 2 مم تميل إلى أن تكون أكبر في الواقع في هذا التحليل قياس الألوان (لا المقايسة فلوروميتريك). ولذلك، قد يكون الإنزيم فلوروميتريك مناسبة لقياس أكثر دقة من لاكتات. دعم قدرات هذه المجموعات المقايسة فحوصات قياس الألوان وفلوروميتريك على السواء، محدداً المقايسة ردا على الجهاز في المختبرات للمستخدم. أنها لا تزال أكثر تكلفة استخدام مجموعات مقايسة اللونية التجارية الحالية لتحديد كمية تركيز نواتج الأيض الخلوية. ومع ذلك، يمكن إجراء المحاكمات على نحو كاف في مختبرات أصغر باستخدام أدوات مشتركة، وقارئ لوحة سبيكتروفوتوميتريك.

حتى الآن، وهناك تقارير قليلة نسبيا باستخدام النهج التقليدية البيوكيميائية في كائن نموذج C. ايليجانس، التي عادة ما تحتاج إلى ثقافة واسعة النطاق من الديدان، بالمقارنة مع الدراسات الوراثية5. بيد التقدم الملحوظ مؤخرا نظم المقايسة البيولوجية (مثلاً.، تحسين حساسية والاستقرار لمجموعات المقايسة) يجعل الدراسات باستخدام ديدان أسطوانية C. ايليجانس، وهو صغير يتكون من خلايا أقل من 1,000، أكثر جذابة والمؤداة بسهولة في المختبر. من الآن فصاعدا، تحليل metabolomic فعالة باستخدام الطيف الكتلي (مللي ثانية) والفصل اللوني للغاز/قياس الطيف الكتلي (GC/MS) يمكن أن يساعد على الحد من بعض المشاكل، مثل ثقافة واسعة النطاق والحساسية التحليلية، والخصوصية، وستساعد على توضيح دور الأيض الخلوية في أمراض الشيخوخة والبشرية بما في ذلك السرطان10. التطلع إلى المستقبل، منهجية أسهل، مثل مجموعات مقايسة اللونية، وتكون فعالة كأداة فحص قبل تحليلات مفيدة أكثر دقة.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

الكتاب يعلن أن لديهم لا تضارب المصالح المالية.

Acknowledgments

وأيد هذا العمل ماليا "منحة بحثية خاصة" من ديتو بونكا جامعة إلى ياناسي سومينو.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Lactate Colorimetric/Fluorimetric Assay kit  BioVision #K607-100 colorimetric/fluorimetric
100 assays; Store at -20oC
EnzyChrom Pyruvate
Assay Kit		 BioAssay
Systems		 #EPYR-100 colorimetric/ fluorometric
100 assays; Store at -20oC
BCA Protein Assay Kit Thermo Scientific #23225 colorimetric assay; store at
 room temperature
Trichloroacetic Acid Wako Pure Chemical #207-04955 store at room temperature
Teflon homogenizer  Iwaki/Pyrex #358034 (Wheaton) Instead of Iwaki/Pyrex,
available by Wheaton

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Warburg, O. On the origin of cancer cells. Science. 123, 309-314 (1956).
  2. Matoba, S., et al. p53 regulates mitochondrial respiration. Science. 312, 1650-1653 (2006).
  3. Yanase, S., Suda, H., Yasuda, K., Ishii, N. Impaired p53/CEP-1 is associated with lifespan extension through an age-related imbalance in the energy metabolism of C. elegans. Genes to Cells. 22 (12), 1004-1010 (2017).
  4. Page, A. P., Johnstone, I. L. The C. elegans. Research Community. The cuticle. WormBook. , (2007).
  5. Hulme, S. E., Whitesides, G. M. Chemistry and the worm: Caenorhabditis elegans as a platform for integrating chemical and biological research. Angewandte Chemie International Edition. 50, 4774-4807 (2011).
  6. Lewis, J. A., Fleming, J. T. Basic culture methods. Methods in Cell Biology, Volume 48, Caenorhabditis elegans: Modern Biological Analysis of an Organism. Epstein, H. F., Shakes, D. C. , Academic Press, Inc. 3-29 (1995).
  7. Senoo-Matsuda, N., et al. A defect in the cytochrome b large subunit in complex II causes both superoxide anion overproduction and abnormal energy metabolism in Caenorhabditis elegans. The Journal of Biological Chemistry. 276 (45), 41553-41558 (2001).
  8. Butler, J. A., Mishur, R. J., Bhaskaran, S., Rea, S. L. A metabolic signature for long life in the Caenorhabditis elegans Mit mutants. Aging Cell. 12, 130-138 (2013).
  9. Marbach, E. P., Weil, M. H. Rapid enzymatic measurement of blood lactate and pyruvate: Use and significance of metaphosphoric acid as a common precipitant. Clinical Chemistry. 13 (4), 314-325 (1967).
  10. Mishur, R. J., et al. Mitochondrial metabolites extend lifespan. Aging Cell. 15, 336-348 (2016).

Tags

الكيمياء الحيوية، المسألة 140، ايليجانس كاينورهابديتيس، استقلاب الطاقة، لاكتات، بيروفات، ومقايسة اللونية، ومرسب المشتركة
قياس الألوان فحوصات من داخل الخلايا لاكتات الصغيرة وبيروفات في السلكية <em>ايليجانس كاينورهابديتيس</em>
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Yanase, S., Yasuda, K., Ishii, N.… More

Yanase, S., Yasuda, K., Ishii, N. Small-Scale Colorimetric Assays of Intracellular Lactate and Pyruvate in the Nematode Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (140), e57807, doi:10.3791/57807 (2018).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter