JoVE
JoVE
Faculty Resource Center
Research
Behavior
Biochemistry
Biology
Bioengineering
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
JoVE Chrome Extension
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to your Course
Authors
Librarians
High Schools
About
Sign-In
Sign In
Contact Us
Research
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
High Schools
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Close
Research
Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
Products
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
Products
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to Your Course
Teacher Resources
Get in Touch
Instant Trial
Log In
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Journal
/
Biology
/
3' slutet sekvensering bibliotek förberedelser med A-seq2
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal
Biology
3′ End Sequencing Library Preparation with A-seq2
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
3' slutet sekvensering bibliotek förberedelser med A-seq2
DOI:
10.3791/56129-v
•
12:01 min
•
October 10, 2017
•
Georges Martin
,
Ralf Schmidt
,
Andreas J. Gruber
,
Souvik Ghosh
,
Walter Keller
,
Mihaela Zavolan
2
1
Computational and Systems Biology, Biozentrum
,
University of Basel
,
2
Swiss Institute of Bioinformatics, Biozentrum
,
University of Basel
Chapters
00:05
Title
00:46
Isolation of mRNA from Cells
03:24
5′ End Phosphorylation, DNase Treatment, and 3′ End Blocking
04:30
Ligation of Reverse 3′ Adapters to 5′ End of RNA Fragments and Reverse Transcription
05:59
Digestion with Uracil DNA Glycosylase Enzyme Mix and Ligation of 5′ Adapters to 5′ Ends of cDNA
07:44
Pilot PCR, Amplification of Libraries, and Size Selection
09:21
Computational Analysis of DNA Sequence Data
10:03
Results: The A-seq2 Method Maps pre-mRNA 3′ End Processing Sites
10:52
Conclusion
Summary
Automatic Translation
English (Original)
العربية (Arabic)
中文 (Chinese)
Nederlands (Dutch)
français (French)
Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
italiano (Italian)
日本語 (Japanese)
한국어 (Korean)
português (Portuguese)
русский (Russian)
español (Spanish)
Türkçe (Turkish)
Automatic Translation
Det här protokollet beskriver en metod för kartläggning pre-mRNA 3' slutet bearbetning platser.
Tags
3′ End Sequencing
A-seq2
MRNA Processing
Polyadenylation
Transcript Isoforms
Cell Types
Poly(A) Stretches
Adapter Dimers
Cell Lysis
Oligo D(T)25 Magnetic Beads
Buffer A
Buffer B
Alkaline Hydrolysis
RNA Isolation
Polynucleotide Kinase
Article
Embed
ADD TO PLAYLIST
Usage Statistics
Related Videos
Stora Sätt Miljö Genomic Bibliotek Produktion
Kromatin Interaktion Analys med parade-End Tag sekvensering (CHIA-PET) för kartläggning kromatin Interaktioner och förstå transkriptionsreglering
Analys av RNA Processing Reaktioner Använda Cell Free Systems: 3 'End Cleavage av Pre-mRNA-substrat<em> In vitro</em
Interactome-Seq: Ett protokoll för Domainome bibliotek konstruktion, validering och urval av Phage Display och nästa generations sekvensering
Bedömning av global DNA Double-Strand End Samband med BrdU-DNA-märkning i kombination med cellcykeldiskrimineringsavbildning
Tillämpning av passiv huvudrörelse för att generera definierade accelerationer vid gnagarnas huvuden
En förbättrad Chemotaxis-analys för snabb identifiering av Rhizobacterial Chemoattractants i Root Exudates
Encellssuspensionspreparat från Nile Tilapia-tarmen för encellssekvensering
Anrikning av mRNA- och bisulfit-mRNA-biblioteksberedning för nästa generations sekvensering
CorrelationCalculator och filigran: Verktyg för datadriven nätverksanalys av metabolomikdata
Read Article