Journal
/
Genetics
/
Bereiding van de monsters en de analyse van de RNASeq gebaseerde gen expressie gegevens uit de zebravis
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Bereiding van de monsters en de analyse van de RNASeq gebaseerde gen expressie gegevens uit de zebravis

DOI:
10.3791/56187-v

•

11:42 min

•

October 27, 2017

•

, ,
1Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine,University of Maryland School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:04Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
  • 02:22Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
  • 04:55Sorting Differentially Expressed Genes
  • 07:00Determine Enriched Pathways
  • 07:57Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
  • 09:12Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
  • 10:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Dit protocol biedt een aanpak voor de hele transcriptome analyse van zebravis embryo's, larven, of cellen gesorteerd. Wij omvatten isolatie van RNA, pad analyse van RNASeq gegevens en qRT-PCR-gebaseerde validatie van gen expressie veranderingen.

Tags

RNASeqGene ExpressionZebrafishEmbryoLarvaTranscriptomeSample PreparationRNA ExtractionRNA SequencingDevelopmental BiologyComparative Analysis

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Parallel Meting van de circadiane klok genexpressie en hormoon in Human primaire celculturen

Eencellige Gene Expression Profiling Met behulp van FACS en qPCR met interne standaarden

Het bestuderen van celcyclusreguleerde genuitdrukking door twee complementaire celsynchronisatieprotocollen

Tweerichtings retrovirale integratie site PCR methodologie en kwantitatieve data analyse werkstroom

Meten van de genexpressie in gebombardeerd gerst Aleurone lagen met grotere gegevensdoorvoer

Een Optogenetic methode te controleren en analyseren van gen expressiepatronen in cel-naar-cel interacties

Een Ecdysone Receptor gebaseerde enkelvoud Gene schakelaar voor bewuste expressie van transgenic met te verwaarlozen Leakiness, robuustheid en reversibiliteit

Verkennen van de wortel Microbiome: extraheren van gegevens van de bacteriële Gemeenschap uit de bodem, de rhizosfeer, en de wortel Endosphere

Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen

Behoud van de biologische culturen en meten van de genexpressie in Aphis Oleanderpijlstaart: een Non-modelsysteem voor Plant-insect interacties

Read Article