Kapillært isoelectric fokus er et antistoff-basert, ultrasensitive, høy gjennomstrømming teknikk, muliggjør detaljert karakterisering av proteiner og deres isoformene fra svært små biologiske prøver. Følgende beskriver en protokoll for oppdagelse og kvantifisering av spesifikke proteiner og deres isoformene i en automatisert og robotisert måte.