Kapillär isoelektrisk fokusering är en antikroppsbaserade, ultrasensitive, hög genomströmning teknik, möjliggör detaljerad karakterisering av proteiner och deras isoformer från extremt små biologiska prover. Nedan beskrivs ett protokoll för detektion och kvantifiering av specifika proteiner och deras isoformer på ett automatiserat och robotiserade sätt.