Detta protokoll ger en översikt över förfarandena för isolering av RNA för transcriptomic profilering av lymfkörtel vävnader från stora djur, inklusive steg i identifiering och excision av lymfkörtlar från boskap och vilda djur, provtagning metoder att tillhandahålla konsekvens över flera djur, och överväganden plus representativa resultat för efter samling bevarande och bearbetning för RNA analys.